Les coraux d'eau froide sont communs dans les eaux au large de l'est du Canada. Malgré cela, peu de registres de séquences d’ADN de spécimens collectés dans la région sont disponibles dans GenBank, et toutes les espèces enregistrées dans la région ne disposent pas de données de séquence, quelle que soit leur origine géographique. Cela peut limiter l’utilisation de techniques comme l’ADN environnemental pour détecter et identifier les coraux. Notre objectif était de séquencer et de publier des séquences pour deux marqueurs de code-barres ADN pour les octocoraux : CO1 et MutS. Nous avons séquencé et déposé 36 séquences dans GenBank à partir de 19 spécimens représentant trois espèces de plume de mer (Octocorallia : Pennatuloidea) : Distichoptilum gracile, Pennatula aculeata et Protoptilum carpenteri. L'identification de tous les spécimens a été confirmée par B. M. Neves (MPO-TNL) avant la soumission. Des spécimens et des tissus d'ADN ont été donnés au Musée canadien de la nature, où ils sont actuellement conservés. Cette publication représente la première partie d'une série de soumissions à GenBank par notre laboratoireLes spécimens ont été collectés dans l’Atlantique nord-ouest et proviennent de profondeurs comprises entre 200 et 1924 mètres. Les spécimens ont été collectés dans le cadre de relevés au chalut multi-espèces menés par des navires de recherche ou de relevés effectués par des véhicules télécommandés (ROV ROPOS). L'ADN a été isolé et purifié à l'aide du kit QIAgen DNeasy Blood and Tissue, avec une incubation initiale d'une nuit avec la protéinase K. Deux régions de code-barres couramment utilisées pour les octocoraux ont été amplifiées à l'aide d'amorces décrites précédemment : 1) COII8068F (McFadden et al., 2004) et COIOCTR (France et Hoover, 2002) pour le gène CO1, et 2) ND42599F (France et Hoover, 2002) et mut3458R (Sánchez et al., 2003) pour le gène MutS. Les amplifications ont été réalisées en utilisant 12.5 µl de Green DreamTaq Master Mix (Thermo Fisher Scientific), 1 µl d'ADN matrice, 0.5 µl de chaque amorce sens et antisens à 10 µM, 0.5 µl d'amorce antisens à 10 µM et 10.5 µl d'eau. Le thermocyclage a été effectué comme suit : 3 minutes de dénaturation initiale à 95 °C, suivis de 40 cycles à 95 °C pendant 30 s, 30 s à une température de hybridation de 48 °C, puis 65 s à une température d'élongation de 72 °C, et un allongement final à 72 °C pendant 4 min. Les produits de PCR ont été purifiés à l'aide de l’Agencourt AMPure XP beads (Beckman Coulter) et envoyés au Centre for Applied Genomics, Toronto, Canada pour le séquençage Sanger. Les séquences ont été visualisées et alignées à l’aide de Geneious Prime 2022.0.2. Les séquences obtenues ont été déposées dans GenBank sous les numéros d'accès OQ569768-OQ569784 et OQ420359-OQ420377.Ce projet a été financé par Pêches et Océans Canada dans le cadre d'une subvention pour le renforcement des capacités régionales (2020-2021) et du Programme des objectifs de conservation marine (MCT) (2021-2024), région de Terre-Neuve-et-Labrador.

