OBJECTIF :Le but de ce travail était de déterminer (1) comment la génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal de la merluche blanche (Urophycis tenuis), et (2) si la variation de la communauté microbienne fournit des informations complémentaires sur la structure de la population de cette espèce dans l'est du Canada.DESCRIPTION :L’intégration du microbiote associé à l’hôte aux approches génomiques offre un cadre prometteur pour mieux comprendre les multiples dimensions biologiques qui façonnent la structure des populations chez les poissons marins. Une compréhension claire de la structure et de la dynamique des populations biologiques est essentielle pour des décisions éclairées en matière de gestion des pêches et de conservation ; toutefois, bien que les approches génomiques aient considérablement amélioré notre capacité à délimiter les populations biologiques, elles n’offrent qu’une représentation partielle de la structure biologique, car les patrons de différenciation reflètent à la fois la divergence historique et les conditions écologiques contemporaines. Le microbiote associé à l’hôte peut influencer les processus écologiques à l’échelle des populations en apportant une variation fonctionnelle et potentiellement héréditaire qui façonne le phénotype et le fitness de l’hôte.Dans cette étude, nous avons combiné le génotypage par séquençage et le séquençage des amplicons du gène de l’ARNr 16S afin d’examiner comment la structure génétique des populations est liée à la composition du microbiote intestinal et d’évaluer si la variation des communautés microbiennes fournit des informations complémentaires sur la structure des populations chez la merluche blanche (Urophycis tenuis) dans l’est du Canada. Les analyses génomiques ont permis d’identifier deux populations présentant un chevauchement spatial plus important que celui rapporté précédemment. La partition de la variation a révélé que la génétique de l’hôte expliquait une fraction négligeable de la variation du microbiote comparativement aux facteurs environnementaux et à la taille des poissons, ce qui suggère une influence des changements ontogénétiques dans l’utilisation de l’habitat et des ressources sur la composition du microbiote intestinal. Plusieurs taxons présentaient une abondance différentielle entre les catégories de taille des poissons, utilisées comme indicateur du régime alimentaire, notamment des taxons ayant un potentiel de dégradation de la chitine, tels que Photobacterium et Lachnospirales, lesquels étaient enrichis chez les individus de plus petite taille, connus pour consommer un régime dominé par les crustacés. Ensemble, ces résultats indiquent que la composition du microbiote intestinal chez la merluche blanche reflète principalement des processus écologiques et d’histoire de vie plutôt que la structure génétique des populations de l’hôte. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Des paramètres environnementaux ont également été collectés à la plupart des sites d'échantillonnage, y compris la profondeur, température de l'eau, le niveau d'oxygène et la salinité.DÉTAILS DE L'ÉCHANTILLON PHYSIQUE :Des échantillons de nageoires ont été collectés pour caractériser les génotypes des poissons. Des échantillons d'intestin (rectum) ont été collectés pour étudier le microbiome intestinal des poissons.MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :En 2022 et 2023, les merluches blanches ont été échantillonnées lors des relevés annuels écosystémiques au chalut de fond du ministère des Pêches et des Océans Canada (MPO).LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

SommaireLa région du Québec du Ministère des Pêches et des Océans (MPO) est responsable de l'évaluation de plusieurs stocks de poissons et d’invertébrés exploités dans l'estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent. Le programme d’échantillonnage des captures commerciales est l’une des sources d’information utilisée pour la réalisation de ces évaluations. Les données récoltées par ce programme, à quai ou en mer, offrent entre autres l’avantage d’une couverture spatio-temporelle relativement importante et permettent d’obtenir une partie des connaissances nécessaires pour déterminer la démographie et la structure des populations exploitées. La mise en œuvre de ce programme est assurée par du personnel spécialisé du MPO dont le principal mandat consiste à prélever des données biologiques sur les espèces de poissons de fond, de poissons pélagiques et d'invertébrés marins exploités commercialement dans les diverses communautés maritimes.DonnéesCe jeu de données sur la merluche blanche (Urophycis tenuis) inclut les métadonnées, le poids d'échantillon, la longueur du poisson, le sexe et le nombre de spécimens mesurés. Le jeu de données couvre les périodes de 1989-1990 et 1992-1993. Afin de protéger la confidentialité des sources, certaines informations (comme celles concernant le navire) ont été exclues et d'autres (comme la date de capture) ont été simplifiées. Les données où il n'y avait qu'un seul navire dans une zone de pêche par année ont également été exclues. Des informations additionnelles incluant les coordonnées des zones de pêche peuvent être obtenues en cliquant sur les liens «Pêches commerciales de l'Atlantique et de l’Arctique» et «Zones de pêche» ci-dessous.

