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Hydrologie : limites des zones hydrologiques de la Colombie-Britannique
Zones représentant des zones présentant des caractéristiques hydrologiques et géomorphologiques homogènes** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Observations de requins blancs (Carcharodon carcharias) dans le Canada atlantique (de 1873 à 2022)
Les emplacements sont indiqués selon les informations disponibles. Lorsque les coordonnées ne sont pas disponibles, l’emplacement approximatif est indiqué à l’aide de la description associée à l’enregistrement. L’effort n’est pas pris en compte dans cet ensemble de données et il n’est pas réparti de manière égale dans la zone représentée sur la carte. Les données provenant du marquage acoustique ou par satellite ne sont pas incluses dans cet ensemble de données. À noter que les enregistrements ne sont pas tous confirmés. Les enregistrements et les signalements concernant les requins blancs sont classés comme confirmés ou non confirmés par les experts scientifiques du MPO d’après les renseignements dont ils disposent (par exemple, images, vidéos, descriptions).
Lits d’éponges siliceuses sur le plateau néo-écossais et biodiversité connexe
Le bassin d’Émeraude, sur le plateau néo-écossais, au large de la Nouvelle-Écosse (Canada), abrite une population unique au monde d’éponges siliceuses Vazella pourtalesi. Grâce à l’analyse de photographies in situ et de données sur les prises au chalut provenant des relevés plurispécifiques annuels au chalut de fond, nous avons examiné la composition de la communauté, la densité des espèces et l’abondance de l’épibenthos et des poissons associés à V. pourtalesi par rapport à des emplacements qui n’abritent pas cette éponge. Nous avons évalué l’importance de V. pourtalesi pour améliorer la densité et l’abondance des espèces de la communauté épibenthique connexe, par rapport au substrat dur sur lequel elle se fixe, à l’aide de modèles linéaires généralisés et d’une analyse de similarité. Nos résultats indiquent que l’assemblage de mégafaune associé à V. pourtalesi était nettement différent sur le plan de la composition et plus élevé en ce qui concerne la densité et l’abondance des espèces par rapport aux sites sans V. pourtalesi. L’analyse de similarité des données sur les prises au chalut a montré que les communautés de poissons associées aux lits d’éponges sont sensiblement différentes de celles sans V. pourtalesi, bien qu’aucune espèce n’ait été trouvée exclusivement sur les lits d’éponges. Notre étude fournit des preuves supplémentaires du rôle joué par les lits d’éponges dans la structure des communautés et la biodiversité des communautés épibenthiques et halieutiques correspondantes dans les eaux profondes. Le mécanisme d’amélioration de la biodiversité dans les lits d’éponges formés par V. pourtalesi est probablement l’effet combiné de l’éponge elle-même et du substrat sur lequel elle se fixe, qui constituent ensemble l’habitat des lits d’éponges. Nous discutons également du rôle de la fourniture d’habitat entre les diverses espèces d’éponges tétractinellides du bonnet Flamand et les lits d’éponges siliceuses monospécifiques du bassin d’Émeraude. Veuillez consulter le document de référence suivant pour obtenir des renseignements supplémentaires au sujet des données :Hawkes N, Korabik M, Beazley L, Rapp HT, Xavier JR et Kenchington E (2019). Glass sponge grounds on the Scotian Shelf and their associated biodiversity. Mar Ecol Prog Ser 614, pp. 91 à 109. https://doi.org/10.3354/meps12903Citer ces données comme: Hawkes, Nickolas; Korabik, Michelle; Beazley, Lindsay; Rapp, Hans Tore; Xavier, Joana; Kenchington, Ellen (2019). Lits d’éponges siliceuses sur le plateau néo-écossais et biodiversité connexe. Publié en Septembre 2023. Secteur des sciences des écosystèmes et des océans, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É). https://open.canada.ca/data/en/dataset/83c8e9af-ad3a-40bc-b1b7-d1ed4a069330
RCBA Réseau Canadien de Biosurveillance Aquatique
Le Réseau canadien de biosurveillance aquatique (RCBA) est un programme de biosurveillance aquatique visant à évaluer la santé des écosystèmes d'eau douce au Canada. Les macroinvertébrés benthiques sont récoltés sur un site et leurs dénombrements sont utilisés comme indicateurs de la santé de ce plan d'eau. Le RCBA se base sur l'approche du réseau de réseaux qui favorise la collaboration interorganisationnelle et le partage de données afin de produire des rapports cohérents et comparables sur la qualité de l'eau douce et les conditions des écosystèmes aquatiques au Canada. Le programme est mis à jour par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) pour soutenir la récolte, l'évaluation, la production de rapports et la distribution d'information sur la surveillance biologique. Un ensemble de protocoles RCBA normalisés à l'échelle nationale est utilisé pour la collecte sur le terrain, les travaux de laboratoire et l'analyse des données de surveillance biologique. Un programme de formation est disponible pour la certification des participants aux protocoles normalisés. Il y a deux types de sites dans la base de données RCBA (référence et test). Les sites de référence représentent les habitats les plus proches de «l’état naturel» avant toute perturbation anthropique. Les données provenant des sites de référence servent à créer des modèles de référence que les partenaires du RCBA utilisent pour évaluer leurs sites test selon une approche connue sous le nom d'approche des conditions de référence (ACR). À l'aide des modèles d'ACR, les partenaires du RCBA jumellent leurs sites test à des groupes de sites de référence pour des habitats similaires et comparent les communautés de macroinvertébrés observées. L'importance des divergences entre les communautés de sites test et les communautés de sites de référence permet aux partenaires du RCBA d'estimer la gravité des impacts à ces endroits. Les échantillons RCBA ont été récoltés depuis 1987 et sont organisés dans la base de données par étude (projet partenaire). Chaque étude comporte des données sur les sites, les habitats et les invertébrés benthiques, et ceci dans les 11 principaux bassins hydrologiques (MDA) du Canada. Des liens vers des données complémentaires sur la qualité de l'eau sont fournis lorsqu'elles sont disponibles. Les visites peuvent être effectuées au même endroit au fil du temps, les visites récurrentes étant identifiées par un nom d'étude / un code de site identique avec des dates différentes. Toutes les données recueillies par le gouvernement fédéral sont disponibles sur Open Data, et de plus en plus de partenaires y ajoutent continuellement leurs données. Les fichiers csv sont mis à jour sur une base mensuelle. Contactez le responsable d'étude RCBA pour demander l'autorisation d'accéder aux données non libres.
Séquences d'ADN de coraux d'eau froide de l'est du Canada: Partie 1
Les coraux d'eau froide sont communs dans les eaux au large de l'est du Canada. Malgré cela, peu de registres de séquences d’ADN de spécimens collectés dans la région sont disponibles dans GenBank, et toutes les espèces enregistrées dans la région ne disposent pas de données de séquence, quelle que soit leur origine géographique. Cela peut limiter l’utilisation de techniques comme l’ADN environnemental pour détecter et identifier les coraux. Notre objectif était de séquencer et de publier des séquences pour deux marqueurs de code-barres ADN pour les octocoraux : CO1 et MutS. Nous avons séquencé et déposé 36 séquences dans GenBank à partir de 19 spécimens représentant trois espèces de plume de mer (Octocorallia : Pennatuloidea) : Distichoptilum gracile, Pennatula aculeata et Protoptilum carpenteri. L'identification de tous les spécimens a été confirmée par B. M. Neves (MPO-TNL) avant la soumission. Des spécimens et des tissus d'ADN ont été donnés au Musée canadien de la nature, où ils sont actuellement conservés. Cette publication représente la première partie d'une série de soumissions à GenBank par notre laboratoireLes spécimens ont été collectés dans l’Atlantique nord-ouest et proviennent de profondeurs comprises entre 200 et 1924 mètres. Les spécimens ont été collectés dans le cadre de relevés au chalut multi-espèces menés par des navires de recherche ou de relevés effectués par des véhicules télécommandés (ROV ROPOS). L'ADN a été isolé et purifié à l'aide du kit QIAgen DNeasy Blood and Tissue, avec une incubation initiale d'une nuit avec la protéinase K. Deux régions de code-barres couramment utilisées pour les octocoraux ont été amplifiées à l'aide d'amorces décrites précédemment : 1) COII8068F (McFadden et al., 2004) et COIOCTR (France et Hoover, 2002) pour le gène CO1, et 2) ND42599F (France et Hoover, 2002) et mut3458R (Sánchez et al., 2003) pour le gène MutS. Les amplifications ont été réalisées en utilisant 12.5 µl de Green DreamTaq Master Mix (Thermo Fisher Scientific), 1 µl d'ADN matrice, 0.5 µl de chaque amorce sens et antisens à 10 µM, 0.5 µl d'amorce antisens à 10 µM et 10.5 µl d'eau. Le thermocyclage a été effectué comme suit : 3 minutes de dénaturation initiale à 95 °C, suivis de 40 cycles à 95 °C pendant 30 s, 30 s à une température de hybridation de 48 °C, puis 65 s à une température d'élongation de 72 °C, et un allongement final à 72 °C pendant 4 min. Les produits de PCR ont été purifiés à l'aide de l’Agencourt AMPure XP beads (Beckman Coulter) et envoyés au Centre for Applied Genomics, Toronto, Canada pour le séquençage Sanger. Les séquences ont été visualisées et alignées à l’aide de Geneious Prime 2022.0.2. Les séquences obtenues ont été déposées dans GenBank sous les numéros d'accès OQ569768-OQ569784 et OQ420359-OQ420377.Ce projet a été financé par Pêches et Océans Canada dans le cadre d'une subvention pour le renforcement des capacités régionales (2020-2021) et du Programme des objectifs de conservation marine (MCT) (2021-2024), région de Terre-Neuve-et-Labrador.
Données des étiquettes satellites de requins pélagiques - Requin-taupe bleu
Le requin-taupe bleu (Isurus oxyrinchus) est une espèce présente dans les eaux canadiennes de l’Atlantique qui est observée dans les pêches commerciales et récréatives. De 2011 à 2013, des étiquettes satellites d’archivage détachables (PSAT) de Wildlife Computers ont été appliquées sur des requins-taupes bleus afin de recueillir des données sur la profondeur (pression), la température et le niveau de lumière ambiante (pour l’estimation de la position). Des déploiements ont été effectués au Canada à bord de navires commerciaux, généralement en été et en automne, de juillet à octobre. Deux types de modèles d’étiquettes ont été déployés : Mk10 (N = 28) et Minipat (N = 9), et 28 des 37 étiquettes ont émis des données (une femelle a été recapturée). Les requins-taupes bleus marqués avaient une longueur à la fourche (courbée) de 80 cm à 229 cm; 13 étaient des femelles, 17 étaient des mâles et 7 étaient de sexe inconnu. Le temps avant la recapture variait de 0 à 185 jours et 6 étiquettes sont demeurées attachées pendant toute la durée prévue. Les données brutes transmises par les PSAT après le déploiement ont été traitées au moyen du logiciel de Wildlife Computers (GPE3) pour obtenir des fichiers sommaires, en supposant une vitesse de nage maximale de 2 m/s, de l’ensemble de données haute résolution NOAA OI SST V2 pour les données de référence sur la température de la surface de la mer (TSM), et de l’ensemble de données ETOPO1-Bedrock pour les données bathymétriques de référence. Les estimations de position selon la méthode de vraisemblance maximale sont disponibles en format .csv et .kmz, et les profils de profondeur et de température sont également présentés en format .csv. Les autres données de sortie des étiquettes ainsi que les métadonnées relatives aux déploiements peuvent être obtenues sur demande en écrivant à warren.joyce@dfo-mpo.gc.ca ou heather.bowlby@dfo-mpo.gc.ca.
