OBJECTIF :Fournir des paramètres démographiques et des indices d'abondance relative pour le hareng de l'Atlantique dans la division 4T de l'OPANO.DESCRIPTION :Les relevés expérimentaux au filet maillant est menée en collaboration avec les pêcheurs de hareng de l'Atlantique et utilise des filets maillants standardisé composés de plusieurs panneaux aux maillages différents. Les filets sont posés sur les frayères au printemps et à l'automne. Les données (poissons et échantillons) sont recueillies afin de fournir: (1) des indices d'abondance relatifs par âge, (2) un estimer de la sélectivité des filets maillant de différentes tailles de maillage utiliser pour la pêche commerciale au fil du temps, et (3) des informations sur la composition démographique du hareng dans les frayères. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Échantillon : emplacement de l'échantillon ; poids de l'échantillon ; taille des mailles ; fréquence de longueurBiologique : longueur ; poids ; poids des gonades ; stade de maturité (biologique) ; sexe (biologique) ; nombre d'anneaux (biologique)LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

Données biologiques de base pour tous les poissons pris au cours de l’expédition de 2012 du BSMFP. Comprend l’identification, le poids, la longueur (totale, à la fourche et standard), le poids du foie, le poids des gonades, le sexe et le niveau de maturité.

Hareng atlantique. Aires de concentration, aires de reproduction et zones de rétention larvaire du Hareng de l'Atlantique dans l'estuaire du Saint-Laurent. Données extraites du Système d'information pour la gestion de l'habitat du poisson (SIGHAP).Aires de concentration, pouponnières et aires de reproduction du hareng de l'atlantique selon une revue de littérature de documents réalisés entre 1977 et 1998.

Données biologiques (poissons et échantillons) sur le hareng dans la base de données sur l’évaluation des stocks de hareng.

En 2019 et en 2020, on a estimé la fécondité du hareng (Clupea harengus) dans cinq zones de fraie (banc German, baie Scots, île Seal, côte sud de la Nouvelle-Écosse et côte est de la Nouvelle-Écosse) situées dans les divisions 4W et 4X de l’Organisation des pêches de l’Atlantique Nord-Ouest (OPANO). L’objectif de ce projet était de décrire les relations de fécondité selon la taille (poids, longueur et âge) dans les aires de fraie, de les comparer aux relations de fécondité selon la taille antérieures, et d’évaluer l’influence des changements liés au poids selon l’âge et à la fécondité au fil du temps sur le potentiel reproducteur d’une unité de biomasse du stock reproducteur.Citer ces données comme suit: Barrett T. Données de: Fécondité du hareng des divisions 4W et 4X: Date de publication: Septembre 2021. Division de l’écologie des population, Pêches et Océans Canada, St. Andrews (Nouveau-Brunswick). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/e39b1318-c9f7-4686-b5e5-7d838c8ac99a

Esturgeon noir. Sites d'importance: reproduction, alimentation et aires de concentration des juvéniles et des adultes. Données extraites du Système d'information pour la gestion de l'habitat du poisson (SIGHAP) selon une revue de littérature de documents réalisés entre 1978 et 2002.

