Ce jeu de données provient des analyses d’échantillons photos issus des déploiements de systèmes de caméras photo déposés (CPD) effectués lors de divers relevés en milieux côtiers sur la rive nord de l'estuaire et du golfe du Saint-Laurent entre Portneuf-sur-Mer et Sept-Îles, entre juin et octobre, de 2019 à 2022. Il contient les données de 4866 occurrences de 109 taxons d'invertébrés épibenthiques et de végétation aquatique submergée (y compris les algues) observés à des profondeurs allant de 0 à plus de 50 mètres. Des renseignements additionnels concernant ce jeu de données sont disponibles dans la section « Description des étapes méthodologiques ». Les relevés scientifiques ont été réalisés dans le cadre du Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada et du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance en soutient aux évaluations fondées sur des preuves ainsi que la prise de décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données acquises lors des relevés comprennent aussi : 1) les données d’occurrence des taxons de poissons et invertébrés observés dans des échantillons vidéo provenant de systèmes de caméras vidéo stéréoscopiques appâtés (CVSA), 2) les données de capture de poissons et invertébrés dans un chalut à perche (occurrence et poids des captures des différents taxons), 3) la classification du substrat benthique basée sur les déploiements du système de caméras photos déposé, 4) des mesures océanographiques de la colonne d'eau d’un CTD Seabird 19plus V2 type profilage (conductivité, température, profondeur, rayonnement photosynthétique actif, pH, oxygène dissous), 5) les concentrations de nutriments (NO2, NO3, NH4, PO4, SiO3) et carbone organique dissous (DOC) et 6) la vitesse et la direction du courant mesurées par des inclinomètres. Les jeux de données des deux premiers éléments seront également disponibles en tant que jeux de données indépendants sur le portail OBIS/GBIF. Pour obtenir les données des éléments 3 à 6 et/ou les données biologiques récoltées sur différents taxons de poissons et invertébrés, veuillez contacter David Lévesque ou Marie-Julie Roux.L’élaboration d’objectifs de conservation écosystémiques dans la gestion des ressources halieutiques nécessite le développement de méthodes d’échantillonnage permettant de maximiser la collecte de données sur l’écosystème, tout en minimisant l’impact sur les organismes et le milieu marin. Ce projet vise la caractérisation écosystémique de la zone côtière de l’estuaire et du golfe du Saint-Laurent entre Portneuf-sur-Mer et Sept-Îles (QC), incluant la physico-chimie de l’eau, le phytoplancton, le zooplancton, la végétation submergée, les habitats benthiques ainsi que les assemblages de poissons et invertébrés. L’échantillonnage est réalisé en combinant des méthodes conventionnelles telles que le profilage CTD, les filets à zooplancton et le chalut à perche, à des méthodes non-extractives telles les caméras photo déposées (CPD) et les systèmes de caméras vidéo stéréoscopiques appâtés (CVSA). Les données amassées contribueront à définir les conditions écosystémiques de référence dans la zone d’étude; explorer les liens entre les conditions environnementales, la structure des habitats et les assemblages biologiques; identifier des habitats d’importance pour les espèces marines; ainsi qu’à l’évaluation de la performance des méthodes d’échantillonnage visuel par rapport aux méthodes conventionnelles. Les résultats permettront d’optimiser les suivis saisonniers ou annuels en vue de mieux comprendre les effets directs et indirectes des activités humaines en milieux côtiers.Description des étapes méthodologiques:1. Acquisition des échantillons de photos en séquence : Le système de caméra photo déposé (CPD) utilisé pour échantillonner les images sous-marines est un cadre d’acier inoxydable ayant la forme d’un prisme à base triangulaire de 50 cm de largeur, de 100 cm de longueur et de 76 cm de hauteur au niveau de l’œillet central. La superficie du quadrat d’échantillonnage est de 0.25 m2 (dimensions intérieures de 50 cm par 50 cm). Le système est composé de deux caméras GoPro Hero 5 (4000 × 3000 pixels) et de deux lumières de plongée de 8000 lumens (Big Blue VL8000). La première caméra permet de capter les éléments se trouvant dans le quadrat en vue du dessus. La seconde caméra permet d’avoir un plan oblique facilitant l’évaluation des éléments présents dans le quadrat. À toutes les stations d’échantillonnage, cinq à neuf déploiements du système (réplicas) capturant des photos toutes les 10 secondes