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Effets de l’acidification des zones côtières et des agents de stress liés au climat sur le pétoncle géant : production larvaire, recrutement et capacité d’adaptation aux nombreux facteurs de changements planétaires
Cet ensemble de données a été recueilli à l’appui d’un projet du Fonds de recherche scientifique compétitif (21-CC-05-06 Effets de l’acidification des zones côtières et des agents de stress liés au climat sur le pétoncle géant : production larvaire, recrutement et capacité d’adaptation aux nombreux facteurs de changements planétaires) dirigé par Pêches et Océans Canada (MPO). L’objectif de cette recherche est de caractériser les conditions environnementales côtières associées à la ponte des pétoncles et à la dérive larvaire dans la baie Passamaquoddy, au Nouveau-Brunswick. Cet ensemble de données comprend des informations sur la température, la conductivité, la salinité, les paramètres sigma-thêta, la pression marine et la profondeur qui sont prises toutes les semaines aux stations d’échantillonnage. Il contient un total de 62 profils de CTP recueillis dans trois stations d’échantillonnage pendant 22 jours, de juin à octobre 2022. Des stations d’échantillonnage ont été choisies pour comparer les signaux de recrutement du pétoncle provenant de la baie Chamcook, un site désaffecté d’élevage du pétoncle à Big Bay (MS-1077), et au milieu de la baie Passamaquoddy. Les données ont été traitées conformément aux lignes directrices du fabricant des instruments et aux procédures d’assurance et de contrôle de la qualité de la Section des données sur les océans et services de l’information du MPO.Citer ces données comme: Miller, E., Quinn, B., Azetsu-Scott, K., Childs, D., Gabriel, C-E., Newhook, M. 2025. Effets de l’acidification des zones côtières et des agents de stress liés au climat sur le pétoncle géant. Publié en Octobre 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews, (N-B).
Marais maritimes de la zone côtière du Québec maritime
Ce jeu de données a été conçu pour le Centre national des urgences environnementales (CNUE) d'Environnement et Changement Climatique Canada (ECCC) pour la préparation et l'intervention en cas de déversement d'hydrocarbures. Les polygones de cette couche proviennent de la geodatabase Cartographie des écosystèmes côtiers de l’estuaire et du golfe du Saint-Laurent, créée par l'Université du Québec à Rimouski (UQAR) et par le Ministère Pêches et Océans (MPO). La couche représente les zones semi-végétalisées (25-75%) et végétalisées (75-100%) dont la végétation de marais est dominante. La région d’étude comprend l’ensemble des littoraux estuariens et maritimes du Québec, à l’exception de certains secteurs dont la majeure partie de la Basse-Côte-Nord et de l’Île d’Anticosti, à l’exception des villages de Kegaska, la Romaine, Chevery, Blanc-Sablon et Port-Menier. Certaines îles au large des côtes de l’estuaire et du golfe font parties de la région couverte, telles que l’Île d’Orléans, l’Isle-aux-Coudres, l’Île Verte et l’Île Bonaventure.La Cartographie des écosystèmes côtiers de l’estuaire et du golfe du Saint-Laurent a été réalisée conjointement par le Laboratoire de dynamique et de gestion intégrée des zones côtières (LDGIZC) de l’Université du Québec à Rimouski dans le cadre du Projet Résilience côtière (https://ldgizc.uqar.ca/Web/projets/projet-resilience-cotiere) financée par le MELCC; et par l’équipe de Pêches et Océans Canada, dans le cadre de son volet Planification pour une Intervention Maritime Intégrée (PIMI) du Plan de Protection des Océans (PPO) ayant pour objectif la mise à jour du Régime de préparation et d’intervention en cas de déversement d’hydrocarbures en milieu marin du Canada. La géodatabase mère de la Cartographie des écosystèmes côtiers est hébergée et diffusée par l'UQAR sur leur plateforme cartographique SIGEC-Web: https://ldgizc.uqar.ca/Web/sigecwebLa caractérisation des marais a été majoritairement réalisée à partir de la photo-interprétation de photos aériennes RVBI prises par le MPO (2015-2020) et de photos obliques héliportées prises par l'UQAR en 2017. Le présent jeu de données inclut aussi en partie les informations de stations de validation visitées par l'UQAR (2018-2020) utilisées pour valider et préciser la photo-interprétation.
Programme sur les données environnementales côtières de référence (région des Maritimes) - données sur la conductivité, la température et la profondeur des côtes nord-ouest de la baie de Fundy
Le Programme sur les données environnementales côtières de référence est une initiative pluriannuelle de Pêches et Océans Canada qui vise à recueillir des données sur le milieu côtier à une série d’emplacements d’un océan à l’autre au Canada en vue de développer une meilleure compréhension des conditions écologiques marines, et ce, en collaboration avec des communautés autochtones et locales ainsi que d’autres intervenants clés. Le programme a commencé la collecte de données en 2019 et, avec le début de la phase 2 en 2023, la zone d’étude de la région des Maritimes a été élargie et renommée « côtes nord-ouest de la baie de Fundy ». On a conçu un programme d’océanographie physique pour répondre aux intérêts océanographiques et aux besoins en matière de données des détenteurs d’intérêts locaux. À partir de 2023, les paramètres océanographiques, y compris la température, la salinité, la profondeur et la turbidité de l’eau, ont fait l’objet d’une surveillance dans une série d’emplacements de la baie Passamaquoddy, de la rivière Sainte-Croix et le long de la côte de la baie de Fundy, y compris la zone de protection marine (ZPM) de l’estuaire de la Musquash. Cet ensemble de données comprend les données saisonnières sur la CTP (conductivité, température et profondeur) et la turbidité à compter du printemps 2023. Les instruments font l’objet d’un entretien pendant les mois d’hiver dans un nombre limité d’emplacements. Les méthodes de collecte des données sont composées principalement d’instruments amarrés au fond à des profondeurs de 5 à 90 mètres, et de quelques flotteurs flottants en surface. Dans l’ensemble, cet ensemble de données permet de saisir la dynamique saisonnière des milieux marins littoraux dans la baie Passamaquoddy, la rivière Sainte-Croix, la baie de Fundy et la ZPM de la Musquash. Citer ces données comme suit : Programme de base pour l'environnement côtier (Région des Maritimes), données sur la conductivité, la température et la profondeur de la côte nord-ouest de Fundy. Publié en Mai 2025. Programme de base pour l'environnement côtier. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews, N.-B. 14-02-2025
Alcids - Système de gestion de l'information sur les ressources côtières (CRIMS)
Répartition de l'habitat des alcides sur la côte de la Colombie-Britannique, indiquant l'abondance relative (AR) par saison et l'importance relative globale (IR). L'IR est basé sur la région du projet et non sur la province dans son ensemble. Le CRIMS est un ancien ensemble de données sur les ressources côtières de la Colombie-Britannique qui a été acquis de manière systématique et synoptique à partir de 1979 et qui a été mis à jour par intermittence au fil des ans. L'information sur les ressources a été collectée dans neuf zones d'étude par le biais d'un comité provincial des normes d'information sur les ressources évalué par des pairs, composé d'agents des pêches du MPO, des Premières nations et d'autres experts en la matière. Il n'est actuellement pas prévu de mettre à jour ces anciennes données.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Inventaire Des Ressources Côtières Axé Sur Les Collectivités
Points, polylignes et polygones où des espèces et des caractéristiques ont été trouvées, récoltées ou détaillées.Inventaire des ressources côtières axé sur les collectivités (IRCC) — Pêches et Océans Canada, en collaboration avec plusieurs organismes fédéraux et provinciaux, a créé, mis en œuvre et géré un programme visant à établir un inventaire des ressources côtières fondé sur les connaissances traditionnelles des résidents locaux. Grâce à des partenariats avec les conseils de développement régional de la province de Terre-Neuve-et-Labrador et d’autres groupes communautaires, le projet a permis de constituer une base de données contenant l’équivalent de plusieurs décennies de connaissances du milieu. La valeur des renseignements recueillis provient d’entretiens individuels réalisés auprès de personnes qui possèdent une connaissance approfondie de la géographie et des ressources immédiates et qui ont vécu, travaillé et effectué des récoltes dans les régions au cours de leur vie. Ce projet s’est déroulé de 1996 à 2007.
