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Données sur la taille des plants (longueur, largeur), la couverture et la biomasse de zostère marine (Zostera marina) sur la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse
Cet ensemble de données comprend des mesures de la taille des plants, de la couverture et de la biomasse de zostère recueillies dans des sites situés le long de la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse, au Canada. Les sites couvraient un large spectre de conditions environnementales, et l’échantillonnage sur le terrain a été effectué de juillet à août 2022. Les plants, ainsi que le pourcentage de couverture et la densité des pousses, ont été échantillonnés à 10 stations d’échantillonnage réparties de façon aléatoire dans chaque herbier de zostère, à peu près à la même profondeur. Les stations se trouvaient à environ 10 m les unes des autres et à au moins 2 m de toute jonction entre la zostère et une zone dénudée de végétation. À chaque station d’échantillonnage, les feuilles de zostère présentes dans un quadrat de 0,5 m x 0,5 m étaient photographiées afin d’être analysées ultérieurement par ordinateur pour déterminer le pourcentage de couverture. Le nombre de pousses était ensuite compté dans un quadrat de 0,25 m x 0,25 m, et trois pousses étaient recueillies. La longueur, la largeur et le poids des pousses ont été mesurés en laboratoire. Ces données ont été utilisées pour déterminer la relation allométrique et la relation couverture-biomasse afin d’estimer la biomasse des herbiers de zostère de façon non destructive. Citer ces données comme: Wong, M.C., Thomson, J. A. Données sur la taille des plants (longueur, largeur), la couverture et la biomasse de zostère marine (Zostera marina) sur la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse. Publié en Février 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).Pour de plus amples renseignements, veuillez consulter: Thomson, J. A., Vercaemer, B., & Wong, M. C. (2025). Non-destructive biomass estimation for eelgrass (Zostera marina): Allometric and percent cover-biomass relationships vary with environmental conditions. Aquatic Botany, 198, 103853. https://doi.org/10.1016/j.aquabot.2024.103853
Base de données nationale sur les zostères pour le Canada (NETForce)
Cette collection de données sur les zostères a été rassemblée pour produire une carte nationale de l'emplacement et de la répartition des herbiers de zostères à travers le Canada. Les fournisseurs de données qui collaborent à cette initiative comprennent des ministères et organismes fédéraux, provinciaux et municipaux, des universités, des organisations non gouvernementales, des groupes communautaires, le secteur privé, des groupes autochtones et des organisations scientifiques indépendantes. Le Groupe de travail national sur la zostère (NETForce) est un partenariat collaboratif, diversifié et inclusif de scientifiques, de gestionnaires et d'intervenants travaillant vers une vision concrète qui consiste à créer une carte nationale de la répartition de la zostère au Canada qui est accessible au public, dynamique et utile pour le suivi et la prise de décision collective. Les données sur les zostères ont été recueillies à l'aide de diverses techniques de cartographie, notamment des modèles de répartition des espèces, des sonars benthiques, des mesures sur le terrain de la présence ou de l'absence d'habitat, des transects vidéo, des photographies aériennes, des validations sur le terrain, de analyse documentaire, de l’imagerie par satellite, de la télédétection LiDAR, de l'imagerie spectrographique aéroportée et des véhicules aériens inoccupés (UAV). Les métadonnées fournies par les partenaires pertinentes pour leurs propres projets et les noms de champs ont été rendus similaires pour l'ensemble de données compilées. Nous avons également créé des champs supplémentaires qui différenciaient les ensembles de données, et ceux-ci comprennent le fournisseur de données, le code de l'institution, le plan d'eau, les techniques de cartographie, la province, la région biogéographique, l'observation des zostères... D'autres champs sont inclus en fonction des métadonnées d'origine fournies par le fournisseur de données (c'est-à-dire