Programmes qui effectuent une analyse en laboratoire des fluides corporels et des tissus afin de déterminer la présence d'irrégularités ou d'identifier des substances inconnues soumises pour analyse. La définition est protégée par le droit d'auteur par Information and Referral Federal of Los Angeles County, Inc. (https://211taxonomy.org/subscriptions/#agreement)** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

Ces ensembles de données fournissent des informations relatives aux estimations de crevettes et de prises accessoires associées au chalutage à panneaux et au casier (novembre 2000) et au chalutage à perche (février 2001) dans le détroit de Simoom. Les ensembles de données ont été compilés et mis en forme par Meagan Mak.Résumé du rapport :Dans Ie cadre d'un projet d'étude des modifications physiques probables des écosystèmes marins imputables à la pêche des crevettes au chalut et au casier, on a recueilli des données sur les prises de poissons et de crevettes, les prises accessoires, ainsi que Ie poids, la proportion relative des sexes, l'emplacement des ceufs et les dommages collateraux à plusieurs espèces de Pandalides et d'Eualidés. On a aussi évalué les dommages causés en particulier à la crevette à front rayé (Pandalus hypsinotusy , soit au rostre, à la carapace, à I'abdomen et à l'éventail caudal, capturée au chalut à perche, au chalut à panneaux et au casier. Sont aussi inc1uses dans Ie présent document des données recueillies dans Ie cadre d'une étude préliminaire réalisée dans Ie chenal Northumberland en juin 2000 et d'un échantillonnage plus exhaustif effectué dans Ie détroit de Simoom en novembre 2000 et en février 2001.

Pêches et Océans Canada (MPO) a sélectionné le secteur de la péninsule de Manicouagan comme site d’intérêt pour l’établissement éventuel d’une Zone de Protection Marine (ZPM) en 1998. Dans cet optique, le MPO a procédé à des relevés permettant l’évaluation de la biodiversité benthique entre 2006 et 2008.Lors des différentes campagnes, plus d’une centaine de stations ont été échantillonnées au moyen de divers engins permettant de cibler les espèces épibenthiques et endobenthiques. Divers engins ont été utilisés lors des trois années d’échantillonnage, notamment une benne SM (Smith-McIntyre) d’une superficie de 0.1 m2 et hauteur de 20 cm, une benne de type IKU d’une superficie de 1,5 m2 et hauteur de 50 cm, une drague hydraulique mesurant 1,36 m de large et 0,66 m de hauteur avec une maille de filet de 2.3 cm. Comme la drague colmatait assez rapidement, des organismes de petites tailles étaient récoltés abondamment. En 2006 et 2007, une caméra installée sur un traineau tiré par un bateau le long de transects de longueur variable selon les campagnes d’ échantillonnage a récolté des images (3 008 x 2 000 pixels) aux 10 secondes, représentant une superficie du fond marin de 40 x 40 cm.Les données sont présentées en format Darwin Core dans le fichier “donnees_manicouagan_data”. Les données disponibles comprennent les identifications taxonomiques des échantillons (individus récoltés ou identifiés sur les images) ainsi que les métadonnées liées aux stations, notamment la date d’échantillonnage, la profondeur et les coordonnées géographiques. Noter que les profondeurs sont à titre indicatif seulement, la bathymétrie étant très abrupte dans ce secteur. De plus amples détails sur l’échantillonnage se trouvent dans le rapport suivant : Provencher, L et Nozères, C. 2011. Protocole de suivi des communautés benthiques de la zone de protection marine Manicouagan. Secr. can. de consult. sci. du MPO. Doc. de rech. 2011/051. iv +25 p. https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/344357.pdf

OBJECTIF :La chlorophylle a est un pigment photosynthétique commun aux algues aquatiques, et sa mesure peut fournir une estimation de l’abondance des algues flottant librement dans un système aquatique. Depuis plus de 40 ans, le bureau de Pêches et Océans Canada – Laboratoire des Grands Lacs pour les pêches et les sciences aquatiques (MPO-LGLPSA) à Sault Ste. Marie (Ontario) recueille des échantillons d’eau afin d’effectuer une analyse spectrophotométrique de la chlorophylle a, produisant des données sous forme de mg/m3. La collecte de données sur la chlorophylle a a généralement été effectuée pour aider à caractériser le niveau de productivité primaire des systèmes aquatiques, car cela peut influer sur l’abondance des poissons. Il s’agissait d’une mesure supplémentaire de la qualité de l’habitat du poisson dans ces systèmes qui servira à divers projets liés au poisson pertinents au mandat du MPO. L’uniformité de la collecte des données dépendait de la durée de chaque projet et du financement disponible. DESCRIPTION :L’étude initiale a permis de recueillir des données sur la chlorophylle a des cinq lacs du bassin des lacs Turkey (BLT – nord et sud des lacs Batchawana, lac Wishart, lac Little Turkey et lac Turkey) ainsi que du lac Quinn, qui est situé à l’extérieur du BLT (voir Smokorowski et coll., 2006) en partenariat avec Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) et Ressources naturelles Canada (RNCan) dans le cadre de l’Initiative canadienne sur les pluies acides. On a entrepris l’étude du bassin du BLT en 1979 pour évaluer les répercussions des pluies acides sur les écosystèmes terrestres et aquatiques. Cet ensemble de données comprend des données sur la chlorophylle a recueillies dans cinq lacs du BLT et le lac Quinn (données également recueillies par le Service canadien de la faune et ECCC) de 1983 à 2010, y compris quelques lacunes de durée variable (Webster et coll., 2021). Il convient de souligner qu’une destruction expérimentale de l’habitat a eu lieu dans certains lacs du BLT et dans le lac Quinn en 1999 et 2000. Plus précisément, à l’automne 1999, 50 % des matériaux ligneux grossiers ont été enlevés des rives des lacs Little Turkey et Quinn, et à l’automne 2000, 50 % des matériaux ligneux grossiers ont été enlevés des rives du lac Wishart (détails dans Smokorowski et coll. 2006). Sommaire des méthodes : L’échantillonnage n’a été effectué que pendant la saison des eaux libres, et la fréquence et l’étendue de la fréquence d’échantillonnage dans chaque plan d’eau varient en fonction du projet et du financement. Il n’y a pas de données sur la chlorophylle a pour les années 1986, 1989-1990, 1996-1997, 2006-2007 et 2009.L’échantillonnage a été réalisé en rinçant sur place, au moins trois fois, des bouteilles en polyéthylène brun opaque de 1 L nettoyées. Pour les échantillons prélevés à la main, la bouteille a été immergée sous la surface (moins de 0,5 mètre) pour prélever l’échantillon. Des échantillons dans des tubes composites ont été prélevés à l’aide d’un tube d’échantillonnage d’eau intégré recueillant de l’eau de l’épilimnion de toute la colonne d’eau jusqu’à une profondeur de cinq mètres. Jusqu’à cinq échantillons de 1 L (1 000 ml) ont été prélevés par station et envoyés au laboratoire sur glace. Chaque échantillon de 1 litre a été filtré au moyen de filtres en fibre de verre (Whatman GF/C de 42,5 mm) dans le jour suivant l’échantillonnage, puis congelé avant l’analyse standard de la chlorophylle a (American Public Health Association [APHA] 1985). De 1983 à 1998, les concentrations de chlorophylle a (mg/L) ont été calculées sur la base de la méthode de l’APHA de 1985; de 1998 à aujourd’hui, le calcul est basé sur la méthode de l’APHA de 1998. Les renseignements de l’ensemble de données d’échantillonnage comprennent les géoréférences des emplacements d’échantillonnage, les données brutes pour les calculs de chlorophylle a et les concentrations de chlorophylle a calculées à l’aide des méthodes APHA (1985) et APHA (1998). Cet ensemble de données a été publié en partenariat avec le Projet Living Data de l'institut canadian d'écologie et d'évolution, qui a été financée par un subvention de financement du Programme FONCER du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada. Nous tenons à remercier Caroline Dallstream pour ses efforts dans la publication de cet ensemble de données. MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :Sommaire des méthodes : L’échantillonnage n’a été effectué que pendant la saison des eaux libres, et la fréquence et l’étendue de la fréquence d’échantillonnage dans chaque plan d’eau varient en fonction du projet et du financement. Il n’y a pas de données sur la chlorophylle a pour les années 1986, 1989-1990, 1996-1997, 2006-2007 et 2009.L’échantillonnage a été réalisé en rinçant sur place, au moins trois fois, des bouteilles en polyéthylène brun opaque de 1 L nettoyées. Pour les échantillons prélevés à la main, la bouteille a été immergée sous la surface (moins de 0,5 mètre) pour prélever l’échantillon. Des échantillons dans des tubes composites ont été prélevés à l’aide d’un tube d’échantillonnage d’eau intégré recueillant de l’eau de l’épilimnion de toute la colonne d’eau jusqu’à une profondeur de cinq mètres. Jusqu’à cinq échantillons de 1 L (1 000 ml) ont été prélevés par station et envoyés au laboratoire sur glace. Chaque échantillon de 1 litre a été filtré au moyen de filtres en fibre de verre (Whatman GF/C de 42,5 mm) dans le jour suivant l’échantillonnage, puis congelé avant l’analyse standard de la chlorophylle a (American Public Health Association [APHA] 1985). De 1983 à 1998, les concentrations de chlorophylle a (mg/L) ont été calculées sur la base de la méthode de l’APHA de 1985; de 1998 à aujourd’hui, le calcul est basé sur la méthode de l’APHA de 1998. Les renseignements de l’ensemble de données d’échantillonnage comprennent les géoréférences des emplacements d’échantillonnage, les données brutes pour les calculs de chlorophylle a et les concentrations de chlorophylle a calculées à l’aide des méthodes APHA (1985) et APHA (1998).LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

L'Inventaire forestier national (IFN) du Canada est un programme d'échantillonnage conçu pour appuyer la production de rapports sur les forêts á l'échelle nationale. D'autre part, les cartes continues d'attributs forestiers sont nécessaires pour appuyer les analyses stratégiques des problématiques régionales de politique et d'aménagement. Nous avons donc produit des cartes couvrant 4,03 × 106 km2 de surface forestiére inventorièe en 2001 à partir d'observations normalisées provenant des placettes photos de l'IFN utilisées comme données de référence. Nous avons utilisé la méthode des k plus proches voisins (kNN) avec 26 couches de données géospatiales, y compris les données spectrales MODIS et les variables climatiques et topographiques, pour produire les cartes de 127 attributs forestiers à une résolution de 250 × 250 m. Les attributs à l'échelle du peuplement comprennent le type de couverture terrestre, la structure et l'abondance relative des espéces ďarbres. Dans cet article, nous rapportons seulement la biomasse totale aérienne et vivante des arbres. Tous les autres attributs abordés sont présentés dans la section matériel supplémentaire (http://nrcresearchpress.com/doi/suppl/10.1139/cjfr-2013-0401). En général, les écarts des valeurs prédites à l'échelle du pixel par rapport à celles des placettes photos de validation, sont plus importants dans les régions montagneuses et dans les zones où, soit la biomasse, soit le taux d'échantillonnage de placettes photos est faible. Les valeurs prédites à l'échelle du pixel sont surestimées lorsque les valeurs observées sont petites et sous-estimées lorsqu'elles sont grandes. Les mesures de précision sont améliorées grâce à l'agrégation spatiale des pixels sur 1 km2 et plus. Dans l'ensemble, ces nouveaux produits fournissent des informations de base uniques pour les analyses stratégiques des forêts (https://nfi.nfis.org).Collection:- **[L'Inventaire forestier national (IFN) du Canada de 2006](https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/e2fadaeb-3106-4111-9d1c-f9791d83fbf4)**

Les échantillons d'eau souterraine ont été échantillonnés dans l'unité hydrogéologique à des fins d'analyses diverses. Les échantillons d'eau souterraine ne représentent pas une observation / phénomène particulier. Ils sont employés ici afin d'ajouter des références concernant les analyses d'eau souterraine. Le jeu de données représente une description générale du site d'échantillonnage et de l'échantillon. Les méthodes d'échantillonnage varient selon le type d'analyse.

Un relevé de recherche sur les pétoncles (principalement le pétoncle géant Placopecten magellanicus, mais aussi le pétoncle d’Islande Chlamys islandica) effectué à l'aide d'une drague a été réalisé par le MPO (Pêches et Océans Canada) tous les 1 ou 2 ans depuis 1992 aux Îles-de-la-Madeleine (zone de pêche 20). L'objectif principal de ce relevé de recherche était d'évaluer les stocks de pétoncle géant. Un autre objectif était de documenter les taxons dans la capture associée à l'habitat de pétoncle selon un plan d'échantillonnage aléatoire fixe. Les occurrences de 2021 et 2022 sont présentées ici par espèce (ou taxon) par station. À partir de 2021, les captures étaient pesées et des spécimens photographiés, avec l’information disponible sur demande. La validité taxonomique et géographique des données a été vérifiée et le registre mondial des espèces marines a servi d'autorité taxonomique pour nommer tous les taxons enregistrés lors du relevé. Les invertébrés épibenthiques (principalement des mollusques, échinodermes et crustacés) ainsi que des poissons démersaux ont été identifiés à partir des captures de la drague. Le jeu de données historiques (1992-2019) est diponible à partir du lien suivant : https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/71732ad5-5c70-4dbf-916d-a94e1380c53bL'aire d'étude est située au sud des Îles-de-la-Madeleine et l'échantillonnage des gisements de pétoncles est effectué à des profondeurs autour de 25 à 35 m. Un tir aléatoire des stations d’échantillonnage est réalisé à partir d’une grille de station fixe. L'échantillonnage est fait le long de transects à ces stations tirées aléatoirement dans la zone d'étude. L'échantillonnage se fait avec une drague à pétoncle Digby doublée (maille de 20 mm) sur approximativement 500 m le long du fond marin. Les quatre paniers de la drague sont examinés pour tous les pétoncles et aussi, débutant en 2022, pour les poissons. Un panier (le premier du côté tribord) est trié et examiné pour les espèces associées. La plupart des spécimens sont comptés par taxon. La présence ou l’abondance relative des organismes trop petits et nombreux, ou coloniaux, est notée. Des cas particuliers sont parfois conservés pour l'analyse taxonomique, par exemple, les ascidies (pour surveiller les espèces envahissantes) et les éponges (pour documenter de nouvelles espèces). La disponibilité de photos et de certains spécimens conservés permet un examen futur. Des changements sont anticipés dans les identifications, notamment pour les Bryozoaires, les Hydrozoaires et les Porifères, qui font actuellement l'objet d'efforts de recherche.

Des échantillons biologiques de panopes du Pacifique ont été recueillis au cours de relevés en Colombie-Britannique dans le cadre d'objectifs de relevés plus vastes pour déterminer la densité, la répartition et la structure des populations de la panope. Des échantillons de panopes ont été prélevés à 41 sites à travers la Colombie-Britannique entre 1993 et 2002. Les mollusques ont été mesurés pour en connaître le poids total, la longueur de coquille, le poids de la coquille ainsi que l'âge. Les paramètres biologiques sont présentés ici pour chaque panope échantillonnée. Voir Bureau D., W. Hajas, N.W. Surry, C.M. Hand, G. Dovey and A. Campbell. 2002. Age, size structure and growth parameters of Geoducks (Panopea abrupta, Conrad 1849) from 34 locations in British Columbia sampled between 1993 and 2000. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 2413: 84 p. et Bureau D., W. Hajas, C.M. Hand and G. Dovey. 2003. Age, size structure and growth parameters of Geoducks (Panopea abrupta, Conrad 1849) from seven locations in British Columbia sampled in 2001 and 2002. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 2494: 29 p.

Dans le cadre de l’élaboration d’un plan d'échantillonnage uniforme à l’échelle nationale pour le Programme de surveillance de l’aquaculture (PSA), ces données présentent les assemblages de mésozooplancton observés dans neuf sites d’aquaculture conchylicole côtiers répartis dans quatre régions du MPO, avec des échantillons prélevés à différents mois, marées et localisations. Dans la plupart des sites, de forts effets spatiaux ont été observés, tandis que les effets de la marée étaient généralement moins importants dans la structuration des communautés de mésozooplancton. La saisonnalité s’est avérée un facteur essentiel pour concevoir un programme de surveillance efficace. Ce jeu de données représente la première étude côtière canadienne de grande envergure utilisant la technologie d’imagerie pour l’identification taxonomique du plancton.Citer ces données comme: Finnis, S., Guyondet, T., McKindsey, C.W., Arseneau, J., Barrell, J., Duhaime, J., Filgueira, R., Gallardi, D., Gaspard, D., Gibb, O., Goodwin, C., Hua, K., Macdonald, T., Milne, R., Lacoursière-Roussel, A. 2023. Guidance on sampling effort to monitor mesozooplankton communities at Canadian bivalve aquaculture sites using an optical imaging system. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3581: vii + 101 p