durant 60 à 120 secondes, ont été réalisés. L'échantillonnage a eu lieu entre le : 28 juin au 5 juillet 201913 juillet au 20 juillet 201930 septembre au 9 octobre 201910 août au 20 août 20201er octobre au 10 octobre 202022 avril au 5 mai 202127 juillet au 10 août 202115 octobre au 24 octobre 202124 juin au 5 juillet 202215 août au 26 août 20222. Analyse d’images: Une méthode d’analyse des images photo avec séquence (en mouvement) a été utilisée pour l’extraction des données d’occurrence et d’abondance des organismes; des mesures ont été prises pour obtenir les pourcentages de couverture de la végétation et des analyses du substrat ont également été effectuées. Les analyses ont été réalisées avec le logiciel ouvert Fiji de ImageJ. Une cote de qualité/visibilité a été attribuée aux séquences d’images analysées.3. Approche taxonomique : Les organismes épibenthiques ont été identifiés au plus bas rang taxonomique possible. Une approche par morphotypes a systématiquement été utilisé (lors des annotations) pour l’identification des éponges, des hydrozoaires et des bryozoaires, et occasionnellement pour d’autres organismes tels que les algues. Des codes d’espèce ont également été utilisés pour distinguer certaines espèces qui ne pouvaient être identifiées au moment des annotations (voir verbatimIdentification). Pour éliminer le biais d'observateur, la même personne a analysé toutes les images utilisées dans cette base de données. Les organismes ont été identifiés à partir d'images sous-marines en utilisant une combinaison de guides d'identification et d'articles scientifiques.4. Nomenclature ouverte : Le concept de nomenclature ouverte a été intégré dans les données d’occurrence pour accompagner les identifications taxonomiques avec leur niveau de certitude, tel que recommandé par Horton et al., 2021. L’abréviation stet. (stetit) a été utilisée lorsque la décision de ne pas aller plus bas a été prise mais qu’une identification est peut-être possible, alors que celle indet (Indeterminabilis) a été utilisé lorsqu’une identification plus bas niveau était considérée incertaine ou impossible (voir identificationqualifier). De plus, l’abréviation Confer (cf.) a été utilisée et intégrée dans les tables de données (voir occurenceRemarks) afin de relier des identifications qui pourraient potentiellement et/ou éventuellement être associées.5. Remarques : Plusieurs remarques ont également été intégrées (voir organismRemarks, identificationRemarks et taxonRemarks), et visent à fournir des informations supplémentaires pouvant être utiles à certains utilisateurs des données; à noter que ces sections pourraient faire l’objet de modifications ou de bonification.6. Contrôle qualité : Les identifications taxonomiques ont été vérifiés grâce à un processus de validation, en collaboration avec différents experts taxonomistes. Tous les noms scientifiques ont été vérifiés sur le registre mondial des espèces marines (WoRMS) pour correspondre aux normes actuellement reconnues. La correspondance WoRMS a été placée dans le champ taxonID du fichier d'occurrence. Le contrôle de la qualité des données a été effectué à l'aide des packages R obistools et worms. Tous les emplacements d'échantillonnage ont été reportés sur une carte afin d'effectuer un contrôle visuel confirmant que les coordonnées de latitude et de longitude se trouvaient dans la zone d'échantillonnage décrite.7. Partage des données : Seules les métadonnées et les données d’occurrence de la biodiversité sont partagés dans ce jeu de données. Les deux fichiers fournis (format DarwinCore) sont complémentaires et sont liés par la clé « eventID ». Le fichier «event» comprend les informations génériques de l'activité, notamment la date et la localisation. Le fichier «occurrence» comprend les identifiants originaux des organismes observés, des commentaires d’identification et leur taxonomie. Un dictionnaire des données est aussi fournis pour expliquer les champs utilisés. Pour l’accès aux autres données ou aux images, contacter David Lévesque.Pour plus de détails à propos du projet et de la méthodologie, un rapport technique (Scallon-Chouinard et al., 2022) incluant les méthodes d’échantillonnage avec les systèmes de caméra déposé (CPD) et de caméras vidéo stéréoscopiques appâtés (CVSA), est actuellement disponible en ligne (https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/41081171.pdf); un autre rapport technique détaillant les méthodes d’analyse d’images photo et vidéo sera également disponible. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans.

OBJECTIF :Recueillir des données localisées de haute qualité pour cartographier la distribution de la zostère dans les baies et les estuaires de la région du Golfe du Canada atlantique.DESCRIPTION :Entre 2018 et 2023, un total de 48 sites côtiers au Nouveau-Brunswick (NB), à l'Île-du-Prince-Édouard (PE) et en Nouvelle-Écosse (NS) ont été entièrement traités pour obtenir des informations sur la présence ou l'absence de zostères et leur profondeur.Des données ont été recueillies sur 18 autres sites de la même région et de la même période (2018-2023), mais elles n'ont pas encore été entièrement traitées pour déterminer la profondeur et la classification des zostères. Ces sites seront intégrés à l'ensemble de données une fois le traitement terminé. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Coordonnées géographiques, horodatage, présence de végétation aquatique submergée.NOTES SUR LE CONTRÔLE DE QUALITÉ :BioSonics Visual Aquatic a été utilisé pour traiter les fichiers dt4 bruts en délimitant le fond et la hauteur de la végétation aquatique submergée (VAS). Le contour initial du fond de l'estuaire a été tracé à l'aide d'un algorithme automatisé intégré au logiciel, puis affiné manuellement afin d'obtenir un contour plus précis. Un algorithme a ensuite été utilisé pour délimiter la végétation, qui a été éditée visuellement en se référant à des notes écrites de vérification sur le terrain et à des photos sous-marines prises avec une caméra sous-marine GoPro équipée d'un GPS. Des experts du MPO ont conseillé les analystes sur les meilleures pratiques et les subtilités des échogrammes. Tous les efforts ont été faits pour s'assurer que la végétation cartographiée était bien de la zostère, mais dans certains cas, notamment lorsque la réponse acoustique n'était pas claire ou que les notes de vérification sur le terrain faisaient défaut, il est possible que d'autres types de VAS aient été inclus.Les données ont été exportées de BioSonics Visual Aquatic en agrégeant des ensembles de 10 pings très proches les uns des autres. Les pings groupés d'une hauteur de canopée végétale >= 0,1 m ont reçu une valeur de présence d'herbes marines (c'est-à-dire « EG_Presence ») de « Y », tandis que les pings groupés avec une hauteur < 0,1 m ont reçu une valeur de présence de « N ».MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :Les données acoustiques ont été recueillies au cours de l'été ou au début de l'automne (selon le site) par la Coalition pour la viabilité du sud du golfe du Saint-Laurent (Coalition-SGSL), en partenariat avec Pêches et Océans Canada (MPO), région du Golfe. Sur certains sites, le ministère de l'Agriculture, de l'Aquaculture et des Pêches du Nouveau-Brunswick (MAAPNB) a également recueilli des données à l'aide de son bateau. Des échosondeurs BioSonics MX Aquatic Habitat équipé d'un transducteur à faisceau unique (8,7°) de 204,8 kHz (la hauteur de montage variait en fonction du bateau utilisé) a été utilisé par toutes les parties pour la collecte des données. Le positionnement a été réalisé à l'aide du GPS interne de BioSonics jusqu'en 2020, puis par la suite une unité GPS externe (Hemisphere S631 RTK GPS) a été utilisée pour améliorer le positionnement d'une précision de 1-2m à ~20cm lorsque le différentiel a été obtenu. Le logiciel BioSonics Visual Acquisition a été utilisé pour collecter les données.LIMITATION DE L'UTILISATION :Ce produit est fourni tel quel et son exactitude n'a pas été vérifiée par rapport à d'autres données. Comme aucun point de vérification au sol indépendant des transects n'a été relevé, l'exactitude des surfaces interpolées créées à partir de ces données ne peut être connue.Ne pas utiliser sans inclure toutes les métadonnées. Les produits de données sont fournis « tels quels » et le MPO ne garantit pas leur intégrité, leur exhaustivité ou leur exactitude.Le GPS interne de l'appareil BioSonics a connu des problèmes, et leur impact sur la précision de la position n'a pas encore été déterminé. À partir de 2021, un GPS externe plus précis a été utilisé pour améliorer la précision.L'utilisation de différents bateaux et géomètres, ainsi que d'analystes, peut entraîner certaines incohérences dans la collecte et l'analyse des données entre les sites et les années. Les caractéristiques spécifiques à chaque site, telles que la végétation aquatique submergée mixte, peuvent compliquer les efforts de cartographie. Les zones peu profondes peuvent également être difficiles à délimiter avec précision, car le fond et/ou la végétation peuvent s'étendre plus haut que le transducteur monté. Dans ces cas, l'analyste a utilisé la meilleure estimation possible.Les conditions météorologiques, telles que le vent, peuvent affecter la précision des résultats, car le transpondeur peut tanguer et rouler avec le bateau, tandis que l'augmentation des sédiments dans l'eau peut interférer avec le signal. Les données acoustiques à faisceau unique ont une empreinte focale très petite, qui varie en fonction de la profondeur, et ne doivent donc pas être considérées comme un outil complet de cartographie des fonds marins. Cependant, il fournit des données ponctuelles précieuses qui peuvent indiquer la présence de végétation, la hauteur de la canopée végétale, la profondeur relative et la vérification sur le terrain pour d'autres techniques de cartographie (par exemple, l'imagerie aérienne ou satellitaire). Par exemple, à une profondeur de 1 m, le faisceau unique de 8,6 degrés utilisé pour ce travail a une empreinte d'environ 0,0177 mètre carré, et à une profondeur de 2 m, cette empreinte passe à 0,0711 mètre carré.

La base de données sur les espèces aquatiques envahissantes des Grand Lacs est une compilation de données sur les communautés de poissons et les habitats provenant des efforts de surveillance de détection précoce du Programme des espèces aquatiques envahissantes et du Programme de carpes envahissantes de MPO dans les eaux canadiennes du bassin des Grands Lacs. Les données comprennent : le site d’échantillonnage, la date, le nombre de poissons, les espèces de poissons et les informations connexes sur l’habitat. Les détails spécifiques au projet, les objectifs, et les méthodes sont souvent présentés dans les rapports canadiens des sciences halieutiques et les sciences océaniques de MPO.

Cet ensemble de donnees porte sur les lignes de services publics suivants : * electricite, * eau, * communications, * mazout. Ces services comprennent ce qui suit : * lignes de communication / lignes de communication submergees, * lignes hydroelectriques / lignes hydroelectriques submergees * gazoducs / oleoducs de gaz naturel submerges, * canalisations d'eau / canalisations d'eau submergees, * canalisations a des fins inconnues, * lignes de transmission a des fins inconnues. Ce produit necessite l'utilisation de logiciels du SIG. *[SIG]: système d’information géographique** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **

Compendium de rapports fournissant des informations sur les animaux et les plantes aquatiques et terrestres, les sols, les eaux de surface, les eaux souterraines, ainsi que les fichiers de données et les cartes qui les accompagnent** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

L'ensemble de donnees a ete utilise pour le Projet de plan directeur sur la biodiversite aquatique pour la protection des Grands Lacs. Il peut etre utilise pour : * la recherche et les inventaires d'especes aquatiques * l'impact et la surveillance environnementaux * la planification et la gestion des ressources axees sur les bassins hydrographiques * l'analyse des peches et autres analyses aquatiques Titre officiel de l'IGO : Classification des ecosystemes aquatiques : bassin des Grands Lacs \- cotes, cours d'eau, lacs et terres humides** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **

La base de données scientifiques sur la biodiversité des poissons des Grand Lacs est une compilation de données sur les communautés de poissons et leurs habitats tirées des relevés scientifiques du MPO; les projets se concentrent sur les poissons dont la conservation est préoccupante. Les données comprennent : le site d’échantillonnage, la date, le nombre de poissons, les espèces de poissons, la longueur des poissons et les informations connexes sur l’habitat. Les détails spécifiques au projet, les objectifs, et les méthodes sont souvent présentés dans les rapports canadiens des sciences halieutiques et les sciences océaniques de MPO.

Durant l'été de chaque année, des groupes communautaires environnementaux recueillent des données importantes pour tester si les regroupements (ce que l’on appelle la communauté) de poissons, crevettes et crabes peuvent être utilisés comme un indicateur de l'état de santé actuel des baies et des estuaires. C'est ainsi qu'une fois par mois, de mai à septembre durant les premieres années et de juin à août, des membres du personnel et des groupes communautaires prélèvent des échantillons à six endroits différents dans leur estuaire désigné. En 2018 et 2019 seulement, un mois durant l' été a été échantilloné.Des poissons, des crevettes et des crabes sont capturés en utilisant une senne de plage, puis sont relâchés à l'eau toujours vivants une fois qu'ils ont été identifiés et comptés. À partir de ces échantillons, les groupes communautaires peuvent fournir de l'information importante au Pêches et Océans Canada, notamment :- l'identification et le nombre d'espèces de poissons, de crevettes et de crabes;- l'état de l'eau et des échantillons d'eau;- des renseignements sur les plantes aquatiques;- des échantillons de sédiments.Avec ces renseignements, les scientifiques du Pêches et Océans Canada travaillant avec des universités et des organismes gouvernementaux peuvent mener des analyses afin de déterminer la pertinence d’indicateurs pour évaluer la santé des baies et des estuaires.PARAMÈTRES COLLECTÉS :Paramètres: abondance, richesse des espèces, stage de développement (jeunes de l’année ou adultes); la température, salinité, oxygène dissout et sels nutritifs dissouts (nitrate, nitrite et phosphate) dans l’eau; % contenu organique, % contenu humide et taille moyenne des sédiments; % de la couverture de végétation aquatique submergée.NOTES SUR LE CONTRÔLE DE QUALITÉ :La saisie des données dans Excel et première vérification de la qualité des données est effectuée par les étudiants d’été du PSCA. Une deuxième vérification de la qualité des données est effectuée par le personnel du MPO. Voir l’article # 2823 joint à ce dossier.En 2018, les données historiques ont été migrées dans une base de données relationnelle. À partir de cette année, les données annuelles seront entrées dans la base de données à l'aide d'une application personnalisée. Le frontal de l'application comporte de nombreux éléments de contrôle qualité intégrés.MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :Veuillez consulter le site suivant pour la méthodologie reliée à l'échantillonnage: http://www.dfo-mpo.gc.ca/Library/341317.pdf (français)

Le Fonds naturel du Canada pour les espèces aquatiques en péril (FNCEAP) est un programme de contribution qui vise à fournir un financement pour les activités de rétablissement et d'atténuation des menaces dans neuf places prioritaires et pour s'attaquer à deux menaces marines pour les espèces aquatiques en péril. La couche des places prioritaires et des menaces marines soutient la FNCEAP en délimitant l'emplacement des places et des menaces.Le Fonds canadien pour les espèces aquatiques en péril (FNCEAP) soutient les candidats dans la conception et la réalisation de projets d'intendance. Ces projets soutiennent le rétablissement et la protection des espèces aquatiques en péril. Le MPO a identifié 2 menaces marines prioritaires et 9 lieux prioritaires pour les projets financés par le FNCEAP, ces zones sont incluses dans ce jeu de données.

L'apport excessif d'azote provenant des activités humaines d'utilisation des terres reste une cause majeure de l'eutrophisation des écosystèmes côtiers dans le monde. Cependant, il existe peu de données sur les taux de pollution par les nutriments ou ses impacts potentiels sur les écosystèmes côtiers du Canada atlantique. Pour combler cette lacune dans les connaissances, un cadre de modèle de charge d'azote (NLM) a été appliqué pour déterminer la charge d'azote totale (kg TN / an) à partir d'apports de sources ponctuelles et diffuses (eaux usées, dépôts atmosphériques, utilisation des terres, engrais applications et industries régionales) dans 109 bassins hydrographiques côtiers bordant la baie de Fundy et le plateau néo-écossais. Pour évaluer l'impact potentiel de la charge d'azote, deux indicateurs ont été calculés pour 40 baies côtières: (1) ∆N, une mesure de la résidence de l'azote qui prédit les problèmes d'oxygène dissous; et (2) le taux de charge de l'estuaire, un prédicteur du potentiel de perte de végétation aquatique submergée. Ce projet a été financé par Pêches et Océans Canada dans le cadre d'une subvention du Programme stratégique de recherche et d’avis fondés sur l’écosystème (PSRAFE). Cette recherche a été publiée dans la littérature scientifique (Kelly et al. 2021).Kelly, N.E., Guijarro-Sabaniel, J. and Zimmerman, R., 2021. Anthropogenic nitrogen loading and risk of eutrophication in the coastal zone of Atlantic Canada. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 263, p.107630. doi: https://doi.org/10.1016/j.ecss.2021.107630Citer ces données comme suit : Kelly, N.E., Guijarro-Sabaniel, J. and Zimmerman, R. Données de: Estimations de la charge d'azote anthropique et des indicateurs d'eutrophisation pour la baie de Fundy et le plateau néo-écossais: Date de publication: Mars 2022. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth (Nouvelle-Écosse). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/08746031-1970-4bf6-b6d4-3de2715c8634