Données des étiquettes satellites de requins pélagiques - Requin blanc
Le requin blanc (Carcharodon carcharias) est une espèce présente dans les eaux canadiennes de l’Atlantique qui est observée dans les pêches commerciales et récréatives. Depuis 2016, des étiquettes satellites d’archivage détachables (PSAT) de Wildlife Computers ont été appliquées sur des requins blancs afin de recueillir des données sur la profondeur (pression), la température et le niveau de lumière ambiante (pour l’estimation de la position). Des déploiements ont été effectués au Canada et aux États-Unis (Cape Cod et Caroline du Sud) à bord de navires affrétés à des fins scientifiques, généralement en été. Les modèles d’étiquettes déployés étaient les suivants : Mk10 (N=1) et Minipat (N=29), et 22 des 27 étiquettes ont émis des données, dont 3 sont toujours en fonction. Un requin est retourné au site de marquage un an plus tard, et l’étiquette physique a été récupérée. Une autre étiquette a été récupérée cinq ans après le déploiement. La longueur totale (courbée) estimée des requins blancs marqués variait de 259 cm à 459 cm; 15 étaient des femelles, 13 étaient des mâles et 2 étaient de sexe inconnu. Le temps avant la recapture variait de 48 à 377 jours et, jusqu’à maintenant, seulement trois étiquettes sont demeurées attachées au requin pendant la durée prévue. Le marquage de requins blancs fait partie d’une étude en cours et les données seront mises à jour ici lorsqu’elles seront disponibles. Les données brutes transmises par les étiquettes après le déploiement ont été traitées au moyen du logiciel de Wildlife Computers (GPE3) pour obtenir des fichiers sommaires, en supposant une vitesse de nage maximale de 2 m/s, de l’ensemble de données haute résolution NOAA OI SST V2 pour les données de référence sur la température de la surface de la mer (TSM), et de l’ensemble de données ETOPO1-Bedrock pour les données bathymétriques de référence. Les estimations de position selon la méthode de vraisemblance maximale sont disponibles en format .csv et .kmz, et les profils de profondeur et de température sont également présentés en format .csv. Les autres données de sortie des étiquettes ainsi que les métadonnées relatives aux déploiements peuvent être obtenues sur demande en écrivant à warren.joyce@dfo-mpo.gc.ca ou heather.bowlby@dfo-mpo.gc.ca.
Réseau hydrographique de la Nouvelle-Écosse
Le réseau hydrographique de la Nouvelle-Écosse est une version améliorée du thème « Caractéristiques de l'eau » de la base de données topographiques de la Nouvelle-Écosse. Cet ensemble de données comprend des épines de réseau pour la connectivité du débit d'eau et diverses attributions pour la direction du flux, la priorité du débit d'eau et les objets toponymiques, le cas échéant.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Relevé normalisé au casier ciblant la morue charbonnière – Bras de mer continentaux
Données sur les activités de pêche (année, date, heure, lieu, captures et effort) et données biologiques connexes provenant du relevé normalisé sur bras de mer s’inscrivant dans le relevé annuel d’évaluation et de recherche sur la morue charbonnière effectué sur la côte de la Colombie-BritanniqueIntroductionPêches et Océans Canada et la Canadian Sablefish Association collaborent afin de réaliser un relevé de recherche annuel indépendant de la pêche dans le cadre d’un accord conjoint. Pour se faire, on utilise des casiers afin d’obtenir des données sur les taux de capture, des échantillons biologiques, des mesures océanographiques et des données sur la remise à l’eau d'individus étiquetés et leur recapture.Des résumés de données sont fournis ici pour les calées standardisées qui sont menées à des stations fixes dans les bras de mer du continent. La conception du relevé de la morue charbonnière a évolué au fil du temps en incorporant et en abandonnant des éléments, y compris des études expérimentales individuelles (non disponibles sur OpenData). Ce relevé normalisé sur bras de mer est distinct des deux relevés suivants par sa méthodologie:(1) Relevé aléatoire stratifiée en zone extracôtière (2003 – aujourd'hui ; disponible sur OpenData en utilisant le lien ci-dessous),(2) Relevé normalisé au casier – données sur la remise à l’eau d'individus étiquetés et leur recapture en zone extracôtière (de 1990 à 2010, pas encore disponible sur OpenData).Pour le relevé normalisé sur bras de mer, les calées sont attribués à cinq polygones spécifiques dans chacune des quatre zones de bras de mer suivantes : Portland Inlet, Gil Island, Finlayson Channel et Dean/Burke Channel. Les quatre bras de mer ont fait l'objet de relevés réguliers entre 2003 et 2019. Aucun bras de mer n'a été étudié en 2020, et cheque bras de mer a été étudié chaque année depuis 2021. Les procédures du relevé sont normalisées et documentées