le pourcentage de couverture de zostères, la densité de zostères, la référence cartographique, la technique de classification des images). Les données couvrent la période de 1987 à aujourd'hui, certains herbiers de zostères n'ayant été relevés qu'une seule fois tandis que d'autres ont été échantillonnés sur plusieurs années. Les informations d'incertitude associées à un ensemble de données sont incluses dans les métadonnées lorsqu'elles sont disponibles. Cette carte est destinée à être toujours d'actualité et des données de zostères supplémentaires seront ajoutées dès qu'elles seront disponibles. Cet ensemble de données compilées a été collecté par de nombreuses organisations à des fins différentes, en utilisant différentes techniques et différentes méthodologies et, par conséquent, une attention particulière doit être portée lors de l'utilisation de ces données. Pour plus d'informations concernant des ensembles de données spécifiques, contactez le fournisseur de données/institution et/ou consultez le rapport technique associé (le cas échéant) inclus dans le dossier Rapport sous la section « Données et ressources ».Ce groupe de données sur la zostère a été divisé en utilisant les limites géographiques des biorégions marines fédérales (https://open.canada.ca/data/en/dataset/23eb8b56-dac8-4efc-be7c-b8fa11ba62e9). Le titre de chaque géodatabase (FGDB/GDB) contient le nom de la biorégion.Le guide Dictionnaire de données fournit la description des champs (anglais et français) de chaque couche incluse dans les géodatabases.Pour plus d'informations, voir: Gomez C., Guijarro-Sabaniel J., Wong M. 2021. National Eelgrass Task (NET) Force: engagement in support of a dynamic map of eelgrass distribution in Canada to support monitoring, research and decision making. Can. Tech. Rep. Aquat. Sci. 3437: vi + 48 p. https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/4098218x.pdfGuijarro-Sabaniel, J., Thomson, J. A., Vercaemer, B. and Wong, M. C. 2024. National Eelgrass Task Force (NETForce): Building a dynamic, open eelgrass map for Canada. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3583: v + 31 p. https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/41223147.pdf
Variation de la vulnérabilité génomique aux changements climatiques dans les populations de zostères marines (Zostera marina) des milieux tempérés
Le déclin mondial des populations d’herbiers marins a suscité de nouveaux appels à leur conservation en tant qu’importants fournisseurs d’habitats biogéniques et d’alimentation, de stabilisation des rives et de stockage du carbone. La zostère (Zostera marina) occupe la plus grande aire de répartition géographique parmi les espèces d’herbiers marins, et couvre un vaste éventail, proportionnellement, de conditions environnementales. Au Canada, les zostères sont considérées comme un seul phylogroupe malgré leur présence dans trois océans et dans une gamme de températures océaniques et de gradients de salinité. Les recherches antérieures se sont concentrées sur l’application d’un nombre relativement restreint de marqueurs pour révéler la structure des populations de zostères, tandis qu’une approche génomique complète est justifiée pour étudier la structure cryptique parmi les populations habitant différents bassins océaniques et conditions environnementales localisées. Nous avons utilisé une approche groupée pour un nouveau séquençage du génome entier afin de caractériser la structure de la population, le flux génétique et les associations environnementales de 23 populations de zostères allant du nord-est des États-Unis à l’Atlantique, aux régions subarctiques et au Pacifique canadien. Nous avons identifié plus de 500 000 SNP qui, lorsqu’ils ont été cartographiés à l’aide d’un ensemble de génomes chromosomiques, ont révélé six grands clades de zostères dans la zone d’étude, où la différence FST par paire variait de 0 chez les populations voisines à 0,54 chez celles des côtes du Pacifique et de l’Atlantique. La diversité génétique était la plus élevée dans le Pacifique et la plus faible dans le subarctique, ce qui correspond à la colonisation des océans Arctique et Atlantique à partir du Pacifique il y a moins de 300 000 ans. À l’aide d’analyses de la redondance et