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Évaluation des méthodes de détermination des sites de surveillance en matière de détection précoce selon le caractère convenable des habitats pour le crabe vert, une espèce envahissante, dans la mer des Salish (Colombie-Britannique)
Dans le monde entier, le crabe vert est une espèce envahissante à haut risque qui peut dévaster les écosystèmes marins côtiers parce qu’il risque d’entraîner le déplacement des espèces indigènes, de causer la dégradation et la perturbation des habitats naturels (notamment les zostères) et de modifier les réseaux trophiques. Il a été récemment détecté dans la partie canadienne de la mer des Salish. À mesure que son établissement se poursuit dans la région, la détermination des endroits sur lesquels concentrer les ressources limitées de surveillance constitue un problème permanent, étant donné la grande quantité d’habitats côtiers qui pourraient être occupés par l’espèce. Diverses méthodes peuvent être utilisées pour déterminer les habitats hautement propices au crabe vert à des échelles spatiales variées. Cependant, aucune d’entre elles n’a été évaluée dans le contexte de la mise en place d’une gestion du crabe vert, pas plus que pour la partie canadienne de la mer des Salish. Nous évaluons ici cinq méthodes individuelles élaborées pour évaluer le caractère convenable des habitats pour le crabe vert (c.-à-d. le modèle MaxEnt, les modèles de régression stimulée par gradient linéaires et logistiques stochastiques, un outil de sélection rapide des sites et un outil d’évaluation et de classement qualitatif des sites) et cinq modèles dérivés générés par la multiplication des résultats de ces modèles individuels. Chaque modèle s’appuie sur des variables d’entrée environnementales et d’habitat légèrement différentes qui touchent les possibilités d’invasion par le crabe vert. Ainsi, plutôt que de déterminer un seul modèle privilégié, nous avons utilisé une approche d’ensemble multimodèles pour déterminer les sites qui devraient être les plus propices à l’espèce. L’approche d’ensemble accroît vraisemblablement le pouvoir prédictif, car elle inclut à la fois les caractéristiques de l’environnement et de l’habitat lors de la détermination des sites prioritaires pour la détection précoce ou la surveillance du crabe vert dans les eaux canadiennes de la mer des Salish. Enfin, nous décrivons comment les modèles évalués ici, seuls ou en combinaison, pourraient être utilisés pour déterminer des sites supplémentaires, soit dans la mer des Salish, soit dans de nouvelles zones.Cet ensemble de données contient la qualité de l'habitat prévue à partir de cinq modèles pour le crabe vert européen sur les plages de la mer des Salish (Colombie-Britannique, région du Pacifique).
Biodiversité du relevé du crabe des neiges au chalut dans la Baie de Ste-Marguerite, dans le golfe du Saint-Laurent (2006-2009)
Un relevé de recherche sur le crabe des neiges (Chionoecetes opilio) a été réalisé de mai 2006 à 2009 dans la Baie Sainte-Marguerite, près de Sept-îles, Québec. L’objectif principal de ce relevé était d’évaluer l’abondance du crabe des neiges et des espèces benthiques associées à l’habitat du crabe des neiges. Seules les données des espèces benthiques associées à l’habitat du crabe des neiges sont présentées dans ce jeu de données.Les données ont été récoltées selon un plan d'échantillonnage à stations fixes constitué de 79 stations, entre 7 et 198 mètres de profondeur. Les spécimens ont été récoltés à l’aide d’un chalut à perche. Le cul du chalut était doublé avec un filet de maille fines afin de récolter les petits individus. Les traits ont été réalisés pour une durée visée de 15 minutes. Les positions début et fin ont été notées pour calculer la distance parcourue à chaque trait à l'aide de la bibliothèque geosphere de R.Les deux fichiers fournis (format DarwinCore) sont complémentaires et sont reliés par la clé « IDactivité ». Le fichier «Information_activité» comprend les informations génériques de l'activité, notamment la date et la localisation. Le fichier «occurrence_taxon» comprend la taxonomie des espèces observées, identifiées à l’espèce ou au niveau taxonomique le plus bas possible. Pour obtenir l’évaluation de l’abondance et de la biomasse, communiquez avec Bernard Sainte-Marie (Bernard.Sainte-Marie@dfo-mpo.gc.ca).Pour les contrôles de qualité, tous les noms taxonomiques ont été vérifiés sur le registre mondial des espèces marines (WoRMS) pour correspondre aux normes reconnues. La correspondance WoRMS a été placée dans le champ « IDnomScientifique » du fichier d'occurrence. Les contrôles de la qualité des données ont été effectués à l'aide des bibliothèques R obistools et worrms. Tous les emplacements d'échantillonnage ont été validés spatialement.
Répartition du crabe dormeur à l’échelle de la côte
Cet ensemble de données contient deux couches géotiff. La première couche (1) représente la répartition du crabe dormeur à l'échelle de la côte, telle qu'elle est prédite à partir d'un modèle géostatistique. Le modèle prédit la probabilité moyenne de détection du crabe dormeur sur l'ensemble de la côte à l'aide d'engins d'échantillonnage piégeants. La deuxième couche (2) représente l'incertitude associée à ces prévisions. Des descriptions détaillées de ces produits de données se trouvent dans Nephin et al. (2023) et le code utilisé pour les produire est disponible à l'adresse suivante : https://gitlab.com/dfo-msea/dungeness-sdm/.Les objectifs de ce travail étaient de modéliser l'habitat du crabe dormeur (_Metacarcinus magister_), une espèce marine côtière limitée aux données, afin d'évaluer l'efficacité de l'intégration des données lorsqu'on fait des prévisions pour des zones géographiques plus vastes que la superficie couverte par une source de données. En Colombie-Britannique, le crabe dormeur est échantillonné à l'échelle régionale et sporadique à l'aide d'une variété d'engins d'échantillonnage et de protocoles de relevé, ce qui en fait une étude de cas idéale pour déterminer si l'intégration de relevés disparates peut améliorer les prévisions de l'habitat. À cette fin, nous rassemblons des données provenant de relevés de plongée, de chalut et de pièges appâtés afin de produire six modèles linéaires à effets mixtes candidats généralisés avec des champs aléatoires spatiaux. Cet ensemble de données contient la moyenne (1) et la différence (2) entre les prévisions du modèle d'enquête et de l'effet d'engrenage.
Probabilité de présence de crabes des neiges dans les zones pilotes de planification d’intervention localisée
Zones dans les zones du plan d’intervention de la baie de Fundy et de Port Hawkesbury où la présence du crabe des neiges est connue. La section de recherche sur l'océanographie et les écosystèmes côtiers (Sciences du MPO) a examiné les sources scientifiques et les connaissances locales pour évaluer et délimiter les zones où le crabe des neiges est présent de façon saisonnière. Depuis mars 2017, cet ensemble de données délimite la présence du crabe des neiges dans les zones du plan d’intervention, décrite dans l’initiative du système de sécurité de classe mondiale pour les navires-citernes, en fonction des normes sur les organismes d’intervention établies par Transports Canada.Une version de cet ensemble de données a été créée pour le Centre national des urgences environnementales (CNUE) selon leur modèle de données et peut être téléchargée dans la section Ressources.Citer ces données comme suit : Lazin, G., Hamer, A.,Corrigan, S., Bower, B., and Harvey, C. <<Données de: Probabilité de présence de crabes des neiges dans les zones pilotes de planification d’intervention localisée >>. Date de publication: Juin 2018. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews (Nouveau-Brunswick). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/edb15c7b-d901-46b0-a460-1aca22c013ea
Surveillance du crabe vert (Carcinus maenas), espèce aquatique envahissante présente en Colombie-Britannique
Les espèces aquatiques envahissantes représentent une menace économique et écologique pour les eaux côtières canadiennes. Afin de réagir à la situation, Pêches et Océans Canada (MPO) a établi des programmes de surveillance afin de détecter la présence des espèces aquatiques envahissantes comme le crabe vert dans les eaux canadiennes et de faire le suivi de leur propagation. Depuis, des pièges Fukui ont été installés chaque année à de nouveaux lieux de surveillance ainsi qu’à des lieux de suivi à long terme situés un peu partout sur la côte de la Colombie-Britannique.