Un projet exploratoire sur la diversité taxonomique et génétique de décapodes échantillonnés en 2022 dans trois sous-régions océaniques (Pacifique Nord-Est, Arctique canadien et Atlantique Nord-Ouest) a été réalisé par le groupe de travail sur l'Arctique au sein de la collaboration canado-américaine sur les pêches et le climat entre Pêches et Océans Canada (MPO) et le National Marine Fisheries Service (NMFS) de la National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA). Ce cadre de collaboration vise à mettre en commun les données canadiennes et américaines afin d'étudier les effets du changement climatique à grande échelle sur la biodiversité marine. Au début de l'été 2022, un protocole d'échantillonnage illustrant une sélection des décapodes ciblés a été fourni aux collaborateurs du MPO et de la NOAA. Les genres ciblés ont été collectés dans le cadre de 10 programmes de recherche au total, dans trois sous-régions océaniques et quatre régions marines. Les échantillons du Pacifique Nord-Est ont été collectés dans la mer de Béring au cours de l'étude de l'écosystème de la mer de Béring septentrionale et du chalutage de surface, et de l'étude du chalutage de fond du plateau continental de la mer de Béring orientale et septentrionale sur les poissons de fond et la faune invertébrée, à bord du F/V Northwest Explorer, du F/V Alaska Knight et du F/V Vesteraalen. Dans l'ouest de l'Arctique canadien (principalement dans la mer de Beaufort et le golfe d'Amundsen), les spécimens ont été collectés au cours de l'étude du MPO sur l'évaluation de l'écosystème marin de la mer de Beaufort (CBS-MEA) à bord du F/V Frosti. Dans l'est de l'Arctique canadien (principalement dans la baie de Baffin et le détroit de Davis), les spécimens ont été recueillis lors du relevé de l'approche fondée sur les connaissances et les écosystèmes dans la baie de Baffin (KEBABB) du MPO à bord du NGCC Amundsen et du relevé de la sous-zone 0B de l'Organisation des pêches de l'Atlantique Nord (OPANO) à bord du R/V Tarajoq. Dans l'estuaire et le golfe du Saint-Laurent (EGSL), des spécimens ont été recueillis lors de relevés côtiers (relevés sur le buccin, le concombre de mer, le crabe des neiges et les pétoncles) à bord du NGCC Leim et au large lors du relevé écosystémique à bord du NGCC Teleost. Les décapodes ont été collectés à partir de divers engins d'échantillonnage (chalut à perche benthique, chalut à panneaux modifié Atlantic Western IIA, chalut Bacalao, chalut à crevettes, drague à pétoncles de type Digby ou drague à concombres de mer modifiée) et identifiés au niveau taxonomique le plus bas possible et photographiés, dans la mesure du possible. Tous les spécimens ont été congelés en mer (n = 995). Au laboratoire, les identifications ont été validées ou affinées à l'aide des photos et des spécimens congelés. L'ADN de 87 spécimens a été extrait et une section du gène COI a été amplifiée afin d'être séquencée à l'aide de la méthode Sanger. Les séquences ont été comparées aux données existantes à l'aide de l'outil BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) dans la base de données des nucléotides du National Center for Bio-technology Information (NCBI-nt, y compris la base de données GenBank) afin de comparer les noms scientifiques, le cas échéant.L'ensemble de données actuel comprend 391 occurrences d'espèces de décapodes. L'ADN a été extrait d'un sous-groupe de 87 spécimens (gène COI). Les séquences sont accessibles publiquement sur la plateforme BOLD sous le code de projet DDAO (voir le document de soutien « citations_references.csv » pour plus d'informations).Les données sont présentées en format Darwin Core et sont séparées en trois fichiers :Le fichier " Activité_décapodes_DDAO_decapods_event_fr" contient les informations des missions, des stations et des déploiements, qui sont présenté sous une structure d'activité hiérarchique.Le fichier " Occurrence_décapodes_DDAO_decapods_fr" contient les occurrences taxonomiques.Le fichier "ADN_décapodes_DDAO_decapods_DNA_fr" contient les données ADN associées.Pour de plus amples détails, veuillez vous référer au rapport technique disponible dans le document de soutien intitulé « citations_references.csv ». LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.