de deux scénarios de projection des changements climatiques, nous avons constaté, grâce aux prévisions de la compensation génomique, que les populations subarctiques sont plus vulnérables que d’autres aux changements climatiques. Dans le cadre de la planification de la conservation au Canada, on devrait veiller à ce que les populations représentatives de chaque clade identifié soient incluses dans un réseau national, afin que la diversité génétique latente soit protégée et que le flux génétique soit maintenu. Les populations du Nord, en particulier, peuvent avoir besoin de mesures d’atténuation supplémentaires étant donné leur plus grande vulnérabilité potentielle à un climat en évolution rapide.Citer ces données comme: Jeffery, Nicholas et al. (2024). Données de: Variation de la vulnérabilité génomique aux changements climatiques dans les populations de zostères marines (Zostera marina) des milieux tempérés. [Ensemble de données]. Dryad. https://doi.org/10.5061/dryad.xpnvx0kp2
Données sur les caractéristiques de la zostère marine (Zostera marina) de la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse
Cet ensemble de données comprend des mesures des caractéristiques de la zostère marine relatives à la structure, à la morphologie et à la physiologie des herbiers dans des sites le long de la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse, au Canada. Les sites étudiés couvraient un large spectre de températures et de conditions de luminosité. L’échantillonnage a eu lieu en juillet et en août, en 2017, en 2021 et en 2022. Les plantes et la densité des herbiers ont été échantillonnées à 10 stations d’échantillonnage réparties de façon aléatoire dans chaque herbier, à peu près à la même profondeur. Les stations se trouvaient à environ 10 m les unes des autres et à au moins 2 m de la jonction entre un herbier et toute zone dénudée de végétation. On a utilisé des quadrats pour mesurer la densité des pousses végétatives et reproductives. Trois plantes provenant de chaque station d’échantillonnage ont été prélevées et traitées en laboratoire pour déterminer la longueur et la largeur de la feuille 3, le nombre de feuilles par pousse, la largeur du rhizome, la concentration en glucides hydrosolubles du rhizome et la teneur totale des feuilles en chlorophylle. Des mesures de température et de luminosité qui résument les conditions relatives à la température et à la lumière durant l’été sont comprises dans les données.Citer ces données comme: Wong, M.C., Dowd, M. Données sur les caractéristiques de la zostère marine (Zostera marina) de la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse. Publié en Février 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).Pour de plus amples renseignements, veuillez consulter: Wong, M.C., Dowd, M. Eelgrass (Zostera marina) Trait Variation Across Varying Temperature-Light Regimes. Estuaries and Coasts 48, 13 (2025). https://doi.org/10.1007/s12237-024-01439-3
Zostère marine du Québec
Ce jeu de données de format shapefile a été conçu à partir des polygones extraits de la géodatabase Cartographie des écosystèmes côtiers du Québec maritime (2022, Laboratoire de dynamique et de gestion intégrée des zones côtières, Pêches et Océans Canada), décrit dans le paragraphe ci-après. Il est constitué des polygones comportant de la zostère marine et rassemble les attributs décrivant la couverture végétale, la composition des herbiers, le nom de l’écosystème, les données d’imagerie ayant permis la photo-interprétation et la présence ou non de données de terrain. Un numéro séquentiel unique associé à chaque polygone permet de retracer le polygone apparié de la géodatabase des écosystèmes côtiers pour connaître les valeurs d’attributs non détaillé dans le présent shapefile. La région d’étude comprend l’ensemble des littoraux estuariens et maritimes du Québec, à l’exception de certains secteurs dont la majeure partie de la Basse-Côte-Nord et de l’Île d’Anticosti, à l’exception des villages de Kegaska, la Romaine, Chevery, Blanc-Sablon et Port-Menier. Certaines îles au large des côtes de l’estuaire et du golfe font parties de la région couverte, telles que l’Île d’Orléans, l’Isle-aux-Coudres, l’Île Verte et l’Île Bonaventure.Le projet de Cartographie des écosystèmes côtiers du Québec maritime a été réalisée conjointement par le Laboratoire de dynamique et de gestion intégrée des zones côtières (LDGIZC) de l’Université du Québec à Rimouski dans le cadre du Projet Résilience côtière; et par l’équipe de Pêches et Océans Canada, dans le cadre de l’initiative Planification pour une Intervention Marine Intégrée (PIMI) du Plan de Protection des Océans (PPO). Dans le cadre de ce projet, une classification des écosystèmes côtiers a été réalisée sur plus de 4 200 km de corridor côtier, avec pour sujet les littoraux estuariens et maritimes du Québec situés entre la limite du haut-estran et l'infralittoral peu profond (environ 10m de profondeur). La méthode de cartographie développée s’appuie sur une segmentation et classification semi-automatisée et une photo-interprétation des écosystèmes côtiers, à partir de photographies multispectrales (RBVI) à très haute résolution (30 cm) acquises entre 2015 et 2020 par le MPO. La classification des entités surfaciques (polygones) s'appuie sur l'attribution de classes de valeurs pour les attributs biologiques et physiques à l'étude (par ex. étagement, substrats, type végétaux, couverture de la végétation, géosystème, etc.). Des photographies obliques héliportées et des données de terrain ont contribué à réduire l’incertitude associée au travail de photo-interprétation. L'UQAR et le MPO ont mené des campagnes d'échantillonnage terrain visant respectivement le médiolittoral (4 390 stations) puis la zone médiolittorale inférieure et infralittorale (2 959 stations), ce qui a permis de valider certains attributs identifiés par photo-interprétation et d'apporter une information détaillée sur la structure des communautés. La géodatabase de la Cartographie des écosystèmes côtiers est hébergée et diffusée par l'UQAR sur la plateforme cartographique SIGEC-Web: https://ldgizc.uqar.ca/Web/sigecwebCredits © MPO (2023, Pêches et Océans Canada)Provencher-Nolet, L., Paquette, L., Pitre, L.D., Grégoire, B. and Desjardins, C. 2024. Cartographie des macrophytes estuariens et marins du Québec. Rapp. Tech. Can. Sci. halieut. Aquat. 3617 : v + 99 p.Grégoire, B., Pitre, L.D., Provencher-Nolet, L., Paquette, L. and Desjardins, C. 2024. Distribution d’organismes marins de la zone côtière peu profonde du Québec recensés par imagerie sous-marine de 2017 à 2021. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 3616 : v + 78 p.Grégoire, B. 2022. Biodiversité du relevé côtier Planification pour une intervention environnementale intégrée dans l’estuaire et le golfe du Saint-Laurent (2017–2021). Observatoire global du Saint-Laurent. [Jeu de données]Jobin, A., Marquis, G., Provencher-Nolet, L., Gabaj Castrillo. M. J., Trubiano C., Drouet, M., Eustache-Létourneau, D., Drejza, S. Fraser, C. Marie, G. et P. Bernatchez (2021) Cartographie des écosystèmes côtiers du Québec maritime — Rapport méthodologique. Chaire de recherche en géoscience côtière, Laboratoire de dynamique et de gestion intégrée des zones côtières, Université du Québec à Rimouski. Rapport remis au ministère de l’Environnement et de la Lutte contre les changements climatiques, septembre 2021, 98 p.
Évaluation des herbiers de zostère à l’échelle de la baie à l’aide d’équipement vidéo et de balayage latéral – Bouctouche
Évaluation de la situation des herbiers de zostère (Zostera marina) à l'échelle de la baie dans les estuaires troubles peu profonds est problématique. Évaluation à l'échelle de la baie (c.-à-d. des dizaines de kilomètres) des herbiers de zostère comprend habituellement des méthodes de télédétection, comme la photographie aérienne ou l'imagerie par satellite. Ces méthodes peuvent être inefficaces si la colonne d'eau est trouble, comme c'est le cas pour de nombreux estuaires peu profonds sur le littoral est du Canada. Un nouveau type de poisson a été mis au point pour évaluer les herbiers de zostère à l’échelle de la baie, quelle que soit la turbidité de la colonne d’eau. Le poisson comprenait une caméra vidéo sous-marine dotée de lasers calibrés, d’un sonar à balayage latéral et d’un système de positionnement par transpondeur. Le poisson a été déployé le long de transects prédéterminés dans trois estuaires du nord du Nouveau-Brunswick. On a produit des cartes sur la couverture et la santé de la zostère (charge d’épiphytes) et sur les caractéristiques des fonds auxiliaires, comme la croissance des algues benthiques, les tapis de bactéries (Beggiatoa) et les huîtres. Les trois estuaires présentaient des accumulations de matière rappelant l'oomycète Leptomitus, bien que celui-ci n’ait pas été identifié clairement dans notre étude. Tabusintac contenait les plus vastes herbiers de zostère en meilleure santé. Cocagne est arrivé en dernière place concernant la santé de la zostère, et Bouctouche était légèrement mieux. La méthode du poisson s'est révélée rentable et utile pour l'évaluation à l’échelle de la baie des herbiers de zostère avec une précision inférieure au mètre en temps réel.Citer ces données comme suit : Vandermeulen H. Données de: Évaluation des herbiers de zostère à l’échelle de la baie à l’aide d’équipement vidéo et de balayage latéral – Bouctouche: Date de publication: Novembre 2017. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth (Nouvelle-Écosse). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/b4c83cd2-20f2-47d8-8614-08c1c44c9d8c
Invertébrés benthiques dans les herbiers marins et les sédiments mous nus dans l'Atlantique de la Nouvelle-Écosse
Cet ensemble de données contient l'abondance (par m²) et la biomasse (mg sec par m²) de macrofaune (≥ 500µm) dans les herbiers marins de zostère et les sédiments mous nus adjacents, collectés sur les sites dans l'Atlantique de la Nouvelle-Écosse de 2009 à 2013.Citer ces données comme suit : Wong, M. C. « Data of: Benthic invertebrates in seagrass and bare soft sediments in Atlantic Nova Scotia ». Date de publication : mai 2020. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth (Nouvelle-Écosse). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/05d5f46a-7f19-11ea-8a4e-1860247f53e3Ouvrages: Wong, M. C., & Dowd, M. (2021). Functional trait complementarity and dominance both determine benthic secondary production in temperate seagrass beds. Ecosphere. 12(11), e03794. https://doi.org/10.1002/ecs2.3794Wong, M. C. (2018). Secondary Production of Macrobenthic Communities in Seagrass (Zostera marina, Eelgrass) Beds and Bare Soft Sediments Across Differing Environmental Conditions in Atlantic Canada. Estuaries and Coasts, 41, 536–548. https://doi.org/10.1007/s12237-017-0286-2
Classification de la couverture de zostère marine au havre de Cocagne
La zostère marine (Zostera marina) est importante pour la sauvagine, notamment la Bernache cravant à ventre pâle (Branta bernicla hrota), la Bernache du Canada (Branta canadensis), le Canard noir (Anas rubripes), le Garrot à œil d’or (Bucephala clangula) et le Garrot d’Islande (Bucephala islandica). Au Nouveau-Brunswick, la zostère marine est présente le long du golfe du Saint-Laurent dans des havres protégés. Les ensembles de données présentés ci-dessous contiennent les résultats de classifications de la couverture de zostère marine effectuées à l’aide de la photographie aérienne ou par satellite pour huit havres : Bouctouche (46,30°N; 64,39°O), Cocagne (46,37°N; 64,60°O), Miscou (47,90°N; 64,55°O), Neguac (47,25°N; 65,03°O), Richibucto (46,70°N; 64,80°O), Saint-Simon (47,77°N; 64,76°O), Tabusintac (47,33°N; 64,93°O) et Tracadie (47,55°N; 64,88°O). Des renseignements sont fournis pour chaque ensemble de données.On a utilisé la photographie aérienne orthocorrigée dans le visible pour classer des polygones contenant de la zostère marine dans le port de Cocagne. Pour l’entraînement et la validation d’image, on a collecté à l’été 2008 des données sur le terrain le long de transects à l’aide d’un sonar à balayage latéral à poisson avec GPS différentiel et d’une caméra vidéo, qui ont par la suite été converties en points géographiques XY afin de décrire la présence de zostère et, de façon qualitative, la densité. On a survolé la zone le 24 septembre 2008 pour la photographier. Le logiciel eCognition Developer v. 8 a été utilisé pour segmenter les images, essentiellement en polygones. Ces polygones ont ensuite été classés manuellement pour évaluer la présence de zostère marine. Les données collectées sur le terrain ont révélé que la présence de zostère marine a été correctement cartographiée dans 87,2 % des cas.
