Le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada appuie la collecte de données écologiques sur l’état actuel des principaux écosystèmes côtiers du Canada. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base (physiques, chimiques et biologiques) qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins. À partir de cette page, vous trouverez des liens pour les données recueillies par des projets qui ont eu lieu dans six zones côtières au Canada entre 2018 et 2022.

Le Programme sur les données environnementales côtières de référence est une initiative pluriannuelle de Pêches et Océans Canada qui vise à recueillir des données sur le milieu côtier à une série d’emplacements d’un océan à l’autre au Canada en vue de développer une meilleure compréhension des conditions écologiques marines, et ce, en collaboration avec des communautés autochtones et locales ainsi que d’autres intervenants clés. Le programme a commencé la collecte de données en 2019 et, avec le début de la phase 2 en 2023, la zone d’étude de la région des Maritimes a été élargie et renommée « côtes nord-ouest de la baie de Fundy ». On a conçu un programme d’océanographie physique pour répondre aux intérêts océanographiques et aux besoins en matière de données des détenteurs d’intérêts locaux. À partir de 2023, les paramètres océanographiques, y compris la température, la salinité, la profondeur et la turbidité de l’eau, ont fait l’objet d’une surveillance dans une série d’emplacements de la baie Passamaquoddy, de la rivière Sainte-Croix et le long de la côte de la baie de Fundy, y compris la zone de protection marine (ZPM) de l’estuaire de la Musquash. Cet ensemble de données comprend les données saisonnières sur la CTP (conductivité, température et profondeur) et la turbidité à compter du printemps 2023. Les instruments font l’objet d’un entretien pendant les mois d’hiver dans un nombre limité d’emplacements. Les méthodes de collecte des données sont composées principalement d’instruments amarrés au fond à des profondeurs de 5 à 90 mètres, et de quelques flotteurs flottants en surface. Dans l’ensemble, cet ensemble de données permet de saisir la dynamique saisonnière des milieux marins littoraux dans la baie Passamaquoddy, la rivière Sainte-Croix, la baie de Fundy et la ZPM de la Musquash. Citer ces données comme suit : Programme de base pour l'environnement côtier (Région des Maritimes), données sur la conductivité, la température et la profondeur de la côte nord-ouest de Fundy. Publié en Mai 2025. Programme de base pour l'environnement côtier. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews, N.-B. 14-02-2025

Ce projet a été mené à bien par le Programme sur les données environnementales côtières de référence (Section de l’écologie côtière et des eaux douces) de la Direction des sciences des Pêches et des Océans (MPO) de la région de Terre-Neuve-et-Labrador. De 2018 à 2022, des données biologiques et physiques de base ont été recueillies dans la baie Placentia à l’aide des protocoles du Programme de monitorage de la zone atlantique (PMZA) et de l’Expérience de productivité en milieu océanique froid (EPMOF). Des données complémentaires ont été recueillies dans la baie à l’aide de CTP amarrés. Dans la mesure du possible, l’échantillonnage a été effectué chaque mois à quatre sites entre mai et novembre afin de saisir les tendances spatiales et temporelles à grande échelle. De plus, des données ont été recueillies deux fois par semaine en avril et mai, et mensuellement de juin à septembre à l’un de ces sites pour saisir des tendances temporelles à plus grande échelle, comme les fleurs printanières, en collaboration avec C. McKenzie, Ph. D. Le phytoplancton a été prélevé à l’aide de remorques et de serviettes verticales. Le zooplancton a été recueilli à l’aide de remorques verticales. Les CTP ont été utilisés pour recueillir des données physiques et biogéochimiques sur la colonne d’eau, y compris la température, la pression, la salinité, la profondeur, la chlorophylle-a, la turbidité, l’oxygène dissous, le pH, le rayonnement actif photosynthétique (PAR), la matière organique dissoute fluorescente et la conductivité. Les données sur la biogéochimie de l’eau ont été obtenues en prélevant des échantillons d’eau à des profondeurs de 5, 10, 20, 30, 40 et 10 m au-dessus du fond pour mesurer les nutriments, la chlorophylle-a, les carbonates, les particules de carbone et d’azote organiques (POC/POA). De plus, des échantillons d’ADNe électronique ont été prélevés à chacun des 4 sites d’échantillonnage. Ce document contient l’emplacement géographique des sites et des renseignements sur le moment et le type de données recueillies à chaque site.

Le Programme sur les données environnementales côtières de référence est une initiative pluriannuelle de Pêches et Océans Canada qui vise à recueillir des données sur le milieu côtier à six emplacements uniques du Canada, notamment le port de Saint John (Nouveau-Brunswick), en collaboration avec des communautés autochtones et locales ainsi que d’autres intervenants clés. L’objectif global du Programme est de recueillir des données écologiques localisées à ces emplacements afin de développer une meilleure compréhension de base des conditions écologiques marines. La région des Maritimes a élaboré un projet relatif à l’océanographie physique qui cadre avec les intérêts et les besoins en matière de données des communautés et des intervenants locaux. Depuis 2020, on a recueilli des données sur la profondeur et la température des eaux de crue de la marée dans certaines zones intertidales à proximité du port de Saint John afin de caractériser la marée qui submerge les hauts marais ainsi que les fluctuations du niveau d’eau près de la chaussée de la baie Courtenay. La submersion des hauts marais a généralement lieu lors de marées de vives-eaux, tandis que le niveau d’eau de la baie Courtenay est influencé par des infrastructures anthropogéniques (p. ex. la chaussée, les vannes de marée). Les données liées à ce projet peuvent contribuer à diverses études, portant sur des sujets comme la vulnérabilité et la résilience côtières ou la morphodynamique des marais salés, grâce à la quantification de la fréquence, de l’amplitude et de la durée des inondations par les marées. Les données ont été recueillies au moyen d’enregistreurs de niveau d’eau de modèle HOBO (U20-001-02) qui ont été installés à l’intérieur de puits de mesurage fabriqués à partir de tuyaux ABS perforés d’une longueur de 15 po et d’un diamètre de 2¼ po. Les puits de mesurage ont été enfoncés dans le sol à une profondeur de 6 po. Un enregistreur de niveau d’eau a été suspendu à l’intérieur de chaque puits, près de l’ouverture, grâce à un boulon. L’enregistreur de niveau d’eau a été fixé à l’aide d’un fil métallique rigide de manière à ce que le volume de mesure soit au niveau du sol. Il était possible de retirer l’enregistreur facilement pour en extraire les données et de le replacer de manière exacte. Les données des enregistreurs ont été téléchargées deux ou trois fois par année et les appareils ont été retirés des puits pendant l’hiver. On a procédé à la compensation barométrique des données pour tenir compte de la pression atmosphérique changeante à l’aide d’un outil du logiciel HOBOware Pro (version 3.7.21) et de données sur la pression barométrique recueillies à un emplacement sec au cours de la période d’étude. Le niveau d’eau qui en résulte est consigné en mètres et se rapporte à la hauteur de l’enregistreur de niveau d’eau (c’est-à-dire au-dessus du niveau du sol).Citation: Température et niveau de l’eau intertidale du port de Saint John (2020-2022). Programme sur les données environnementales côtières de référence. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews, (N-B). XX-XX-2024

L’objectif de ce projet était de localiser les zones de mélange en milieu côtier sur la rive nord de l’estuaire maritime, qui sont occasionnées par la friction des eaux sur le fond et mesurer les effets de ces zones de mélange sur la modification des masses d’eau et sur le potentiel de productivité des zones adjacentes en utilisant la biomasse et la structure de taille du phytoplancton comme indicateur de productivité. Des transects de température et salinité à l’aide de CTD et des prises d’échantillons d’eau ont été effectuées à l’aide d’une bouteille Niskin pour tenter de déceler la signature du mélange et pour déterminer si les sels nutritifs et/ou la productivité sont plus grands dans les zones adjacentes. L’échantillonnage a eu lieu en 3 sorties de 3 stations organisées en transect de 100 N m qui ont été faites en début de saison (30 juin), mi-saison (16 août) et fin de saison (9 octobre). Les transects étaient chacun composés de trois stations allant de 10 m de profondeur plus près de la côte, jusqu’à 50 ou 75 m, selon le transect, en s’éloignant de la côte. Des échantillons ont été récoltés pour analyse de sels nutritifs et de biomasse de phytoplancton (> 0.7 µm et > 5µm) à des profondeurs de 1, 10, 25 et 50 m. La transparence optique de l’eau a aussi été mesurée par disque de Secchi. Le premier fichier fourni « donnees_profils_data » est un récapitulatif des profils CTD de chaque station. Le deuxième fichier « donnees_discretes_discret_data » contient les résultats des analyses des échantillons d’eau récoltés grâce aux bouteilles. Le fichier « Identification_station_identification » décrit la répartition des consécutives au travers des différentes stations.Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.

Ce projet a été mené à bien par le Programme sur les données environnementales côtières de référence (Section de l’écologie côtière et des eaux douces) de la Direction des sciences des Pêches et des Océans (MPO) de la région de Terre-Neuve-et-Labrador. De 2020 à 2023, trois cartouches amarrées ont été déployées et récupérées semestriellement dans la baie. De 2020 à novembre 2021, les CTP amarrés ont recueilli des enregistrements horaires de conductivité, de température et de pression. De 2021 à 2023, ces CTP ont recueilli des informations à l’année, toutes les heures, sur la température, la conductivité, la pression, l’oxygène dissous et la chlorophylle a. Les rejets acoustiques ont également recueilli des données horaires sur le bruit ambiant (NM). Ce document contient l’emplacement géographique des sites et des renseignements sur les dates et les types de données recueillies à chaque site.

Les programmes de surveillance sont une composante importante de la gestion des zones de protection marine (ZPM), car ils fournissent l’information requise sur l’état des écosystèmes protégés et sur les changements qui surviennent dans ceux-ci. Une surveillance est requise pour évaluer l’efficacité des ZPM par rapport à leurs objectifs de conservation et fournit les renseignements nécessaires pour évaluer les avantages que présente un accès restreint pour la biodiversité. Toutefois, pour la zone côtière de la Nouvelle-Écosse, il manque de données de référence, notamment sur la diversité des poissons et la structure des communautés dans les lits de macrophytes, ce qui rend la surveillance difficile. En 2017, les îles de la côte Est ont été désignées comme site d’intérêt en zone côtière pour l’établissement potentiel d’une ZPM. En 2018, un aperçu a été réalisé pour détailler les paramètres écologiques spatiaux et temporels du site d’intérêt. Ces renseignements ont révélé un écosystème côtier unique associé à un archipel dense et à un paysage marin relativement naturel. On a supposé que les habitats biogéniques de plantes et d’algues dans la zone abritaient une diversité d’espèces juvéniles de poissons. Le principal objectif de ce projet est d’entreprendre l’élaboration d’un programme à long terme de surveillance de la biodiversité dans les îles de la côte Est et d’autres zones côtières d’intérêt pour la planification de la conservation. Nous proposons de mettre en œuvre ce programme avec l’utilisation de méthodes d’échantillonnage direct (senne de plage, plongée en scaphandre autonome et échantillonnage d’isotopes stables) et indirect (ADN environnemental – ADNe). L’ADNe est un outil utile pour examiner la biodiversité marine de manière non invasive, à une petite échelle spatiale. L’ADNe peut être facilement recueilli et filtré, son séquençage devient de plus en plus rentable, et il peut constituer un outil utile pour la surveillance des zones de protection marine. Bien que l’ADNe donne généralement des résultats comparables aux techniques d’échantillonnage traditionnelles pour ce qui est des données sur la biodiversité recueillies, on sait peu de choses sur la façon dont les signaux de l’ADNe fluctuent au fil des ans (ou même des jours ou des semaines). Nous comparerons les détections d’espèces à l’aide du métacodage de l’ADNe aux relevés visuels (plongée en scaphandre autonome, senne) et au recensement des herbiers de zostères sur le littoral, pour fournir une base de référence et des séries chronologiques de la diversité des espèces sur lesquelles fonder le suivi à long terme. Ce projet permettra de dresser des inventaires des emplacements des herbiers de zostères et de la diversité des poissons et des invertébrés qu’ils renferment. Nous recueillons également des données sur la distribution de la longueur des poissons afin d’examiner les tendances saisonnières et interannuelles de la structure selon la taille au fil du temps. Les données générées par les échantillonnages directs et indirects fourniront un catalogue complet et continu de la diversité des espèces et de la structure des communautés dans les herbiers de zostères sur les côtes, en plus de permettre d’établir les meilleures pratiques pour l’échantillonnage de l’ADNe dans l’environnement côtier.Citer ces données comme: Jeffery, N.W., Pettitt-Wade, H., Van Wyngaarden, M., and Stanley, R.R.E. Programme de surveillance de la biodiversité côtière des Maritimes – senne de plage.Publié en Decembre 2023. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É). https://open.canada.ca/data/en/dataset/dbbcb23a-d018-4b70-b8ec-89997aded770

