Caractéristiques de la zone de transect utilisée dans le cadre des relevés des oiseaux de rivage à l’île Sidney

Observations et comptes des oiseaux de rivage effectués par les experts pour l’ensemble des années.

Les zones clés pour la faune (WKA) sont des emplacements utilisés par la faune pour ses fonctions vitales saisonnières essentielles. Les WKA sont identifiés en interprétant les emplacements observés de la faune à des moments clés de l'année, et non par une évaluation intensive de l'habitat. Polygones dérivés d'entretiens avec des habitants et de l'interprétation par SIG des enquêtes sur la faune et l'habitat. L'interprétation du SIG suit des critères spécifiques au taxon et/ou aux populations de taxons. Les zones clés sont basées sur les emplacements observés de la faune à des périodes clés de l'année, et non sur l'évaluation de l'habitat. Grâce à de nouvelles informations, les limites et les désignations des zones clés peuvent changer et des zones clés supplémentaires peuvent être identifiées. De plus, les zones clés ne sont pas les seuls sites importants pour la faune. D'autres sources d'information peuvent identifier d'autres sites importants pour la faune pour des raisons dépassant le cadre du programme d'inventaire de la WKA. Les mises à jour des domaines clés ne sont effectuées que périodiquement. Pour obtenir les informations les plus récentes, veuillez consulter le biologiste régional de votre domaine d'intérêt. Si vous avez des questions ou souhaitez contribuer à la base de données de la WKA, veuillez contacter le programme d'inventaire de la WKA ([wka@yukon.ca] (mailto : wka@yukon.ca)).Distribué depuis [GeoYukon] (https://mapservices.gov.yk.ca/GeoYukon/) par le [gouvernement du Yukon] (https://yukon.ca/). Découvrez d'autres données cartographiques numériques et des cartes interactives issues de la collection de données cartographiques numériques du Yukon.Pour plus d'informations : [geomatics.help@yukon.ca] (mailto : geomatics.help@yukon.ca)

Compte des piailleurs dans le cadre des relevés des oiseaux de rivage à l’île Sidney

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a

Cet ensemble de données a été compilé dans le cadre d'un effort pluriannuel dirigé par Pêches et Océans Canada (MPO) pour appuyer la réglementation de l'aquaculture durable dans la « Coast of Bays », une région de la côte sud de Terre-Neuve. Il s'agit du deuxième d'une série visant à fournir une base de connaissances océanographiques de la Coast of Bays.Cet ensemble de données comprend les profils de température, de salinité et de concentration en oxygène dissous collectés lors de campagnes CTD, chaque campagne contient un nombre variable de profils échantillonnés dans la zone d'intérêt. Au total, 760 profils provenant de 11 campagnes, réalisés sur 276 stations, ont été collectés de juin 2009 à novembre 2013. Les données ont été traitées et contrôlées pour leur qualité à l'aide des directives du fabricant de l'instrumentation, des outils personnalisés et de contrôle visuel. Les données sont fournies dans un format texte délimité par des tabulations compatible avec la plupart des langages et outils de traitement de données (par exemple, MS Excel) ainsi qu'avec le logiciel Ocean Data View (https://odv.awi.de/) pour une visualisation rapide. Un résumé des profils CTD et des stations est également fourni sous forme de fichier CSV (valeurs séparées par des virgules).Une description complète des données et de leur utilisation dans le contexte du projet de motivation se trouve à l'adresse suivante: http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/ResDocs-DocRech/2017/2017_077-fra .html. Les analyses de cet ensemble de données ont été présentées lors d'une réunion du Secrétariat canadien de consultation scientifique (SCCS) qui s'est tenue à St John's en mars 2015 (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/schedule-horraire/2015/ 03_25-26b-fra.html) et à partir duquel un avis scientifique (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/SAR-AS/2016/2016_039-fra.html) et un compte rendu (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/Pro-Cr/2017/2017_043-fra.html) ont été publiés.

