La série d’ensembles de données « Indicateur agroenvironnemental – Risque de contamination de l’eau par les coliformes » comprend deux variables, à savoir la charge en coliformes du sol et le risque de contamination de l’eau. L’indicateur de la charge en coliformes du sol est une estimation de l’accumulation de coliformes sur le sol, tandis que l’indicateur du risque de contamination de l’eau par les coliformes est le risque relatif de pénétration des coliformes dans les cours d’eau.Les produits de cette série d’ensembles de données présentent des résultats pour des zones prédéfinies, comme définies dans la série sur les pédo-paysages du Canada (PPC v. 3.2) au moyen des valeurs uniques SOIL_LANDSCAPE_ID..

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves à Terre-Neuve-et-Labrador au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines des secteurs coquilliers au Canada (Colombie-Britannique, Île-du-Prince-Édouard, Nouveau-Brunswick, Nouvelle-Écosse, Québec, Terre-Neuve-et-Labrador) pour la récolte de mollusques bivalves. Il comprend les résultats analytiques de la concentration en coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Des données sur la température et la salinité des eaux des secteurs coquilliers sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données ainsi que les coordonnées géographiques des stations d’échantillonnage.Ces données servent à formuler des recommandations de classification des secteurs coquilliers. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves au Nouveau-Brunswick au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves en Colombie-Britannique au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves au Québec au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves à l’Île-du-Prince-Edouard au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves en Nouvelle-Écosse au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

La thématique sur le suivi physicochimique des rivières et du fleuve présente les données de l’ensemble des stations des réseaux de suivi de la qualité de l’eau des rivières du Québec et du fleuve Saint-Laurent.Les réseaux de suivi de la qualité générale des eaux ont pour objectif de caractériser, à l’aide des paramètres physicochimiques et bactériologiques courants, la qualité des eaux sur le plan spatial et de suivre l’évolution de cette qualité dans le temps. Pour le suivi régulier de la qualité générale de l’eau des rivières et du fleuve, les paramètres mesurés sont : le phosphore total, l’azote total, les nitrites et nitrates, l’azote ammoniacal, la chlorophylle a, les phéopigments, les coliformes fécaux, la turbidité, les matières en suspension, le pH, la conductivité, le carbone organique dissous et la température. Ces données sont utilisées pour calculer l’indice de la qualité bactériologique et physicochimique de l’eau (IQBP), un indice de classification de la qualité de l'eau.Le jeu de données sur le suivi physicochimique de rivières et du fleuve comprend aussi les aires de drainage de certaines des stations. La table attributaire fourni la compilation de l’utilisation du territoire par catégorie pour la dernière année disponible au moment de la production de la donnée. Le suivi est réalisé annuellement.

OBJECTIF :Le but de ce travail était de déterminer (1) comment la génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal de la merluche blanche (Urophycis tenuis), et (2) si la variation de la communauté microbienne fournit des informations complémentaires sur la structure de la population de cette espèce dans l'est du Canada.DESCRIPTION :L’intégration du microbiote associé à l’hôte aux approches génomiques offre un cadre prometteur pour mieux comprendre les multiples dimensions biologiques qui façonnent la structure des populations chez les poissons marins. Une compréhension claire de la structure et de la dynamique des populations biologiques est essentielle pour des décisions éclairées en matière de gestion des pêches et de conservation ; toutefois, bien que les approches génomiques aient considérablement amélioré notre capacité à délimiter les populations biologiques, elles n’offrent qu’une représentation partielle de la structure biologique, car les patrons de différenciation reflètent à la fois la divergence historique et les conditions écologiques contemporaines. Le microbiote associé à l’hôte peut influencer les processus écologiques à l’échelle des populations en apportant une variation fonctionnelle et potentiellement héréditaire qui façonne le phénotype et le fitness de l’hôte.Dans cette étude, nous avons combiné le génotypage par séquençage et le séquençage des amplicons du gène de l’ARNr 16S afin d’examiner comment la structure génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal et d’évaluer si la variation des communautés microbiennes fournit des informations complémentaires sur la structure des populations chez la merluche blanche (Urophycis tenuis) dans l’est du Canada. Les analyses génomiques ont permis d’identifier deux populations présentant un chevauchement spatial plus important que celui rapporté précédemment. La partition de la variation a révélé que la génétique de l’hôte expliquait une fraction négligeable de la variation du microbiote comparativement aux facteurs environnementaux et à la taille des poissons, ce qui suggère une influence des changements ontogénétiques dans l’utilisation de l’habitat et des ressources sur la composition du microbiote intestinal. Plusieurs taxons présentaient une abondance différentielle entre les catégories de taille des poissons, utilisées comme indicateur du régime alimentaire, notamment des taxons ayant un potentiel de dégradation de la chitine, tels que Photobacterium et Lachnospirales, lesquels étaient enrichis chez les individus de plus petite taille, connus pour consommer un régime dominé par les crustacés. Ensemble, ces résultats indiquent que la composition du microbiote intestinal chez la merluche blanche reflète principalement des processus écologiques et d’histoire de vie plutôt que la structure génétique des populations de l’hôte. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Des paramètres environnementaux ont également été collectés à la plupart des sites d'échantillonnage, y compris la profondeur, température de l'eau, le niveau d'oxygène et la salinité.DÉTAILS DE L'ÉCHANTILLON PHYSIQUE :Des échantillons de nageoires ont été collectés pour caractériser les génotypes des poissons. Des échantillons d'intestin (rectum) ont été collectés pour étudier le microbiome intestinal des poissons.MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :En 2022 et 2023, les merluches blanches ont été échantillonnées lors des relevés annuels écosystémiques au chalut de fond du ministère des Pêches et des Océans Canada (MPO).LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.