OBJECTIF :La chlorophylle a est un pigment photosynthétique commun aux algues aquatiques, et sa mesure peut fournir une estimation de l’abondance des algues flottant librement dans un système aquatique. Depuis plus de 40 ans, le bureau de Pêches et Océans Canada – Laboratoire des Grands Lacs pour les pêches et les sciences aquatiques (MPO-LGLPSA) à Sault Ste. Marie (Ontario) recueille des échantillons d’eau afin d’effectuer une analyse spectrophotométrique de la chlorophylle a, produisant des données sous forme de mg/m3. La collecte de données sur la chlorophylle a a généralement été effectuée pour aider à caractériser le niveau de productivité primaire des systèmes aquatiques, car cela peut influer sur l’abondance des poissons. Il s’agissait d’une mesure supplémentaire de la qualité de l’habitat du poisson dans ces systèmes qui servira à divers projets liés au poisson pertinents au mandat du MPO. L’uniformité de la collecte des données dépendait de la durée de chaque projet et du financement disponible. DESCRIPTION :L’étude initiale a permis de recueillir des données sur la chlorophylle a des cinq lacs du bassin des lacs Turkey (BLT – nord et sud des lacs Batchawana, lac Wishart, lac Little Turkey et lac Turkey) ainsi que du lac Quinn, qui est situé à l’extérieur du BLT (voir Smokorowski et coll., 2006) en partenariat avec Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) et Ressources naturelles Canada (RNCan) dans le cadre de l’Initiative canadienne sur les pluies acides. On a entrepris l’étude du bassin du BLT en 1979 pour évaluer les répercussions des pluies acides sur les écosystèmes terrestres et aquatiques. Cet ensemble de données comprend des données sur la chlorophylle a recueillies dans cinq lacs du BLT et le lac Quinn (données également recueillies par le Service canadien de la faune et ECCC) de 1983 à 2010, y compris quelques lacunes de durée variable (Webster et coll., 2021). Il convient de souligner qu’une destruction expérimentale de l’habitat a eu lieu dans certains lacs du BLT et dans le lac Quinn en 1999 et 2000. Plus précisément, à l’automne 1999, 50 % des matériaux ligneux grossiers ont été enlevés des rives des lacs Little Turkey et Quinn, et à l’automne 2000, 50 % des matériaux ligneux grossiers ont été enlevés des rives du lac Wishart (détails dans Smokorowski et coll. 2006). Sommaire des méthodes : L’échantillonnage n’a été effectué que pendant la saison des eaux libres, et la fréquence et l’étendue de la fréquence d’échantillonnage dans chaque plan d’eau varient en fonction du projet et du financement. Il n’y a pas de données sur la chlorophylle a pour les années 1986, 1989-1990, 1996-1997, 2006-2007 et 2009.L’échantillonnage a été réalisé en rinçant sur place, au moins trois fois, des bouteilles en polyéthylène brun opaque de 1 L nettoyées. Pour les échantillons prélevés à la main, la bouteille a été immergée sous la surface (moins de 0,5 mètre) pour prélever l’échantillon. Des échantillons dans des tubes composites ont été prélevés à l’aide d’un tube d’échantillonnage d’eau intégré recueillant de l’eau de l’épilimnion de toute la colonne d’eau jusqu’à une profondeur de cinq mètres. Jusqu’à cinq échantillons de 1 L (1 000 ml) ont été prélevés par station et envoyés au laboratoire sur glace. Chaque échantillon de 1 litre a été filtré au moyen de filtres en fibre de verre (Whatman GF/C de 42,5 mm) dans le jour suivant l’échantillonnage, puis congelé avant l’analyse standard de la chlorophylle a (American Public Health Association [APHA] 1985). De 1983 à 1998, les concentrations de chlorophylle a (mg/L) ont été calculées sur la base de la méthode de l’APHA de 1985; de 1998 à aujourd’hui, le calcul est basé sur la méthode de l’APHA de 1998. Les renseignements de l’ensemble de données d’échantillonnage comprennent les géoréférences des emplacements d’échantillonnage, les données brutes pour les calculs de chlorophylle a et les concentrations de chlorophylle a calculées à l’aide des méthodes APHA (1985) et APHA (1998). Cet ensemble de données a été publié en partenariat avec le Projet Living Data de l'institut canadian d'écologie et d'évolution, qui a été financée par un subvention de financement du Programme FONCER du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada. Nous tenons à remercier Caroline Dallstream pour ses efforts dans la publication de cet ensemble de données. MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :Sommaire des méthodes : L’échantillonnage n’a été effectué que pendant la saison des eaux libres, et la fréquence et l’étendue de la fréquence d’échantillonnage dans chaque plan d’eau varient en fonction du projet et du financement. Il n’y a pas de données sur la chlorophylle a pour les années 1986, 1989-1990, 1996-1997, 2006-2007 et 2009.L’échantillonnage a été réalisé en rinçant sur place, au moins trois fois, des bouteilles en polyéthylène brun opaque de 1 L nettoyées. Pour les échantillons prélevés à la main, la bouteille a été immergée sous la surface (moins de 0,5 mètre) pour prélever l’échantillon. Des échantillons dans des tubes composites ont été prélevés à l’aide d’un tube d’échantillonnage d’eau intégré recueillant de l’eau de l’épilimnion de toute la colonne d’eau jusqu’à une profondeur de cinq mètres. Jusqu’à cinq échantillons de 1 L (1 000 ml) ont été prélevés par station et envoyés au laboratoire sur glace. Chaque échantillon de 1 litre a été filtré au moyen de filtres en fibre de verre (Whatman GF/C de 42,5 mm) dans le jour suivant l’échantillonnage, puis congelé avant l’analyse standard de la chlorophylle a (American Public Health Association [APHA] 1985). De 1983 à 1998, les concentrations de chlorophylle a (mg/L) ont été calculées sur la base de la méthode de l’APHA de 1985; de 1998 à aujourd’hui, le calcul est basé sur la méthode de l’APHA de 1998. Les renseignements de l’ensemble de données d’échantillonnage comprennent les géoréférences des emplacements d’échantillonnage, les données brutes pour les calculs de chlorophylle a et les concentrations de chlorophylle a calculées à l’aide des méthodes APHA (1985) et APHA (1998).LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