Biodiversité du relevé du crabe des neiges au chalut sur la Basse-Côte-Nord du golfe du Saint-Laurent (2018)
Un relevé de recherche sur le crabe des neiges (Chionoecetes opilio) a été réalisé du 1 au 17 juillet 2018 sur la Basse-Côte-Nord du golfe du Saint-Laurent entre Havre-Saint-Pierre et Blanc-Sablon. L’objectif principal de ce relevé était d’évaluer l’abondance du crabe des neiges et des espèces benthiques associées à l’habitat du crabe des neiges. Seules les données des espèces benthiques associées à l’habitat du crabe des neiges sont présentées dans ce jeu de données.Les données ont été récoltées selon un plan d'échantillonnage à stations fixes constitué de 61 stations, entre 46 et 230 mètres de profondeur. Les spécimens ont été récoltés à l’aide d’un chalut à perche d’une largeur totale de 2.8 mètres et une hauteur totale de 0.76 mètre. Le cul du chalut était doublé avec un filet de maille étirée de 16 millimètres afin de récolter les petits individus. Les traits ont été réalisés à une vitesse visée de 2 nœuds et d'une durée visée de 10 minutes. Les positions début et fin ont été notées pour calculer la distance parcourue à chaque trait à l'aide de la bibliothèque geosphere de R. La distance moyenne des traits était d’environ 25 m selon l'état du fond. La superficie couverte à chaque trait était le produit de l’ouverture du chalut et de la distance parcourue.Les deux fichiers fournis (format DarwinCore) sont complémentaires et sont reliés par la clé « IDactivité ». Le fichier «Information_activité» comprend les informations génériques de l'activité, notamment la date et la localisation. Le fichier «occurrence_taxon» comprend la taxonomie des espèces observées, identifiées à l’espèce ou au niveau taxonomique le plus bas possible. Pour obtenir l’évaluation de l’abondance et de la biomasse, communiquez avec Cédric Juillet (cedric.juillet@dfo-mpo.gc.ca).Pour les contrôles de qualité, tous les noms taxonomiques ont été vérifiés sur le registre mondial des espèces marines (WoRMS) pour correspondre aux normes reconnues. La correspondance WoRMS a été placée dans le champ « IDnomScientifique » du fichier d'occurrence. Les cas spéciaux ont été notés dans le champ « commentairesIdentification » et certains spécimens sélectionnés ont été confirmés à l'aide de photos de terrain. Les contrôles de la qualité des données ont été effectués à l'aide des bibliothèques R obistools et worrms. Tous les emplacements d'échantillonnage ont été validés spatialement.
Biodiversité du relevé du crabe des neiges au chalut dans l'estuaire du Saint-Laurent (2019)
Un relevé de recherche sur le crabe des neiges (Chionoecetes opilio) a été réalisé du 7 au 26 juillet 2019 dans l'estuaire du Saint-Laurent entre Forestville, Baie-Comeau et Matane. L’objectif principal de ce relevé était d’évaluer l’abondance du crabe des neiges et des espèces benthiques associées à l’habitat du crabe des neiges. Seules les données des espèces benthiques associées à l’habitat du crabe des neiges sont présentées dans ce jeu de données.Les données ont été récoltées selon un plan d'échantillonnage à stations fixes constitué de 66 stations, entre 31 et 279 mètres de profondeur. Les spécimens ont été récoltés à l’aide d’un chalut à perche d’une largeur totale de 2.8 mètres et une hauteur totale de 0.76 mètre. Le cul du chalut était doublé avec un filet de maille étirée de 16 millimètres afin de récolter les petits individus. Les traits ont été réalisés à une vitesse visée de 2 nœuds et d'une durée visée de 15 minutes. Les positions début et fin ont été notées pour calculer la distance parcourue à chaque trait à l'aide de la bibliothèque geosphere de R. """La distance moyenne des traits était d’environ 25 m.""" La superficie couverte à chaque trait était le produit de l’ouverture du chalut et de la distance parcourue.Les deux fichiers fournis (format DarwinCore) sont complémentaires et sont reliés par la clé « IDactivité ». Le fichier «Information_activité» comprend les informations génériques de l'activité, notamment la date et la localisation. Le fichier «occurrence_taxon» comprend la taxonomie des espèces observées, identifiées à l’espèce ou au niveau taxonomique le plus bas possible. Pour obtenir l’évaluation de l’abondance et de la biomasse, communiquez avec Cédric Juillet (cedric.juillet@dfo-mpo.gc.ca).Pour les contrôles de qualité, tous les noms taxonomiques ont été vérifiés sur le registre mondial des espèces marines (WoRMS) pour correspondre aux normes reconnues. La correspondance WoRMS a été placée dans le champ « IDnomScientifique » du fichier d'occurrence. Les contrôles de la qualité des données ont été effectués à l'aide des bibliothèques R obistools et worrms. Tous les emplacements d'échantillonnage ont été validés spatialement.
