Cet inventaire, réalisé du 26 septembre au 3 octobre 2019, visait à décrire la structure des communautés de macroalgues et de macroinvertébrés benthiques provenant de cinq petits estuaires de la Haute-Côte-Nord du Québec, soit la baie Barthélemy et les rivières Colombier, Mistassini, Franquelin et Saint-Nicolas. Cet inventaire fait partie de l'étude doctorale de Valentine Loiseau sur les changements globaux du système du Saint-Laurent, principalement l’étude des communautés benthiques marines en réponse aux changements de salinité, pour assurer une bonne gestion de l’environnement face aux changements futurs. L’objectif principal est de décrire la structure et les niveaux de diversités spécifique des communautés médiolittorales de macroinvertébrés benthiques et de macroalgues le long d’un gradient de salinité. Ces cinq petits estuaires ont été sélectionnés en raison de leur taille similaire, de leurs substrats durs et de leur accès facile. Trois niveaux de stress hypoosmotique (faible, moyen, élevé) et un niveau de contrôle (eau de mer) ont été utilisé pour chacun des estuaires choisis, à raison de huit quadrats par niveau de stress. Les positions des quadrats ont été choisis au hasard mais devaient répondre à deux critères : (1) hauteur régulière dans l'estran pour contrôler l'influence des autres stress (température, exposition) ; et (2) présence d'au moins une macroalgue pour maintenir l'homogénéité. Un pourcentage de couverture par les espèces de macroalgues et de macroinvertébrés a été estimé, puis tous les organismes ont été pesés par espèce et par groupe de taille. La salinité du point d'eau le plus proche a été mesurée à mi-marée avec un réfractomètre portable et une sonde CTD (Conductivité-Température-Densité) de type Castaway. L’inventaire a été fait selon un plan d’échantillonnage aléatoire stratifié et l’unité d’échantillonnage était un quadrat mesurant 25 x 25 cm. Les trois fichiers fournis (format DarwinCore) sont complémentaires et sont reliés par la clé «IDactivité». Le fichier «Information_activité» comprend les informations génériques du quadrat, notamment la date et la localisation. Le fichier «information_supplémentaire_activité_et_occurrence» comprend la salinité et le type de substrat du quadrat, ainsi que le poids total de tous les individus de la même espèce capturés dans le quadrat extrapolé à un mètre carré de surface. Pour les nudibranches et les balanes, le poids a été estimé à partir de la taille des individus pour que ces derniers ne soient pas retiré du milieu. Le fichier «occurrence_taxon» comprend l’inventaire taxonomique des espèces de macroalgues et de macroinvertébrés benthiques observées dans le quadrat, identifiées à l’espèce ou au niveau taxonomique le plus bas possible et la biomasse par espèce identifiée. Pour le contrôle de qualité, les organismes ont été identifiés sur le terrain à l’aide du guide suivant: Chabot, Robert et Anne Rossignol. 2003. Algues et faune du littoral du Saint-Laurent maritime : Guide d'identification. Institut des Sciences de la mer de Rimouski, Rimouski ; Pêches et Océans Canada (Institut Maurice-Lamontagne), Mont-Joli. 113 pages. La taxonomie a été vérifiée sur le registre mondial des espèces marines (WoRMS) pour correspondre aux normes reconnues et à l’aide des bibliothèques R obistools et worrms. La correspondance WoRMS a été placée dans le champ «IDnomScientifique» du fichier d'occurrence. Tous les lieux d'échantillonnage ont été validés spatialement. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.

