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Lieux réglementés à l'égard du longicorne asiatique
L'Agence canadienne d’inspection des aliments (ACIA) a établi une zone réglementée afin d'éradiquer le longicorne asiatique. Compte tenu de la réglementation de cette zone, des restrictions sont désormais imposées sur le déplacement de matériel de pépinière, d'arbres, de billes, de bois d'œuvre, de bois ainsi que des copeaux de bois et d'écorce provenant de certaines essences feuillues ayant été identifiées comme les hôtes du longicorne asiatique, en plus du bois de chauffage de toutes les essences d'arbres. Ces restrictions sont nécessaires pour empêcher la propagation du longicorne asiatique. Cela aidera à protéger l'environnement et les ressources forestières du Canada, ainsi qu'à maintenir l'accès aux marchés internationaux pour l'industrie forestière et les pépinières dans les régions non réglementées de l'Ontario et du reste du Canada.
Profenusa thomsoni
Découvertes historiques de Profenusa thomsoni
Coleophora laricella
Découvertes historiques de Coleophora laricella
Fenusa pumila
Découvertes historiques de Fenusa pumila
Coleophora serratella
Découvertes historiques de Coleophora serratella
Pristiphora geniculata
Découvertes historiques de Pristiphora geniculata
Limites des zones de gestion des sources des agents pathogènes du poisson
La couche de segment des limites d'une zone infectee d'agents pathogenes du poisson correspond aux limites des zones de gestion des agents pathogenes. Elle est delimitee par des segments du reseau routier de l'Ontario. Cette classe de donnees sert a stocker le nom des routes associees a chaque segment et qui correspondent aux limites de la zone de gestion de l'agent pathogene des poissons. Ce produit necessite l'utilisation de logiciels du SIG. *[SIG]: système d’information géographique** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **
Évaluation nationale des risques liés aux espèces aquatiques envahissantes (EAE) pour les moules zébrées et quagga
La moule zébrée (Dreissena polymorpha) et la moule quagga (Dreissena rostriformis bugensis) ont une longue histoire d’invasion dans les écosystèmes d’eau douce d’Europe et d’Amérique du Nord et ont des impacts écologiques et économiques significatifs. Une évaluation des risques écologiques liés à ces deux espèces envahissantes pour les écosystèmes d'eau douce du Canada a été complétée en avril 2022, dans le but de fournir des conseils scientifiques pour éclairer les décisions et les mesures de gestion. Celles-ci comprennent la détection précoce, les plans d’interventions et/ou les mesures réglementaires et politiques visant à atténuer la propagation potentielle et le risque que posent la moule zébrée et quagga pour les écosystèmes d'eau douce canadiens (MPO 2023). Le potentiel d'introduction (pression de propagules et connectivité), le potentiel d'établissement (habitats propices, y compris un modèle basé sur le calcium et Maximum Entropy (MaxEnt)), le potentiel d'invasion et les impacts écologiques ont été utilisés pour calculer le risque écologique pour les moules zébrées et les moules quagga au Canada. Cette évaluation n'a pas évalué le risque pour les plans d’eau individuels, mais a été réalisée à une résolution de 9 260 m x 9 260 m. Ces cartes à haute résolution sont fournies ici. Des cartes du risque écologique au niveau des sous-aires de drainage sont également fournies. Pêches et Océans Canada n'est pas responsable des omissions ou des erreurs qui peuvent être contenues dans ce jeu de données et ne peut être tenu responsable de toute perte, financière ou autre, due à l'utilisation de ces données. Veuillez indiquer Wilcox et collab. 2024 comme source de données dans les cartes, rapports ou articles imprimés ou publiés sur papier ou sur l'internet.
Zones de gestion des agents pathogènes du poisson
On a cree des zones afin de gerer les risques de propagation des agents pathogenes du poisson. Ce produit necessite l'utilisation de logiciels du SIG. *[SIG]: système d’information géographique** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie. Les valeurs françaises pour le titre et la description du jeu de données proviennent de la province de l’Ontario alors que celles des mots-clés et des noms des ressources sont le résultat d'une traduction automatique (Amazon Translate) **
Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur MiFish (12S)
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a
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