Mélange des eaux côtières et effet sur le potentiel de productivité de l’écosystème côtier
L’objectif de ce projet était de localiser les zones de mélange en milieu côtier sur la rive nord de l’estuaire maritime, qui sont occasionnées par la friction des eaux sur le fond et mesurer les effets de ces zones de mélange sur la modification des masses d’eau et sur le potentiel de productivité des zones adjacentes en utilisant la biomasse et la structure de taille du phytoplancton comme indicateur de productivité. Des transects de température et salinité à l’aide de CTD et des prises d’échantillons d’eau ont été effectuées à l’aide d’une bouteille Niskin pour tenter de déceler la signature du mélange et pour déterminer si les sels nutritifs et/ou la productivité sont plus grands dans les zones adjacentes. L’échantillonnage a eu lieu en 3 sorties de 3 stations organisées en transect de 100 N m qui ont été faites en début de saison (30 juin), mi-saison (16 août) et fin de saison (9 octobre). Les transects étaient chacun composés de trois stations allant de 10 m de profondeur plus près de la côte, jusqu’à 50 ou 75 m, selon le transect, en s’éloignant de la côte. Des échantillons ont été récoltés pour analyse de sels nutritifs et de biomasse de phytoplancton (> 0.7 µm et > 5µm) à des profondeurs de 1, 10, 25 et 50 m. La transparence optique de l’eau a aussi été mesurée par disque de Secchi. Le premier fichier fourni « donnees_profils_data » est un récapitulatif des profils CTD de chaque station. Le deuxième fichier « donnees_discretes_discret_data » contient les résultats des analyses des échantillons d’eau récoltés grâce aux bouteilles. Le fichier « Identification_station_identification » décrit la répartition des consécutives au travers des différentes stations.Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.
Écosections marines - Système de gestion de l'information sur les ressources côtières (CRIMS)
Classification des écosections marines pour les zones côtières et extracôtières de la Colombie-Britannique. Les écosections marines sont les suivantes : le détroit de Johnstone ; le talus continental ; l'entrée Dixon ; le détroit d'Hécate ; le détroit de la Reine-Charlotte ; le détroit de Juan de Fuca ; les fjords de la côte nord ; le détroit de la Reine-Charlotte ; le détroit de Géorgie ; le Pacifique subarctique ; le Pacifique de transition ; et le plateau de l'île de Vancouver. La Classification écologique marine de la Colombie-Britannique (BCMEC) est une classification hiérarchique qui délimite les zones marines provinciales en écozones, écoprovinces, écorégions et écosections. La classification a été développée à partir des classifications écologiques marines fédérales et provinciales précédentes qui étaient basées sur des informations à l'échelle 1:2 000 000. Le BCMEC a été élaboré pour la planification marine et côtière, la gestion des ressources et une stratégie provinciale en matière d'aires marines protégées. Un nouveau niveau de classification plus restreint appelé ecounits développé en utilisant la profondeur, le courant, l'exposition, le relief souterrain et le substrat à l'échelle 1:250 000 a été créé pour vérifier les plus grandes écosections et délimiter leurs limites. Le CRIMS est un ancien ensemble de données sur les ressources côtières de la Colombie-Britannique qui a été acquis de manière systématique et synoptique à partir de 1979 et qui a été mis à jour par intermittence au fil des ans. L'information sur les ressources a été collectée dans neuf zones d'étude par le biais d'un comité provincial des normes d'information sur les ressources évalué par des pairs, composé d'agents des pêches du MPO, des Premières nations et d'autres experts en la matière. Il n'est actuellement pas prévu de mettre à jour ces anciennes données.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Études des côtes et des écosystèmes marins du Nord dans la mer de Beaufort canadienne—données sur la qualité de l'eau
Ce projet avait comme objectif de recueillir des données pour élaborer un modèle du réseau alimentaire des niveaux trophiques inférieurs de la zone littorale de la mer de Beaufort. L'échantillonnage a eu lieu de 2005 à 2008 à bord du NGCC Nahidik. Le caractère multidisciplinaire du programme Nahidik a permis de réaliser des mesures de biologie et d'écologie (production primaire, phytoplancton, zooplancton, benthos, poissons), d'océanographie chimique et physique, de contaminants, de géologie et d'hydroacoustique. Les données ont été recueillies en juillet et août de chaque année. Le programme Nahidik a fourni des données permettant de constituer une base de référence pour les études futures, ainsi qu'une source d'information pour l'évaluation environnementale.Ce registre contient des données sur la qualité de l'eau, notamment l'azote et le phosphore en suspension et totaux, le carbone dissous et en suspension, la chlorophylle a et le silicium en suspension.
Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur COI
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b
Programme sur les données environnementales côtières de référence
Le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada appuie la collecte de données écologiques sur l’état actuel des principaux écosystèmes côtiers du Canada. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base (physiques, chimiques et biologiques) qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins. À partir de cette page, vous trouverez des liens pour les données recueillies par des projets qui ont eu lieu dans six zones côtières au Canada entre 2018 et 2022.
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