Description:Cet ensemble de données contient des couches d’occurrence prévue pour 65 espèces de poissons de fond ainsi que la richesse globale des espèces (c.-à-d. le nombre total d’espèces présentes) dans les eaux du Pacifique canadien, et l’erreur-type médiane par cellule de grille pour toutes les espèces. Il couvre toutes les profondeurs d’habitat du fond marin comprises entre 10 et 1 400 mètres qui ont une salinité estivale moyenne supérieure à 28 USP. Deux couches sont fournies pour chaque espèce : 1) l’occurrence prévue de l’espèce (prob_occur) et 2) la probabilité qu’une cellule de grille soit un point chaud d’occurrence pour cette espèce (hotspot_prob) défini comme étant le seuil le plus bas entre : 1) 0,8 ou 2) le 80e centile des valeurs de probabilité d’occurrence prévues pour toutes les cellules de grille dont la probabilité d’occurrence était supérieure à 0.05. La première mesure fournit une prévision globale de la répartition de l’espèce, tandis que la deuxième indique les régions où l’espèce est la plus susceptible d’être présente, ce qui tient compte de l’incertitude dans notre modèle. Toutes les couches sont fournies à une résolution de 1 km.Méthodes :Ces couches ont été créées à l’aide d’un modèle de répartition des espèces décrit par Thompson et ses collaborateurs (2023). Ce modèle intègre les données de trois relevés indépendants des pêches : les relevés synoptiques au chalut de fond des poissons démersaux de Pêches et Océans Canada (MPO; Sinclair et al. 2003; Anderson et al. 2019), les relevés à la palangre sur fond dur des poissons démersaux du MPO (Lochead et Yamanaka 2006, 2007; Doherty et al. 2019), et les relevés aux lignes fixes indépendants de la commission internationale du flétan du Pacifique (IPHC 2021). De plus amples renseignements sur les méthodes se trouvent dans le fichier PDF des métadonnées accessible avec le jeu de données.Extrait du rapport de Thompson et ses collaborateurs (2023):Des prévisions de la répartition des espèces de poissons de fond sont nécessaires pour soutenir les initiatives de planification spatiale marine en cours dans les eaux du Pacifique canadien. Des données pour éclairer les modèles de répartition des espèces sont disponibles à partir de plusieurs relevés indépendants des pêches. Cependant, aucun relevé unique ne couvre l’ensemble de la région et différents types d’engins de pêche sont nécessaires pour étudier la diversité des habitats occupés par les poissons de fond. Les engins de chalutage de fond sont utilisés pour échantillonner l’habitat de fond meuble, principalement sur le plateau continental et le talus, tandis que les engins de pêche à la palangre se concentrent souvent sur les habitats littoraux et de fond dur où le chalutage est impossible. Puisque les données obtenues par les relevés de ces deux types d’engins de pêche ne sont pas directement comparables, les modèles antérieurs de répartition des espèces dans cette région se sont limités à l’utilisation des données d’un relevé à la fois, réduisant ainsi leur étendue spatiale et leur utilité à l’échelle régionale. Nous présentons ici une méthode d’intégration des données sur la présence et l’absence des espèces entre les relevés et les types d’engins de pêche qui nous permettent de prévoir la répartition sur toute la côte de 66 espèces de poissons de fond en Colombie-Britannique. Notre modèle tire parti de l’utilisation des données disponibles provenant de multiples relevés pour estimer la façon dont les espèces réagissent aux gradients environnementaux tout en tenant compte des différences de capturabilité entre les différents relevés. Dans l’ensemble, nous constatons que cette méthode intégrée présente deux avantages principaux : 1) elle augmente l’exactitude des prévisions dans les régions et les relevés à données limitées tout en ayant des répercussions négligeables sur l’exactitude lorsque les données sont déjà suffisantes pour réaliser des prévisions; 2) elle réduit l’incertitude, ce qui se traduit par des intervalles de confiance plus serrés concernant les espèces qui devraient être présentes. Ces avantages sont particulièrement pertinents dans les régions de notre côte où notre compréhension de la qualité de l’habitat est limitée en raison de l’absence de relevés de recherche spatialement complets à long terme sur les poissons de fond.Sources de donnéesLes données de recherche ont été fournies par l’Unité des données sur le poisson de fond de la Direction des sciences (région du Pacifique) aux fins des relevés de recherche de la base de données GFBio entre 2003 et 2020 pour toutes les espèces qui comptaient au moins 150 observations, pour tous les types d’engins de pêche et les jeux de données de relevés disponibles.IncertitudesIl s’agit de résultats modélisés en fonction des observations des espèces en mer et des prévisions connexes en matière de covariables environnementales qui pourraient ne pas toujours refléter précisément les véritables aires de répartition des poissons de fond, bien que des méthodes qui intègrent différents types et différentes sources de données aient démontré leur capacité à améliorer l’inférence du modèle en accroissant la précision des prévisions et en réduisant l’incertitude.

