Ces données indiquent l’adéquation d’un site pour la mise en place de taillis en courte rotation de peuplier hybride sur des terres propices (c.-à-d., non boisées) au boisement dans l’ensemble du Canada.La détermination de la faisabilité d’un programme de boisement à grande échelle constitue l’une des approches qu’examine le gouvernement du Canada afin d’accroître le potentiel du pays à piéger le carbone présent dans l’atmosphère ou à produire des bioproduits et de la bioénergie. Cependant, le boisement à grande échelle exige des connaissances sur les endroits adéquats où établir et faire croître des arbres. On peut utiliser à cette fin des modèles spatiaux reposant sur la logique booléenne ou des modèles statistiques au sein d’un système d’information géographique, mais il manque souvent des données environnementales empiriques, et l’association de ces données à l’adéquation d’un terrain constitue le plus souvent un processus subjectif. Afin de remédier à ce problème, on a mis au point au Canada une approche de modélisation à logique floue afin d’évaluer si un site convient pour un boisement de peuplier hybride (Populus spp.) ou de saule (Salix spp.). Les connaissances approfondies concernant le choix et l’ampleur des variables environnementales ont été intégrées aux ensembles de règles floues à partir desquels les estimations sur l’adéquation d’un site ont été produites et présentées spatialement. Les variables environnementales sélectionnées comprenaient les précipitations pendant la saison de croissance, l’indice d’humidité climatique, les degrés-jours de croissance, la capacité des terres pour l’agriculture et l’élévation selon l’Inventaire des terres du Canada. L’adéquation d’un site est généralement définie comme étant l’aptitude d’un type de terrain donné à convenir pour une utilisation en particulier. Pour cette évaluation, l’adéquation d’un site a été définie comme étant l’aptitude des conditions édaphiques (c.-à-d., du sol), climatiques et topographiques en vue de planter et de faire croître des essences de taillis en courte rotation à des taux 8 fois supérieurs à ceux des essences indigènes. La plage de valeurs de l’indice d’adéquation va de 1 à 100, les valeurs les plus élevées correspondant à une adéquation supérieure. Il a été établi qu’environ 246 000 km2, ou 38 p. 100, des ressources terrestres admissibles du Canada conviennent pour y faire du boisement à courte rotation de peuplier hybride ou de saule.

Ces données indiquent l’adéquation d’un site pour la mise en place de taillis en courte rotation de saule sur des terres propices (c.-à-d., non boisées) au boisement dans l’ensemble du Canada.La détermination de la faisabilité d’un programme de boisement à grande échelle constitue l’une des approches qu’examine le gouvernement du Canada afin d’accroître le potentiel du pays à piéger le carbone présent dans l’atmosphère ou à produire des bioproduits et de la bioénergie. Cependant, le boisement à grande échelle exige des connaissances sur les endroits adéquats où établir et faire croître des arbres. On peut utiliser à cette fin des modèles spatiaux reposant sur la logique booléenne ou des modèles statistiques au sein d’un système d’information géographique, mais il manque souvent des données environnementales empiriques, et l’association de ces données à l’adéquation d’un terrain constitue le plus souvent un processus subjectif. Afin de remédier à ce problème, on a mis au point au Canada une approche de modélisation à logique floue afin d’évaluer si un site convient pour un boisement de peuplier hybride (Populus spp.) ou de saule (Salix spp.). Les connaissances approfondies concernant le choix et l’ampleur des variables environnementales ont été intégrées aux ensembles de règles floues à partir desquels les estimations sur l’adéquation d’un site ont été produites et présentées spatialement. Les variables environnementales sélectionnées comprenaient les précipitations pendant la saison de croissance, l’indice d’humidité climatique, les degrés-jours de croissance, la capacité des terres pour l’agriculture et l’élévation selon l’Inventaire des terres du Canada. L’adéquation d’un site est généralement définie comme étant l’aptitude d’un type de terrain donné à convenir pour une utilisation en particulier. Pour cette évaluation, l’adéquation d’un site a été définie comme étant l’aptitude des conditions édaphiques (c.-à-d., du sol), climatiques et topographiques en vue de planter et de faire croître des essences de taillis en courte rotation à des taux 8 fois supérieurs à ceux des essences indigènes. La plage de valeurs de l’indice d’adéquation va de 1 à 100, les valeurs les plus élevées correspondant à une adéquation supérieure. Il a été établi qu’environ 246 000 km2, ou 38 p. 100, des ressources terrestres admissibles du Canada conviennent pour y faire du boisement à courte rotation de peuplier hybride ou de saule.