Évaluation de l'habitat côtier à l'échelle de la baie du lac Bras d'Or - Malagawash 2007 Les données de 2008 font partie de la publication Évaluation de l'habitat côtier à l'échelle de la baie du lac Bras d'OrUn historique des relevés benthiques des zones littorales du lac Bras d'Or (de 2005 à 2011) est présenté. Pour les premiers travaux, on a utilisé une caméra sous-marine et un sonar latéral à support fixe. La prochaine étape était le développement d'un poisson; dans cet appareil, la caméra et le sonar latéral ont été placés sur une plateforme avec positionnement par transpondeur. De 2009 à 2011, ce nouveau poisson a été utilisé pour obtenir une référence-terrain d'un échosondeur. Les relevés ont été principalement réalisés dans la moitié nord du lac, à savoir d'une profondeur de dix mètres jusqu'aux eaux peu profondes à moins d'un mètre. On pouvait faire la distinction entre les différents rivages à partir des proportions relatives des types de substrat et de la couverture de macrophytes. La grande majorité des macrophytes étaient présents dans les trois premiers mètres de profondeur. Cette zone était dominée par une couverture mince, mais uniforme, de zostère (Zostera marina L.) sur presque tous les rivages avec un régime de courants ou de vagues propices à la croissance de cette plante. Cependant, les herbiers de zostère étaient souvent en mauvais état, et on présume qu'ils subissent des répercussions négatives en raison de la fréquente turbidité de la colonne d'eau, de l'envasement et de la possible eutrophisation localisée. Toutes les données d'enquête ont été intégrées à un système d'information géographique, et le présent document est un guide pour cette trousse. Le système d'information géographique pourrait être utilisé pour répondre aux questions de gestion, y compris le placement et la nature des projets de compensation de l'habitat ainsi que la sélection des zones de protection sur le littoral. Il pourrait aussi servir de base de référence pour déterminer les changements à long terme.Vandermeulen, H. 2016. Relevés des zones littorales du lac Bras d'Or par vidéo à balayage latéral et par échosondeur. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3183: viii + 39 p.Citer ces données comme: Vandermeulen H. Évaluation de l'habitat côtier à l'échelle de la baie du lac Bras d'Or - Malagawash 2007 - 2008. Publié en Mai 2022. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).

Zones de rafting de phoques. Le CRIMS est un ancien ensemble de données sur les ressources côtières de la Colombie-Britannique qui a été acquis de manière systématique et synoptique à partir de 1979 et qui a été mis à jour par intermittence au fil des ans. L'information sur les ressources a été collectée dans neuf zones d'étude par le biais d'un comité provincial des normes d'information sur les ressources évalué par des pairs, composé d'agents des pêches du MPO, des Premières nations et d'autres experts en la matière. Il n'est actuellement pas prévu de mettre à jour ces anciennes données.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

Cet ensemble de données a été compilé dans le cadre d'un effort pluriannuel dirigé par Pêches et Océans Canada (MPO) pour appuyer la réglementation de l'aquaculture durable dans la région de la « Coast of Bays », une région de la côte sud de Terre-Neuve. Il s'agit du premier ensemble d'une série visant à fournir une base de connaissances océanographiques de la Coast of Bays.Cet ensemble de données comprend des produits SIG et des analyses résumées dans un tableau MS Excel. Les données SIG comprennent des fichiers de formes de vecteurs et des images TIFF matricielles, fournissant des informations sur les dimensions physiques de la zone d'intérêt (par exemple, la superficie, le volume, le périmètre, la longueur et la largeur des baies) et d'autres caractéristiques physiques (par exemple, le volume de marée et d'apport d'eau douce).Vous trouverez une description complète des données et de leur utilisation dans le contexte du projet a l’origine de leur création à l'adresse suivante: http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/ResDocs-DocRech/2017/2017_076-fra .html. Les analyses de cet ensemble de données ont été présentées lors d'une réunion du Secrétariat canadien de consultation scientifique (SCCS) qui s'est tenue à St John's en mars 2015 (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/schedule-horraire/2015/ 03_25-26b-fra.html) et à partir duquel un avis scientifique (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/SAR-AS/2016/2016_039-fra.html) et un compte rendu (http://www.dfo-mpo.gc.ca/csas-sccs/Publications/Pro-Cr/2017/2017_043-fra.html) ont été publiés.

Segments du littoral indiquant les sites de ponte du hareng le long de la côte de la Colombie-Britannique. Les informations relatives aux attributs incluent l'importance relative, la fréquence de génération et l'indice d'apparition. Le CRIMS est un ancien ensemble de données sur les ressources côtières de la Colombie-Britannique qui a été acquis de manière systématique et synoptique à partir de 1979 et qui a été mis à jour par intermittence au fil des ans. L'information sur les ressources a été collectée dans neuf zones d'étude par le biais d'un comité provincial des normes d'information sur les ressources évalué par des pairs, composé d'agents des pêches du MPO, des Premières nations et d'autres experts en la matière. Il n'est actuellement pas prévu de mettre à jour ces anciennes données.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **