Ce jeu de données bathymétriques des cinq plans d’eau intérieurs des Îles de la Madeleine a été produit par la Direction régionale des sciences (DRS) de la région du Québec de Pêches et Océans Canada (MPO) dans le cadre des travaux de caractérisation du refuge marin des lagunes des Îles‑de‑la‑Madeleine. Les données proviennent de plusieurs sources, incluant un relevé LiDAR bathymétrique, de la bathymétrie dérivée d’images satellitaires (SDB), des relevés acoustiques et des échantillonnages ponctuels de profondeur réalisés dans les plans d’eau intérieurs.Le produit final est un raster de résolution 5 m projeté en NAD83 / MTM zone 4. Les profondeurs sont exprimées en mètres et réduites au zéro des cartes (ZC). Ce jeu de données constitue un produit scientifique dérivé, généré par des traitements, interpolations et intégrations réalisés par une équipe de la DRS, et ne représente pas un produit hydrographique du Service hydrographique du Canada (SHC). Les données peuvent contenir des incertitudes, des artefacts d’acquisition ou de traitement, et ne répondent pas aux normes hydrographiques de l’Organisation Hydrographique Internationale (OHI).Ce jeu de données est fourni exclusivement à des fins d’information, d’analyse, de gestion et de recherche scientifique. Il ne doit en aucun cas être utilisé pour la navigation, pour la prise de décision opérationnelle en mer, ou pour toute activité où la sécurité des personnes ou des biens pourrait dépendre de l’exactitude des profondeurs.La MPO et le SHC déclinent toute responsabilité quant à l’usage, l’interprétation ou les décisions prises sur la base de ce produit.Pour plus d’information sur la méthodologie et un aperçu des données, consulter Grégoire et al. (2026).

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b

Pêches et Océans Canada a initié, en 2018, le Programme multidisciplinaire arctique (PMA) – Glace séculaire, la première étude écosystémique de la région peu étudiée de la mer de Lincoln au sein de la Zone de protection marine de Tuvaijuittuq, où la glace pluriannuelle persiste dans l’océan arctique. Le Programme PMA-Glace séculaire utilise une approche concertée pour intégrer les composantes physique, biochimique et écologique de l’écosystème connecté glace de mer-océan, et sa réponse aux forçages climatiques et océaniques. Ce programme établit une base de référence de connaissances écologiques pour Tuvaijuittuq et, en particulier, pour son écosystème unique de glace pluriannuelle. La base de données procure des données de référence sur l’abondance des bactéries et virus dans la glace pluriannuelle et annuelle, ainsi que les eaux de surface de la mer de Lincoln, au sein de Tuvaijuittuq. Les données ont été récoltées au cours de la campagne du printemps 2018 du programme PMA-Glace séculaire, au large de la Station des Forces Canadiennes (SFC) Alert.

Cet ensemble de données contient les données présentées dans l’article « Spatiotemporal variation of ringed seal blubber cortisol levels in the Canadian Arctic » de Wesley R. Ogloff, Randi A. Anderson, David J. Yurkowski, Cassandra D. Debets, W. Gary Anderson, Steven H. Ferguson, paru dans le Journal of Mammalogy en 2022; gyac047, https://doi.org/10.1093/jmammal/gyac047Veuillez citer ces données comme suit :Wesley R. Ogloff, Randi A. Anderson, David J. Yurkowski, Cassandra D. Debets, W. Gary Anderson, Steven H. Ferguson, 2022. Variation spatiotemporelle de la concentration en cortisol dans le lard de phoques annelés récoltés dans l’Arctique canadien. Division de la recherche aquatique dans l’Arctique, Pêches et Océans Canada, Winnipeg (Manitoba).https://open.canada.ca/data/en/dataset/e1c6b350-0159-11ed-8212-1860247f53e3

Les MetNotes sont des polygones de format libre, géo- et temporellement référencés, émis par le SMC, qui sont complémentaires aux systèmes de diffusion actuels basés sur la localisation. Le texte concis d'une MetNote (semblable à un Tweet) est conforme à la communication d'aujourd'hui où les gens recherchent des informations en un coup d'œil. Les météorologues émettront une MetNote pour ajouter des renseignements contextuels et/ou d'impact afin de compléter les prévisions publiques valables pour une zone spécifique et un intervalle de temps spécifique.

Un relevé de recherche sur les pétoncles (principalement le pétoncle géant Placopecten magellanicus, mais aussi le pétoncle d’Islande Chlamys islandica) effectué à l'aide d'une drague a été réalisé par le MPO (Pêches et Océans Canada) tous les 1 ou 2 ans depuis 1992 aux Îles-de-la-Madeleine (zone de pêche 20). L'objectif principal de ce relevé de recherche était d'évaluer les stocks de pétoncle géant. Un autre objectif était de documenter les taxons dans la capture associée à l'habitat de pétoncle selon un plan d'échantillonnage aléatoire fixe. Les occurrences de 2021 et 2022 sont présentées ici par espèce (ou taxon) par station. À partir de 2021, les captures étaient pesées et des spécimens photographiés, avec l’information disponible sur demande. La validité taxonomique et géographique des données a été vérifiée et le registre mondial des espèces marines a servi d'autorité taxonomique pour nommer tous les taxons enregistrés lors du relevé. Les invertébrés épibenthiques (principalement des mollusques, échinodermes et crustacés) ainsi que des poissons démersaux ont été identifiés à partir des captures de la drague. Le jeu de données historiques (1992-2019) est diponible à partir du lien suivant : https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/71732ad5-5c70-4dbf-916d-a94e1380c53bL'aire d'étude est située au sud des Îles-de-la-Madeleine et l'échantillonnage des gisements de pétoncles est effectué à des profondeurs autour de 25 à 35 m. Un tir aléatoire des stations d’échantillonnage est réalisé à partir d’une grille de station fixe. L'échantillonnage est fait le long de transects à ces stations tirées aléatoirement dans la zone d'étude. L'échantillonnage se fait avec une drague à pétoncle Digby doublée (maille de 20 mm) sur approximativement 500 m le long du fond marin. Les quatre paniers de la drague sont examinés pour tous les pétoncles et aussi, débutant en 2022, pour les poissons. Un panier (le premier du côté tribord) est trié et examiné pour les espèces associées. La plupart des spécimens sont comptés par taxon. La présence ou l’abondance relative des organismes trop petits et nombreux, ou coloniaux, est notée. Des cas particuliers sont parfois conservés pour l'analyse taxonomique, par exemple, les ascidies (pour surveiller les espèces envahissantes) et les éponges (pour documenter de nouvelles espèces). La disponibilité de photos et de certains spécimens conservés permet un examen futur. Des changements sont anticipés dans les identifications, notamment pour les Bryozoaires, les Hydrozoaires et les Porifères, qui font actuellement l'objet d'efforts de recherche.

Ce jeu de données cartographique représente une mise à jour géomorphologique de l’emprise des cinq plans d'eau intérieurs qui forment le refuge marin des lagunes des Îles de la Madeleine. Il a été produit par Pêches et Océans Canada (MPO) dans le cadre des travaux de caractérisation du refuge marin.Les données utilisées proviennent de la version du 15 août 2022 de la base de données géospatiales des écosystèmes côtiers (BDG) du Québec maritime, élaborée à partir de plusieurs sources dont des images satellitaires et aéroportées de 2019 (Jobin et al. 2021; Provencher-Nolet et al. 2024). Les limites des plans d’eau ont été définies selon la pleine mer supérieure de grande marée, ce qui représente l’extension maximale de l’eau lors des marées les plus hautes.Le produit final est un fichier shapefile polygonal représentant les cinq plans d'eau intérieurs du refuge marin ainsi que les zones terrestres de l’archipel. Les données sont projetées en NAD83 / MTM zone 4.Pour plus d’information sur la méthode utilisée pour générer cette couche à partir des données de la BDG, consulter Grégoire et al. (2026). La méthode employée pour la création des données géospatiales sources est décrite dans Jobin et al. (2021) et Provencher-Nolet et al. (2024).

Découvertes historiques de Coleophora laricella

Ce fichier contient une représentation généralisée des bassins hydrographiques développée à partir de l'Atlas des bassins versants de la Colombie-Britannique au 1/50 000, chaque région étant codée en fonction de la présence d'espèces de poissons d'eau douce (y compris le saumon anadrome au stade d'eau douce). Les codes initiaux des espèces de poissons pour la présence/l'absence dans chaque bassin hydrographique ont été dérivés d'une superposition SIG des occurrences d'espèces de poissons dans des régions poissonneuses largement définies en Colombie-Britannique. Cette superposition d'aires de répartition des poissons décrit les occurrences d'espèces de poissons dans 30 régions de la province. Ces vastes gammes d'espèces ont été dérivées du livre « Key to Freshwater Fish of BC » de McPhail et Carveth et ont été affinées en fonction de l'opinion d'experts la plus récente. Le codage des polygones des bassins hydrographiques basé sur cet avis d'expert était initialement le suivant : 0 = hors de l'aire de répartition de l'espèce ; 4 = aire de répartition principale ; 5 = aire de répartition introduite ; 6 = aire de répartition périphérique ; 9 = polygones estuariens uniquement. Le codage des espèces de poissons des bassins versants a été affiné à partir d'observations réelles d'espèces de poissons dans les lacs et les rivières de la Colombie-Britannique. Ces données proviennent de plusieurs sources d'inventaire des poissons. Les bassins versants pour lesquels la présence de chaque espèce de poisson a été enregistrée ont donc été recodés comme tels : 4, 5, 6, 9 sont désormais égaux à « 1 » s'il s'agit d'un enregistrement de musée, et 4, 5, 6, 9 sont désormais égaux à « 2 » pour un enregistrement moins fiable, et 0 est désormais égal à « 8 » pour un enregistrement hors des limites** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