L'ensemble de données des zones vertes et blanches historiques comprend tous les polygones qui représentent les zones vertes et blanches historiques de l'Alberta.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**

Les données sur le rétablissement des forêts après perturbation recueillies pour les écosystèmes forestiers du Canada, d'une superficie totale d'environ 650 millions d'hectares, illustrent leur rétablissement après les incendies et les récoltes survenus entre 1986 et 2012. Il a été développé dans le cadre du Système national de surveillance des écosystèmes terrestres (NTEMS) du Canada. Ces extrants spatialement explicites représentent le taux de rétablissement spectral (le taux auquel un pixel revient à 80 % de sa valeur avant la perturbation) (White et al. 2017) au cours de la période d'observation (1985-2017) à l'aide de la mesure Y2R (Years-to-Recovery, ou années jusqu'au rétablissement) dérivée des données de la série chronologique de Landsat. Pour chacune des 12 écozones forestières du Canada, des taux de référence de rétablissement spectral (Y2R) ont été établis. Ces références ont ensuite été utilisées pour déterminer les regroupements spatiaux de pixels de rétablissement dans le paysage où les mesures Y2R étaient soit nettement plus élevées, soit plus faibles que leur référence par rapport à l'écozone. Enfin, les secteurs qui ont été perturbés par des incendies et des récoltes (1986-2012), mais qui ne s'étaient pas rétablis à la fin de la période d'observation (2017) sont également indiqués. À noter que ces secteurs sont toujours en cours de rétablissement. Ils n'étaient pas encore rétablis, selon notre mesure de rétablissement spectral, à la fin de la série chronologique en 2017. Pour une synthèse des méthodes, la validation de la mesure Y2R et l'interprétation des tendances dérivées, voir White et al. (2022) et White et al. (2017). White, J.C., Hermosilla, T., Wulder, M.A., Coops, N.C., 2022. Mapping, validating, and interpreting spatio-temporal trends in post-disturbance forest recovery. Remote Sensing of Environment, 271, 112904. https://doi.org/10.1016/j.rse.2022.112904 . ( White et al. 2022) White, J.C., Wulder, M.A., Hermosilla, T., Coops, N.C., Hobart, G.W. 2017. A nationwide annual characterization of 25 years of forest disturbance and recovery for Canada using Landsat time series. Remote Sensing of Environment, 194, pp. 303-321. DOI: https://doi.org/10.1016/j.rse.2017.03.035 . ( White et al. 2017)

L'ensemble de données des zones vertes/blanches comprend tous les polygones qui représentent les zones vertes et blanches de la province de l'Alberta à des fins administratives du ministère de l'Environnement et des Aires protégées de l'Alberta.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**

La région du Québec du Ministère des Pêches et des Océans (MPO) est responsable de l'évaluation de plusieurs stocks de poissons et d’invertébrés exploités dans l'estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent. Le programme d’échantillonnage des captures commerciales est l’une des sources d’information utilisée pour la réalisation de ces évaluations. Les données récoltées par ce programme, à quai ou en mer, offrent entre autres l’avantage d’une couverture spatio-temporelle relativement importante et permettent d’obtenir une partie des connaissances nécessaires pour déterminer la démographie et la structure des populations exploitées. La mise en œuvre de ce programme est assurée par du personnel spécialisé du MPO dont le principal mandat consiste à prélever des données biologiques sur les espèces de poissons de fond, de poissons pélagiques et d'invertébrés marins exploités commercialement dans les diverses communautés maritimes.Les espèces suivantes ont été échantillonnée lors de ce programme de 1976 à présent:1. Buccin (Buccinum undatum)2. Capelan (Mallotus villosus)3. Concombre de mer (Cucumaria frondosa)4. Crabe commun (Cancer irroratus)5. Crabe des neiges (Chionoecetes opilio)6. Crabe lyre atlantique (Hyas araneus)7. Crabe Lyre (Hyas coarctatus)8. Flétan Atlantique (Hippoglossus hippoglossus)9. Flétan du Groendland (Reinhardtius hippoglossoides)10. Hareng Atlantique (Clupea harengus)11. Homard Américain (Homarus americanus)12. Limande à queue jaune (Limanda ferruginea)13. Mactre Atlantique (Spisula solidissima)14. Mactre de Stimpson (Mactromeris polynyma)15. Maquereau bleu (Scomber scombrus)16. Merluche blanche (Urophycis tenuis)17. Morue franche (Gadus morhua)18. Mye commune (Mya arenaria)19. Oursin vert (Strongylocentrotus droebachiensis)20. Pétoncle d'Islande (Chlamys islandica)21. Pétoncle géant (Placopecten magellanicus)22. Plie canadienne (Hippoglossoides platessoides)23. Plie rouge (Pseudopleuronectes americanus)24. Sébaste (Sebastes sp.)Pour plus d'informations sur ces espèces, voir la section «Ressources connexes» ci-dessous.