Pêches et Océans Canada (MPO) réalise annuellement un relevé scientifique multidisciplinaire avec un chalut de fond dans l’estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent pendant l’été depuis 1984. Au fil des années, ce relevé a été effectué à bord de quatre navires: le NM Lady Hammond (1984-1990), le NGCC Alfred Needler (1990-2005), le NGCC Teleost (2004-2021) et le NGCC Cabot (2022-en cours). Il est important de noter que les objectifs, les méthodes employées et l'identification des espèces lors de ces relevés se sont améliorés au fil du temps en fonction des demandes et des mandats du MPO. Les données ne sont donc pas directement comparables entre ces relevés. Les spécificités des missions réalisées à bord du NGCC Alfred Needler sont décrites ci-dessous.Objectifs:1. Évaluer l'abondance et la condition des populations de poissons de fond et de la crevettenordique2. Évaluer les conditions environnementales3. Réaliser un inventaire de la biodiversité de la mégafaune benthique et démersale4. Monitorer l'écosystème pélagique5. Récolter des échantillons pour divers projets de rechercheDescription du relevéLe relevé couvre les divisions 4R, 4S, 3Pn et la partie septentrionale de la division 4T de l’Organisation des Pêches de l’Atlantique Nord-Ouest (OPANO). Ce relevé suit un plan d’échantillonnage aléatoire stratifié et l'engin de pêche utilisé sur le NGCC Alfred Needler est un chalut à crevette URI (81'/114'). La durée de chalutage pour un trait standard de pêche est de 25 minutes, calculée à partir du contact du chalut avec le fond. La vitesse de chalutage est fixée à 3 nœuds.DonnéesÀ chacun des traits de pêche, la capture est triée et pesée par taxon et les individus sont dénombrés et des données biologiques sont récoltées sur un sous-échantillon. Pour les poissons, les crabes et les encornets, la taille et le poids sont colligés par individu. De plus, pour certaines espèces, le sexe, la maturité des gonades et les poids de certains organes (estomac, foie, gonades) sont aussi évalués. Les rayons mous de la nageoire anale sont dénombrés pour les sébastes et des otolithes sont récoltés chez plusieurs espèces dont la plie grise, le flétan du Groenland, la morue et le flétan atlantique. Un échantillon d’environ 2 kg de crevettes est trié et pesé par espèce et par stade de maturité pour la crevette nordique. Les crevettes sont mesurées individuellement. Les autres invertébrés sont pesés et dénombrés par taxon (pas de mesure individuelle) et photographiés.Les données biologiques sont divisées en 5 fichiers : Un fichier « Métadonnées » contenant les informations des traits, un fichier « Captures » contenant les prises par trait pour les taxons de poisson, un fichier « Carbio » contenant les caractéristiques biologiques et morphométriques par individus, un fichier « Fréquences Longueur » pour les fréquences de longueur des poissons et un fichier « Crevettes » regroupant les informations relatives au captures de crevette. Il est important de noter qu'il s'agit des données brutes. Seuls les traits considéré réussis sont conservés. Dans chacun des traits toutes les espèces sont conservées sauf quelques exceptions. Veuillez contacter l'équipe de la gestion de données pour de plus amples informations (gddaiss-dmsaisb@dfo-mpo.gc.ca).

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a

Ce projet a été mené à bien par la Section des pélagiques de la Direction des sciences de Pêches et des Océans (MPO) de la région de Terre-Neuve-et-Labrador. Dans le cadre du Programme sur les données environnementales côtières de référence, un programme de recherche historique sur les filets maillants a été rétablit dans la baie Placentia. Quatre pêcheurs locaux ont établi des flottes de filets normalisés pour capturer le hareng pendant 6 semaines au printemps. Les données recueillies ont servi à mettre à jour une série chronologique et à fournir des conseils lors de l’évaluation des stocks de hareng en octobre 2022. Ce programme a été reconduit en 2022-2023. Les données recueillies dans le cadre de ce programme comprenaient les taux de capture du filet maillant, les prises accessoires, la température et les échantillons biologiques (hareng); à partir desquels des mesures biologiques telles que la longueur, le poids, le sexe, la maturité et l’âge ont été mesurées. Cet enregistrement contient des données sur les captures pour la période 2018-2021, ainsi que des données biologiques pour 2018.

La base de données sur les contaminants dans les poissons est une compilation de données sur les contaminants analysés à partir d’échantillons de tissus de poissons à l’Institut des eaux douces, de 1970 à 2005. Les données comprennent le numéro de laboratoire, la région, l’analyse, les organes, les espèces, le lac, la forme (poisson entier, vidé non étêté, vidé sans tête), le poids, la longueur et les concentrations de contaminants. Le mercure total était le contaminant prédominant mesuré, mais les données comprennent un certain nombre d’échantillons qui ont été analysés pour les pesticides et d’autres contaminants. Les résultats ont été exprimés en parties par million (ppm) ou en parties par milliard (ppb) selon le paramètre analysé. Les concentrations sont exprimées en fonction du poids humide.