Les modèles de répartition des espèces permettent de prédire et de déterminer les zones prioritaires pour améliorer la surveillance des cétacés dans les eaux de l’est du Canada au large de la Nouvelle-Écosse, de Terre Neuve et du Labrador. Cet ensemble de données correspond à l’information présentée par Gomez et al. (2020) et comprend les observations et les extrants des modèles de répartition pour dix espèces de cétacés avec suffisamment de renseignements (n > 450) et d’observations pour seulement six espèces supplémentaires. Pour plus d’information sur les observations, y compris celles qui ont été inclues dans chaque modèle de répartition, voir Gomez et al. (2020). La présente étude a utilisé une compilation de données de diverses sources sur les observations de cétacés effectuées à partir d’aéronefs et de navires entre 1975 et 2015 et assemblées par Gomez et al. (2017). Il convient de noter que les données sur les observations de bon nombre de ces sources ne sont pas pondérées en fonction de l’effort et que les tendances de répartition apparentes basées sur ces données d’observation fortuites semblent biaisées par le moment et l’endroit où ont été effectuées les activités de levés. Les conditions météorologiques défavorables et un effort visuel diminué en hiver, au printemps et à l’automne expliquent probablement le nombre moins élevé d’observation comparativement à l’été. L’ensemble de données n’inclut pas les données sur les animaux morts, les échouages, les empêtrements et les piégeages. Bien que certains des ensembles de données incluent des renseignements obtenus durant la période de chasse à la baleine (prises ou observations effectuées avant 1975), seules les observations de baleines nageant librement pendant la période postérieure à la chasse à la baleine (entre 1975 et 2015) ont été utilisées pour les analyses et les modélisations effectuées dans le cadre de la présente étude. Pour les contrôles de qualité, tous les renseignements provenant de l’extérieur de notre zone d’étude ont été supprimés et tous les renseignements redondants ont été retirés (espèces, jour, mois, latitude et longitude identiques). Les données utilisées ne reflètent pas les mises à jour ou corrections apportées aux bases de données depuis la compilation des données en 2016. Il n’est pas possible de télécharger les observations ici – veuillez communiquer avec la source originale des données indiquée ci-dessous pour obtenir les données brutes des observations. La présente étude constitue une importante initiative dans l’Est du Canada et vise à mettre en lumière les zones clés pour la surveillance de cétacés dans les eaux au large de la Nouvelle Écosse, de Terre-Neuve et du Labrador. Les habitats que l’on considère de grande qualité sont les secteurs où les efforts de surveillance des cétacés peuvent être priorisés et dont les résultats peuvent aider à diriger les activités de relevés dans le futur. Les extrants de ces modèles utilisaient des observations de cétacés sur plusieurs décennies ainsi que des prédicteurs environnementaux dynamiques basés sur des moyennes saisonnières sur plusieurs années. Cinq variables environnementales prédictives ont été choisies comme indicateurs de disponibilité des proies pour le modèle de répartition de l’espèce : la profondeur de l’océan, l’indice topographique du bassin versant, la température à la surface de la mer, les secteurs où persiste une concentration élevée de chlorophylle a et le taux régional de chlorophylle a. Voir Gomez et al. (2020) pour de plus amples détails sur les méthodes de modélisation. On s’attend à ce que ces modèles relèvent des tendances persistantes au fil du temps (entre 1975 et 2015). De plus, les résultats des modèles de répartition présentés ici ne sont pas comme des cartes de densité des espèces; ils sont plutôt le portrait de l’habitat propice prédit en fonction de caractéristiques environnementales et d’observations qui ne sont pas tirées de relevés basés sur l’effort. Par conséquent, l’utilisation de ces modèles dans les processus de planification spatiale marine doit être combinée à des approches complémentaires comme la validation acoustique et visuelle des résultats des modèles de répartition ainsi qu’à des efforts de surveillance et de modélisation supplémentaires. Veuillez consulter Gomez et al. (2020) pour des exemples de façons optimales d’utiliser ces données de sortie. Les efforts futurs seront axés sur l’utilisation de données plus récentes et sur l’amélioration de ces modèles afin de faciliter l’inclusion des cétacés dans les processus de planification spatiale marine qui sont présentement en cours. Sources des données:Pêches et Océans Canada, la région des Maritimes et Région de Terre-Neuve-et-Labrador (Base de données des observations de baleines, Division des sciences de l’écosystème et de la mer, Dartmouth, NS ; http://www.inter.dfo-mpo.gc.ca/Maritimes/SABS/popec/sara/Database, MacDonald et. al. 2017)Système d’information biogéographique des océans (OBIS; http://www.iobis.org/) North Atlantic Right Whale Consortium (NARWC; http://www.narwc.org/) Laboratoire Whitehead à l'Université Dalhousie (http://whitelab.biology.dal.ca/)Environnement et Changement climatique Canada, (Service canadien de la faune), Programme des Oiseaux de mer de l'Est du Canada (Gjerdrum et al. 2012). Références:Gomez, C., Konrad, C.M., Vanderlaan, A., Moors-Murphy, H.B., Marotte, E., Lawson, J.,Kouwenberg, A-L., Fuentes-Yaco, C., Buren, A. 2020. Identifying priority areas toenhance monitoring of cetaceans in the Northwest Atlantic Ocean. Can. Tech. Rep.Fish. Aquat. Sci. 3370: vi + 103 p. http://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/Library/40869155.pdfGomez C, Lawson J, Kouwenberg A, Moors-Murphy H, Buren A, Fuentes-Yaco C, Marotte E, Wiersma YF, Wimmer T. 2017. Predicted distribution of whales at risk: identifying priority areas to enhance cetacean monitoring in the Northwest Atlantic Ocean. Endangered Species Research 32:437-458 https://www.int-res.com/abstracts/esr/v32/p437-458/Gjerdrum, C., D.A. Fifield, and S.I. Wilhelm. 2012. Eastern Canada Seabirds at Sea (ECSAS) standardized protocol for pelagic seabird surveys from moving and stationary platforms. 31 Canadian Wildlife Service Technical Report Series No. 515. Atlantic Region. vi + 37 p. MacDonald, D., Emery, P., Themelis, D., Smedbol, R.K., Harris, L.E., and McCurdy, Q. 2017. Marine mammal and pelagic animal sightings (Whalesightings) database: a user’s guide. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3244: v + 44 p.