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b

OBJECTIF :Caractériser les réseaux alimentaires des communautés de poissons lacustres à l'aide d'isotopes stables, de la morphologie du contenu intestinal et de l'ADN.DESCRIPTION :Ensemble de données de différentes espèces dans les lacs Miramichi, McKiel, et Nashwaak. PARAMÈTRES COLLECTÉS :Nombre d'espèces (écologiques); points (spacial)LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a

Nous avons évalué un échantillonneur autonome d'ADN environnemental (ADNe) fabriqués par Dartmouth Ocean Technologies Inc. (DOT, Dartmouth, Canada) par rapport au temps de filtration de l'échantillon en laboratoire afin de déterminer la performance des échantillonneurs amarrés pour la surveillance du milieu marin. Nous avons déployé trois échantillonneurs autonomes de DOT dans le bassin de Bedford (Canada) pendant neuf semaines à l’été et à l’automne 2023. Les échantillonneurs ont filtré l'eau de mer in situ lors d'entretiens programmés au cours de cette période, et nous avons recueilli des échantillons contemporains avec une pompe à vide standard au cours de chaque période d'échantillonnage. Les deux types d’échantillons d’ADNe ont capturé une diversité de poissons similaire, y compris la diversité type de l’Atlantique Nord-Ouest. La communauté d’invertébrés détectée à l’aide du marqueur COI était différente d’un type d’échantillon à l’autre, probablement en raison des différences dans la taille des pores du filtre. Nous avons constaté que l'encrassement biologique des échantillonneurs amarrés était minime au cours de la période d'étude, même dans une zone très fréquentée comme le bassin de Bedford, probablement en raison de la période expérimentale relativement courte et du filtre en cuivre couvrant les clapets d’entrée et de sortie des instruments. Dans l’ensemble, nos résultats sont prometteurs en ce qui concerne le déploiement d’échantillonneurs autonomes d’ADNe dans les aires marines de conservation pour contribuer à la surveillance dans l’océan tempéré, mais d’autres essais sur de plus longues périodes sont nécessaires pour déterminer si l’ADN demeure bien préservé dans les échantillonneurs autonomes à des températures océaniques ambiantes.Citer ces données comme: Jeffery, N.W., Van Wyngaarden, M., and Stanley, R.R.E. Évaluation d’un échantillonneur autonome d’ADNe pour la surveillance du milieu marin : Applications à court et à long terme. Publié en Décembre 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).

Pêches et Océans Canada (MPO) s’est engagé à établir un réseau représentatif d’aires marines de conservation représentant collectivement 30 % de la zone économique exclusive (ZEE) d’ici 2030. Le programme des objectifs de conservation marine (OCM) 2.0 a été établi en 2021 en vue d’aider à atteindre cet objectif et d’établir un suivi à long terme dans les aires de conservation canadiennes. L’information sur la répartition des espèces présentes dans une aire protégée est essentielle à la gestion et au suivi d’un site. Les décisions sur le zonage, les évaluations des risques, les approbations d’activités et l’efficacité de la gestion exigent toutes de l’information sur la répartition et l’état des espèces présentes. La biorégion du plateau néo-écossais et de la baie de Fundy, qui couvre l’ensemble de la région des Maritimes, compte huit refuges marins, trois zones de protection marines et deux sites d’intérêt. L’ADN environnemental (ADNe) constitue une approche prometteuse pour le suivi de la biodiversité, qui suscite un intérêt croissant dans le domaine marin. Des filtres spécialisés permettent de capturer des millions de fragments d’ADNe dans des échantillons d’eau relativement petits (environ trois litres). Il est ensuite possible de séquencer ces fragments pour connaître la composition des espèces présentes dans une zone. Le métacodage à barres de l’ADNe est fondé sur le codage à barres de l’ADN, qui permet d’identifier des espèces simplement à l’aide de leurs séquences d’ADN uniques. En plus d’être relativement simple, cette méthode est efficace (elle permet de caractériser à la fois la diversité des poissons et des invertébrés) et non invasive (elle ne nécessite aucune perturbation d’habitats benthiques sensibles ni aucun prélèvement de tissus sur des poissons ou des invertébrés capturés). Il a été démontré que la méthode fondée sur l’ADNe est comparable à d’autres techniques de recensement de la biodiversité et qu’elle permet de recenser rapidement la biodiversité dans des zones relativement grandes, comme le site d’intérêt des îles de la côte Est. Le relevé plurispécifique au chalut que la région des Maritimes du MPO effectue en été figure parmi les relevés en cours depuis le plus longtemps. Les données qui en sont issues servent à l’évaluation de stocks halieutiques et constituent l’une des rares sources d’information utilisées pour la planification et le suivi des aires de protection extracôtières. Dans le cadre de ce projet, nous combinons des échantillons d’ADNe prélevés dans des zones de conservation existantes et proposées avec des données sur les prises au chalut afin de créer des séries chronologiques permettant de suivre la biodiversité et les communautés d’espèces dans ces zones. Nous utilisons l’ADNe et les données sur les prises au chalut de façon complémentaire. En effet, les données sur les prises au chalut fournissent de l’information sur l’abondance, la répartition selon la taille et le sexe des poissons, tandis que l’ADNe fournit de l’information sur la diversité génétique et permet de détecter des espèces cryptiques et rares.Citer ces données comme: Jeffery, N.W. Publié en may 2026. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).