La Division de la gestion des côtes et des océans (DGOC) de Pêches et Océans Canada (MPO) dans la région des Maritimes a mis à jour ses cartes des débarquements des pêches pour la période 2010 à 2014. Ces cartes seront utilisées pour : la prise de décisions relatives à la gestion des zones côtières et des océans; l'atténuation des effets négatifs de l'exploitation des océans par les humains; les opérations et les protocoles d'intervention en cas d'urgence environnementale; les processus de certification du Marine Stewardship Council; la planification des réseaux d'aires marines protégées; l'évaluation des risques écologiques; et la surveillance de la conformité et des menaces pour la conservation des coraux et des éponges et des aires marines protégées. Les cartes sur les pêches ont été créées pour déterminer les zones de pêche importantes en utilisant le poids au débarquement accumulé (kg) par cellule de grille de 2 x 2 minutes pour les espèces sélectionnées ou les types d'engins. Ces ensembles de données ont été filtrés pour respecter la politique relative à la protection des renseignements personnels du gouvernement du Canada. Des évaluations sur la confidentialité ont été menées afin de déterminer les zones unitaires de l'Organisation des pêches de l'Atlantique Nord-Ouest (OPANO) qui contiennent des données ayant moins de cinq identifications de navires, de permis et de pêcheurs. Si ce seuil n’était pas atteint, les emplacements et le poids des prises ont été retenus de ces zones unitaires pour protéger l'identité ou l'activité des navires ou entreprises individuels.Des cartes ont été créées pour les espèces suivantes ou les types d'engins suivants : 1. Flétan de l'Atlantique 2. Thon rouge 3. Poisson de fond, pelangre4. Poisson de fond, chalut5. Morue 6. Morue, aiglefin, goberge 7. Brosme 8. Aiguillat 9. Poisson plat 10. Poisson de fond, filet maillant11. Flétan du Groenland 12. Poisson de fond13. Poisson de fond (périodes trimestrielles T1, T2, T3, T4) 14. Myxine 15. Hareng 16. Grands poissons pélagiques 17. Maquereau 18. Baudroie 19. Palourde, pêche hauturière 20. Homard, pêche hauturière 21. Homard, zone grise 22. Crabes, à l'exclusion du crabe des neiges 23. Thons, à l'exclusion du thon rouge 24. Goberge 25. Requin-taupe commun, requin-taupe bleu et requin bleu26. Merluche-écureuil 27. Sébaste 28. Pétoncle 29. Pétoncle (composites trimestriels T1, T2, T3, T4) 30. Chabot 31. Oursin 32. Crevette 33. Merlu argenté34. Raie 35. Crabe des neiges 36. Calmar 37. Espadon 38. Merluche blanche 39. Loup de mer

Ces couches de données montrent les débarquements par poids des prises issues de la pêche commerciale en tenant compte des pêches dirigées et des prises accessoires pour la plate-forme Néo-Écossaise, la baie de Fundy et le banc de Georges des divisions 4VWX de l'Organisation des pêches de l'Atlantique Nord-Ouest (OPANO) et les portions canadiennes des divisions 5Y et 5Z. Les cartes interrégionales de l’Atlantique canadien sont également incluses pour quatre espèces (flétan de l'Atlantique, thon rouge, sébaste et pétoncle) dans les divisions 4RST, 3KLMNOP et 2GHJ de l’OPANO. Les cartes composites sur cinq ans (2014 à 2018) qui regroupent les prises pour chaque série de cartes sont accessibles au public. Les cartes incluent le poids des prises (en kilogrammes) par cellule de carte quadrillée hexagonale de 10 km2 pour les espèces ou les groupes d’espèces choisis et les types d’engins afin de cibler les zones de pêche importantes. Elles peuvent être utilisées à des fins décisionnelles relativement à la gestion des côtes et des océans, incluant la planification spatiale marine, les opérations et les protocoles d’intervention en cas d’urgence environnementale, les processus de certification du Marine Stewardship Council, les réseaux d’aires marines protégées et l’évaluation de risque écologique.Ces ensembles de données ont été filtrés pour respecter la politique relative à la protection des renseignements personnels du gouvernement du Canada. Des évaluations sur la confidentialité ont été menées afin de déterminer les zones unitaires de l’OPANO qui contiennent des données ayant moins de cinq identifications de navires, de permis ou de pêcheurs. Si ce seuil n’était pas atteint, les emplacements et le poids des prises ont été retenus de ces zones unitaires pour protéger l'identité ou l'activité des navires ou entreprises individuels.Des cartes ont été créées pour les espèces, les groupes d’espèces et les types d'engins suivants :1. Poisson de fond (toutes les espèces)2. Chalut de fond pour le poisson de fond3. Filet maillant pour le poisson de fond4. Palangre de fond pour le poisson de fond5. Poisson de fond (périodes trimestrielles T1, T2, T3, T4)6. Morue7. Morue, aiglefin, goberge8. Poisson plat9. Flétan de l'Atlantique10. Flétan du Groenland11. Myxine12. Brosme13. Chien de mer14. Sébaste15. Merluche-écureuil16. Merlu argenté17. Merluche blanche18. Baudroie19. Chabot20. Raie21. Loup de mer22. Calmar23. Hareng24. Maquereau25. Grands poissons pélagiques26. Thon rouge27. Autres thons28. Espadon29. Maraîche, requin-taupe bleu et requin bleu30. Crabe des neiges31. Autres crabes32. Pétoncle33. Pétoncle (composites trimestriels T1, T2, T3, T4)34. Palourde hauturière35. Crevette36. Homard hauturier37. Homard de la zone litigieuse38. Buccin

Statistiques de l'inventaire des forêts des zones verte et blanche du Manitoba pour le Rapport quinquennal sur l'état de la foresterie 2016-2021.Statistiques de l'inventaire des forêts des zones verte et blanche du Manitoba pour le Rapport quinquennal sur l'état de la foresterie 2016-2021. Cet ensemble de données est utilisé dans le manuel Insights de la carte récit du Rapport quinquennal sur l'état de la foresterie du Manitoba, 2016-2021.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**

Ces couches de données montrent les débarquements par poids des prises issues de la pêche commerciale en tenant compte des pêches dirigées et des prises accessoires pour la plate-forme Néo-Écossaise, la baie de Fundy et le banc de Georges des divisions 4VWX de l'Organisation des pêches de l'Atlantique Nord-Ouest (OPANO) et les portions canadiennes des divisions 5Y et 5Z. Les cartes composites sur cinq ans (2019 à 2023) qui regroupent les prises pour chaque série de cartes sont accessibles au public. Les cartes incluent le poids des prises (en kilogrammes) par cellule de carte quadrillée hexagonale de 10 km2 pour les espèces ou les groupes d’espèces choisis et les types d’engins afin de cibler les zones de pêche importantes. Elles peuvent soutenir la prise de décision relativement à la gestion des côtes et des océans, notamment la planification spatiale marine, les opérations et les protocoles d’intervention en cas d’urgence environnementale, les processus de certification du Marine Stewardship Council, les réseaux d’aires marines protégées et l’évaluation de risque écologique.Les emplacements de prises reportés peuvent présenter des coordonnées arrondies ou contenir des erreurs. Bien que certaines erreurs ont été corrigées, il est probable que d'autres erreurs subsistent dans les données.Ces ensembles de données ont été filtrés pour respecter la politique relative à la protection des renseignements personnels du gouvernement du Canada. Des évaluations sur la confidentialité ont été menées afin de déterminer les zones unitaires de MPO qui contiennent des données ayant moins de cinq identifications de navires, de permis ou de pêcheurs. Si ce seuil n’était pas atteint, les emplacements et le poids des prises ont été retenus de ces zones unitaires pour protéger l'identité ou l'activité des navires ou entreprises individuels.Des cartes ont été créées pour les espèces, les groupes d’espèces et les types d'engins suivants :1. Poisson de fond (toutes les espèces)2. Chalut de fond pour le poisson de fond3. Palangre de fond pour le poisson de fond4. Filet maillant pour le poisson de fond5. Poisson de fond (périodes trimestrielles)6. Morue7. Morue, aiglefin, goberge8. Poisson plat9. Flétan de l'Atlantique10. Flétan du Groenland11. Myxine12. Brosme13. Chien de mer14. Sébaste15. Merluche-écureuil16. Merlu argenté17. Merluche blanche18. Baudroie19. Chabot20. Raie21. Loup de mer22. Calmar23. Hareng24. Maquereau25. Filets maillants pour hareng et maquereau26. Senne coulissante27. Grands poissons pélagiques28. Thon rouge29. Autres thons30. Espadon31. Crabe des neiges32. Autres crabes33. Pétoncle34. Pétoncle (composites trimestriels)35. Palourde hauturière36. Chalut à crevettes37. Casier à crevette38. Homard hauturier39. Homard de la zone litigieuse40. Buccin