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Initiative Pole to Pole du MBON : Biodiversité des plages de sable dans du sud-ouest du Nouveau-Brunswick, Canada
L’initiative Pole to Pole du Marine Biodiversity Observation Network (MBON P2P) a pour but d’élaborer un cadre pour la collecte, l’utilisation et le partage de données sur la biodiversité marine d’une manière coordonnée et normalisée, en s’appuyant sur l’infrastructure existante gérée par le Système mondial d’observation de l’océan (SMOO; COI-UNESCO), le Réseau d’observation de la biodiversité du Groupe des observations de la Terre (GEO BON) et le Système d’information biogéographique des océans (OBIS). L’initiative Pole to Pole du MBON vise à devenir une ressource essentielle pour la prise de décision et la gestion des ressources vivantes dans les pays des Amériques en ce qui concerne les exigences en matière de rapports, et ce, dans le cadre de la Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES), des objectifs d’Aichi sur la Convention sur la diversité biologique (CDB) et des objectifs du Programme de développement durable à l’horizon 2030.Cette collecte correspond aux espèces que l’on a observées sur les plages de sable du havre Musquash, la baie Mispec et de Plage de New River au Nouveau-Brunswick, au Canada, en utilisant le protocole d’échantillonnage de MBON P2P pour les plages de sable, avec le financement du Programme sur les données environnementales côtières de référence du gouvernement du Canada.La présente publication doit être citée comme suit : Reinhart B, Jonah L (2025). MBON POLE TO POLE: SANDY BEACH BIODIVERSITY OF SOUTHWEST NEW BRUNSWICK, CANADA. Version 1.7. Caribbean OBIS Node. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/mbon/resource?r=sandybeachesbayoffundynb&v=1.7
Milieux boisés RCI
Milieux boisés d'intérêt et écosystèmes ou habitats particuliers visés par le Règlement de contrôle intérimaire (RCI) Plan nature modifié par le règlement 1274-1.Attributs :MB_ID - Identifiant du milieu boiséECOHABPARTICULIER - Présence d'un écosystème ou habitat particulier (Oui/Non)INFORCI - Information supplémentaire sur le Règlement de contrôle intérimaire
Stations de Surveillance de la Biodiversité pour la Macrofaune et la Méiofaune Benthiques dans Les Aires de Conservation de Disko Fan et du Bassin Hatton
En 2012 et 2013, Pêches et Océans Canada a effectué des relevés du benthos dans deux zones fermées à la pêche entrant en contact avec le fond : la zone d’hivernage du narval et de coraux d’eaux froides (l’actuelle aire de conservation de Disko Fan, ACDF) et la zone de protection volontaire des coraux dans le bassin Hatton (l’actuelle aire de conservation du bassin Hatton, ACBH). Des échantillons ont été prélevés selon les protocoles recommandés dans le Plan de surveillance de la biodiversité circumpolaire du Conseil de l’Arctique, dans le but de fournir des données de référence pour la surveillance future des invertébrés benthiques dans cette région sensible, ainsi que de faciliter les comparaisons panarctiques des communautés benthiques. Cinq stations de surveillance de la biodiversité ont été établies, quatre dans l’aire de conservation de Disko Fan et une dans l’aire de conservation du bassin Hatton, et chacune d’entre elles a été entièrement échantillonnée conformément à ces protocoles avec des bennes Van Veen ou des carottiers à boîte, des caméras sous-marines et des enregistreurs de température fixés à l’engin. Ce rapport résume la faune benthique prélevée à l’aide de bennes ou de carottiers lors du relevé de 2012 dans les aires de conservation et complète un autre rapport documentant l’épibenthos d’après les transects couverts par des caméras dans l’aire de conservation de Disko Fan. Nous présentons ici un rapport sur la macrofaune dans la classe de taille de 1 cm, et sur la méiofaune foraminifère.Les données fournies sont présentées dans le rapport suivant (voir lien connexe) :Jacobs, K., M. Bouchard Marmen, B. Rincón, B. MacDonald, C. Lirette, O. Gibb, M. Treble et E. Kenchington, 2022. Stations de surveillance de la biodiversité pour la macrofaune et la méiofaune benthiques dans les aires de conservation de Disko Fan et du bassin Hatton. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 3487: vi + 86 p.Citer ces données comme: Bouchard Marmen, Marieve; Rincon, Beatriz ; MacDonald, Barry; Lirette, Camille; Gibb, Olivia; Treble, Margaret ; Jacobs, Kevin; Kenchington, Ellen (2022). Stations de surveillance de la biodiversité pour la macrofaune et la méiofaune benthiques dans les aires de conservation de Disko Fan et du bassin Hatton. Publié en Janvier 2023. Secteur des sciences des écosystèmes et des océans, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É). https://open.canada.ca/data/en/dataset/b7bcff18-698b-4d40-a7bd-13d39925cbeb
Le métacodage à barres de l’ADNe enrichit les données des relevés au chalut traditionnels pour le suivi de la biodiversité dans l’environnement marin
Les zones de protection marine doivent faire l’objet d’un suivi complet pour garantir la réalisation de leurs objectifs. Toutefois, le suivi des écosystèmes naturels à grande échelle est compliqué par la biodiversité qu’il vise à mesurer. Le métacodage à barres de l’ADN environnemental (ADNe) est une solution prometteuse pour relever ce défi de surveillance. Nous avons procédé à un échantillonnage jumelé sur 54 sites pour les assemblages de poissons et d’invertébrés dans l’Atlantique nord-ouest en utilisant des chaluts à poissons de fond et un métacodage à barres de l’ADNe de l’eau de mer benthique en utilisant quatre marqueurs génétiques (ARNr 12S, ARNr 16S, ARNr 18S, et CO1). Par rapport au chalutage, l’ADNe a permis de détecter des schémas similaires de renouvellement des espèces, des estimations plus importantes de la diversité gamma et des estimations plus faibles de la diversité alpha. Au total, 63,6 % (42/66) des espèces de poissons capturées par chalutage ont été détectées par l’ADNe, ainsi que 26 espèces supplémentaires. Sur les 24 détections manquées par l’ADNe, 12 étaient inévitables, car elles manquaient de séquences de référence. Si l’on exclut les taxons classés à un niveau supérieur à celui de l’espèce et ceux qui n’ont pas de nom d’espèce, 23,6 % (17/72) des espèces d’invertébrés capturées par le chalutage ont été détectées par CO1, qui a détecté 98 espèces supplémentaires. Nous démontrons que l’ADNe est capable de détecter des schémas d’assemblage de communautés et de renouvellement des espèces dans un environnement extracôtier en soulignant son fort potentiel en tant qu’outil non invasif, complet et évolutif pour la surveillance de la biodiversité qui soutient les programmes de conservation marine.Citer ces données comme suit: Jeffery, N., Rubidge, E., Abbott, C., Westfall, K., Stanley, R. (2024).Données de Le métacodage à barres de l’ADNe enrichit les données des relevés au chalut traditionnels pour le suivi de la biodiversité dans l’environnement marin. Date de publication Août 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).https://open.canada.ca/data/en/dataset/43a91ba7-8025-4330-88db-db14022d729d
Registre des aires protégées et des AMCE au Québec
Ces thématiques présentent la compilation des aires protégées au Québec. Elles comprennent également les territoires d’importance. Les aires protégées regroupent diverses désignations juridiques ou administratives différentes. Les territoires inscrits au Registre des aires protégées et des AMCE doivent répondre aux définitions de la Loi sur la conservation du patrimoine naturel (LCPN; RLRQ, chapitre C-61.01) ou à celles de l’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN). La définition de la LCPN d'une aire protégée est « Une aire protégée est un territoire, en milieu terrestre ou aquatique, géographiquement délimité, dont l'encadrement juridique et l'administration visent spécifiquement à assurer la protection et le maintien de la diversité biologique et des ressources naturelles et culturelles associées ». Alors que l’UICN la définit comme « Un espace géographique clairement défini, reconnu, consacré et géré, par tout moyen efficace, juridique ou autre, afin d'assurer à long terme la conservation de la nature ainsi que les services écosystémiques et les valeurs culturelles qui lui sont associés ». Les autres mesures de conservation efficaces (AMCE), un concept reconnu à l’international, sont des zones qui bénéficient de mesures (légales, réglementaires ou autres) pour préserver à long terme la biodiversité à l’extérieur des aires protégées. Contrairement à une aire protégée, une AMCE n’a pas nécessairement un objectif de conservation prépondérant, mais génère tout de même des résultats positifs, durables et efficaces pour la biodiversité. Un territoire d’importance pour la conservation est un territoire géographiquement délimité, pour lequel le ministère de l’Environnement et, de la Lutte contre les changements climatiques, de la Faune et des Parcs (MELCCFP) ou une instance du gouvernement du Québec a exprimé son intention d'en prioriser l'affectation aux fins d'aires protégées.