Financé dans le cadre du Programme des objectifs de conservation marine du MPO en partenariat avec le Huntsman Marine Science Centre (HMSC), ce relevé benthique d’images et d’échantillons tiré des plongées sous-marines effectuées durant les étés 2021 et 2022 documente l’occurrence d’éponges sur 42 sites de plongée à l’intérieur du site d’intérêt des îles de la côte Est (SI ~2 089 km2) au large de la côte atlantique de la Nouvelle-Écosse, au Canada. La qualité de l’eau, les occurrences d’espèces et leur nombre, les caractéristiques des habitats, de la pente et du substrat ont été catalogués à partir des registres des plongeurs, d’images de caméras, des notes accompagnant les spécimens et de données bathymétriques à haute résolution. Un total de 54 plongées à des profondeurs comprises entre 11 et 33 m (sous le niveau de la mer) qui ont permis de recueillir jusqu’à 147 images fixes, une heure de vidéo et 17 échantillons par site, ont donné lieu à 220 observations pour 27 taxons d’éponges différents. Cela incluait trois nouvelles espèces pour le Canada (Hymedesmia stellifera, Plocamionida arndti, Hymedesmia jecusculum) et une extension de l’aire de répartition d’une espèce nouvelle pour la science (Crellomima mehqisinpekonuta) qui a été récemment décrite dans la baie de Fundy. Quatre espèces qui pourraient sembler nouvelles pour la science (Halichondria sp., Hymedesmia sp., Protosuberires sp., et Sphaerotylus sp.) ont été répertoriées. On a découvert que les éponges occupent une diversité de micro-habitats, dont plusieurs se trouvent à proximité les uns des autres. Un total de huit classes d’habitat distinctes ont été définies, en fonction des abondances variables et de la diversité des éponges et des espèces benthiques associées. Ces habitats sont probablement largement répartis parmi les nombreuses caractéristiques complexes des fonds marins submergés à l’intérieur de ce SI. Les spécimens recueillis ont été conservés et sont entreposés au Centre de référence Atlantique (CRA) à St. Andrew’s, au Nouveau-Brunswick.Citer ces données comme: Goodwin, C., Cooper, J.A., Lawton, P., Teed, L.L. 2025. Sponge occurrence and associated species and habitat descriptions derived from the 2021 and 2022 SCUBA diving surveys in the Eastern Shore Islands Area of Interest, Nova Scotia. Version 1.4. Fisheries and Oceans Canada. Occurrence dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=eastern_shore_islands_sponge_survey_2021_2022&v=1.4

Description:Les données climatologiques saisonnières sur la salinité de l’océan Pacifique Nord-Est ont été calculées pour couvrir la période de 2001 à 2020. Les observations historiques comprenant toutes les données disponibles de conductivité-température-profondeur (CTD), de bouteilles et de flotteurs profileurs de la World Ocean Database du Centre national de données océanographiques (CNDO), du Marine Environmental Data Service (MEDS), de la section sur les propriétés de l’eau du site Web de l’Institut des sciences de la mer et du Système intégré d’observation des océans du Canada (SIOOC – Pacifique).Méthodes:L’interpolation a été réalisée pour cinquante-deux niveaux verticaux de la surface à 5 000 m. On a réalisé une interpolation spatiale de données par analyse variationnelle (DIVA) pendant toutes les années au cours de chaque saison et les estimations ont été présentées sur une grille cohérente. On a calculé la moyenne des nœuds de la grille pour obtenir les données climatologiques saisonnières. La méthode DIVA a de nouveau été utilisée pour obtenir les données climatologiques définitives, suivie par un filtre médian et un lissage en 5 points. Les mois de printemps étaient définis comme allant d’avril à juin, ceux d’été comme allant de juillet à septembre, ceux d’automne comme allant d’octobre à décembre et ceux d’hiver comme allant de janvier à mars. Les données disponibles ici contiennent des couches matricielles de données climatologiques saisonnières sur la salinité pour la zone économique exclusive (ZEE) canadienne de l’océan Pacifique, un sous-ensemble des données climatologiques saisonnières de l’océan Pacifique Nord-Est, en haute résolution spatiale de 1/300 degré.Sources de données:Données du CNDO, du MEDS, de l’IOS et du SIOOC – Pacifique.Incertitudes :Des incertitudes sont engendrées lorsque les données d’observation qui ont fait l’objet d’un contrôle de la qualité sont interpolées dans l’espace à des distances variables du point d’observation. Les moyennes climatologiques sont calculées à partir de ces valeurs interpolées.

Ce fichier contient une représentation généralisée des bassins hydrographiques développée à partir de l'Atlas des bassins versants de la Colombie-Britannique au 1/50 000, chaque région étant codée en fonction de la présence d'espèces de poissons d'eau douce (y compris le saumon anadrome au stade d'eau douce). Les codes initiaux des espèces de poissons pour la présence/l'absence dans chaque bassin hydrographique ont été dérivés d'une superposition SIG des occurrences d'espèces de poissons dans des régions poissonneuses largement définies en Colombie-Britannique. Cette superposition d'aires de répartition des poissons décrit les occurrences d'espèces de poissons dans 30 régions de la province. Ces vastes gammes d'espèces ont été dérivées du livre « Key to Freshwater Fish of BC » de McPhail et Carveth et ont été affinées en fonction de l'opinion d'experts la plus récente. Le codage des polygones des bassins hydrographiques basé sur cet avis d'expert était initialement le suivant : 0 = hors de l'aire de répartition de l'espèce ; 4 = aire de répartition principale ; 5 = aire de répartition introduite ; 6 = aire de répartition périphérique ; 9 = polygones estuariens uniquement. Le codage des espèces de poissons des bassins versants a été affiné à partir d'observations réelles d'espèces de poissons dans les lacs et les rivières de la Colombie-Britannique. Ces données proviennent de plusieurs sources d'inventaire des poissons. Les bassins versants pour lesquels la présence de chaque espèce de poisson a été enregistrée ont donc été recodés comme tels : 4, 5, 6, 9 sont désormais égaux à « 1 » s'il s'agit d'un enregistrement de musée, et 4, 5, 6, 9 sont désormais égaux à « 2 » pour un enregistrement moins fiable, et 0 est désormais égal à « 8 » pour un enregistrement hors des limites** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

