The purpose of the cartographic data resulting from analyses of the ecological connectivity of natural environments in the St. Lawrence lowlands is to equip users by making it possible to integrate the concepts of ecological connectivity and the quality of the habitat of natural terrestrial environments into conservation issues. It is a knowledge tool for recognizing natural environments of importance for ecological connectivity in the St. Lawrence Lowlands region. This data is the result of research conducted by McGill University and its partners (Apex Resource Management Solutions, Quebec Center for Biodiversity Science and Habitat) on behalf of the Ministry of the Environment, the Fight against Climate Change, and its partners (Apex Resource Management Solutions, Wildlife and Parks) (MELCCFP).**This third party metadata element was translated using an automated translation tool (Amazon Translate).**

Effective conservation planning relies on understanding population connectivity which can be informed by genomic data. This is particularly important for sessile species like the horse mussel (Modiolus modiolus), a key habitat-forming species and conservation priority in Atlantic Canada), yet little genomic information is available to describe horse mussel connectivity patterns. We used more than 8000 restriction-site associated DNA sequencing-derived single nucleotide polymorphisms and a panel of 8 microsatellites to examine genomic connectivity among horse mussel populations in the Bay of Fundy, along the Scotian Shelf, and in the broader northwestern Atlantic extending to Newfoundland. Despite phenotypic differences between sampling locations, we found an overall lack of genetic diversity and population structure in horse mussels in the Northwest Atlantic Ocean. All sampled locations had low heterozygosity, very low FST, elevated inbreeding coefficients, and deviated from Hardy-Weinberg Equilibrium, highlighting generally low genetic diversity across all metrics. Principal components analysis, Admixture analysis, pairwise FST calculations, and analysis of outlier loci (potentially under selection) all showed no independent genomic clusters within the data, and an analysis of molecular variance showed that less than 1% of the variation within the SNP dataset was found between sampling locations. Our results suggest that connectivity is high among horse mussel populations in the Northwest Atlantic, and coupled with large effective population sizes, this has resulted in minimal genomic divergence across the region. These results can inform conservation design considerations in the Bay of Fundy and support further integration into the broader regional conservation network.Cite this data as: Van Wyngaarden, Mallory et al. (2024). Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus. Published: May 2025. Coastal Ecosystem Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth, NS.

Parks Canada’s National Program for Ecological Corridors was initiated to strengthen the network of protected areas across Canada through the creation of ecological corridors. To achieve this goal, Parks Canada sought out to develop tools for a common approach on the scientific and governance aspects of corridor creation and management. The National Priority Areas for Ecological Corridors (NPAECs) were developed using a scientific framework for national-scale prioritization of where ecological corridors are most urgently needed. Improving or maintaining ecological connectivity in these areas will greatly benefit biodiversity conservation and climate change adaptation. The NPAECs were identified based on a methodology that is multivariate, data driven, national in scale, and spatially explicit at a coarse resolution. The Criteria for Ecological Corridors in Canada provide a common approach to ensure ecological corridors are managed and stewarded to maintain or restore effective ecological connectivity, while upholding Indigenous stewardship values. They are derived from the internationally recognized International Union for Conservation of Nature’s Guidelines on Connectivity and adapted to the Canadian context. The NPAECs geographic data layer, the list of datasets used to identify them, the Criteria and their accompanying guidance can be found below. More details and context about both program elements are available on the Program’s webpage (https://parks.canada.ca/nature/science/conservation/corridors-ecologiques-ecological-corridors).

This dataset shows length weighted connectivity values summarized by hydrologic unit code (HUC) for a provincial stream connectivity indicator that assesses connectivity for aquatic organisms in stream networks. The stream connectivity indicator supports evaluation and reporting on indicator condition over time and provides information to support management of watercourse crossings. The stream connectivity indicator produces an estimate of the average connectivity in a stream network, considering the movement requirements of local species and the locations of watercourse crossings. The indicator is calculated and summarized using hydrologic unit codes (HUCs). Indicator values are calculated at a HUC 6 scale, and summarized for HUC 8 watersheds at four timesteps: 2010, 2014, 2016 and 2018.

The Nova Scotia Hydrographic Network is an enhanced version of the Nova Scotia Topographic Database's Water Features theme. This dataset includes network spines for connectivity of water flow and various attribution for flow direction, priority of water flow and toponymic objects where applicable.

Layer that includes the known information on potential haul-out sites for the harbour seal and gray seal in the Estuary and Gulf of St. Lawrence according to a literature review of documents produced between 1978 and 2000.Additional InformationPotential haul-out sites for the harbor seal and gray seal were produced according to a literature review of the following documents:Andersen, A. et M. Gagnon. 1980. Les ressources halieutiques de l'estuaire du Saint-Laurent. Rapp. can. ind. sci. halieut. aquat., 119: iv + 56 p.Argus Groupe-Conseil inc. 1992. Synthèse et analyse des connaissances relatives aux ressources naturelles du Saguenay et de l'estuaire maritime du Saint-Laurent. Parc marin du Saguenay. Service canadien des parcs, région du Québec.Biorex. 1995. Cartographie des ressources halieutiques et de leurs habitats dans l'estuaire moyen du Saint-Laurent. Rapport au ministère des Pêches et des Océans, Région du Québec, Division de la gestion de l'habitat du poisson. 36 p. + annexes. Biorex. 1996. Base de données géoréférencées sur les ressources halieutiques et leurs habitats : estuaire maritime du Saint-Laurent et fjord du Saguenay. Rapport au ministère des Pêches et des Océans, Région du Québec, Division de la gestion de l'habitat du poisson. Volume 1 : 38 p. + annexes et Volume 2 : 34 p. + annexes.Chevrier, V. 1994. Cartographie des habitats du poisson aux Îles-de-la-Madeleine. Rapport technique no. 1. Réalisé en collaboration avec le M.P.O., Attention Frag'Îles et la M.R.C. des Îles-de-la-Madeleine. 24 p. + 1 ann. + 36 cartes.Comité de la zone d'intervention prioritaire (ZIP) de la Côte-Nord du golfe. 1999. Inventaire des habitats côtiers et marins sensibles de la Basse-Cote-Nord : Rapport final, présenté à Pêches et Océans Canada par le Comité ZIP Côte-Nord du Golfe. 126 p.Comité de protection de la santé et de l'environnement de Gaspé inc. (C.P.S.E.G.). 1996.Communication personnelle par Carol Fournier, MPO. 1999. Communications personnelles par Gosselin, J-F-. 1996. Desaulniers, J. 1989. Étude des populations de pinnipèdes de l'Archipel-de-Mingan et relation entre l'activité de chasse au phoque et la sécurité publique 1987 à 1989. Parcs Canada. Région du Québec. Service de la conservation des ressources naturelles.Enquêtes auprès des pêcheurs. 1995.Lavigne, P.-J. 1978. La chasse estivale du phoque dans le Saint-Laurent. Rapport non publié. 65 p. Pêches et Océans Canada, Région du Québec.Lesage, Véronique. 2000. Communication personnel.Lesage, V., M. O. Hammill, and K.M. Kovacs. 1995. Harbour seal (Phoca vitulina) and Grey seal (Halichoerus grypus) abundance in the St. Lawrence estuary. Can. Manuscr. Rep. Fish. Aquat. Sci. 2307: iii + 19 p.Naturam Environnement inc. 1996. Caractérisation physique et biologique de l'habitat du poisson du secteur de Pointe-aux-Outardes. Realisé pour le compte de la Corporation du Parc régional de Pointe-aux-Outardes. 196 p.

Layer that includes the known information on rainbow smelt breeding and feeding areas in the Saguenay River, the fluvial section and Estuary of St. Lawrence according to a literature review of documents produced between 1977 and 2000.Additional InformationRainbow smelt's breeding and feeding areas were produced according to a literature review of the following documents:Argus inc. (Les consultants en environnement). 1995b. Barachois de Malbaie: étude d'avant-projet de conservation et de mise en valeur. Rapport présenté au Club des ornithologues de la Gaspésie dans le cadre du programme Saint-Laurent Vision 2000. 71 p. + ann.Bouthillier, L., P. Dumont et G. Roy. 1993. Répertoire des habitats du poisson de la région de Montréal, Québec. Ministère du Loisir, de la Chasse et de la Pêche du Québec, Direction régionale de Montréal. ii + 6 p. + fiches d'habitats + 18 cartes d'habitats à l'échelle 1:50 000 + bibliographie 15 p.Dubé, J., M. Letendre, M. Beaudoin et B. Dumas. 1992. Marina l'Escale inc. Relevés sur l'habitat du poisson au printemps 1992. Lots 6-P, 7-P et littoral de la rivière Richelieu, Notre-Dame-du-Mont-Carmel, MRC du Haut-Richelieu. Québec, Ministère du Loisir, de la Chasse et de la Pêche, Service de l'aménagement et de l'exploitation de la faune, Montréal, 13 p. + annexes.Dumont, P. et R. Fortin. 1977. Relations entre les niveaux d'eau printaniers et la reproduction du Grand Brochet du Haut-Richelieu et de la baie Missisquoi. Université du Québec à Montréal, Département des sciences biologiques, pour le Bureau international Champlain Richelieu, Comité d'impact sur l'environnement, x + 108 p.Dumont, P., J. Leclerc et Y. Chagnon. 1990. Pêche électrique sur la rivière Yamaska le 18 avril 1990. Québec, Ministère du Loisir de la Chasse et de la Pêche, Service de l'aménagement et de l'exploitation de la faune, Montréal. [Données non publiées].Enquête auprès des agents des pêches du MPO. 1994.Fréchet, A., Dodson J.J., Powles, H. 1983. Les parasites de l'éperlan d'amérique (Osmerus mordax) anadrome du Québec et leur utilité comme étiquettes biologiques. Canadian journal of zoology no 61: 621-626.Gagnon, M., Y. Ménard et J.-F. La Rue. 1993. Caractérisation et évaluation des habitats du poisson dans la zone de transition saline du Saint-Laurent. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 1920: viii + 104 p.Jacquaz et coll. 1990. Étude biophysique de l'habitat du poisson de quatre barachois de la baie des Chaleurs.Lemieux, C. 1995. Acquisition de connaissances des habitats côtiers dans la région de Rimouski (1995). Rapport du Groupe-Conseil GENIVAR présenté au Ministère des Pêches et des Océans du Canada, Division de la Gestion de l’Habitat du Poisson, 52 pages + 2 annexes.Lemieux, C. et R. Lalumière. 1995. Acquisition de connaissances des habitats côtiers du barachois de Saint-Omer. Rap. du Groupe conseil Genivar inc. pour la DGHP, MPO, 44 pages + 3 ann.Lemieux, C. 1996. Acquisition de connaissances des habitats côtiers de l'Anse Saint-Jean et de la baie Sainte- Marguerite dans la région du Saguenay. Rap. du Groupe conseil Genivar inc. pour la DGHP, ministère des Pêches et Océans, 79 p. + annexes.Lesueur, C. 1995. Acquisition de connaissances du milieu côtier dans la batture de Saint-Fulgence. Rapport du Comité ZIP-Saguenay au ministère des Pêches et des Océans du Canada et au Ministère de l'Environnement et de la Faune. 38 p. + annexes.Lesueur, C. 1998. Acquisition de connaissances sur les poissons migrateurs et dulcicoles du Saguenay. Rapport du projet triennal : résultats obtenus de 1995 à 1998. Rapport du Comité ZIP-Saguenay au ministère des Pêches et des Océans Canada, au ministère de l'Environnement et de la Faune et à Patrimoine Canada. 74 p. + annexe.Letendre, M., B. Dumas et M. Beaudoin. 1990. Inventaire de la rivière des Prairies, au niveau de l'île de Pierre. Québec, Ministère du Loisir de la Chasse et de la Pêche, Service de l'aménagement et de l'exploitation de la faune, Montréal. [Travaux en cours].Logimer. 1985. Développement d'un programme de conservation et de reconstitution des habitats lagunaires gaspésiens. Rapport présenté à Pêches et Océans Canada, section Habitat du poisson. 306 p. et annexes.Naturam Environnement. 1997. Acquisition de connaissances et mise en valeur des habitats du poisson du complexe Baie Verte/Baie Laval, phase 3 : rapport final. Document réalisé par la Corporation de développpement de la Baie Verte avec l'aide du MPO dans le cadre du Plan d'action pour l'habitat du poisson.Pageau, G. et R. Tanguay. 1977. Frayères, sites propices à la reproduction, et sites de concentration de jeunes poissons d'intérêt sportif et commercial dans le fleuve Saint-Laurent. Rapport soumis au Comité d'étude sur le fleuve Saint-Laurent par le Ministère du Tourisme, de la Chasse et de la Pêche, Rapp. tech. 3, 436 p.Pesca. 1997. Étude de conservation et de mise en valeur de la Pointe Verte, Maria. Rapport préliminaire présenté au ministère des Pêches et des Océans. 86p.Société de la Faune et des Parcs du Québec. 2000. Atlas des habitats critiques connus ou d'intérêt particulier pour les poissons du fleuve Saint-Laurent entre le port de Montréal et l'Île aux Coudres. Direction du développement de la faune.