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b

Cette ressource documente un jeu de données sur les occurrences d’épifaune collectées en 2021 dans le cadre du programme KEBABB (Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Baffin Bay) développé par Pêches et Océans Canada (MPO) en collaboration avec des partenaires universitaires. L’objectif général du programme KEBABB est de caractériser la variabilité et les tendances des conditions océanographiques physiques, chimiques et biologiques et des réseaux trophiques soutenant les pêches dans les écosystèmes de l’ouest de la baie de Baffin et du détroit de Lancaster. En 2021, le MPO a étendu le programme KEBABB au détroit de Barrow (KEBABS-Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Barrow Strait), une zone productive clé de l’aire marine nationale de conservation de Tallurutiup Imanga. L’étude a eu lieu dans l’Arctique canadien de l’Est (principalement dans la baie de Baffin, détroit de Davis et détroit de Barrow). L’échantillonnage est effectué le long de transects à des stations fixes dans la zone d’étude. Les prises sont collectées avec un chalut Agassiz de 3 m (filet à mailles internes de 5 mm) pendant 3 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 1.5 nœuds et avec un chalut à perche benthique de 3 m (filet à mailles internes de 6.4 mm) pendant 15 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 3 nœuds. Un total de 16 stations ont été échantillonnées pour l’épifaune en 2021 entre 85 et 850 m. Les invertébrés épibenthiques sont identifiés au niveau taxonomique le plus bas possible et photographiés. Tous les spécimens inconnus sont congelés. En laboratoire, les identifications sont validées ou précisées avec les photos et les spécimens congelés.Les données sont présentées en format Darwin Core et sont séparées en deux fichiers :Le fichier “Activité_épifaune_KEBABB_epifauna_event_fr” qui contient les informations des missions, des stations et des déploiements, qui sont présenté sous une structure d’activité hiérarchique.Le fichier “Occurrence_épifaune_KEBABB_epifauna_fr” qui contient les occurrences taxonomiques.De plus amples détails sur l’échantillonnage se trouvent dans le rapport suivant : Pućko, M., Charette, J., Tremblay P., Brulotte S., St-Denis B., Ciastek S., Hedges, K., Kuzyk, Z., Roy V., and Michel, C. 2022. An ecosystem-based approach in the eastern Arctic: KEBABB/S (Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Baffin Bay/Barrow Strait) 2021 expedition report. Can. Manuscr. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3250: viii + 58 p. https://publications.gc.ca/collections/collection_2022/mpo-dfo/Fs97-4-3250-eng.pdfLIMITATION DE L’UTILISATION :Pour assurer l’intégrité scientifique et l’utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

Découvertes historiques de Profenusa thomsoni

OBJECTIF :Le but de ce travail était de déterminer (1) comment la génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal de la merluche blanche (Urophycis tenuis), et (2) si la variation de la communauté microbienne fournit des informations complémentaires sur la structure de la population de cette espèce dans l'est du Canada.DESCRIPTION :L’intégration du microbiote associé à l’hôte aux approches génomiques offre un cadre prometteur pour mieux comprendre les multiples dimensions biologiques qui façonnent la structure des populations chez les poissons marins. Une compréhension claire de la structure et de la dynamique des populations biologiques est essentielle pour des décisions éclairées en matière de gestion des pêches et de conservation ; toutefois, bien que les approches génomiques aient considérablement amélioré notre capacité à délimiter les populations biologiques, elles n’offrent qu’une représentation partielle de la structure biologique, car les patrons de différenciation reflètent à la fois la divergence historique et les conditions écologiques contemporaines. Le microbiote associé à l’hôte peut influencer les processus écologiques à l’échelle des populations en apportant une variation fonctionnelle et potentiellement héréditaire qui façonne le phénotype et le fitness de l’hôte.Dans cette étude, nous avons combiné le génotypage par séquençage et le séquençage des amplicons du gène de l’ARNr 16S afin d’examiner comment la structure génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal et d’évaluer si la variation des communautés microbiennes fournit des informations complémentaires sur la structure des populations chez la merluche blanche (Urophycis tenuis) dans l’est du Canada. Les analyses génomiques ont permis d’identifier deux populations présentant un chevauchement spatial plus important que celui rapporté précédemment. La partition de la variation a révélé que la génétique de l’hôte expliquait une fraction négligeable de la variation du microbiote comparativement aux facteurs environnementaux et à la taille des poissons, ce qui suggère une influence des changements ontogénétiques dans l’utilisation de l’habitat et des ressources sur la composition du microbiote intestinal. Plusieurs taxons présentaient une abondance différentielle entre les catégories de taille des poissons, utilisées comme indicateur du régime alimentaire, notamment des taxons ayant un potentiel de dégradation de la chitine, tels que Photobacterium et Lachnospirales, lesquels étaient enrichis chez les individus de plus petite taille, connus pour consommer un régime dominé par les crustacés. Ensemble, ces résultats indiquent que la composition du microbiote intestinal chez la merluche blanche reflète principalement des processus écologiques et d’histoire de vie plutôt que la structure génétique des populations de l’hôte. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Des paramètres environnementaux ont également été collectés à la plupart des sites d'échantillonnage, y compris la profondeur, température de l'eau, le niveau d'oxygène et la salinité.DÉTAILS DE L'ÉCHANTILLON PHYSIQUE :Des échantillons de nageoires ont été collectés pour caractériser les génotypes des poissons. Des échantillons d'intestin (rectum) ont été collectés pour étudier le microbiome intestinal des poissons.MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :En 2022 et 2023, les merluches blanches ont été échantillonnées lors des relevés annuels écosystémiques au chalut de fond du ministère des Pêches et des Océans Canada (MPO).LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

Ce jeu de données documente les occurrences d'épifaune collectées de 2021 à 2024 lors de l'évaluation environnementale marine de la mer de Beaufort canadienne (CBS-MEA) menée par Pêches et Océans Canada (MPO). Le programme CBS-MEA se concentre sur l'intégration de l'océanographie, des liens dans le réseau alimentaire, des couplages physico-biologiques et des variabilités spatiales et interannuelles. Le programme vise également à élargir la couverture de référence de la diversité des espèces, des abondances et des associations avec les habitats dans des zones de la mer de Beaufort et de l'archipel canadien de l'Ouest précédemment non étudiées. L'étude a eu lieu principalement dans la mer de Beaufort et dans le golfe d'Amundsen. L'échantillonnage est effectué le long de transects à des stations fixes dans la zone d'étude. Les prises sont collectées avec un chalut à perche benthique de 3 m pendant 10 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 2 noeuds et avec un chalut à panneaux Atlantic Western IIA modifié pendant 20 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 2,9 noeuds. Un total de 32 stations ont été échantillonnées pour l'épifaune en 2021, 22 en 2022, 23 en 2023 et 22 en 2024, à des profondeurs entre 22 et 655 m. Les invertébrés épibenthiques sont identifiés au niveau taxonomique le plus bas possible et photographiés. Tous les spécimens inconnus sont congelés. En laboratoire, les identifications sont validées ou précisées avec les photos et les spécimens congelés.Les données sont présentées en format Darwin Core et sont séparées en deux fichiers : Le fichier "Activité_épifaune_CBSMEA_epifauna_event_fr" qui contient les informations des missions, des stations et des déploiements, qui sont présenté sous une structure d'activité hiérarchique.Le fichier "Occurrence_épifaune_CBSMEA_epifauna_fr" qui contient les occurrences taxonomiques.

Les zones d'importance écologique et biologique (ZIEB) sont des zones au sein des eaux océaniques canadiennesque des évaluations scientifiques officielles ont désignées comme ayant une importance écologique et biologique particulière par rapport à l'écosystème marin environnant.Le fait qu'une zone n'ait pas été désignée comme ayant une importance écologique et biologique ne signifie pas pour autant qu'elle n'a pas une importance écologique. Toutes les zones assument des fonctions écologiques dans une certaine mesure et exigent une gestion durable. Les zones désignées comme des ZIEB devraient plutôt être vues comme des zones extrêmement importantes, où les connaissances, les législateurs et les utilisateurs des ressources marines doivent exercer une grande prudence eu égard au risque, afin de veiller à ce que les écosystèmes restent sains et productifs.Pourquoi des ZIEB sont-elles désignées?Les renseignements relatifs à ces aires sont utilisés pour appuyer la planification marine, notamment l'évaluation environnementale et la mise en place d'activités marines:- En informant et guidant les industries et les législateurs pour une planification et une conduite d'activités optimale, par exemple: les zones d'importance écologique et biologique ont été prises en compte et mentionnées dans les évaluations portant sur le pétrole et le gaz.- Des renseignements ont été fournis aux promoteurs de projets de câbles sous-marins, afin de les aider à en déterminer les tracés.- En information et en guidant le processus de gestion intégrée des océans dans cinq zones étendues de gestion des océans et 12 biorégions marines.- En servant de fondement pour la détermination des zones d'intérêt et des zones de protection marines (de manière individuelle et dans le cadre de la planification des réseaux biorégionaux de zones de protection marines).Comment désigne-t-on les zones d'importance écologique et biologique?Le processus utilisé pour désigner les zones d'importance écologique et biologique comprend généralement deux étapes. La première étape consiste à recueillir des données scientifiques et des connaissances relatives aux écosystèmes d'une aire marine, notamment les espèces de poissons, de mammifères marins et d'oiseaux marins, la flore marine, la productivité marine, les conditions physiques et chimiques, et la géologie. Les « connaissances » comprennent les connaissances empiriques des utilisateurs de longue date de ces aires. Dans certains cas (p. ex. dans l'Arctique), d'importants efforts sont déployés pour réunir les connaissances traditionnelles sur les écosystèmes et les conditions environnementales des membres des communautés, des pêcheurs, des chasseurs et des personnes dont la connaissance de la zone étudiée complète l'information existante et permet souvent d'aider à combler les lacunes dans les données scientifiques.La deuxième étape consiste à évaluer l'information disponible relative à une aire marine (p. ex., une biorégion) en utilisant cinq critères scientifiques nationaux:- La spécificité: dans quelle mesure l'écosystème d'une aire est-il distinct des écosystèmes environnants?- La concentration: l'aire étudiée abrite-t-elle des espèces ou est-elle un lieu de regroupement d'espèces?- Les conséquences sur la valeur adaptative: dans quelle mesure l'aire est-elle vitale pour le cycle biologique des espèces qui l'utilisent (p. ex., est-ce une zone de frai ou d'alimentation?- Le caractère naturel: dans quelle mesure la zone étudiée est-elle demeurée intacte ou est-elle perturbée par les activités humaines?- La résilience: dans quelle mesure l'écosystème est-il capable de se rétablir s'il est perturbé?Progrès réalisés à ce jour et prochaines étapesDes zones d'importance écologique et biologique ont été désignées dans une grande partie des eaux océaniques de l'Atlantique et du Pacifique canadien, ainsi que dans la quasi-totalité de l'océan Arctique. À mesure que des ressources seront disponibles pour mener à bien le processus, des zones d'importance écologique et biologique continueront à être désignées dans les zones prioritaires. Les limites ou les emplacements des zones d'importance écologique et biologique existantes sont susceptibles d'être modifiés pour refléter les nouvelles connaissances et conditions environnementales.

Les précipitations accumulées représentent la hauteur totale de précipitations (solide ou liquide) qui a été enregistrée sur une durée donnée. Les produits sont générés pour les périodes suivantes : l’année agricole, la saison de croissance et la saison hivernale ainsi que les produits roulants pour les jours 7, 14, 30, 60, 90, 180, 270, 365, 730, 1095, 1460 et 1825.

Le Programme sur les données environnementales côtières de référence est une initiative pluriannuelle de Pêches et Océans Canada qui vise à recueillir des données sur le milieu côtier à une série d’emplacements d’un océan à l’autre au Canada en vue de développer une meilleure compréhension des conditions écologiques marines, et ce, en collaboration avec des communautés autochtones et locales ainsi que d’autres intervenants clés. Le programme a commencé la collecte de données en 2019 et, avec le début de la phase 2 en 2023, la zone d’étude de la région des Maritimes a été élargie et renommée « côtes nord-ouest de la baie de Fundy ». On a conçu un programme d’océanographie physique pour répondre aux intérêts océanographiques et aux besoins en matière de données des détenteurs d’intérêts locaux. À partir de 2023, les paramètres océanographiques, y compris la température, la salinité, la profondeur et la turbidité de l’eau, ont fait l’objet d’une surveillance dans une série d’emplacements de la baie Passamaquoddy, de la rivière Sainte-Croix et le long de la côte de la baie de Fundy, y compris la zone de protection marine (ZPM) de l’estuaire de la Musquash. Cet ensemble de données comprend les données saisonnières sur la CTP (conductivité, température et profondeur) et la turbidité à compter du printemps 2023. Les instruments font l’objet d’un entretien pendant les mois d’hiver dans un nombre limité d’emplacements. Les méthodes de collecte des données sont composées principalement d’instruments amarrés au fond à des profondeurs de 5 à 90 mètres, et de quelques flotteurs flottants en surface. Dans l’ensemble, cet ensemble de données permet de saisir la dynamique saisonnière des milieux marins littoraux dans la baie Passamaquoddy, la rivière Sainte-Croix, la baie de Fundy et la ZPM de la Musquash. Citer ces données comme suit : Programme de base pour l'environnement côtier (Région des Maritimes), données sur la conductivité, la température et la profondeur de la côte nord-ouest de Fundy. Publié en Mai 2025. Programme de base pour l'environnement côtier. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews, N.-B. 14-02-2025