Relevés scientifiques du crabe des neiges (Chionoecetes opilio) dans l'estuaire et le nord du Golfe du Saint-Laurent
Depuis 1992, des relevés scientifiques sont réalisés chaque année, alternativement, dans l’estuaire et le Nord du Golfe du Saint-Laurent. Ces relevés permettent de suivre la population et l’écosystème du crabe des neiges et ainsi comprendre l’état du stock exploitable et le renouvellement de l’espèce. Des traits de chalut à perche suivant un échantillonnage systématique ont lieu tous les 2 ans dans l’estuaire et en Basse-Côte-Nord. Dans la zone de l’estuaire (zone 17), un échantillonnage de 94 stations est réalisé. Dans la zone de la Basse-Côte-Nord (zone 13 et 14), 60 stations régulières sont généralement échantillonnées et 35 stations exploratoires sont distribuées dans les secteurs de Baie Johan Bettz et Kegaska (zone 15 et 16) mais aussi sur la rive sud de la zone 13 du côté de Terre-Neuve. À chaque station, un trait de pêche de 5 à 10 minutes est réalisé. Les crabes récoltés sont mesurés (largeur du céphalothorax), sexés et dénombrés. L’état de la carapace, la maturité sexuelle et les stades de développement des oeufs sont aussi évalués. Le nombre de crabes capturés, classés selon différentes catégories de taille, permet d’estimer des densités et ainsi de suivre l’état et le renouvellement de la population de crabe des neiges dans les différentes zones de pêche. Ce jeu de données sur le crabe des neiges (Chionoecetes opilio) contient des données d’abondance et de densité de crabes sous différentes classes de taille ainsi que des variables géographiques et bathymétriques par station. Le jeu de données couvre la période de 1992 à présentement et se réactualise à chaque année. Un nettoyage des données aberrantes a été réalisé.Pour certaines périodes temporelles, les espèces associées font l’objet d’une identification et d’un décompte semi-quantitatif directement sur la table de tri et les résultats sont présentés dans les publications suivantes : - https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/8fbd81a4-ce4a-40e3-81f6-e2a5c44955de- https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/268bf29e-b9d6-4267-bc86-230f4edfb80b- https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/97dac757-2ef6-4144-b7d9-a0d8d51f8319
Estimations de l'abondance et de la biomasse pour le crabe des neiges (crabe commercial et femelle adulte) dans le sud du golfe du Saint-Laurent
OBJECTIF :Ces données ont été mises à jour à la suite d’un processus d’avis scientifique régional du Secrétariat canadien des avis scientifiques (SCAS). Les publications associées se retrouvent dans la section citation ci-dessous ou encore seront publiées, lorsque disponibles, sur le calendrier des avis scientifiques de Pêches et Océans Canada (MPO).DESCRIPTION :Fournir un registre de l’abondance et de la biomasse des crabes des neiges femelles commerciales et matures dans le sud du golfe du Saint-Laurent. Le crabe des neiges femelle représente un indice du stock reproducteur.Le crabe des neiges dans le sud du golfe est traité comme un seul stock dans les évaluations annuelles. Les estimations de l’abondance et de la biomasse du stock reproducteur commercial et femelle sont produites à l’aide du krigeage, un type d’analyse spatiale. La série chronologique commence en 1997. LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.
Programme d’échantillonnage des captures commerciales dans l'estuaire et le golfe du Saint-Laurent
La région du Québec du Ministère des Pêches et des Océans (MPO) est responsable de l'évaluation de plusieurs stocks de poissons et d’invertébrés exploités dans l'estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent. Le programme d’échantillonnage des captures commerciales est l’une des sources d’information utilisée pour la réalisation de ces évaluations. Les données récoltées par ce programme, à quai ou en mer, offrent entre autres l’avantage d’une couverture spatio-temporelle relativement importante et permettent d’obtenir une partie des connaissances nécessaires pour déterminer la démographie et la structure des populations exploitées. La mise en œuvre de ce programme est assurée par du personnel spécialisé du MPO dont le principal mandat consiste à prélever des données biologiques sur les espèces de poissons de fond, de poissons pélagiques et d'invertébrés marins exploités commercialement dans les diverses communautés maritimes.Les espèces suivantes ont été échantillonnée lors de ce programme de 1976 à présent:1. Buccin (Buccinum undatum)2. Capelan (Mallotus villosus)3. Concombre de mer (Cucumaria frondosa)4. Crabe commun (Cancer irroratus)5. Crabe des neiges (Chionoecetes opilio)6. Crabe lyre atlantique (Hyas araneus)7. Crabe Lyre (Hyas coarctatus)8. Flétan Atlantique (Hippoglossus hippoglossus)9. Flétan du Groendland (Reinhardtius hippoglossoides)10. Hareng Atlantique (Clupea harengus)11. Homard Américain (Homarus americanus)12. Limande à queue jaune (Limanda ferruginea)13. Mactre Atlantique (Spisula solidissima)14. Mactre de Stimpson (Mactromeris polynyma)15. Maquereau bleu (Scomber scombrus)16. Merluche blanche (Urophycis tenuis)17. Morue franche (Gadus morhua)18. Mye commune (Mya arenaria)19. Oursin vert (Strongylocentrotus droebachiensis)20. Pétoncle d'Islande (Chlamys islandica)21. Pétoncle géant (Placopecten magellanicus)22. Plie canadienne (Hippoglossoides platessoides)23. Plie rouge (Pseudopleuronectes americanus)24. Sébaste (Sebastes sp.)Pour plus d'informations sur ces espèces, voir la section «Ressources connexes» ci-dessous.
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