Le site d’intérêt (SI) des îles de la côte Est constitue un grand SI côtier dans la région des Maritimes d’une superficie de 2 089 km2 et qui s’étend sur 100 km de littoral. Bien qu’une grande partie des données qui ont mené à la désignation de la zone comme site d’intérêt aient été recueillies dans les zones côtières (c.-à-d. répartition de la zostère marine et du varech, sites de nidification des oiseaux côtiers et frayères du hareng), il y a moins d’information disponible sur la structure des communautés de poissons et d’invertébrés dans les zones extracôtières du site d’intérêt. L’effort d’échantillonnage actuel au large des côtes est principalement axé sur le relevé plurispécifique estival par navire de recherche qui couvre le plateau néo-écossais, mais qui n’effectue pas d’échantillonnage dans la fourchette des profondeurs couverte par le SI (moins de 100 m de profondeur environ). L’ADN environnemental (ADNe) constitue une approche prometteuse pour la surveillance de la biodiversité qui fait l’objet d’une attention accrue dans le domaine marin. L’échantillonnage de volumes d’eau relativement petits (de 1 à 5 litres environ) permet de capturer des millions de fragments d’ADNe sur des filtres que l’on peut ensuite séquencer en vue d’identifier la composition des espèces d’une zone donnée. Le métacodage à barres de l’ADNe repose sur les principes du codage à barres de l’ADN, qui consiste à identifier les espèces uniquement à partir de leurs séquences d’ADN uniques. Le métacodage par barres de l’ADNe s’appuie sur une bibliothèque de références exhaustive de séquences génétiques d’espèces connues, permettant ainsi d’identifier rapidement les espèces capturées dans chaque échantillon d’eau. Cette méthode est relativement simple, efficace (elle permet de caractériser la diversité des poissons et des invertébrés à la fois) et non invasive, ce qui signifie qu’elle ne perturbe pas les habitats benthiques vulnérables et ne nécessite pas de dissection des échantillons de tissus prélevés sur les poissons et les invertébrés capturés. L’ADNe s’est révélé comparable à d’autres techniques de recensement de la biodiversité et offre la possibilité de réaliser rapidement des relevés sur la biodiversité dans une zone relativement vaste, comme le site d’intérêt des îles de la côte Est. Notre échantillonnage de l’ADNe dans les îles de la côte Est cible les poissons et les invertébrés au moyen de plusieurs marqueurs génétiques (p. ex. 12S et COI), en vue d’obtenir des renseignements de base sur ces communautés dans des transects s’étendant de la zone côtière à la zone extracôtière du site d’intérêt. Au fil du temps, nous étudierons les changements dans la richesse des espèces et la composition des communautés en utilisant les relevés annuels de l’ADNe comme outil de surveillance continue pour cette région côtière.Citer ces données comme: Jeffery, N.W.Surveillance de l’ADN environnemental au large de la zone d’intérêt des îles de la côte Est. Publié en avril 2026. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).

Les zones de protection marine doivent faire l’objet d’un suivi complet pour garantir la réalisation de leurs objectifs. Toutefois, le suivi des écosystèmes naturels à grande échelle est compliqué par la biodiversité qu’il vise à mesurer. Le métacodage à barres de l’ADN environnemental (ADNe) est une solution prometteuse pour relever ce défi de surveillance. Nous avons procédé à un échantillonnage jumelé sur 54 sites pour les assemblages de poissons et d’invertébrés dans l’Atlantique nord-ouest en utilisant des chaluts à poissons de fond et un métacodage à barres de l’ADNe de l’eau de mer benthique en utilisant quatre marqueurs génétiques (ARNr 12S, ARNr 16S, ARNr 18S, et CO1). Par rapport au chalutage, l’ADNe a permis de détecter des schémas similaires de renouvellement des espèces, des estimations plus importantes de la diversité gamma et des estimations plus faibles de la diversité alpha. Au total, 63,6 % (42/66) des espèces de poissons capturées par chalutage ont été détectées par l’ADNe, ainsi que 26 espèces supplémentaires. Sur les 24 détections manquées par l’ADNe, 12 étaient inévitables, car elles manquaient de séquences de référence. Si l’on exclut les taxons classés à un niveau supérieur à celui de l’espèce et ceux qui n’ont pas de nom d’espèce, 23,6 % (17/72) des espèces d’invertébrés capturées par le chalutage ont été détectées par CO1, qui a détecté 98 espèces supplémentaires. Nous démontrons que l’ADNe est capable de détecter des schémas d’assemblage de communautés et de renouvellement des espèces dans un environnement extracôtier en soulignant son fort potentiel en tant qu’outil non invasif, complet et évolutif pour la surveillance de la biodiversité qui soutient les programmes de conservation marine.Citer ces données comme suit: Jeffery, N., Rubidge, E., Abbott, C., Westfall, K., Stanley, R. (2024).Données de Le métacodage à barres de l’ADNe enrichit les données des relevés au chalut traditionnels pour le suivi de la biodiversité dans l’environnement marin. Date de publication Août 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).https://open.canada.ca/data/en/dataset/43a91ba7-8025-4330-88db-db14022d729d

Une planification efficace de la conservation repose sur la compréhension de la connectivité entre les populations, qui peut être documentée par des données génomiques. Ceci est particulièrement important pour les espèces sessiles comme la modiole (Modiolus modiolus), une espèce essentielle à la formation de certains habitats qui constitue une priorité en matière de conservation au Canada atlantique. Cependant, peu d’informations génomiques sont disponibles pour décrire les tendances en matière de connectivité de la modiole. Nous avons utilisé plus de 8 000 polymorphismes mononucléotidiques dérivés du séquençage de l’ADN associé aux sites de restriction et un ensemble de 8 microsatellites pour examiner la connectivité génomique entre les populations de modioles dans la baie de Fundy, le long du plateau néo-écossais et dans l’Atlantique Nord-Ouest, jusqu’à Terre-Neuve. Malgré les différences phénotypiques entre les lieux d’échantillonnage, nous avons constaté un manque général de diversité génétique et de structure démographique chez les modioles dans l’Atlantique Nord-Ouest. Tous les sites échantillonnés présentaient une faible hétérozygosité, un très faible FST, des coefficients de consanguinité élevés et un écart par rapport à l’équilibre Hardy-Weinberg, ce qui met en évidence la diversité génétique généralement faible pour tous les paramètres mesurés. L’analyse des composantes principales, l’analyse du métissage, les calculs par paires du FST et l’analyse des loci aberrants (pouvant faire l’objet d’une sélection) n’ont révélé aucun groupe génomique indépendant dans les données, et une analyse de la variation moléculaire a montré que moins de 1 % de la variation observée dans l’ensemble de données sur les SNP était constatée entre les sites d’échantillonnage. Nos résultats suggèrent que la connectivité est élevée entre les populations de modioles de l’Atlantique Nord-Ouest, ce qui, conjugué à des tailles de population réelles importantes, a entraîné une divergence génomique minimale dans la région. Ces résultats peuvent éclairer les considérations relatives à la conception de mesures de conservation dans la baie de Fundy et favoriser une meilleure intégration dans l’ensemble du réseau régional de conservation.Citer ces données comme: an Wyngaarden, Mallory et al. (2024).Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest. Publié en Mai 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).