Risque pour la biodiversité
Les données représentent une évaluation du risque pour la biodiversité dans la zone agricole de l'Alberta en 2002. Le risque lié à la biodiversité fait référence à la perte de diversité biologique ou à la diversité de la vie végétale et animale dans les paysages agricoles. Cette carte, créée dans ArcGIS, tente de montrer où la biodiversité pourrait être menacée, par exemple dans les zones comportant un habitat important qui coïncident avec des zones de plus grande activité économique agricole. On pense que la biodiversité influe sur la santé globale de l'environnement.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**
Biodiversité de l'endofaune benthique du relevé au carottier à boîte du programme CBS-MEA (2021-2023)
Ce jeu de données documente les occurrences d'endofaune collectées de 2021 à 2023 lors de l'évaluation environnementale marine de la mer de Beaufort canadienne (CBS-MEA) menée par Pêches et Océans Canada (MPO). Le programme CBS-MEA se concentre sur l'intégration de l'océanographie, des liens dans le réseau alimentaire, des couplages physico-biologiques et des variabilités spatiales et interannuelles. Le programme vise également à élargir la couverture de référence de la diversité des espèces, des abondances et des associations avec les habitats dans des zones de la mer de Beaufort et de l'archipel canadien de l'Ouest précédemment non étudiées. L'étude a eu lieu principalement dans la mer de Beaufort et dans le golfe d'Amundsen. L'échantillonnage est effectué le long de transects à des stations fixes dans la zone d'étude. Les prises sont collectées à l'aide d'un carottier à boîte de 50 x 50 cm. 2 ou 3 carottes sont collectées par station pour obtenir des réplicats. Un total de 29 stations ont été échantillonnées pour l'endofaune en 2021, 15 en 2022 et 25 en 2023 à des profondeurs entre 10 et 653 m. La moitié du carottier (0.125 m2) est échantillonnée pour la taxonomie de l’endofaune. Les premiers 20 cm de sédiment sont collectés et tamisés à travers un tamis de 0.5 mm. Les échantillons sont conservés dans une solution d'eau de mer-formaldéhyde (10 % v/v). En laboratoire, l'endofaune est identifiée au niveau taxonomique le plus bas possible.Les données sont présentés en deux fichiers : Le fichier "Activité_endofaune_CBSMEA_infauna_event_fr" qui contient les informations des missions, des stations et des déploiements, qui sont présenté sous une structure d'activité hiérarchique.Le fichier "Occurrence_endofaune_CBSMEA_infauna_fr" qui contient les occurrences taxonomiques.
Parcs provinciaux réglementés
Chacun des parcs provinciaux de l'Ontario est classe dans l'une ou l'autre des categories ci-dessous. * Parcs sauvages * Reserves naturelles * Parcs du patrimoine culturel * Parcs naturels * Parcs de voies navigables * Parcs de loisirs Ces parcs sont geres par Parcs Ontario. La [_Loi de 2006 sur les parcs provinciaux et les reserves de conservation_](/fr/lois/loi/06p12) oriente l'amenagement et la gestion de ces parcs. Cette loi a pour objet : * de proteger de façon permanente un reseau de parcs provinciaux et de reserves de conservation; * de proteger le patrimoine naturel et culturel de l'Ontario; * de maintenir la biodiversite; * d'offrir des possibilites d'activites recreatives durables sur le plan ecologique. Instructions pour telecharger cet ensemble de donnees * Cliquez sur le lien ci-dessous et faites defiler la page jusqu'a ce que vous trouviez les **Options de transfert** dans la section **Information sur la distribution**. * Selectionnez le lien a cote de l'etiquette **Donn ees a telecharger**. * Vous devez fournir votre nom, le nom de votre organisation et votre adresse courriel afin d'acceder a l'ensemble de donnees. Ce produit necessite l'utilisation de logiciels du SIG. *[SIG]: système d’information géographique** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **
Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur COI
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b
Le réseau d'aires protégées de la Nouvelle-Écosse
Ces terres contribuent à préserver les valeurs naturelles de la Nouvelle-Écosse grâce à une combinaison de lois, de propriété et de gestion. Sont inclus ici : les parcs nationaux, les réserves nationales de faune, les réserves naturelles provinciales, les réserves naturelles provinciales, certains parcs provinciaux et certaines propriétés et servitudes foncières. Cette combinaison de terres fédérales, provinciales et privées contribue à la réalisation des objectifs provinciaux et nationaux en matière de conservation des terres et de biodiversité.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
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