Ce projet a été mené à bien par le Programme sur les données environnementales côtières de référence (Section de l’écologie côtière et des eaux douces) de la Direction des sciences des Pêches et des Océans (MPO) de la région de Terre-Neuve-et-Labrador. La communauté de poissons et d’invertébrés de la côte a été échantillonnée annuellement dans la baie Placentia à 14 sites pendant 5 ans (de 2018 à 2022). L’objectif de ce programme était de recueillir des données sur les communautés et les habitats de poissons juvéniles (en particulier la morue de l’Atlantique) dans la baie Placentia. Les sites et le calendrier (octobre) ont été choisis en fonction de l’échantillonnage historique. Plusieurs types de données ont été recueillis au cours de chacune de ces excursions d’échantillonnage. L’ensemencement de la plage à bord d’un bateau a servi à recueillir des données sur la diversité, l’abondance, la répartition et la taille des poissons et des invertébrés. Des transects visuels ont été utilisés pour déterminer les types et les proportions de végétation et de substrat (habitat) aux sites de pêche à la senne. Les profils CTP (température, conductivité, profondeur et salinité) ont été obtenus à l’aide d’un CTP de dragage. Enfin, des échantillons d’ADN électronique ont été prélevés à chaque site (2018-2021) pour obtenir des renseignements complémentaires sur la présence de poissons juvéniles et d’autres espèces présentes. Ce document contient l’emplacement géographique des 14 sites et des renseignements sur le moment et le type de données recueillies à chaque site.

Le Programme sur les données environnementales côtières de référence est une initiative pluriannuelle de Pêches et Océans Canada qui est conçue pour recueillir, en collaboration avec des collectivités autochtones, d’autres collectivités locales et d’autres intervenants clés, des données environnementales côtières dans six sites pilotes répartis aux quatre coins du Canada (port de Vancouver, port de Prince Rupert, estuaire maritime du Saint-Laurent, port de Saint John, baie de Plaisance et Iqaluit). Le but du programme est de recueillir des renseignements locaux dans ces zones en vue de permettre une meilleure compréhension des conditions écologiques marines. La région des Maritimes a mis sur pied un programme d’océanographie physique pour répondre aux intérêts océanographiques et aux besoins en données des collectivités et parties intéressées locales, dans le but de présenter ces renseignements sous forme de données ouvertes. Depuis 2019, différents paramètres océanographiques, notamment la température, la salinité, la profondeur, la turbidité et les courants, sont mesurés de manière continue dans une série d’endroits couvrant un large éventail de milieux dans le port de Saint John et ses approches, notamment le cours inférieur de la rivière Saint-Jean et de la rivière Kennebecasis, des marais et des échancrures du littoral, ainsi que la zone de protection marine (ZPM) de l’estuaire de la Musquash. Cet ensemble de données inclut des mesures de la conductivité, de la température et de la profondeur obtenues depuis août 2019, auxquelles se sont ajoutés des capteurs de turbidité en 2020. Des méthodes variées sont utilisées pour recueillir les données : des instruments installés au fond de l’eau à des profondeurs de 10 à 50 mètres, des mouillages qui flottent en surface, ainsi que des instruments montés de façon rigide dans des zones d’estran. Les données intertidales s’interrompent lors de certaines marées basses où le niveau d’eau est plus bas que le capteur, ce qui entraîne une perte de fonctionnalité pendant des périodes d’une heure ou deux heures au plus. Dans l’ensemble, cet ensemble de données capte un équilibre dynamique entre l’eau salée et l’eau douce dans le cours inférieur de la rivière Saint-Jean, où les marées sont importantes, la dynamique saisonnière côtière de milieux marins situés près du rivage dans la ZPM de la Musquash, de même que les fluctuations constantes des ruisseaux et marais intertidaux.Mis à jour 2 - Avril 2025: données 2023-24 inclusesMis à jour 1 - Nnovembre 2023: inclut les données de 2022; suppression des erreurs d’heure d’été des données de 2019, 2020 et 2021; mise à jour de la position pour l’amarrage de surface d’Evandale.

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b