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PCR quantitative (qPCR) des principales espèces de macroalgues non indigènes dans les eaux de la Nouvelle-Écosse et du Nouveau-Brunswick
Pour soutenir la surveillance des principales espèces de macroalgues et non indigènes en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick, on a conçu et testé cinq essais de PCR quantitative (qPCR) et sur 111 sites en 2022-2023, ciblant les espèces de macroalgues non indigènes suivantes : Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica et Fucus serratus. Tous les essais ont été élaborés en 2022 par le Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, à Terre-Neuve, au Canada), à l’exception de l’essai pour Antithamnion sparsum, pour lequel un essai a été élaboré en 2023 par le Laboratoire de biotechnologie aquatique (LBA) de l’Institut océanographique de Bedford. Toutes les amplifications ont été effectuées par le LBA en 2022-2023. Le test mis au point pour Fucus serratus s’est avéré par la suite non spécifique et amplifie à la fois F. serratus et Fucus distichus.Citer ces données comme: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&v=1.5Pour plus d'informations, voir:LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725.
Données de surveillance de bio-encrassement des espèces aquatiques envahissantes (EAE) de la Région du Golfe
OBJECTIF :Procéder à une détection précoce des espèces aquatiques envahissantes (EAE) nouvellement arrivées et déterminer la répartition, l'établissement et la distribution spatiale des EAE existantes dans les eaux marines du sud du golfe du Saint-Laurent (SGSL), limites de la région du Golfe du MPO (côtes nord et est du NB, rives du golfe de la N.-É. et rivage de l’Île-du-Prince-Édouard).DESCRIPTION :Les Sciences du MPO surveillent les EAE dans la région du Golfe. Les données recueillies dans le cadre du programme de surveillance de l'encrassement biologique du MPO donnent un aperçu de la répartition et de l'abondance des espèces aquatiques envahissantes (EAE) dans la région du Golfe. Cette information peut être utilisée par le grand public, les scientifiques et les gestionnaires du MPO.Programme de surveillance ciblant les espèces aquatiques envahissantes (EAE). Les espèces de salissures biologiques indigènes ne sont pas incluses dans cet ensemble de données. Botrylloides violaceus: Botrylloïde violetBotryllus schlosseri: Botrylle étoiléCiona intestinalis: Ascidie jauneStyela clava: Ascidie plisséeCaprella mutica*: Caprelle japonaiseMembranipora membranacea: MembraniporeCarcinus maenas*: Crabe vert européenCodium fragile*: Codium fragileJuxtacribrilina mutabilis**: Bryozoaire côtelé (JCM)*indique les espèces qui ne sont pas incluses dans les données de couverture en pourcentage car elles ne sont pas bien capturées par la méthode d'échantillonnage, mais sont incluses dans les données de détection.**indique que l'espèce n'a été pleinement intégrée au protocole de surveillance qu'à partir de 2025.Nous présentons ici un ensemble de données sur la détection et le pourcentage de couverture des EAE, ainsi que les coordonnées des stations de surveillance. Les données environnementales collectées, incluant celles des enregistreurs de température, ne sont pas incluses ici. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Température de l'air et de l'eau, salinité, profondeur, oxygène dissous, conditions météorologiques, liste des EAE d'encrassement biologique, pourcentage de couverture d'EAE sur des plaques de PVC et la détection fortuite d'autres espèces et d'AIS dans la zone environnante. Seules les données relatives aux espèces sont transférées vers la plateforme Open Data.NOTES SUR LE CONTRÔLE DE QUALITÉ :Chaque échantillon et espèce est traité et identifié de manière normalisée à l'aide de protocoles normalisés d'EAE des Sciences du MPO et de références taxonomiques. Les données sont entrées manuellement dans la base de données d'EAE de la Région du Golfe du MPO et leur exactitude est vérifiée de manière aléatoire.MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :La surveillance de l'encrassement biologique est effectuée à l'aide de plaques collectrices en PVC qui sont déployées dans la colonne d'eau à environ 1 mètre sous la surface de la mer au printemps de chaque année. Des organismes d'encrassement biologique se fixent sur ces plaques qui sont récupérées à l'automne de la même année. Les abondances d'EAE sont exprimées en pourcentage de couverture sur les plaques. Les données physico-chimiques, incluant la température, la conductivité et la profondeur ainsi que les conditions météorologiques, sont notées à chaque site de surveillance géoréférencé au cours du déploiement initial et au moment de la récupération des plaques. Tous les organismes d’encrassement biologique installés sur la face inférieure des plaques de PVC sont notés et le pourcentage de recouvrement de chaque EAE sur les plaques est estimé. Toute EAE présente sur le site est également notée. Un enregistreur de température et de lumière HOBO a été déployé.LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.
Limites du projet d'inventaire des écosystèmes sensibles (SEI)
Les limites du projet Sensitive Ecosystems Inventory (SEI) (zones d'étude) contiennent des attributs décrivant chaque projet (métadonnées au niveau du projet) et incluent des liens vers les emplacements d'autres données associées au projet (par exemple, des rapports, des ensembles de données polygonales, des fichiers de graphiques). Le SEI identifie et cartographie les écosystèmes terrestres rares et fragiles dans une zone donnée dans le but d'encourager les décisions d'utilisation des terres qui garantiront l'intégrité continue de ces écosystèmes. Cette couche est dérivée de la couche STE_TEI_PROJECT_BOUNDARIES_SP en filtrant sur l'attribut PROJECT_TYPE. Les types de projets incluent : SEI, TEMSEI, TEMSET, TEMSEW et SEIWHR. Version actuelle : v11 (publiée le 03/10/2024) Versions précédentes : v10 (publiée le 14/11/2020), v9 (publiée le 01/05/2021), v8 (publiée le 01/09/2016)** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Polygones détaillés de l'inventaire des écosystèmes sensibles (SEI) avec vue spatiale sous forme de table attributaire courte
SEI_Polygons contient des polygones d'inventaire des écosystèmes sensibles avec des attributs clés et fusionnés (concaténés) dérivés des attributs standard RISC (Resource Inventory Standards Committee). Le SEI identifie et cartographie les écosystèmes terrestres rares et fragiles. Les écosystèmes cartographiés peuvent inclure (sans toutefois s'y limiter) des forêts plus anciennes, des zones boisées, des falaises côtières, des écosystèmes herbacés et à végétation clairsemée, des prairies, des écosystèmes riverains et des zones humides. Les méthodes SEI incluent l'interprétation manuelle de photos aériennes ou la thématisation d'autres cartographies des écosystèmes, chacune étant soutenue par une vérification sélective sur le terrain. Cette couche est dérivée de la couche STE_TEI_ATTRIBUTE_POLYS_SP en filtrant sur l'attribut PROJECT_TYPE. Les types de projets incluent : SEI, TEMSEI, TEMSET et SEIWHR. Version actuelle : v11 (publiée le 03/10/2024) Versions précédentes : v10 (publiée le 14/11/2020), v9 (publiée le 01/05/2021), v8 (publiée le 01/09/2016)** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Dépôts de récupération des têtes de salmonidés du Pacifique provenant de la pêche récréative
Emplacement et coordonnées des Dépôts de récupération des têtes de salmonidés du Pacifique provenant de la pêche récréative.La communauté des pêcheurs sportifs a un rôle important à jouer dans la récupération des micromarques magnétisées codées qui ont été posées sur le saumon coho et le saumon quinnat. Une micromarque magnétisée codée est une pièce de câble d'un millimètre sur laquelle a été gravé un numéro unique à l'aide d'un laser. La micromarque est insérée dans le cartilage du nez des jeunes saumons avant qu’ils n’entament leur migration vers l’océan. Le Canada et les États-Unis marquent plus de 50 millions de jeunes saumons tous les ans. Le MPO applique ainsi environ 5,5 millions de micromarques, soit près de 5,5 kilomètres de câble. Les pêcheurs à la ligne peuvent reconnaître la présence d'une micromarque magnétisée codée à l'absence de nageoire adipeuse (située sur la surface dorsale du saumon). Si vous avez pêché un saumon coho ou quinnat comportant une nageoire adipeuse coupée, il suffit de retirer la tête du poisson, de remplir une étiquette de pêche récréative, puis de soumettre la tête à l'un des Dépôts de récupération des têtes de salmonidés pris dans des pêches récréatives dans la zone. Il est aussi important de déposer les têtes provenant des zones estuariennes ou dulcicoles que de ramener celles provenant des zones maritimes. Même si les pêcheurs qui pêchent près des écloseries savent de manière relativement sûre d’où proviennent leurs prises, aucun renseignement ne sera enregistré s’ils ne déposent pas les têtes provenant des poissons sans nageoire adipeuse. Sans ces données, l’état des stocks et la valeur de la ressource risquent d’être sous-évalués.
Utilisation saisonnière des frayères de morue de l’Atlantique Bar Haven dans la baie Placentia
Ce projet a été mené à bien par la Section du poisson de fond de la Direction des sciences des Pêches et des Océans (MPO) de la région de Terre-Neuve-et-Labrador. De 2018 à 2020, 14 récepteurs acoustiques ont été déployés toute l’année dans la baie Placentia dans le cadre du Programme sur les données environnementales côtières de référence pour former 4 portes : Bar Haven (2 récepteurs), Centre Channel (1 récepteur), Eastern Channel (6 récepteurs) et Western Channel (5 récepteurs). De plus, 162 émetteurs ont été fixés sur des morues de l’Atlantique dans la région 3Ps (2019-2022). Au cours de la période de déploiement, ces récepteurs ont enregistré un total de 2 094 024 détections provenant de 63 émetteurs uniques, dont 45 morues marquées dans le cadre du programme de télémétrie acoustique de poisson-fond. La plupart des morues détectées ont été marquées dans la baie Placentia (43 poissons) et bon nombre de morues ont été détectées par plusieurs récepteurs ou cours de nombreuses années (37 poissons). La collecte passive de données pour ce projet peut s’étendre jusqu’en 2030. Ce document contient les emplacements des récepteurs acoustiques à Placentia Bay, T.-N.-L.