OBJECTIF :Fournir l’accès à des données détaillées sur le contenu stomacal et aux métadonnées associées du thon rouge de l’Atlantique échantillonné dans le sud du golfe du Saint‑Laurent entre 2018 et 2023. Ces données appuient les sciences halieutiques en contribuant aux analyses des dynamiques prédateur‑proie, de la composition du régime alimentaire et de la compréhension de l’écosystème, ainsi qu’à l’évaluation des stocks et aux activités de gestion des pêches au sein de Pêches et Océans Canada. DESCRIPTION :Ce jeu de données contient des métadonnées et des informations sur le contenu stomacal recueillies chez le thon rouge de l’Atlantique (ABFT) capturé de la mi‑août à la fin septembre dans la pêche commerciale dans le sud du golfe du Saint‑Laurent entre 2018 et 2023. Les échantillons d’estomac proviennent principalement de poissons récoltés près de l’extrémité est de l’Île‑du‑Prince‑Édouard, avec des échantillons supplémentaires recueillis dans la région de Miscou/Baie‑des‑Chaleurs en 2018 et 2019. MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :Les poissons ont été mesurés à la longueur courbée à la fourche la plus proche (cm) et pesés au poids rond le plus proche (kg). Les estomacs ont été obtenus directement auprès des pêcheurs ou par l’intermédiaire d’un acheteur de poisson, puis stockés à −20 °C avant d’être analysés en laboratoire. Les numéros d’identification des estomacs ont été croisés avec les numéros de marque des thons rouges enregistrés par le fournisseur afin d’obtenir les données des journaux de bord et des ports (lieu et moment de capture, poids, longueur, sexe, engin, etc.) pour chaque échantillon. Les estomacs ont été décongelés en laboratoire, puis leur contenu a été trié et identifié au niveau taxonomique le plus bas possible. Pour chaque estomac, les proies ont été pesées collectivement par groupe taxonomique et individuellement au 0,1 g près.Les appâts morts utilisés pour capturer les thons rouges, identifiés par des marques de coupe, ont été enregistrés et pesés mais exclus de l’analyse. Les appâts vivants ne peuvent pas être identifiés par l’analyse du contenu stomacal. Seuls quelques otolithes ont été trouvés en 2018, et leur qualité dégradée n’a pas permis d’effectuer une détermination de l’âge ou de l’espèce. Les proies rares et de petite taille, telles que les algues et les roches, ont été classées dans la catégorie « autres ». Les restes de poissons qui n’ont pas pu être identifiés ont été classés dans la catégorie « restes de téléostéens non identifiés ».De 2019 à 2021, lorsque les éléments du contenu stomacal ne pouvaient pas être identifiés visuellement et lorsque des tissus étaient disponibles, des échantillons de tissus ont été prélevés et stockés à −20 °C pour une analyse par code-barres ADN. L'extraction de l'ADN, l'amplification de la sous-unité 1 de la cytochrome oxydase mitochondriale, le séquençage Sanger et l'attribution des espèces ont été réalisés à la Plateforme d’Analyses Génomiques et à la Plateforme Bio-informatique de l'Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (PAG-IBIS, Université Laval, Québec, QC, Canada, http://www.ibis.ulaval.ca/en/services-2/genomic-analysis-platform/).L'ADN a été extrait à partir de 20 mg de tissu musculaire à l'aide du kit Omega Bio-tek E-Z-96 Tissue DNA (Omega Bio-tek, Norcross, GA, USA) en suivant les instructions du fabricant. La région de la sous-unité 1 de la cytochrome oxydase mitochondriale a été amplifiée et séquencée comme décrit dans Hashemzadeh Segherloo et al. (2021). Les séquences Sanger, en lecture avant et arrière, ont été analysées indépendamment à l’aide de l’outil Basic Local Alignment Search Tool contre les séquences non redondantes afin d’identifier la meilleure correspondance pour chaque séquence. Lorsque les échantillons ne pouvaient pas être identifiés par une correspondance de séquence, ils étaient classés comme « poissons non identifiables ».Les proies identifiées avec succès grâce au code-barres ADN ont été intégrées dans la base de données d'analyse du contenu stomacal et utilisées dans toutes les analyses ultérieures du régime alimentaire (abondance, occurrence et poids). Le poids des éléments enregistrés dans la base de données correspondait au poids des restes tels qu’ils étaient et non à des poids reconstruits estimés pour un animal vivant de l’espèce identifiée par le code-barres ADN.LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.