Classification de la couverture de zostère marine le long du golfe du Saint-Laurent au Nouveau-Brunswick
Classification de la couverture de zostère marine le long du golfe du Saint-Laurent au Nouveau-BrunswickLa zostère marine (Zostera marina) est importante pour la sauvagine, notamment la Bernache cravant à ventre pâle (Branta bernicla hrota), la Bernache du Canada (Branta canadensis), le Canard noir (Anas rubripes), le Garrot à œil d’or (Bucephala clangula) et le Garrot d’Islande (Bucephala islandica). Au Nouveau-Brunswick, la zostère marine est présente le long du golfe du Saint-Laurent dans des havres protégés. Les ensembles de données présentés ci-dessous contiennent les résultats de classifications de la couverture de zostère marine effectuées à l’aide de la photographie aérienne ou par satellite pour sept havres : Bouctouche (46,30°N; 64,39°O), Miscou (47,90°N; 64,55°O), Neguac (47,25°N; 65,03°O), Richibucto (46,70°N; 64,80°O), Saint-Simon (47,77°N; 64,76°O), Tracadie (47,55°N; 64,88°O), et Cocagne (46.370°N; 64.600°O). Des renseignements sont fournis pour chaque ensemble de données.1. BouctoucheCet ensemble de données contient les résultats d’une classification de la couverture de zostère marine dans la baie de Bouctouche, au Nouveau-Brunswick. Une photographie aérienne en couleur réelle à une résolution de 57 centimètres a été prise le 2 septembre 2009 par la firme Nortek Resources de Thorburn, en Nouvelle-Écosse (http://www.nortekresources.com/ [en anglais seulement]). La classification d’image a d’abord été effectuée à l’aide du logiciel eCognition Developer v. 8, qui segmente l’image en unités ayant des propriétés spectrales similaires, puis ces unités ont été classées manuellement. Le ministère des Pêches et des Océans (région du Golfe, Moncton, Nouveau-Brunswick) a également effectué un relevé visuel dans 688 sites au cours de la même campagne sur le terrain. On a utilisé les deux tiers de ces sites pour aider à la classification d’image, tandis que les sites restants ont servi à évaluer l’exactitude. Trois classes ont été établies :i. Zostère marine de bonne qualité : peuplements relativement denses; feuilles propres et vertes; présence minimale d’épiphytes ou d’algues; ii. Zostère marine de qualité moyenne : feuilles principalement vertes qui peuvent montrer une certaine présence d’épiphytes ou d’algues. Ces peuplements peuvent être moins denses ou aussi denses que ceux de bonne qualité, mais les meilleurs brins n’y sont certainement pas aussi abondants;iii. Zostère marine absente ou de mauvaise qualité : les zostères sont absentes ou, si elles sont présentes, elles sont généralement couvertes d’épiphytes ou d’algues, ou encore moribondes ou mortes. La couverture de zostère marine a été classée correctement dans 83,7 % des cas au moyen d’une technique de vérification floue de l’exactitude, selon laquelle les images qui étaient décalées d’une classe, p. ex. une image de zostère marine de bonne qualité classée comme étant de qualité moyenne, ont vu leur poids diminuer de moitié dans l’évaluation de l’exactitude globale. Des 187 sites qui se trouvaient dans la zone de classification, 131 ont été classés correctement, 51 étaient décalés d’une classe, et 5 ont été classés incorrectement [(131 + (51/2)) / 187 = 0,837].2. MiscouUne photographie aérienne en couleur réelle à une résolution de 57 centimètres a été prise le 20 et le 24 août 2009 par la firme Nortek Resources de Thorburn, en Nouvelle-Écosse (http://www.nortekresources.com/ [en anglais seulement]). La classification d’image a d’abord été effectuée à l’aide du logiciel eCognition Developer v. 8, qui segmente l’image en unités ayant des propriétés spectrales similaires, puis ces unités ont été classées manuellement. Le ministère des Pêches et des Océans (région du Golfe, Moncton, Nouveau-Brunswick) a également effectué un relevé visuel dans 103 sites au cours de la même campagne sur le terrain. De ces 103 sites, on en a utilisé 72 (70 %) pour aider à la classification d’image, tandis que les sites restants ont servi à évaluer l’exactitude. Trois classes ont été établies :i. Zostère marine de bonne qualité : peuplements relativement denses; feuilles propres et vertes; présence minimale d’épiphytes ou d’algues; ii. Zostère marine de qualité moyenne : feuilles principalement vertes qui peuvent montrer une certaine présence d’épiphytes ou d’algues. Ces peuplements peuvent être moins denses ou aussi denses que ceux de bonne qualité, mais les meilleurs brins n’y sont certainement pas aussi abondants;iii. Zostère marine absente ou de mauvaise qualité : les zostères sont absentes ou, si elles sont présentes, elles sont généralement couvertes d’épiphytes ou d’algues, ou encore moribondes ou mortes. La couverture de zostère marine a été classée correctement dans 96,7 % des cas (30/31 = 0,967). 3. NeguacCet ensemble de données contient les résultats d’une classification de la couverture de zostère marine dans la baie de Neguac, au Nouveau-Brunswick. Une photographie aérienne en couleur réelle à une résolution de 57 centimètres a été prise le 2 septembre 2009 par la firme Nortek Resources de Thorburn, en Nouvelle-Écosse (http://www.nortekresources.com/ [en anglais seulement]). La classification d’image a d’abord été effectuée à l’aide du logiciel eCognition Developer v. 8, qui segmente l’image en unités ayant des propriétés spectrales similaires, puis ces unités ont été classées manuellement. Le ministère des Pêches et des Océans (région du Golfe, Moncton, Nouveau-Brunswick) a également effectué un relevé visuel dans 126 sites au cours de la même campagne sur le terrain. On a utilisé les deux tiers de ces sites pour aider à la classification d’image, tandis que les sites restants ont servi à évaluer l’exactitude. Trois classes ont été établies :i. Zostère marine de bonne qualité : peuplements relativement denses; feuilles propres et vertes; présence minimale d’épiphytes ou d’algues; ii. Zostère marine de qualité moyenne : feuilles principalement vertes qui peuvent montrer une certaine présence d’épiphytes ou d’algues. Ces peuplements peuvent être moins denses ou aussi denses que ceux de bonne qualité, mais les meilleurs brins n’y sont certainement pas aussi abondants;iii. Zostère marine absente ou de mauvaise qualité : les zostères sont absentes ou, si elles sont présentes, elles sont généralement couvertes d’épiphytes ou d’algues, ou encore moribondes ou mortes. La couverture de zostère marine a été classée correctement dans 81 % des cas au moyen d’une technique de vérification floue de l’exactitude, selon laquelle les images qui étaient décalées d’une classe, p. ex. une image de zostère marine de bonne qualité classée comme étant de qualité moyenne, ont vu leur poids diminuer de moitié dans l’évaluation de l’exactitude globale. Des 39 sites qui se trouvaient dans la zone de classification, 27 ont été classés correctement, 9 étaient décalés d’une classe, et 3 ont été classés incorrectement [(27 + (9/2)) / 39 = 0,81].4. RichibuctoUne carte de répartition de la zostère marine a fait l’objet d’une classification à l’aide de l’imagerie par télédétection au havre de Richibucto, au Nouveau-Brunswick. Elle provenait d’une image prise par le satellite QuickBird à marée aussi basse que possible le 28 août 2007. QuickBird offre une résolution au sol de 2,4 m. La classification a été orientée objet à l’aide du logiciel Definiens. L’exactitude était de 81,5 %. Pour l’évaluation de l’exactitude et l’entraînement d’image, on a collecté des données le long de transects à l’aide d’un sonar à balayage latéral à poisson avec GPS différentiel et d’une caméra vidéo, qui ont par la suite été converties en points géographiques XY afin de décrire la présence de zostère marine.5. Saint-SimonCet ensemble de données contient les résultats d’une classification de la couverture de zostère marine dans le port de Shippagan, au Nouveau-Brunswick. Elle provenait d’une image prise par le satellite QuickBird à marée aussi basse que possible le 27 juillet 2007. La classification a été orientée objet à l’aide du logiciel Definiens. Pour l’évaluation de l’exactitude et l’entraînement d’image, on a collecté des données le long de transects à l’aide d’un sonar à balayage latéral à poisson avec GPS différentiel et d’une caméra vidéo, qui ont par la suite été converties en points géographiques XY afin de décrire la présence de zostère marine.6. TracadieCet ensemble de données contient les résultats d’une classification de la couverture de zostère marine dans la baie Tracadie, au Nouveau-Brunswick. Une photographie aérienne en couleur réelle à une résolution de 57 centimètres a été prise le 2 septembre 2009 par la firme Nortek Resources de Thorburn, en Nouvelle-Écosse (http://www.nortekresources.com/ [en anglais seulement]). La classification d’image a d’abord été effectuée à l’aide du logiciel eCognition Developer v. 8, qui segmente l’image en unités ayant des propriétés spectrales similaires, puis ces unités ont été classées manuellement. Le ministère des Pêches et des Océans (région du Golfe, Moncton, Nouveau-Brunswick) a également effectué un relevé visuel dans 101 sites au cours de la même campagne sur le terrain. On a utilisé environ les deux tiers de ces sites pour aider à la classification d’image, tandis que les sites restants ont servi à évaluer l’exactitude. Trois classes ont été établies :i. Zostère marine de bonne qualité : peuplements relativement denses; feuilles propres et vertes; présence minimale d’épiphytes ou d’algues; ii. Zostère marine de qualité moyenne : feuilles principalement vertes qui peuvent montrer une certaine présence d’épiphytes ou d’algues. Ces peuplements peuvent être moins denses ou aussi denses que ceux de bonne qualité, mais les meilleurs brins n’y sont certainement pas aussi abondants;iii. Zostère marine absente ou de mauvaise qualité : les zostères sont absentes ou, si elles sont présentes, elles sont généralement couvertes d’épiphytes ou d’algues, ou encore moribondes ou mortes. La couverture de zostère a été classée correctement dans 79,3 % des cas au moyen d’une technique de vérification floue de l’exactitude, selon laquelle les images qui étaient décalées d’une classe, p. ex. une image de zostère marine de bonne qualité classée comme étant de qualité moyenne, ont vu leur poids diminuer de moitié dans l’évaluation de l’exactitude globale. Des 29 sites qui se trouvaient dans la zone de classification, 18 ont été classés correctement, 10 étaient décalés d’une classe, et 1 a été classé incorrectement [(18 + (10/2)) / 29 = 0,793].7. CocagneOn a utilisé la photographie aérienne orthocorrigée dans le visible pour classer des polygones contenant de la zostère marine dans le port de Cocagne. Pour l’entraînement et la validation d’image, on a collecté à l’été 2008 des données sur le terrain le long de transects à l’aide d’un sonar à balayage latéral à poisson avec GPS différentiel et d’une caméra vidéo, qui ont par la suite été converties en points géographiques XY afin de décrire la présence de zostère et, de façon qualitative, la densité. On a survolé la zone le 24 septembre 2008 pour la photographier. Le logiciel eCognition Developer v. 8 a été utilisé pour segmenter les images, essentiellement en polygones. Ces polygones ont ensuite été classés manuellement pour évaluer la présence de zostère marine. Les données collectées sur le terrain ont révélé que la présence de zostère marine a été correctement cartographiée dans 87,2 % des cas.
Données mensuelles sur la zostère marine à des sites sélectionnés en Nouvelle-Écosse
Cet ensemble de données comprend des mesures de la productivité et de la résilience des herbiers marins recueillies sur le terrain le long de la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse, au Canada. Les sites étudiés couvraient un large spectre de températures et de conditions de luminosité. Des échantillons ont été prélevés chaque mois, de mai 2018 à juillet 2019. Les plantes et la densité de l’herbier ont été échantillonnées à 10 stations d’échantillonnage réparties de façon aléatoire dans chaque herbier, à peu près à la même profondeur. Les stations se trouvaient à environ 10 m les unes des autres et à au moins 2 m de la jonction entre l’herbier et toute zone dénudée de végétation. Des quadrats ont été utilisés pour mesurer la densité des pousses végétatives et reproductives, et des carottiers manuels ont permis d’échantillonner la biomasse aérienne et souterraine de l’herbier. Trois plantes provenant de chaque station d’échantillonnage ont également été prélevées et traitées en laboratoire pour déterminer la longueur et la largeur de la feuille 3, le nombre de feuilles par pousse, la largeur du rhizome et la concentration en glucides hydrosolubles du rhizome. Cet ensemble de données comprend également des séries chronologiques d’enregistrements de la température au fond de l’eau à chaque site, mesurée à intervalles de 15 minutes à l’aide d’enregistreurs de données HOBO TidbiT v2.Citer ces données comme: Wong, Melisa C., and Michael Dowd. 2023. “The Role of Short-Term Temperature Variability and Light in Shaping the Phenology and Characteristics of Seagrass Beds.” Ecosphere 14(11): e4698. https://doi.org/10.1002/ecs2.4698
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