Sea scallop (Placopecten magellanicus) and Iceland scallop (Chlamys islandica) concentration areas of this layer are described as being known and commercially exploited historically and/or currently. The mapping of these areas is based on several sources of information: research surveys (since 1977, annually but alternating sectors since 2009), exploratory fisheries (2000, 2001, 2003) and commercial fisheries (annually). These concentration areas are considered among the most abundant beds and are used for commercial fishing.This layer does not represent the general distribution of the species nor the extent to which fishing is allowed and does not take into account the large unexploited beds. The extent of shellfish beds can change over time in response to, among others, harvesting and recruitment rates. The polygons might underestimate the concentration areas because fishing and scientific surveys occurred where the target resource was known to be more abundant. However, the precision is good enough for resource protection and management needs in case of an environmental incident. This information is valid until data from a more recent research survey is published.Data sources and references:Bourdages, H. et Goudreau, P. 2010. Évaluation des stocks de pétoncles des eaux côtières du Québec en 2009 : données de la pêche commerciale. Secr. can. de consult. sci. du MPO. Doc. de rech. 2010/068. viii + 69 p. Giguère, M., Brulotte, S. et Goudreau, P. 2000. État des stocks de pétoncles des eaux côtières du Québec. Secr. can. de consult. sci. du MPO. Doc. de rech. 2000/086. xi + 46 p.Trottier, S., Bourdages, H., Goudreau, P et Brulotte, S. 2017. Évaluation des stocks de pétoncle des eaux côtières du Québec en 2015: données de la pêche commerciale, des relevés de recherche et des pêches exploratoires. Secr. can. de consult. sci. du MPO. Doc. de rech. 2017/037: xvi + 176 p.

Production of a layer that includes the known information on seaweed medium to high density areas in the Chaleur Bay, the Estuary and the Gulf of St. Lawrence according to a literature review of documents produced between 1995 and 1999.Additional InformationSeaweed density areas were produced according to a literature review of the following documents:Mariculture de Percé inc. 1995. Essai d'augmentation de la biomasse du homard "Récifs artificiels", Rapport no 95, Programme d'essai et d'expérimentation halieutiques et aquicoles.Lemieux, C. 1995. Acquisition de connaissances des habitats côtiers dans la région de Rimouski (1995). Rapport du Groupe-Conseil GENIVAR présenté au Ministère des Pêches et des Océans du Canada, Division de la Gestion de l’Habitat du Poisson, 52 pages + 2 annexes.Belzile, L., Lalumière, R., Cloutier, O. et J.F. Martel. 1997. Inventaire des laminaires dans la Baie des Chaleurs entre Miguasha et Bonaventure. Rapport conjoint Groupe-conseil Génivar inc. et Regroupement des pêcheurs professionnels du sud de la Gaspésie pour le compte de Pêches et Océans Canada, Québec. 13 pagesVaillancourt, M.-A. et C. Lafontaine. 1999. Caractérisation de la Baie Mitis. Jardins de Métis et Pêches et Océans Canada. Grand-Métis. 185 p.Calderón, I. 1996. Caractérisation de la végétation et de la faune ichtyenne de la baie de Sept-Îles. Document réalisé par la Corporation de protection de l'environnement de Sept-Îles pour Pêches et Océans Canada. 26p. + 5 annexes.Calderón, I. 1996. Caractérisation des habitats du poisson de la baie de Sept-Îles - Phase II. Corporation de protection de l'environnement de Sept-Îles. 37 pages.

The names of these rivers in the Bay of Fundy and Port Hawkesbury Area Response Plan (ARP) regions were obtained from Recovery Potential Assessments (see references), and cross referenced with the Atlas of Canada hosted online by Natural Resources Canada. These rivers were then identified and marked in ArcGIS using the Nova Scotia and New Brunswick Hydrographic Networks. Point features were used to represent the river mouths. For rivers large enough to be represented by polygon features, the point was placed where the polygon closed the inlet. For smaller rivers represented by a polyline, the point was placed where the line intersected the coastline. When multiple tributaries of a river were identified as salmon rivers, only the most seaward was marked.Cite this data as: Corrigan, S. Data of: Salmon Rivers Presence, Maritimes Region. Published: June 2019. Coastal Ecosystems Science Division, Fisheries and Oceans Canada, St. Andrews, N.B. https://open.canada.ca/data/en/dataset/ded53eaa-bb98-4476-beea-3138372c740b