Cet ensemble de données accompagne l’article accessible à tous intitulé « Improving satellite chlorophyll-a retrieval in the turbid waters of the Bay of Fundy, Canada », publié dans Estuaries and Coasts (https://doi.org/10.1007/s12237-024-01334-x). Une description complète des méthodes est fournie dans l’article. En bref, nous avons traité les données satellitaires quotidiennes du MODIS (spectroradiomètre imageur à résolution moyenne) du satellite Aqua de 2003 à 2021 à une résolution de 300 m afin de comprendre et de quantifier les tendances spatiales et temporelles de la concentration de chlorophylle a (chl a, une mesure de la biomasse du phytoplancton), et la concentration de matières particulaires en suspension (MPS) dans les eaux de surface de la baie de Fundy. Cet ensemble de données fournit la climatologie annuelle et saisonnière médiane de la chl a (mg m-3) et des MPS (g m-3) de 2003 à 2021 en sous forme de couches GeoTIFF. Les saisons sont définies comme suit : hiver (janvier à mars), printemps (avril à juin), été (juillet à septembre) et automne (octobre à décembre). La chl a a été calculée avec l’algorithme OCX-SPMCor et MPS a été calculé avec l’algorithme de Nechad et al. 2010.Citer ces données comme suit: Wilson, K., Hilborn, A., Clay, S., Devred, E. Données de: Concentrations de chlorophylle a de surface et de matières particulaires en suspension obtenues par satellite dans la baie de Fundy de 2003 à 2021: Date de publication: Février 2024. Secteur des sciences des écosystèmes et des océans, Pêches et Océans Canada, Dartmouth (Nouvelle-Écosse). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/272f5cf1-52bb-416b-b92a-8bc9384fc24d

Série temporelle de la concentration de chlorophylle-a (mg/m2) aux 3 stations fixes et aux 46 stations, positionnées le long des sections, du Programme de Monitorage de la Zone Atlantique (PMZA) sous la responsabilité de la région du Québec. Les données de chlorophylle-a intégrées (0-100 m) des dix dernières années ont été moyennées et présentées en 2 couches soit une couche représentant les données du relevé estival effectué en juin (2013-2022, 2020 non échantillonné) et une autre couche représentant les données du relevé d'automne (2013-2022). Finalement, une troisième couche présente les positions des stations fixes du programme (Gyre Anticosti, Courant de Gaspé et Rimouski).Chaque station est liée à un fichier .png qui affiche les graphiques des données intégrées par année et à un fichier .csv qui contient toutes les données de chlorophylle-a intégrées recueillies à la station depuis le début de l'échantillonnage (colonnes : Station, Latitude, Longitude, Date(UTC), Sounding(m), Depth_min/Profondeur_min(m), Depth_max/Profondeur_max(m), Integrated_chlorophyll-a/Chlorophylle-a_intégrée(mg/m²)).ObjectifLe Programme de Monitorage de la Zone Atlantique (PMZA) a été mis sur pied en 1998 dans le but d’augmenter la capacité du Ministère de Pêches et Océans Canada (MPO) de détecter, suivre et prévoir les changements de productivité et d’état du milieu marin.Le PMZA recueille des données à partir d’un réseau de stations constitué de sites de monitorage à fréquence élevée et de stations regroupées en sections dans chacune des régions du MPO suivantes : Québec, Golfe, Maritimes et Terre-Neuve. Le plan d’échantillonnage fournit l’information de base sur la variabilité naturelle des propriétés physiques, chimiques et biologiques du Plateau continental du nord-ouest de l'atlantique. L'échantillonnage le long des sections fournit de l’information géographique détaillée mais il est limité à une couverture saisonnière alors que les sites de monitorage situés dans un endroit stratégique et échantillonnés régulièrement fournissent de l’information plus détaillée sur les changements temporels dans les propriétés des écosystèmes.Dans la région du Québec, deux relevés (46 stations regroupées en sections) sont effectués chaque année, un en juin et l’autre à l’automne dans l’estuaire et le golfe du Saint-Laurent. Historiquement, 3 stations fixes ont été échantillonnées plus fréquemment dont la station Rimouski qui fait toujours partie du programme et qui est échantillonnée environ une fois par semaine en saison estivale et de façon occasionnelle en période hivernale.Des rapports annuels (physique, biologique et un Avis scientifique zonal) sont disponibles auprès du Secrétariat canadien de consultation scientifique (SCCS), (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/index-fra.htm).Devine, L., Scarratt, M., Plourde, S., Galbraith, P.S., Michaud, S., and Lehoux, C. 2017. Chemical and Biological Oceanographic Conditions in the Estuary and Gulf of St. Lawrence during 2015. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Res. Doc. 2017/034. v + 48 pp. Information additionnelleL'échantillonnage de l'eau servant à l'analyse de la chlorophylle-a (méthode Welschmeyer 1994) se fait à partir de bouteilles Niskin selon le protocole d'échantillonnage du PMZA: Mitchell, M. R., Harrison, G., Pauley, K., Gagné, A., Maillet, G., and Strain, P. 2002. Atlantic Zonal Monitoring Program sampling protocol. Can. Tech. Rep. Hydrogr. Ocean Sci. 223: iv + 23 pp.

Description:La concentration de chlorophylle-a (un indicateur de la biomasse du phytoplancton) a été tirée du MODIS sur le satellite Aqua; les données ont été distribuées par l’Ocean Biology Processing Group de la NASA, puis la valeur moyenne a été calculée en composites climatologiques mensuels. Les données couvrent les années 2003 à 2020 et ce dossier comprend des données à une résolution de 4 km.Méthodes :Les données du MPIDO-Aqua sur la chlorophylle-a (Chl-a) ont été acquises auprès du Ocean Biology Processing Group de la NASA au niveau de traitement 3 (version 2018), avec une résolution de 4 km; la concentration de Chl-a a été calculée selon la méthode OC3/OCI. Les mois de janvier et décembre ont été exclus de cet ensemble de données, car les données des mois d’hiver aux latitudes plus élevées sont manquantes en raison du faible angle du soleil, qui empêchait l’acquisition. On a calculé la valeur moyenne géométrique mensuelle de tous les pixels pour chaque année, puis la moyenne géométrique et le facteur d’écart-type géométrique de la chlorophylle-a, par mois, à partir de ces images. Ces méthodes de calcul de la moyenne et de l’écart-type ont été choisies en raison de la distribution log-normale de la chlorophylle-a. L’écart-type géométrique est un facteur sans unité, dont la limite inférieure est le rapport de la moyenne géométrique et de l’écart-type géométrique, et la limite supérieure est la multiplication des deux. En plus de la moyenne géométrique et du facteur d’écart-type géométrique, on a calculé le nombre d’occurrences de données valides à chaque pixel sur la période d’observation. Les pixels ayant moins de deux occurrences sur toute la période d’observation ont été retirés de ces cartes, et leur valeur définie à NaN dans les fichiers tif. Toutes les trames obtenues ont été recadrées à la zone économique exclusive canadienne et assignées au système de référence des coordonnées géographiques NAD83 (EPSG:4269), et ont une résolution finale en pixels d’environ 0,0417 degré. La moyenne géométrique mensuelle, le facteur d’écart-type géométrique mensuel et le nombre d’occurrences pour tous les pixels sont fournis.Sources de données :NASA Ocean Biology Processing Group. (2017). MODIS-Aqua Level 2 Ocean Color Data Version R2018.0. NASA Ocean Biology Distributed Active Archive Center. https://doi.org/10.5067/AQUA/MODIS/L2/OC/2018Incertitudes:Les valeurs obtenues par satellite ont été évaluées en fonction de jeux de données mondiaux et de jeux de données d’échantillons dans la région du Pacifique (voir les références). Cependant, des incertitudes sont engendrées lors du calcul groupé de la moyenne des images au fil du temps, car chaque pixel présente un nombre différent d’observations. Des événements de courte durée ou limités dans l’espace peuvent ne pas être pris en compte.

Description:La concentration de chlorophylle-a (un indicateur de la biomasse du phytoplancton) a été tirée du MODIS sur le satellite Aqua; les données ont été distribuées par l’Ocean Biology Processing Group de la NASA, puis la valeur moyenne a été calculée en composites climatologiques mensuels. Les données couvrent les années 2003 à 2020 et ce dossier comprend des données à une résolution de 1 km.Méthodes :Les données du MPIDO-Aqua sur la chlorophylle-a (Chl-a) ont été acquises auprès du Ocean Biology Processing Group de la NASA au niveau de traitement 2 (version 2018), avec une résolution de 1 km; la concentration de Chl-a a été calculée selon la méthode OC3/OCI. Les mois de janvier et décembre ont été exclus de cet ensemble de données, car les données des mois d’hiver aux latitudes plus élevées sont manquantes en raison du faible angle du soleil, qui empêchait l’acquisition. Les pixels ont été alignés sur une grille régulière en utilisant le programme SeaDAS, après quoi la moyenne géométrique mensuel de la valeur de tous les pixels a été calculé pour les années. Enfin, la moyenne géométrique et le facteur d’écart-type géométrique de la chlorophylle-a, par mois, à partir de ces images. Ces méthodes de calcul de la moyenne et de l’écart-type ont été choisies en raison de la distribution log-normale de la chlorophylle-a. L’écart-type géométrique est un facteur sans unité, dont la limite inférieure est le rapport de la moyenne géométrique et de l’écart-type géométrique, et la limite supérieure est la multiplication des deux. En plus de ces variables, on a calculé le nombre d’occurrences de données valides à chaque pixel sur la période d’observation. Les pixels ayant moins de deux occurrences sur toute la période d’observation ont été retirés de ces cartes, et leur valeur définie à NaN dans les fichiers tif. Quelques petits écarts entre les pixels (près de la bordure des images individuelles) ont été remplis en utilisant la valeur médiane de entourant les pixels, il y avait plus de quatre valeurs. Toutes les trames obtenues ont été recadrées à la zone économique exclusive canadienne et assignées au système de référence des coordonnées géographiques NAD83 (EPSG:4269), et ont une résolution finale en pixels d’environ 0,01 degré. La moyenne géométrique mensuelle, le facteur d’écart-type géométrique mensuel et le nombre d’occurrences pour tous les pixels sont fournis.Sources de données :NASA Ocean Biology Processing Group. (2017). MODIS-Aqua Level 2 Ocean Color Data Version R2018.0. NASA Ocean Biology Distributed Active Archive Center. https://doi.org/10.5067/AQUA/MODIS/L2/OC/2018Incertitudes:Les valeurs obtenues par satellite ont été évaluées en fonction de jeux de données mondiaux et de jeux de données d’échantillons dans la région du Pacifique (voir les références). Cependant, des incertitudes sont engendrées lors du calcul groupé de la moyenne des images au fil du temps, car chaque pixel présente un nombre différent d’observations. Des événements de courte durée ou limités dans l’espace peuvent ne pas être pris en compte.

Cet ensemble de donnees comprend des donnees sur les lieux d'echantillonnage, la chimie de l'eau et la chlorophylle provenant de 18 endroits du bassin des Grands Lacs et du fleuve Saint-Laurent et de 4 endroits du lac Simcoe.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **

Cet enregistrement contient des images de la concentration en chlorophylle-a mesurée par satellite dans la mer de Beaufort canadienne à une résolution de 1.1 km. Le jeu de données est composé de 276 images, agrégées en composites de deux semaines, en calculant la valeur moyenne à chaque pixel, pour les années 1998 à 2020.La série temporelle des données couvre deux capteurs de couleur de l'océan: MODIS-Aqua et SeaWiFS. L'algorithme «Arctic Ocean Empirical» a été utilisé pour calculer la concentration en chlorophylle-a, après que les images aient été corrigées des effets atmosphériques en utilisant l'algorithme de commutation NIR-SWIR et que la réflectance de télédétection (Rrs) ait été produite. Une transformation linéaire dans l'espace log-10 a été appliquée à la concentration en chlorophylle-a mesurée par SeaWiFS pour améliorer sa corrélation avec la chlorophylle-a mesurée par MODIS-Aqua.Les mois d'octobre à février ont été exclus de cet ensemble de données car l'angle du soleil en hiver est trop faible (ex., nuit polaire) pour que des données fiables puissent être acquises, et la région est principalement couverte de glace de mer. Pour plus de détails, voir Galley et al. 2022.

Une série chronologique de la fluorescence de la chlorophylle a été recueilli en différents emplacements autour de la côte de l'île de Vancouver, en Colombie-Britannique (C.-B.), au Canada, afin de surveiller les concentrations de phytoplancton. Un fluorimètre Wetlabs ECO a été déployé à des intervalles de temps de quelques mois selon un calendrier en fonction de la saison et de la disponibilité du capteur. L'instrument est suspendu par une chaîne fixée sur le côté de la bouée ou à un quai, selon l'emplacement, et prenait des mesures de la chlorophylle en utilisant une émission de fluorescence à 695 nm. L'instrument mesurait également la turbidité en détectant la lumière dispersée à 700 nm. Les unités étaient munies de batteries internes et permettaient le stockage des données; elles étaient programmées pour prendre un groupe de cinq mesures toutes les 30 minutes. Un tampon de nettoyage en cuivre couvrait la fenêtre d'échantillonnage entre les groupes de mesure afin de réduire les salissures marines. À moins d'indication contraire, toutes les heures sont exprimés en temps universel coordonné (UTC).

Cet ensemble de données comprend des données sur la composition chimique de l’eau recueillies dans cinq des six lacs du projet NOLSS en 1987 et en 1990 : espèces d’azote et de phosphore, carbone, chlorophylle a, conductivité, silice réactive soluble, chlorure, sulfate, conductivité, sodium, potassium, magnésium, calcium, pH, alcalinité et acides organiques.

Le programme de surveillance du lac Simcoe mesure les limites chimiques et physiques de la qualite de l'eau, comme le phosphore total, l'azote, la chlorophylle a, le pH, l'alcalinite, la conductivite, le carbone organique et inorganique dissous, le silice, les autres ions, la transparence, la temperature et l'oxygene dissous. Des echantillons d'eau sont preleves toutes les deux semaines au printemps, en ete et en automne.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **