Cet ensemble de données a été compilé dans le cadre d'un effort pluriannuel dirigé par Pêches et Océans Canada (MPO) pour appuyer la réglementation de l'aquaculture durable dans la « Coast of Bays », une région de la côte sud de Terre-Neuve. Il s'agit du deuxième d'une série visant à fournir une base de connaissances océanographiques de la Coast of Bays.Cet ensemble de données comprend les profils de température, de salinité et de concentration en oxygène dissous collectés lors de campagnes CTD, chaque campagne contient un nombre variable de profils échantillonnés dans la zone d'intérêt. Au total, 760 profils provenant de 11 campagnes, réalisés sur 276 stations, ont été collectés de juin 2009 à novembre 2013. Les données ont été traitées et contrôlées pour leur qualité à l'aide des directives du fabricant de l'instrumentation, des outils personnalisés et de contrôle visuel. Les données sont fournies dans un format texte délimité par des tabulations compatible avec la plupart des langages et outils de traitement de données (par exemple, MS Excel) ainsi qu'avec le logiciel Ocean Data View (https://odv.awi.de/) pour une visualisation rapide. Un résumé des profils CTD et des stations est également fourni sous forme de fichier CSV (valeurs séparées par des virgules).Une description complète des données et de leur utilisation dans le contexte du projet de motivation se trouve à l'adresse suivante: http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/ResDocs-DocRech/2017/2017_077-fra .html. Les analyses de cet ensemble de données ont été présentées lors d'une réunion du Secrétariat canadien de consultation scientifique (SCCS) qui s'est tenue à St John's en mars 2015 (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/schedule-horraire/2015/ 03_25-26b-fra.html) et à partir duquel un avis scientifique (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/SAR-AS/2016/2016_039-fra.html) et un compte rendu (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/Pro-Cr/2017/2017_043-fra.html) ont été publiés.

La base de données ODI (Ocean Data Inventory) est un inventaire de toutes les données de séries chronologiques océanographiques conservées par la Division des sciences océanologiques de l'Institut océanographique de Bedford. Les données archivées incluent quelque 5800 séries chronologiques recueillies à l'aide de Doppler acoustiques et de courantomètres, 4500 séries chronologiques de lectures de la température côtière recueillies au moyen de thermographes et d'un petit nombre (200) de marégraphes. Bon nombre des courantomètres comportent aussi des sondes de température et de salinité. La zone pour laquelle nous possédons des données est grossièrement définie comme l'Atlantique nord et l'Arctique, de 30° à 82° de latitude nord, bien qu'il existe aussi une certaine quantité de données pour d'autres parties du monde. La période couverte est de 1960 à ce jour. La base de données est mise à jour régulièrement.

En septembre 1989, M. Shawn Robinson, Ph. D., établi à la Station biologique de St. Andrews (SABS), a lancé un programme de surveillance océanographique systématique visant 25 stations de surveillance des approches et du secteur de la baie Passamaquoddy. Les stations ont été disposées selon un quadrillage uniforme en fonction d’une latitude et d’une longitude de deux minutes d’arc dans la zone d’étude afin d’établir une base de données sur les configurations spatiales des propriétés de l’eau. On a pris à l’aide d’une sonde CTP d’enregistrement interne Seacat SBE 19 de Sea bird Electronics Inc des mesures mensuelles de la colonne d’eau, qui ont permis de déterminer la température et la salinité à toutes les stations. La sonde a été programmée pour enregistrer la conductivité, la température et la profondeur à la fréquence de 2 Hz, ce qui correspond à deux mesures par mètre de profondeur d’eau.À l’aide du NR Pandalus, puis du NGCC Viola M. Davidson, dont le port d’attache est à la SABS, on enregistre chaque mois des profils verticaux de CTP pour chacune des 25 stations de la zone d’étude. On configure la sonde CTP de sorte que ses capteurs soient orientés vers le benthos. On la fixe ensuite à un câble en acier inoxydable lié à un treuil hydraulique se trouvant sur le pont du navire, puis on installe un lest à un mètre sous la sonde. On descend la sonde à un mètre sous la surface de l’eau et on l’y maintient pendant une minute pour qu’elle atteigne un état d’équilibre. Par la suite, on la fait descendre de 1 m/s jusqu’au benthos à l’aide du bloc de mesure du treuil, qui permet de déterminer le moment où la sonde atteint la profondeur maximale à la station visée. Lorsque le lest touche le fond, la sonde est retirée de l’eau, éteinte et plongée dans un seau d’eau de mer fraîchement puisée afin de minimiser le temps d’équilibrage à la station suivante. Au début du programme, la sonde CTP mesurait la salinité de l’eau qui circulait dans la cellule de conductivité en réaction à la descente de 1 m/s. Toutefois, en août 1992, une pompe a été installée sur la sonde afin d’assurer un débit d’eau plus constant. On mesure les températures de surface à l’aide d’un thermomètre à mercure portatif à partir d’échantillons prélevés au moyen d’un seau à l’arrivée à chaque station, et on enregistre les mesures d’après le disque de Secchi.Au retour à la SABS, toutes les données sont téléchargées de la sonde CTP vers un ordinateur du MPO au moyen du logiciel exclusif Sea-Soft. Les données obtenues pendant la descente de chaque profil sont consignées, regroupées par intervalles d’un mètre et traitées pour en éliminer les pics de données, les inversions de densité et les anomalies dues à un mauvais équilibrage de l’instrument. Les données traitées sont ensuite stockées dans la base de données Oracle (PTRAN) du MPO sous le schéma IMTA_SABS dans les tableaux INVHYD et INVINF. Les numéros et emplacements des stations sont enregistrés dans le tableau CTD_STATIONS du schéma IMTA_SABS.Citer ces données comme suit: Robinson, S. Données de: Échantillonnage mensuel CTP (conductivité, température et profondeur) dans la baie Passamaquoddy (de 1989 à 2018). Date de publication: Octobre 2019. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews (Nouveau-Brunswick). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/12184962-7879-4214-aef0-b31162f04a27

L’ensemble de données en question contient les données de modélisation et d’observation utilisées dans la publication Fjord circulation permits persistent subsurface water mass in a long, deep mid-latitude inlet (La circulation dans un fjord permet la présence constante d’une masse d’eau sous la surface dans un bras long et profond situé à une latitude moyenne) rédigée par Laura Bianucci et ses collaborateurs de la Division des sciences océaniques de la région du Pacifique de Pêches et Océans Canada, et publiée dans le journal Ocean Science en 2024. Une application du modèle des volumes finis d’océanologie côtière (FVCOM v4.1) a été exécutée du 24 mai au 27 juin 2019 dans la région des îles Discovery de la Colombie-Britannique, au Canada. Les profils de température et de salinité observés dans cette zone pendant cette période figurent dans l’ensemble de données, tout comme les valeurs modélisées aux mêmes moments et aux mêmes endroits.

Une nouvelle méthode de relevé, à l'échelle de la baie (c.-à-d. des dizaines de kilomètres), a été utilisée pour étudier les populations d'algues de la côte sud-ouest du Cap-Breton, au Canada, aux fins d'exploitation économique potentielle. Étant donné que les méthodes traditionnelles de télédétection étaient peu susceptibles de donner de bons résultats dans ces eaux, le relevé a été effectué en utilisant la vidéo et les méthodes acoustiques. Un poisson, positionné par transpondeur, et dans lequel avaient été placés une caméra vidéo et un sonar à balayage latéral, a été remorqué le long de transects prédéterminés, perpendiculaires au rivage, pour fournir des renseignements sur le type de fond et la couverture d'algues. Les données du poisson ont été utilisées pour vérifier les données de l'échosondeur (type de fond et hauteur de la couverture de macrophytes) recueillies le long des isobathes de 5, 10 et 20 mètres. La zone de relevé a été divisée en six zones constituées d'une catégorie d'exposition, d'une profondeur et de types de fonds. Des échantillons ont été recueillis au moyen de techniques destructives à chaque profondeur dans les quadrats ainsi qu'aux stations à terre afin de fournir des estimations de la biomasse. Plus de trentecinq taxons ont été dénombrés, qui ont indiqué les profondeurs et les zones dans lesquelles la présence des algues était fréquente. Le genre Ascophyllum était abondant à certaines des stations terrestres. Les genres Chondrus, Cystoclonium, Desmarestia, Fucus, Phyllophora, Polysiphonia et Saccharina étaient fréquents à 5 mètres, tandis que les genres Desmarestia et Saccharina dominaient à 10 mètres, avec des poids humides parfois supérieurs à 1 kg·m-2. Enfin, le genre Agarum dominait à 20 mètres. Le système d'échantillonnage par grille du poisson/échosondeur était relativement grossier afin de couvrir la zone de relevé de 140 km2 dans un délai de 12 jours. Par conséquent, le relevé n'a pas permis d'obtenir des renseignements détaillés sur le plan spatial. Cependant, des renseignements pertinents ont été recueillis pour décrire les caractéristiques générales sur le type de fond et la couverture d'algues par zone afin d'orienter une étude plus approfondie.Citer ces données comme suit : Vandermeulen H. Données de: Une nouvelle étude vidéo et acoustique des algues de I'île Madame: Date de publication: Août 2021. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth (Nouvelle-Écosse). https://open.canada.ca/data/fr/dataset/ebdd8f91-9131-45f0-8aec-aba9f65e3fae

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a

Données sur les prises, l’effort de pêche, les emplacements (latitude, longitude), ainsi que données biologiques connexes provenant de relevés à la palangre sur plusieurs espèces de poissons de fond dans la partie sud des bras de mer et des eaux protégées se trouvant à l’est de l’île de Vancouver en Colombie-Britannique.IntroductionLe relevé à la palangre sur fond dur mené dans la région sud des eaux intérieures fait partie d’un ensemble de relevés coordonnés et à long terme qui, ensemble, couvrent la plupart des habitats côtiers à fond dur des côtes de la Colombie-Britannique. Les autres sont, le relevé à la palangre sur fond dur mené dans la région nord des eaux intérieures, le relevé à la palangre sur fond dur mené dans la région sud des eaux extérieures, et le relevé à la palangre sur fond dur mené dans la région nord des eaux extérieures.Le relevé à la palangre sur fond dur mené dans la région sud des eaux intérieures a débuté en 2005. À partir de 2009,ce relevé était effectué tous les deux ans. Cependant, aucun relevé n’a été effectué en 2017, et le relevé de 2020 a été reporté à 2021 en raison de la pandémie de COVID-19. L’objectif de ces relevés est de fournir des indices d’abondance indépendants de la pêche et des données biologiques connexes pour l’évaluation du sébaste côtier et d’autres espèces de poissons démersaux qui vivent dans des habitats à fond dur impossibles à chaluter. Les relevés sont réalisés selon un plan d’échantillonnage aléatoire stratifié, et les unités d’échantillonnage sont des blocs de deux kilomètres carrés. Les relevés son effectué à l’aide d’hameçons circulaires de taille 13/0 appâtés avec des calmars congelés.Les relevés à la palangre sur fond dur mené dans la région sud des eaux intérieures sont effectués par Pêches et Océans Canada (MPO) à l’aide du navire de recherche Neocaligus de la Garde côtière canadienne. Ce relevé couvre la partie sud des bras de mer et des eaux protégées se trouvant à l’est de l’île de Vancouver, comprend la baie Desolation, le détroit de Georgie, et le sud des îles Gulf (zones de gestion des pêches du Pacifique 14 – 20, 28, et 29).EffortCe tableau contient de l’information sur les sorties de relevé et les activités de pêche (calées) faisant partie de cette série de relevés. L’information sur les sorties comprend l’année où le relevé a été effectué, un identificateur unique de la sortie, le navire ayant réalisé le relevé et les dates de début et de fin de la sortie (les dates auxquelles le navire n’était pas à quai et servait à effectuer le relevé). L’information sur la calée comprend la date, l’heure, le lieu et la profondeur auxquels la pêche a eu lieu, la durée de l'immersion, la distance entre d'hameçons, et le nombre d’hameçons comptés. Toutes les activités de pêche fructueuses sont incluses, indépendamment des prises.PrisesCe tableau contient l’information sur les prises lors des activités de pêche fructueuses. Les prises sont indiquées en fonction de l’espèce et du niveau taxonomique le plus bas possible. De 2005 à 2018, toutes les prises sont comptées et la plupart des prises sont pesées; certaines prises sont trop petites (quantités « traces ») ou trop grosses (p. ex. un très grosse Raie Biocellée) pour être pesées. À partir de 2020, les prises sont enregistrées sous forme de dénombrement uniquement. L’identificateur unique de sortie et le numéro de trait sont inclus afin de pouvoir relier les prises et l’information sur l’activité de pêche (y compris le lieu de prise).BiologieCe tableau contient les données biologiques pour les prises qui ont été échantillonnées. Les données peuvent inclure la longueur, le sexe, le poids ou l’âge. Différents types de longueurs sont mesurées selon les espèces. Les structures d’âge sont recueillies dans la mesure du possible pour les espèces pour lesquelles il existe des méthodes de détermination de l’âge validées et elles sont archivées jusqu’à ce que cette information soit nécessaire pour une évaluation; par conséquent, l’âge de toutes les structures existantes n’a pas été établi à ce point. Des échantillons de tissus (généralement une rognure de nageoire) peuvent être prélevés à des fins d’analyse génétique (ADN) pour certains individus d’espèces particulières. Les échantillons destinés aux analyses génétiques peuvent être archivés jusqu’à ce qu’ils soient requis pour l’analyse; pour de plus amples renseignements, veuillez consulter les personnes responsables des données. L’identificateur unique de sortie et le numéro de trait sont inclus afin de pouvoir relier les échantillons à l’information sur l’activité de pêche et la prise.

Le Programme sur les données environnementales côtières de référence est une initiative pluriannuelle de Pêches et Océans Canada qui vise à recueillir des données sur le milieu côtier à une série d’emplacements d’un océan à l’autre au Canada en vue de développer une meilleure compréhension des conditions écologiques marines, et ce, en collaboration avec des communautés autochtones et locales ainsi que d’autres intervenants clés. Le programme a commencé la collecte de données en 2019 et, avec le début de la phase 2 en 2023, la zone d’étude de la région des Maritimes a été élargie et renommée « côtes nord-ouest de la baie de Fundy ». On a conçu un programme d’océanographie physique pour répondre aux intérêts océanographiques et aux besoins en matière de données des détenteurs d’intérêts locaux. À partir de 2023, les paramètres océanographiques, y compris la température, la salinité, la profondeur et la turbidité de l’eau, ont fait l’objet d’une surveillance dans une série d’emplacements de la baie Passamaquoddy, de la rivière Sainte-Croix et le long de la côte de la baie de Fundy, y compris la zone de protection marine (ZPM) de l’estuaire de la Musquash. Cet ensemble de données comprend les données saisonnières sur la CTP (conductivité, température et profondeur) et la turbidité à compter du printemps 2023. Les instruments font l’objet d’un entretien pendant les mois d’hiver dans un nombre limité d’emplacements. Les méthodes de collecte des données sont composées principalement d’instruments amarrés au fond à des profondeurs de 5 à 90 mètres, et de quelques flotteurs flottants en surface. Dans l’ensemble, cet ensemble de données permet de saisir la dynamique saisonnière des milieux marins littoraux dans la baie Passamaquoddy, la rivière Sainte-Croix, la baie de Fundy et la ZPM de la Musquash. Citer ces données comme suit : Programme de base pour l'environnement côtier (Région des Maritimes), données sur la conductivité, la température et la profondeur de la côte nord-ouest de Fundy. Publié en Mai 2025. Programme de base pour l'environnement côtier. Division des sciences des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, St. Andrews, N.-B. 14-02-2025

Ce jeu de données contient les données de température et de salinité de surface du réseau élargi des thermographes côtiers du système du St-Laurent: fleuve, estuaire et golfe. Il inclut les données du réseau des niveaux d'eau du Service hydrographique du Canada (SINECO), du réseau des thermographes côtiers du programme de monitorage à long terme du Ministère des Pêches et Océans (MPO)-Québec et du réseau de bouées océanographiques.Chaque station est liée à un fichier .png qui affiche les graphiques de température et de salinité en fonction du temps et à un fichier .csv qui contient toutes les données de température et de salinité de surface (colonnes : Station,Latitude,Longitude,Date(UTC),Depth/Profondeur(m),Temperature/Température(ºC),Salinity/Salinité(psu)).Information additionnelleUne description détaillée des différents réseaux (SINECO, bouées océanographiques et thermographes côtiers du MPO-Québec) est disponible sur le site de l’Observatoire global du Saint-Laurent (OGSL) aux adresses suivantes :SINECO : https://ogsl.ca/fr/conditions-maritimes-maregraphes-mpo-shc-a-propos/Bouées océanographiques : https://ogsl.ca/fr/conditions-maritimes-bouees-mpo/Thermographes côtiers: https://ogsl.ca/fr/conditions-maritimes-thermographes-mpo-contexte/Rapports techniques associés aux thermographes côtiers (la publication de 2017 étant également disponible à l’adresse ci-haut mentionnée sur l’OGSL) :Pettigrew, B., Gilbert, D. and Desmarais R. 2016. Thermograph network in the Gulf of St. Lawrence. Can. Tech. Rep. Hydrogr. Ocean Sci. 311: vi + 77 p.Pettigrew, B., Gilbert, D. and Desmarais R. 2017. Thermograph network in the Gulf of St. Lawrence: 2014-2016 update. Can. Tech. Rep. Hydrogr. Ocean Sci. 317: vii + 54 p.

En 2018, la région des Maritimes du MPO a annoncé que les îles de la côte Est étaient un « site d’intérêt » (SI) que l’on pourrait désigner comme une zone de protection marine en vertu de la Loi sur les océans du gouvernement fédéral. Dans le cadre de son mandat de surveillance des zones de conservation établies et potentielles, le Secteur des sciences du MPO déploie régulièrement des instruments, y compris des sondes mesurant la conductivité, la température et la profondeur, ainsi que d’autres instruments permettant de mesurer l’oxygène dissous, les nutriments et d’autres propriétés chimiques des océans. Les renseignements recueillis comprennent la température et d’autres données océanographiques concernant le SI des îles de la côte Est à partir de juin 2024. Les données sont dérivées d’enregistreurs de température (enregistreurs Hobo Tidbit ou similaires) et de dispositifs MicroCAT de Sea-Bird, mais pourraient inclure dans les années à venir des profils actuels ou des données océanographiques supplémentaires. On utilisera ces données pour surveiller les températures dans cette région côtière afin de détecter tout changement biologique associé aux fluctuations de température et du climat, et pour vérifier les modèles océanographiques sur le terrain.Citer ces données comme suit: Jeffery, N., Stanley, R., Pettitt- Wade, H (2025).Données océanographiques de référence pour le site d’intérêt des îles de la côte Est. Date de publication Septembre 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).https://open.canada.ca/data/en/dataset/f0020cec-5671-4908-8fdd-11fc097de99d