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Changements prévus dans le potentiel de croissance, la survie des œufs et la qualité de l’habitat thermique pour les espèces de morue dans l’Atlantique Nord-Ouest et l’est de l’Arctique canadien
La morue arctique (Boreogadus saida), la morue franche (Gadus morhua) et la morue du Groenland (Gadus macrocephalus) sont des espèces de gadidés très importantes sur le plan écologique et socio-économique dans l'Atlantique Nord-Ouest. Toutefois, on ne sait pas exactement de quelle façon les changements d’origine climatique dans la température des océans pourraient modifier la répartition de ces espèces d’ici la fin du siècle (2100). Nous avons utilisé des modèles de répartition des espèces basés sur la physiologie pour prédire de quelle façon le réchauffement des océans influencera la disponibilité d’habitats appropriés pour les premiers stades biologiques de ces gadidés marins. Nous avons appliqué les projections de la température des océans de la phase 5 du Projet d’intercomparaison des modèles couplés (CMIP5) aux modèles de survie des œufs et de croissance des juvéniles pour la morue arctique, la morue franche et la morue du Groenland afin de créer des surfaces matricielles de la qualité prévue de l’habitat pour ces paramètres sur quatre périodes climatologiques (de 1981 à 2005, de 2026 à 2050, de 2051 à 2075 et de 2076 à 2100). L’analyse s’est concentrée sur les changements prévus de la température dans les zones du plateau océanique où la profondeur de l’océan est inférieure ou égale à 400 mètres. Nous avons créé un indice intégré de qualité de l’habitat en combinant les surfaces matricielles de la qualité de l’habitat pour la survie des œufs et le potentiel de croissance afin de prédire les zones et les périodes où les conditions thermiques sont appropriées pour les deux stades biologiques. Les surfaces matricielles qui en résultent indiquent que l’habitat thermique approprié pour les juvéniles des trois espèces se déplacera vers le pôle, mais l’ampleur du déplacement et la superficie globale de l’habitat thermique approprié restant différeront selon les espèces et les stades biologiques au fil du temps. Les surfaces modélisées sont fournies en format NetCDF par paramètre (survie des œufs, potentiel de croissance et qualité de l’habitat). Les surfaces de données pour la morue arctique, la morue franche et la morue du Groenland sont comprises dans chaque fichier NetCDF en tant que variables dans le temps. Il convient de noter que dans le cadre de cette étude, nous faisons référence à Gadus macrocephalus/ogac en tant que morue du Groenland, car Gadus ogac est considéré comme un synonyme récent de Gadus macrocephalus (Carr et al. 1999). Pour de plus amples renseignements sur les méthodes et les résultats de cette analyse, voir Cote et al. (2021).Références :Carr, S. M., Kivlichan, D. S., Pepin, P., & Crutcher, D. C. (1999). Molecular systematics of gadid fishes: implications for the biogeographic origins of Pacific species. Canadian Journal of Zoology, 77(1), 19–26. https://doi.org/10.1139/cjz-77-1-19Cote, D., Konecny, C. A., Seiden, J., Hauser, T., Kristiansen, T., & Laurel, B. J. (2021). Forecasted shifts in thermal habitat for cod species in the northwest Atlantic and eastern Canadian Arctic. Frontiers in Marine Science, 8(November), 1–15. https://doi.org/10.3389/fmars.2021.764072
Relevé multidisciplinaire hivernal d'évaluation des poissons de fond dans le nord du golfe du Saint-Laurent (NM Gadus Atlantica 1978 - 1994)
Pêches et Océans Canada (MPO) a effectué des relevés scientifiques multidisciplinaires hivernaux au chalut de fond dans le nord du golfe du Saint-Laurent et le détroit de Cabot de 1978 à 1994. Les spécificités des missions réalisées à bord du MV Lady Hammond sont décrites ci-dessous.Objectifs:1. Évaluer l'abondance et la condition des populations de poissons de fond2. Évaluer les conditions environnementales3. Inventorier la biodiversité4. Récolter des échantillons pour divers projets de rechercheDescription du relevéCe relevé hivernal couvre le nord du golfe du Saint-Laurent soit les divisions 4R, 4S, 3Pn et la partie septentrionale de la division 4T de l’Organisation des Pêches de l’Atlantique Nord-Ouest (OPANO). Ce relevé suit un plan d’échantillonnage aléatoire stratifié et l’engin de pêche utilisé sur le NM Gadus Atlantica est un chalut de fond à panneaux Engel 145. La durée de chalutage pour un trait standard de pêche est de 30 minutes, calculée à partir du contact du chalut avec le fond. La vitesse de chalutage est fixée à 3.5 nœuds.DonnéesÀ chacun des traits de pêche, la capture est triée et pesée par taxon et les individus sont dénombrés et des données biologiques sont récoltées sur un sous-échantillon. Pour les poissons, les crabes et les encornets, la taille et le poids sont colligés par individu. De plus, pour certaines espèces, le sexe, la maturité des gonades et les poids de certains organes (estomac, foie, gonades) sont aussi évalués. Les rayons mous de la nageoire anale sont dénombrés pour les sébastes et des otolithes sont conservés pour la morue et le flétan du Groenland. Les invertébrés sont pesés et dénombrés par taxon (pas de mesure individuelle).Les données biologiques sont divisées en 4 fichiers : Un fichier « Métadonnées » contenant les informations des traits, un fichier « Captures » contenant les prises par trait pour les taxons de poisson, un fichier « Carbio » contenant les caractéristiques biologiques et morphométriques par individus et un fichier « Fréquences Longueur » pour les fréquences de longueur des poissons. Il est important de noter qu'il s'agit des données brutes. Seuls les traits considéré réussis sont conservés. Dans chacun des traits toutes les espèces sont conservées sauf quelques exceptions. Veuillez contacter l'équipe de la gestion de données pour de plus amples informations (gddaiss-dmsaisb@dfo-mpo.gc.ca).
Distributeurs de kits de test rapide d'antigène pour la COVID-19 au Manitoba
Couche de points caractéristiques montrant les sites de distribution des kits de test rapide d'antigène de la COVID-19 au Manitoba.Couche de points caractéristiques montrant l'emplacement des sites de distribution où des kits de test rapide d'antigène de la COVID-19 sont actuellement disponibles au Manitoba. L'objectif principal de ces données est de communiquer au public les heures d'ouverture de ces sites. Les distributeurs comprennent des pharmacies, des magasins de détail et des bibliothèques communautaires. Ces données sont fournies par Manitoba Shared Health et sont mises à jour au besoin. Cette couche de caractéristiques est utilisée dans la carte de disponibilité des kits de test rapide d'antigène pour la COVID-19 du Manitoba et dans l'application de disponibilité des kits de test rapide d'antigène de la COVID-19 du Manitoba. Pour plus d'informations sur la réponse du Manitoba à la COVID-19, veuillez consulter le site suivant : https://www.gov.mb.ca/covid19/index.html Champs inclus [Alias (Nom du champ) : Description du champ] Catégorie du site (Site_Category) : Indique s'il s'agit d'un commerce de détail, d'une pharmacie ou d'une bibliothèque communautaire Nom du site (Site_Name) : Nom commercial officiel du site Adresse (Adresse) : Adresse du site Ville ou village (City_or_Town) : Ville ou village où se trouve le site Code postal (Postal_Code) : Code postal correspondant à l'adresse postale du site Téléphone (Téléphone) : Numéro de téléphone du site Service français (French_Service) : indique si un site s'est identifié comme proposant des services disponibles en français ; si inconnu, la valeur est nulle Autorité sanitaire (Health_Authority) : Nom de l'autorité sanitaire régionale où se trouve le site Heures d'ouverture (Hours_of_operation) : Liste des jours et heures d'ouverture du site au public Alt Hours Start (Alt_Hours_Start) : Date de début ou autre heures en vigueur Alt Hours End (Alt_Hours_End) : date de fin à laquelle les heures alternées sont en vigueur Heures alternées de Fonctionnement (Alternate_Hours_of_Operation) : liste des jours et heures alternatifs auxquels le site est ouvert au public Latitude (latitude) : coordonnée latitudinale du site Longitude (longitude) : coordonnée longitudinale du site** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**
Tableau des saisons de chasse GHA
Le but de cet ensemble de données est de donner une représentation précise des limites de la chasse au gibier au Manitoba.Le but de cet ensemble de données est de donner une représentation précise des limites de chasse au gibier au Manitoba. Les zones de chasse au gibier (GHA) sont définies conformément au Règlement sur les zones et zones de chasse (220/86) de la Loi sur la faune (CCSM c. W130). Les zones de chasse au gibier sont utilisées pour établir les limites pour les saisons de chasse spécifiques à l'espèce, les allocations de prises, les limites de prises et les règlements connexes. Reportez-vous au règlement sur les zones et zones de chasse pour les descriptions des limites de la GHA. Champs inclus (Alias (nom du champ) : description du champ) OBJECTID (OBJECTID) : nombres entiers uniques séquentiels générés automatiquement GHA (GHA) : le numéro attribué à chaque zone de chasse Shape_Length (Shape_Length) : la longueur de l'entité en unités internes Shape_Area (Shape_Area) : surface de l'entité en unités internes au carré** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**
Biologique et écologique
Symbolisation et publication de l'ensemble de données de caractéristiques ISO BiologicEcologic. 5 septembre 2017.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**
Genre Dominant - Schéma des attributs communs pour les inventaires des ressources forestières
Le Schéma des attributs communs pour les inventaires des ressources forestières (SACIRF) est un dépôt de données d’inventaire sur les ressources forestières du Canada. Les ensembles de données d’inventaire sur les ressources forestières du SACIRF sont harmonisés selon un modèle de données commun afin de pouvoir utiliser ensemble les données recueillies par divers organismes appliquant des normes différentes. Les ministères et organismes provinciaux, territoriaux et fédéraux participants partagent des ensembles de données d’inventaire sur les ressources forestières cartographiques actuelles et historiques par l’intermédiaire du SACIRF, afin que leurs données soient accessibles aux utilisateurs dont les domaines d’intérêt couvrent de multiples provinces et territoires. Le SACIRF a initialement été élaboré par des chercheurs universitaires (Cumming et coll., https://doi.org/10.1139/cjfr-2014-0102).Cette version du SACIRF (SACIRF v5) a été élaborée de nouveau en collaboration avec des chercheurs universitaires de l’Université Laval pour offrir une version gouvernementale du SACIRF qui soit repérable, accessible, interexploitable et réutilisable. Elle utilise les données les plus actuelles sur l’inventaire forestier communiquées par les ministères et organismes provinciaux, territoriaux et fédéraux participants. Le SACIRFv5 est hébergé dans le portail de données du Conseil canadien des ministres des forêts, le Système national d’information sur les forêts (http://nfis.org).
Gamme hivernale pour les ongulés - Approuvé
L'ensemble de données contient les limites légales approuvées pour l'aire d'hivernage des ongulés et les zones spécifiées pour les espèces d'ongulés.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Tableau supplémentaire sur l'étiquette d'inventaire forestier
Ce tableau est une liste d'attributs de polygones à utiliser dans la production de cartes pour la série de cartes de l'Inventaire de la végétation. Il contient des informations sur les attributs des polygones de l'inventaire qui ne sont pas étiquetés avec l'annotation d'inventaire. Les informations attributaires sont extraites de ce tableau pour être utilisées comme étiquettes supplémentaires sur la mise en page de la carte pour la série de cartes de l'Inventaire forestier.Distribué depuis [GeoYukon] (https://yukon.ca/geoyukon) par le [gouvernement du Yukon] (https://yukon.ca/maps). Découvrez d'autres données cartographiques numériques et des cartes interactives issues de la collection de données cartographiques numériques du Yukon.Pour plus d'informations : [geomatics.help@yukon.ca] (mailto : geomatics.help@yukon.ca)
Activité grippale et pseudogrippale - Semaine Courante
Surveillance de l’influenza est un système national qui sert à assurer une surveillance constante de la grippe et de maladies semblables à la grippe au Canada.La surveillance des niveaux d’activité est une composante de Surveillance de l'influenza qui donne une évaluation globale de l’intensité et de la répartition géographique des cas de grippe confirmés en laboratoire, de l’activité pseudogrippale et des éclosions signalées pour une région de surveillance donnée. Une région de surveillance peut être classée dans l’une des quatre catégories suivantes : aucune activité, sporadique, localisée ou étendue.Pour une description des catégories, consultez la ressource Dictionnaire de données. Pour de plus amples renseignements sur l’activité de la grippe au Canada, consultez le rapport Surveillance de l'influenza.(https://www.canada.ca/fr/sante-publique/services/maladies/grippe-influenza/surveillance-influenza/rapports-hebdomadaires-influenza.html)Remarque : Les niveaux d’activité signalés reflètent les données de surveillance disponibles pour la Surveillance de l’influenza au moment de la production. Des retards de communication des données peuvent affecter les données de façon rétrospective.
Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur COI
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b
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