L'ensemble de données sur les occurrences documentées contient trois ensembles de données qui, combinés, aident à fournir des informations générales sur les emplacements du caribou des bois et les zones de relevé en Saskatchewan. Ces informations peuvent aider les utilisateurs dans leurs efforts pour éviter ou atténuer les impacts sur le caribou des bois lorsqu'ils opèrent dans l'aire de répartition du caribou des bois. Des emplacements généralisés d'utilisation des caribous ont été fournis afin de mieux refléter leurs vastes domaines vitaux. L'absence d'hexagone dans une zone ne doit pas être interprétée comme une absence de caribou des bois.Veuillez lire le guide des données pour obtenir des informations importantes sur ce produit. Téléchargez les limites du levé, les occurrences de télémétrie et les observations/panneaux. Téléchargez le package complet, y compris le guide des données, ici. Le produit de données publiques sur l'occurrence documentée du caribou des bois est composé de trois fichiers de formes et de classes d'entités : 1. Occurrence du caribou des bois - Observation et signalisation 2. Occurrence du caribou des bois - Télémétrie 3. Limites du relevé sur le caribou des bois Les deux ensembles de données sur les occurrences contiennent une grille d'hexagones de 18 kilomètres carrés (tessellation). L'inclusion d'un hexagone dans l'ensemble de données indique qu'une ou plusieurs observations d'animaux, signes ou points de télémétrie ont été documentés dans cette zone. Il est important de noter que l'absence de présence de caribous (par exemple, pas d'hexagone) ne doit pas être interprétée comme une absence de caribou des bois. Il se peut plutôt que les données n'aient pas été recueillies dans ces zones ou qu'aucune observation fortuite ou autre n'ait été reçue. L'ensemble de données sur les limites des relevés affiche les limites des relevés sur le caribou des bois qui ont été réalisés par le ministère de l'Environnement ou en collaboration avec celui-ci de 2005 à 2024. Les limites proviennent de sources multiples et comprennent divers types d'enquêtes (collecte de pastilles fécales ou télémétrie). Ces limites fournissent un contexte lorsqu'elles sont comparées aux ensembles de données sur les occurrences du caribou des bois. Nous nous attendons à voir davantage de lieux d'occurrence dans les zones qui ont fait l'objet d'une enquête. Ces informations peuvent fournir un contexte à des zones où le nombre d'occurrences semble être plus élevé. Pour une description complète des données, veuillez consulter le document Data Guide disponible en téléchargement sur le Saskatchewan GeoHub.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate).**

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves à l’Île-du-Prince-Edouard au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves au Nouveau-Brunswick au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Cet ensemble de données porte sur la qualité bactériologique des eaux marines dans les zones de récolte de mollusques bivalves au Québec au Canada. Des données sur la température, la salinité et la profondeur des eaux des zones de récolte de mollusques sont aussi fournies comme complément à l’interprétation des données sur les coliformes fécaux, qui est l’indicateur de contamination suivi annuellement par Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) dans le cadre du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques (PCCSM). Les positions géographiques des sites d’échantillonnage sont également fournies dans cet ensemble de données. Ces données servent à formuler des recommandations de classification des zones de récolte de mollusques. Les recommandations d'ECCC sont révisées et adoptées par les Comités interministériels régionaux des mollusques avant la mise en œuvre règlementaire par Pêches et Océans Canada (MPO).Cet ensemble de données est « obsolète ». Veuillez utiliser la source mise à jour ici.https://ouvert.canada.ca/data/fr/dataset/6417332a-7f37-49bd-8be9-ce0402deed2a

Pour soutenir la surveillance des principales espèces de macroalgues et non indigènes en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick, on a conçu et testé cinq essais de PCR quantitative (qPCR) et sur 111 sites en 2022-2023, ciblant les espèces de macroalgues non indigènes suivantes : Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica et Fucus serratus. Tous les essais ont été élaborés en 2022 par le Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, à Terre-Neuve, au Canada), à l’exception de l’essai pour Antithamnion sparsum, pour lequel un essai a été élaboré en 2023 par le Laboratoire de biotechnologie aquatique (LBA) de l’Institut océanographique de Bedford. Toutes les amplifications ont été effectuées par le LBA en 2022-2023. Le test mis au point pour Fucus serratus s’est avéré par la suite non spécifique et amplifie à la fois F. serratus et Fucus distichus.Citer ces données comme: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&v=1.5Pour plus d'informations, voir:LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725.