Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves au Nouveau-Brunswick au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves à Terre-Neuve-et-Labrador au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines des secteurs coquilliers au Canada (Colombie-Britannique, Île-du-Prince-Édouard, Nouveau-Brunswick, Nouvelle-Écosse, Québec, Terre-Neuve-et-Labrador) pour la récolte de mollusques bivalves. Il comprend les résultats analytiques de la concentration en coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Des données sur la température et la salinité des eaux des secteurs coquilliers sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données ainsi que les coordonnées géographiques des stations d’échantillonnage.Ces données servent à formuler des recommandations de classification des secteurs coquilliers. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).

La série d’ensembles de données « Indicateur agroenvironnemental – Risque de contamination de l’eau par les coliformes » comprend deux variables, à savoir la charge en coliformes du sol et le risque de contamination de l’eau. L’indicateur de la charge en coliformes du sol est une estimation de l’accumulation de coliformes sur le sol, tandis que l’indicateur du risque de contamination de l’eau par les coliformes est le risque relatif de pénétration des coliformes dans les cours d’eau.Les produits de cette série d’ensembles de données présentent des résultats pour des zones prédéfinies, comme définies dans la série sur les pédo-paysages du Canada (PPC v. 3.2) au moyen des valeurs uniques SOIL_LANDSCAPE_ID..

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves en Colombie-Britannique au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves au Québec au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves à l’Île-du-Prince-Edouard au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves en Nouvelle-Écosse au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

OBJECTIF :Le but de ce travail était de déterminer (1) comment la génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal de la merluche blanche (Urophycis tenuis), et (2) si la variation de la communauté microbienne fournit des informations complémentaires sur la structure de la population de cette espèce dans l'est du Canada.DESCRIPTION :L’intégration du microbiote associé à l’hôte aux approches génomiques offre un cadre prometteur pour mieux comprendre les multiples dimensions biologiques qui façonnent la structure des populations chez les poissons marins. Une compréhension claire de la structure et de la dynamique des populations biologiques est essentielle pour des décisions éclairées en matière de gestion des pêches et de conservation ; toutefois, bien que les approches génomiques aient considérablement amélioré notre capacité à délimiter les populations biologiques, elles n’offrent qu’une représentation partielle de la structure biologique, car les patrons de différenciation reflètent à la fois la divergence historique et les conditions écologiques contemporaines. Le microbiote associé à l’hôte peut influencer les processus écologiques à l’échelle des populations en apportant une variation fonctionnelle et potentiellement héréditaire qui façonne le phénotype et le fitness de l’hôte.Dans cette étude, nous avons combiné le génotypage par séquençage et le séquençage des amplicons du gène de l’ARNr 16S afin d’examiner comment la structure génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal et d’évaluer si la variation des communautés microbiennes fournit des informations complémentaires sur la structure des populations chez la merluche blanche (Urophycis tenuis) dans l’est du Canada. Les analyses génomiques ont permis d’identifier deux populations présentant un chevauchement spatial plus important que celui rapporté précédemment. La partition de la variation a révélé que la génétique de l’hôte expliquait une fraction négligeable de la variation du microbiote comparativement aux facteurs environnementaux et à la taille des poissons, ce qui suggère une influence des changements ontogénétiques dans l’utilisation de l’habitat et des ressources sur la composition du microbiote intestinal. Plusieurs taxons présentaient une abondance différentielle entre les catégories de taille des poissons, utilisées comme indicateur du régime alimentaire, notamment des taxons ayant un potentiel de dégradation de la chitine, tels que Photobacterium et Lachnospirales, lesquels étaient enrichis chez les individus de plus petite taille, connus pour consommer un régime dominé par les crustacés. Ensemble, ces résultats indiquent que la composition du microbiote intestinal chez la merluche blanche reflète principalement des processus écologiques et d’histoire de vie plutôt que la structure génétique des populations de l’hôte. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Des paramètres environnementaux ont également été collectés à la plupart des sites d'échantillonnage, y compris la profondeur, température de l'eau, le niveau d'oxygène et la salinité.DÉTAILS DE L'ÉCHANTILLON PHYSIQUE :Des échantillons de nageoires ont été collectés pour caractériser les génotypes des poissons. Des échantillons d'intestin (rectum) ont été collectés pour étudier le microbiome intestinal des poissons.MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :En 2022 et 2023, les merluches blanches ont été échantillonnées lors des relevés annuels écosystémiques au chalut de fond du ministère des Pêches et des Océans Canada (MPO).LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

On a cree des zones afin de gerer les risques de propagation des agents pathogenes du poisson. Ce produit necessite l'utilisation de logiciels du SIG. *[SIG]: système d’information géographique** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **