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Polygones détaillés de la cartographie du bioterrain (TBT) avec vue spatiale sous forme de table attributaire courte
Bioterrain (TBT) contient des polygones dotés d'attributs clés et d'attributs fusionnés (concaténés) dérivés des attributs standard du RISC (Resource Inventory Standards Committee). Le TBT divise le paysage en unités à l'aide du système de classification du terrain de la Colombie-Britannique et de critères écologiques. Les attributs des polygones incluent (sans toutefois s'y limiter) les matériaux de surface, l'expression de la surface, les processus géomorphologiques, la classe de drainage et l'aspect. Les méthodes TBT comprennent l'interprétation manuelle de photos aériennes appuyée par une vérification sélective sur le terrain. La cartographie du bioterrain fait partie intégrante de la cartographie des écosystèmes et de ses produits dérivés. Cette couche est dérivée de la couche STE_TEI_ATTRIBUTE_POLYS_SP en filtrant sur l'attribut PROJECT_TYPE. Les types de projets incluent : TEM, TEMNSS, TEMPRE, TEMSEI, TEMSET, TEMTSM, TBS, TBT, TEMWHR, TEMSDM, TEMPRW et TEMSEW. Version actuelle : v11 (publiée le 03/10/2024) Versions précédentes : v10 (publiée le 14/11/2020), v9 (publiée le 01/05/2021), v8 (publiée le 01/09/2016)** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Limites du projet de cartographie du terrain (TER)
Les limites du projet de cartographie du terrain (TER) contiennent (zones d'étude) et des attributs décrivant chaque projet (métadonnées au niveau du projet), ainsi que des liens vers les emplacements d'autres données associées au projet (par exemple, des rapports, des ensembles de données polygonales, des fichiers graphiques, des légendes) pour les projets d'inventaire du terrain, de bioterrain et de cartographie de la stabilité du terrain. Le TER divise le paysage en unités en fonction des matériaux de surface, du relief et des processus géomorphologiques à l'aide du système de classification des terrains de la Colombie-Britannique. Cette couche est dérivée de la couche STE_TEI_PROJECT_BOUNDARIES_SP en filtrant sur l'attribut PROJECT_TYPE. Les types de projets incluent : TEM, TEMNSS, TEMPRE, TEMSEI, TEMSET, TEMTSM, TSM, TSMREC, TSMDET, TIM, TBS, TBT, TIMSOI, TEMWHR, TEMSDM, TEMPRW, NEMPRW et TEMSEW. Version actuelle : v11 (publiée le 03/10/2024) Versions précédentes : v10 (publiée le 14/11/2020), v9 (publiée le 01/05/2021), v8 (publiée le 01/09/2016)** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur MiFish (12S)
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a
Lignes de biobandage Shorezone
Les lignes de biobandage de la zone côtière sont une représentation linéaire des différents types de biotes (flore et faune) et de leur distribution, ou de leur absence, présents dans l'unité côtière.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Coleophora laricella
Découvertes historiques de Coleophora laricella
Gilpinia hercyniae
Découvertes historiques de Gilpinia hercyniae
Pristiphora geniculata
Découvertes historiques de Pristiphora geniculata
Données sur les débarquements dans le cadre de tournois de pêche récréative au requin et base de données canadienne sur les étiquettes-aiguillons
Ces données sont constituées de la base de données sur les débarquements dans le cadre de tournois de pêche récréative au requin (de 1993 à 2022 inclusivement) et de la base de données canadienne sur les étiquettes-aiguillons (à partir de 2006; mise à jour annuelle). Les deux ont été recueillies par la Division des sciences de la région des Maritimes de Pêches et Océans Canada. Les enregistrements des débarquements comprennent l’échantillonnage biologique de 4 266 animaux et les enregistrements d’étiquettes-aiguillons comprennent 4 138 marquages et 97 recaptures à ce jour. Les utilisateurs potentiels devraient consulter Bowlby et al. (2022) pour obtenir la description, l’historique de gestion et les détails techniques de ces données. Les données portent principalement sur le requin bleu parce qu’il s’agit de la principale espèce capturée dans le cadre des tournois récréatifs.Citer ces données comme suit:Bowlby, H., Joyce, W. Données sur les débarquements dans le cadre de tournois de pêche récréative au requin et base de données canadienne sur les étiquettes-aiguillons. Publié en janvier 2023. Division de l’écologie des population, Pêches et Océans Canada, Dartmouth (Nouvelle-Écosse). https://open.canada.ca/data/en/dataset/4309f1f7-6779-416d-9660-c02f0f99b482
Biodiversité de l'épifaune benthique du relevé au chalut du programme KEBABB (2021)
Cette ressource documente un jeu de données sur les occurrences d’épifaune collectées en 2021 dans le cadre du programme KEBABB (Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Baffin Bay) développé par Pêches et Océans Canada (MPO) en collaboration avec des partenaires universitaires. L’objectif général du programme KEBABB est de caractériser la variabilité et les tendances des conditions océanographiques physiques, chimiques et biologiques et des réseaux trophiques soutenant les pêches dans les écosystèmes de l’ouest de la baie de Baffin et du détroit de Lancaster. En 2021, le MPO a étendu le programme KEBABB au détroit de Barrow (KEBABS-Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Barrow Strait), une zone productive clé de l’aire marine nationale de conservation de Tallurutiup Imanga. L’étude a eu lieu dans l’Arctique canadien de l’Est (principalement dans la baie de Baffin, détroit de Davis et détroit de Barrow). L’échantillonnage est effectué le long de transects à des stations fixes dans la zone d’étude. Les prises sont collectées avec un chalut Agassiz de 3 m (filet à mailles internes de 5 mm) pendant 3 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 1.5 nœuds et avec un chalut à perche benthique de 3 m (filet à mailles internes de 6.4 mm) pendant 15 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 3 nœuds. Un total de 16 stations ont été échantillonnées pour l’épifaune en 2021 entre 85 et 850 m. Les invertébrés épibenthiques sont identifiés au niveau taxonomique le plus bas possible et photographiés. Tous les spécimens inconnus sont congelés. En laboratoire, les identifications sont validées ou précisées avec les photos et les spécimens congelés.Les données sont présentées en format Darwin Core et sont séparées en deux fichiers :Le fichier “Activité_épifaune_KEBABB_epifauna_event_fr” qui contient les informations des missions, des stations et des déploiements, qui sont présenté sous une structure d’activité hiérarchique.Le fichier “Occurrence_épifaune_KEBABB_epifauna_fr” qui contient les occurrences taxonomiques.De plus amples détails sur l’échantillonnage se trouvent dans le rapport suivant : Pućko, M., Charette, J., Tremblay P., Brulotte S., St-Denis B., Ciastek S., Hedges, K., Kuzyk, Z., Roy V., and Michel, C. 2022. An ecosystem-based approach in the eastern Arctic: KEBABB/S (Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Baffin Bay/Barrow Strait) 2021 expedition report. Can. Manuscr. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3250: viii + 58 p. https://publications.gc.ca/collections/collection_2022/mpo-dfo/Fs97-4-3250-eng.pdfLIMITATION DE L’UTILISATION :Pour assurer l’intégrité scientifique et l’utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.
Profenusa thomsoni
Découvertes historiques de Profenusa thomsoni
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