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Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur COI
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b
Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur MiFish (12S)
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a
TANTALIS - Accords de partage des recettes relatives aux terres de la Couronne
TA_CROWN_REV_SHARE_AGRMNTS_SVW contient la représentation spatiale (polygone) des accords de partage des recettes relatives aux terres de la Couronne actifs et appliqués. Un accord de partage des recettes est conclu entre la Couronne et une ou plusieurs parties pour partager les recettes. La vue a été créée pour fournir une présentation simplifiée de ce type de tenure unique à partir des informations de disposition du système opérationnel Tantalis. Le même contenu pourrait être dérivé du TA_CROWN_TENURES_SVW en filtrant uniquement sur ce type de tenure. Il est possible que cet ensemble de données contienne peu ou pas d'enregistrements, selon le nombre actuel de mandats actifs ou de candidatures.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Monuments de contrôle géodésique MASCOT
Monuments de contrôle géodésique Mascot pour la Colombie-Britannique. Les monuments de contrôle géodésiques sont un réseau de marqueurs interconnectés dans le sol dont les coordonnées et/ou les élévations sont déterminées avec précision. Ce sont des points fixes sur lesquels on peut référencer spatialement les relevés, la cartographie, l'imagerie aérienne et satellitaire, etc.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Demande d'offres d'emploi dans le secteur du pétrole et du gaz - 50 000
Représenter le processus concurrentiel de cession des droits pétroliers et gaziers du Yukon régi par la Loi sur le pétrole et le gaz du Yukon et administré par le gouvernement du Yukon. Le processus de disposition a été conçu de manière à ce que l'industrie pétrolière et gazière soit en mesure de demander les emplacements pour lesquels elle a l'intention de soumettre des offres. Demande d'affichage (RFP) - Manifestation d'intérêt de la part de l'industrie pour l'acquisition de droits pétroliers et gaziers dans un endroit précis. Pour plus d'informations, rendez-vous sur https://yukon.ca/en/doing-business/licensing/apply-oil-and-gas-rights#disposition-overviewDistribué depuis [GeoYukon] (https://yukon.ca/geoyukon) par le [gouvernement du Yukon] (https://yukon.ca/maps). Découvrez d'autres données cartographiques numériques et des cartes interactives issues de la collection de données cartographiques numériques du Yukon.Pour plus d'informations : [geomatics.help@yukon.ca] (mailto : geomatics.help@yukon.ca)
Permis d'emprise routière pour le pétrole et le gaz
Autorisations foncières représentant l'emprise routière pour les activités routières. Les données spatiales comprennent des données polygonales pour les emprises routières approuvées et postérieures à la construction, collectées le 30 octobre 2006 ou après cette date. Cet ensemble de données est mis à jour tous les soirs.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Emplacements des offres pour le pétrole et le gaz - 50 000
Processus de disposition des droits pétroliers et gaziers du Yukon. Appel d'offres (CFB) - une invitation à soumettre des offres pour les emplacements publiés. L'ensemble de données sur les appels d'offres contient des informations de base sur le processus de disposition administré par le gouvernement du Yukon. Pour plus d'informations sur le processus de disposition, rendez-vous sur [https://yukon.ca/en/doing-business/licensing/apply-oil-and-gas-rights#disposition-overview](https://yukon.ca/en/doing-business/licensing/apply-oil-and-gas-rights)Distribué depuis [GeoYukon] (https://yukon.ca/geoyukon) par le [gouvernement du Yukon] (https://yukon.ca/maps). Découvrez d'autres données cartographiques numériques et des cartes interactives issues de la collection de données cartographiques numériques du Yukon.Pour plus d'informations : [geomatics.help@yukon.ca] (mailto : geomatics.help@yukon.ca)
Dispositions relatives au pétrole et au gaz - 50 000
Dispositions relatives au pétrole et au gaz du Yukon. Créé à partir des résumés de disposition et du système de division des terres pétrolières et gazières. Pour plus d'informations, rendez-vous sur [https://yukon.ca/en/doing-business/licensing/apply-oil-and-gas-rights#disposition-overview](https://yukon.ca:443/en/doing-business/licensing/apply-oil-and-gas-rights)Distribué depuis [GeoYukon] (https://yukon.ca/geoyukon) par le [gouvernement du Yukon] (https://yukon.ca/maps). Découvrez d'autres données cartographiques numériques et des cartes interactives issues de la collection de données cartographiques numériques du Yukon.Pour plus d'informations : [geomatics.help@yukon.ca] (mailto : geomatics.help@yukon.ca)
Données sur l’empoissonnement pour les besoins de la pêche récréative
Données sur l’empoissonnement pour les besoins de la pêche récréative. Contient : * les données sur l’empoissonnement au cours des dix dernières années pour espèces, lorsque l’empoissonnement visait à favoriser la pêche récréative. Il s’agit d’un sous-ensemble de données du système d’information sur l’empoissonnement. Ces données peuvent également être obtenues au moyen de [l'application en ligne ON-Pêche](https://www.lioapplications.lrc.gov.on.ca/fishonline/Index.html?viewer=FishONLine.FishONLine&locale=fr-CA). Pour en savoir davantage sur les lieux d’empoissonnement à des fins de recherche ou de rétablissement, veuillez communiquer avec un bureau de district du ministère des Richesses naturelles et des Forêts dans votre collectivité. Données connexes : * [Renseignements uniques sur l’emplacement des plans d’eau de l’Ontario](https://data.ontario.ca/fr/dataset/ontario-waterbody-location-identifier)** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **
Règlement
L'ensemble de données sur les colonies comprend tous les polygones qui représentent les colonies de l'Alberta. Une colonie est une zone de terrain qui a été arpentée avant le troisième système d'enquête et qui ne suit normalement pas la grille ATS.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**
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