Cette couche de données présente en détail les zones importantes (ZI) pour les principales espèces de cétacés dans l’écorégion du détroit de Georgia (DG). Ces données ont été cartographiées afin d’éclairer la sélection des zones marines d’importance écologique et biologique (ZIEB). Les experts ont indiqué que ces zones sont pertinentes en raison de leur classement élevé par rapport à l’un ou plusieurs des trois critères suivants : unicité, concentration et conséquences sur la valeur adaptative. La répartition des ZI au sein des écorégions est utilisée pour la désignation des ZIEB.La Loi sur les océans du Canada offre un cadre législatif pour la gestion des océans canadiens selon une approche complète des écosystèmes, en particulier dans les zones considérées comme importantes sur le plan écologique ou biologique. Pêches et Océans Canada (MPO) a élaboré des directives pour la désignation des zones d'importance écologique et biologique (ZIEB). Les critères servant à définir ces zones comprennent l'unicité, la concentration, les conséquences sur le succès reproducteur, la résilience et le caractère naturel. Le présent processus de consultation scientifique expose les propositions de zones d'importance écologique et biologique (ZIEB) dans les eaux marines dans la région canadienne du Pacifique, en particulier dans le détroit de Georgia, le long de la côte ouest de l'île de Vancouver (écorégion du plateau sud), et dans la zone de gestion intégrée de la côte nord du Pacifique (ZGICNP) (écorégion du plateau nord).La première évaluation des ZI dans la ZGICNP s’est déroulée de septembre 2004 à mars 2005. Cathryn Clarke a coordonné la collecte des données spatiales. D’autres travaux ont été réalisés sur la côte ouest de l’île de Vancouver (COIV) et dans le détroit de Georgia (DG) en 2009 et il se peut qu’on ait eu recours à des conseillers scientifiques, des étendues temporelles, des données et des méthodes d’évaluation différents. Dans certains cas, l’évaluation des ZI sur la COIV et dans le DG permet de réviser les données recueillies au sujet de la ZGICNP; elle doit alors être traitée comme une activité distincte.D’autres ensembles de données de cette série présentent en détail les ZI pour les oiseaux, les coraux et les éponges, les poissons, les caractéristiques géographiques, les invertébrés et les autres vertébrés.Bien que la collecte de données soit considérée comme terminée, l’émergence de nouvelles données importantes peut justifier une révision des ZI au cas par cas.

Cette couche de données présente en détail les zones importantes (ZI) pour les principales espèces de cétacés dans l’écorégion de la côte ouest de l’île de Vancouver (COIV). Ces données ont été cartographiées afin d’éclairer la sélection des zones marines d’importance écologique et biologique (ZIEB). Les experts ont indiqué que ces zones sont pertinentes en raison de leur classement élevé par rapport à l’un ou plusieurs des trois critères suivants : unicité, concentration et conséquences sur la valeur adaptative. La répartition des ZI au sein des écorégions est utilisée pour la désignation des ZIEB.La Loi sur les océans du Canada offre un cadre législatif pour la gestion des océans canadiens selon une approche complète des écosystèmes, en particulier dans les zones considérées comme importantes sur le plan écologique ou biologique. Pêches et Océans Canada (MPO) a élaboré des directives pour la désignation des zones d'importance écologique et biologique (ZIEB). Les critères servant à définir ces zones comprennent l'unicité, la concentration, les conséquences sur le succès reproducteur, la résilience et le caractère naturel. Le présent processus de consultation scientifique expose les propositions de zones d'importance écologique et biologique (ZIEB) dans les eaux marines dans la région canadienne du Pacifique, en particulier dans le détroit de Georgia, le long de la côte ouest de l'île de Vancouver (écorégion du plateau sud), et dans la zone de gestion intégrée de la côte nord du Pacifique (ZGICNP) (écorégion du plateau nord).La première évaluation des ZI dans la ZGICNP s’est déroulée de septembre 2004 à mars 2005. Cathryn Clarke a coordonné la collecte des données spatiales. D’autres travaux ont été réalisés sur la côte ouest de l’île de Vancouver (COIV) et dans le détroit de Georgia (DG) en 2009 et il se peut qu’on ait eu recours à des conseillers scientifiques, des étendues temporelles, des données et des méthodes d’évaluation différents. Dans certains cas, l’évaluation des ZI sur la COIV et dans le DG permet de réviser les données recueillies au sujet de la ZGICNP; elle doit alors être traitée comme une activité distincte.D’autres ensembles de données de cette série présentent en détail les ZI pour les oiseaux, les coraux et les éponges, les poissons, les caractéristiques géographiques, les invertébrés et les autres vertébrés.Bien que la collecte de données soit considérée comme terminée, l’émergence de nouvelles données importantes peut justifier une révision des ZI au cas par cas.

Cette couche de données présente en détail les zones importantes (ZI) pour les principales espèces de cétacés dans la zone de gestion intégrée de la côte nord du Pacifique (ZGICNP). Ces données ont été cartographiées afin d’éclairer la sélection des zones marines d’importance écologique et biologique (ZIEB). Les experts ont indiqué que ces zones sont pertinentes en raison de leur classement élevé par rapport à l’un ou plusieurs des trois critères suivants : unicité, concentration et conséquences sur la valeur adaptative. La répartition des ZI au sein des écorégions est utilisée pour la désignation des ZIEB.La Loi sur les océans du Canada offre un cadre législatif pour la gestion des océans canadiens selon une approche complète des écosystèmes, en particulier dans les zones considérées comme importantes sur le plan écologique ou biologique. Pêches et Océans Canada (MPO) a élaboré des directives pour la désignation des zones d'importance écologique et biologique (ZIEB). Les critères servant à définir ces zones comprennent l'unicité, la concentration, les conséquences sur le succès reproducteur, la résilience et le caractère naturel. Le présent processus de consultation scientifique expose les propositions de zones d'importance écologique et biologique (ZIEB) dans les eaux marines dans la région canadienne du Pacifique, en particulier dans le détroit de Georgia, le long de la côte ouest de l'île de Vancouver (écorégion du plateau sud), et dans la zone de gestion intégrée de la côte nord du Pacifique (ZGICNP) (écorégion du plateau nord).La première évaluation des ZI dans la ZGICNP s’est déroulée de septembre 2004 à mars 2005. Cathryn Clarke a coordonné la collecte des données spatiales. D’autres travaux ont été réalisés sur la côte ouest de l’île de Vancouver (COIV) et dans le détroit de Georgia (DG) en 2009 et il se peut qu’on ait eu recours à des conseillers scientifiques, des étendues temporelles, des données et des méthodes d’évaluation différents. Dans certains cas, l’évaluation des ZI sur la COIV et dans le DG permet de réviser les données recueillies au sujet de la ZGICNP; elle doit alors être traitée comme une activité distincte.D’autres ensembles de données de cette série présentent en détail les ZI pour les oiseaux, les coraux et les éponges, les poissons, les caractéristiques géographiques, les invertébrés et les autres vertébrés.Bien que la collecte de données soit considérée comme terminée, l’émergence de nouvelles données importantes peut justifier une révision des ZI au cas par cas.

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L'ensemble de données de la Fish and Wildlife Enforcement Unit comprend les polygones représentant les unités chargées de l'application de la loi sur la pêche et la faune de l'Alberta. Les services de sécurité publique et d'urgence de l'Alberta, du gouvernement de l'Alberta, gèrent les services d'application de la loi sur la pêche et la faune afin de fournir au public et à d'autres ministères des informations concernant l'emplacement des unités de contrôle de la pêche et de la faune dans la province.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**

Données modélisées montrant la distribution probable des baleines grises. Le CRIMS est un ancien ensemble de données sur les ressources côtières de la Colombie-Britannique qui a été acquis de manière systématique et synoptique à partir de 1979 et qui a été mis à jour par intermittence au fil des ans. L'information sur les ressources a été collectée dans neuf zones d'étude par le biais d'un comité provincial des normes d'information sur les ressources évalué par des pairs, composé d'agents des pêches du MPO, des Premières nations et d'autres experts en la matière. Il n'est actuellement pas prévu de mettre à jour ces anciennes données.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b