dans les rapports techniques du ministère canadien de la pêche et des sciences aquatiques.Les tableaux fournis présentent les données du relevé normalisé sur bras de mer sur (i) l’effort, (ii) les captures, (iii) les renseignements biologiques.Données sur l'effort recueillie dans le bras de mer Ce tableau contient des renseignements sur les sorties et les activités de pêche (calées) réalisées dans le cadre du relevé annuel. Les renseignements concernant la sortie comprennent l’année du relevé, un numéro d’identification unique associé à la sortie, le navire à partir duquel le relevé a été réalisé et les dates de début et de fin de la sortie (c’est-à-dire les dates auxquelles le navire n’était pas amarré au quai et était utilisé pour le relevé). Les renseignements concernant la calée comprennent la date, l’heure, l’emplacement et la profondeur de la pêche, la strate de superficie et de profondeur du relevé pour cette calée, la raison justifiant la calée, le temps d’immersion, le nombre de casiers installés et le nombre de casiers avec captures.Tous les événements de pêche réussis sont inclus, les calées réussies étant celles qui répondent aux spécifications de conception de l'enquête.Données sur le capture recueillie dans le bras de merCe tableau contient des renseignements sur les captures issues d’activités de pêche fructueuses. Les captures sont identifiées en fonction de l’espèce ou du niveau taxonomique le plus bas possible. Elles sont consignées selon le poids des poissons pêchés ou leur nombre. Le numéro d’identification unique lié à la sortie et le numéro lié à la calée sont indiqués afin que les captures puissent être associées aux renseignements de l’activité de pêche en question (ce qui comprend l’emplacement de la pêche).Données biologiques recueillies dans le bras de merCe tableau contient les données biologiques des captures échantillonnées. Ces données peuvent comprendre une partie ou l’ensemble des renseignements suivants : la longueur, le poids, le sexe, la maturité et l’âge du poisson. La plupart des captures échantillonnées sont des morues charbonnières. Cependant, certaines années, les captures comprenaient des sébastes, des poissons plats et d’autres espèces de poissons ronds. Des structures servant à la détermination de l’âge sont prélevées et archivées jusqu’à ce qu’elles soient nécessaires à des fins d’analyse; des structures sont donc en attente d'analyse. Des échantillons de tissus (généralement une entaille de nageoire) peuvent être prélevés en vue d’une analyse génétique (ADN) pour identifier l'espèce avec précision. Des échantillons tissus peuvent être archivés jusqu’à ce qu’ils soient nécessaires à des fins d’analyse. Pour obtenir plus de renseignements à ce sujet, veuillez consulter les personnes-ressources. Le numéro d’identification unique lié à la sortie et le numéro lié à la calée sont indiqués afin que les échantillons puissent être associés à l’activité de pêche et aux renseignements sur les captures.
Dépôts de récupération des têtes de salmonidés du Pacifique provenant de la pêche récréative
Emplacement et coordonnées des Dépôts de récupération des têtes de salmonidés du Pacifique provenant de la pêche récréative.La communauté des pêcheurs sportifs a un rôle important à jouer dans la récupération des micromarques magnétisées codées qui ont été posées sur le saumon coho et le saumon quinnat. Une micromarque magnétisée codée est une pièce de câble d'un millimètre sur laquelle a été gravé un numéro unique à l'aide d'un laser. La micromarque est insérée dans le cartilage du nez des jeunes saumons avant qu’ils n’entament leur migration vers l’océan. Le Canada et les États-Unis marquent plus de 50 millions de jeunes saumons tous les ans. Le MPO applique ainsi environ 5,5 millions de micromarques, soit près de 5,5 kilomètres de câble. Les pêcheurs à la ligne peuvent reconnaître la présence d'une micromarque magnétisée codée à l'absence de nageoire adipeuse (située sur la surface dorsale du saumon). Si vous avez pêché un saumon coho ou quinnat comportant une nageoire adipeuse coupée, il suffit de retirer la tête du poisson, de remplir une étiquette de pêche récréative, puis de soumettre la tête à l'un des Dépôts de récupération des têtes de salmonidés pris dans des pêches récréatives dans la zone. Il est aussi important de déposer les têtes provenant des zones estuariennes ou dulcicoles que de ramener celles provenant des zones maritimes. Même si les pêcheurs qui pêchent près des écloseries savent de manière relativement sûre d’où proviennent leurs prises, aucun renseignement ne sera enregistré s’ils ne déposent pas les têtes provenant des poissons sans nageoire adipeuse. Sans ces données, l’état des stocks et la valeur de la ressource risquent d’être sous-évalués.
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