Probabilité de présence de saumons de l’Atlantique dans les zones pilotes de planification d’intervention localisée
En 2001 et en 2003, des post-saumoneaux de l’Atlantique ont fait l’objet d’un relevé au chalut de surface. Ces données ont été fournies à la section de recherche sur l’océanographie et les écosystèmes côtiers de Pêches et Océans Canada (MPO). On a tenu compte de ces données et de l’information provenant d’études de marquage ultérieures afin d’estimer la probabilité de la présence du saumon de l’Atlantique dans les régions visées par le Plan d’intervention régional. La présence du saumon de l’Atlantique varie selon les saisons; les renseignements spatiaux doivent être utilisés conjointement avec l’information temporelle dans le tableau d’attributs.Une version de cet ensemble de données a été créée pour le Centre national des urgences environnementales (CNUE) selon leur modèle de données et peut être téléchargée dans la section Ressources.Citer ces données comme suit : Lazin, G., Hamer, A.,Corrigan, S., Bower, B., and Harvey, C. <<Data of: Likelihood of presence of Atlantic Salmon in Area Response Planning pilot areas >>. Date de publication: Juin 2018. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews (Nouveau-Brunswick). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/436cdf90-9d6b-4784-938b-feec48844a67
Menaces et places prioritaires du Fonds de la nature du Canada pour les espèces aquatiques en péril (FNCEAP)
Le Fonds naturel du Canada pour les espèces aquatiques en péril (FNCEAP) est un programme de contribution qui vise à fournir un financement pour les activités de rétablissement et d'atténuation des menaces dans neuf places prioritaires et pour s'attaquer à deux menaces marines pour les espèces aquatiques en péril. La couche des places prioritaires et des menaces marines soutient la FNCEAP en délimitant l'emplacement des places et des menaces.Le Fonds canadien pour les espèces aquatiques en péril (FNCEAP) soutient les candidats dans la conception et la réalisation de projets d'intendance. Ces projets soutiennent le rétablissement et la protection des espèces aquatiques en péril. Le MPO a identifié 2 menaces marines prioritaires et 9 lieux prioritaires pour les projets financés par le FNCEAP, ces zones sont incluses dans ce jeu de données.
Occurrences d'éléments non sensibles ACIMS
Une occurrence d'élément (EO) est une zone terrestre et/ou aquatique dans laquelle une espèce ou une communauté écologique est ou était présente. Un élément est soit une espèce (ou des taxons de sous-espèces) soit une communauté écologique, l'occurrence étant l'emplacement documenté. Le concept EO fait partie de la méthodologie NatureServe. Cette méthodologie est utilisée dans l'ensemble du réseau NatureServe. Les EO sont créées sur la base de la norme de données d'occurrence des éléments et sont un produit dérivé développé à partir des observations soumises. Une zone géographique devrait avoir une valeur pratique pour la conservation de l'élément, comme en témoigne la présence continue (ou historique) potentielle et/ou la récurrence régulière de l'élément à un endroit donné. Pour les éléments d'espèces, l'OT correspond souvent à la population locale, mais le cas échéant, il peut s'agir d'une partie d'une population (par exemple, pour les personnes qui se dispersent sur de longues distances) ou d'un groupe de populations voisines (par exemple, une métapopulation). Pour les éléments de communauté écologique, l'EO peut représenter un peuplement ou une parcelle d'une communauté naturelle, ou un groupe de peuplements ou de parcelles d'une communauté naturelle. Cet ensemble de données contient des EO non sensibles. Les zones d'intérêt non sensibles sont des localisations (c'est-à-dire des occurrences) d'espèces ou de communautés rares (ou dont la conservation est préoccupante pour une autre raison) et pour lesquelles il n'existe aucune restriction concernant l'accès du public aux données de localisation (au-delà de l'acceptation des conditions générales détaillées ci-dessous). Ces données sont mises à jour quotidiennement.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**
Saumon de l’Atlantique étiqueté du lac Ontario
Obtenir des données sur les recaptures de saumons de l’Atlantique étiquetés du lac Ontario. Cet ensemble de données représente les saumons de l’Atlantique adultes étiquetés qui ont été relâchés, puis recapturés par des pêcheurs à la ligne. Ces poissons étaient utilisés comme stock de géniteurs (reproduction) dans le programme de pisciculture du ministère des Richesses naturelles et des Forêts. Tous les poissons ont été étiquetés à l’aide d’une étiquette-ruban près de la nageoire dorsale. Chaque étiquette comporte un numéro unique et un numéro de téléphone que les pêcheurs à la ligne peuvent composer pour informer le ministère de leur prise. Les données comprennent : * La date d’étiquetage * La date de recapture * Le numéro d’étiquette et sa couleur * L’emplacement de la remise à l’eau * L’emplacement de la recapture * Le nombre de jours depuis la remise à l’eau * La distance parcourue** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **
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