Un projet exploratoire sur la diversité taxonomique et génétique de décapodes échantillonnés en 2022 dans trois sous-régions océaniques (Pacifique Nord-Est, Arctique canadien et Atlantique Nord-Ouest) a été réalisé par le groupe de travail sur l'Arctique au sein de la collaboration canado-américaine sur les pêches et le climat entre Pêches et Océans Canada (MPO) et le National Marine Fisheries Service (NMFS) de la National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA). Ce cadre de collaboration vise à mettre en commun les données canadiennes et américaines afin d'étudier les effets du changement climatique à grande échelle sur la biodiversité marine. Au début de l'été 2022, un protocole d'échantillonnage illustrant une sélection des décapodes ciblés a été fourni aux collaborateurs du MPO et de la NOAA. Les genres ciblés ont été collectés dans le cadre de 10 programmes de recherche au total, dans trois sous-régions océaniques et quatre régions marines. Les échantillons du Pacifique Nord-Est ont été collectés dans la mer de Béring au cours de l'étude de l'écosystème de la mer de Béring septentrionale et du chalutage de surface, et de l'étude du chalutage de fond du plateau continental de la mer de Béring orientale et septentrionale sur les poissons de fond et la faune invertébrée, à bord du F/V Northwest Explorer, du F/V Alaska Knight et du F/V Vesteraalen. Dans l'ouest de l'Arctique canadien (principalement dans la mer de Beaufort et le golfe d'Amundsen), les spécimens ont été collectés au cours de l'étude du MPO sur l'évaluation de l'écosystème marin de la mer de Beaufort (CBS-MEA) à bord du F/V Frosti. Dans l'est de l'Arctique canadien (principalement dans la baie de Baffin et le détroit de Davis), les spécimens ont été recueillis lors du relevé de l'approche fondée sur les connaissances et les écosystèmes dans la baie de Baffin (KEBABB) du MPO à bord du NGCC Amundsen et du relevé de la sous-zone 0B de l'Organisation des pêches de l'Atlantique Nord (OPANO) à bord du R/V Tarajoq. Dans l'estuaire et le golfe du Saint-Laurent (EGSL), des spécimens ont été recueillis lors de relevés côtiers (relevés sur le buccin, le concombre de mer, le crabe des neiges et les pétoncles) à bord du NGCC Leim et au large lors du relevé écosystémique à bord du NGCC Teleost. Les décapodes ont été collectés à partir de divers engins d'échantillonnage (chalut à perche benthique, chalut à panneaux modifié Atlantic Western IIA, chalut Bacalao, chalut à crevettes, drague à pétoncles de type Digby ou drague à concombres de mer modifiée) et identifiés au niveau taxonomique le plus bas possible et photographiés, dans la mesure du possible. Tous les spécimens ont été congelés en mer (n = 995). Au laboratoire, les identifications ont été validées ou affinées à l'aide des photos et des spécimens congelés. L'ADN de 87 spécimens a été extrait et une section du gène COI a été amplifiée afin d'être séquencée à l'aide de la méthode Sanger. Les séquences ont été comparées aux données existantes à l'aide de l'outil BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) dans la base de données des nucléotides du National Center for Bio-technology Information (NCBI-nt, y compris la base de données GenBank) afin de comparer les noms scientifiques, le cas échéant.L'ensemble de données actuel comprend 391 occurrences d'espèces de décapodes. L'ADN a été extrait d'un sous-groupe de 87 spécimens (gène COI). Les séquences sont accessibles publiquement sur la plateforme BOLD sous le code de projet DDAO (voir le document de soutien « citations_references.csv » pour plus d'informations).Les données sont présentées en format Darwin Core et sont séparées en trois fichiers :Le fichier " Activité_décapodes_DDAO_decapods_event_fr" contient les informations des missions, des stations et des déploiements, qui sont présenté sous une structure d'activité hiérarchique.Le fichier " Occurrence_décapodes_DDAO_decapods_fr" contient les occurrences taxonomiques.Le fichier "ADN_décapodes_DDAO_decapods_DNA_fr" contient les données ADN associées.Pour de plus amples détails, veuillez vous référer au rapport technique disponible dans le document de soutien intitulé « citations_references.csv ». LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.