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Traçage du flux de carbone et de la structure d’un réseau trophique marin côtier de l’Arctique à l’aide d’isoprénoïdes hautement ramifiés et d’isotopes stables du carbone, de l’azote et du soufre
OBJECTIF :Dans le cadre de cette étude, nous avons examiné la structure et la fonction du réseau trophique marin de l’île Southampton pour 149 espèces d’invertébrés benthiques et pélagiques, de poissons, de mammifères marins et d’oiseaux de mer prélevés entre 2016 et 2019 en vue de fournir une base de référence pour les études futures qui visent à quantifier les changements temporels dans la structuration du réseau trophique. Plus précisément, nous avons utilisé une approche à biomarqueurs multiples combinant des isotopes stables et des isoprénoïdes hautement ramifiés pour : i) déterminer la structure trophique verticale du réseau trophique marin, ii) étudier la contribution des proies benthiques et pélagiques aux espèces des niveaux trophiques supérieurs, et iii) déterminer le rôle des algues de glace et de l’utilisation des sources de carbone par le phytoplancton dans différents niveaux trophiques et compartiments (pélagiques et benthiques). En apportant un nouvel éclairage sur le fonctionnement du réseau trophique de l’île Southampton et plus particulièrement sur la façon dont la contribution des algues de glace et de l’habitat benthique façonne sa structure, ces résultats seront pertinents pour la gestion adaptative et les initiatives de conservation mises en œuvre en réponse aux facteurs de stress anthropiques et aux changements climatiques. DESCRIPTION :Les altérations de l’environnement marin découlant du climat sont plus rapides dans les régions arctiques et subarctiques, y compris la baie d’Hudson dans le nord du Canada, où le déclin de la glace de mer, le réchauffement des eaux de surface et l’acidification des océans se produisent à des rythmes alarmants. Ces changements modifient les régimes de production primaire, dont les répercussions finiront par toucher l’ensemble du réseau du réseau trophique. Ici, nous avons étudié i) la structure trophique verticale de l’écosystème marin de l’île Southampton dans le nord de la baie d’Hudson, ii) la contribution des proies benthiques et pélagiques aux espèces des niveaux trophiques supérieurs, et iii) la contribution relative des algues de glace et du carbone dérivé du phytoplancton dans le maintien de cet écosystème. À cette fin, nous avons mesuré les rapports isotopiques stables du carbone, de l’azote et du soufre ainsi que les isoprénoïdes hautement ramifiés dans les échantillons appartenant à 149 taxons, y compris des invertébrés, des poissons, des oiseaux de mer et des mammifères marins. Nous avons constaté que les invertébrés benthiques occupaient 4 niveaux trophiques et que le réseau trophique global atteignait une position moyenne au sein du réseau trophique de 4,8. La signature δ34S moyenne des organismes pélagiques indique qu’ils exploitent à la fois les sources d’aliments benthiques et pélagiques, ce qui veut dire qu’il existerait de nombreuses interconnexions entre ces compartiments dans cette zone côtière. La dépendance relativement élevée des mammifères marins de l’Arctique à l’égard du carbone sympagique (53,3 ± 22,2 %) par leur consommation de proies invertébrées benthiques confirme le rôle important du sous-réseau benthique pour le maintien des consommateurs de niveaux trophiques supérieurs dans l’environnement pélagique côtier. Par conséquent, une diminution potentielle de la productivité des algues de glace pourrait entraîner une altération profonde du réseau trophique benthique et un effet en cascade sur cet écosystème arctique.Collaborateurs:Centre des sciences de l’observation de la Terre, Université du Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada - R’emi Amiraux, C.J. Mundy, Jens K. Ehn, Z.A. Kuzyk.Québec-Océan, Sentinelle Nord et Takuvik, Département de biologie, Université Laval, Québec, Québec, Canada - Marie Pierrejean.Association écossaise pour les sciences marines, Oban, Royaume-Uni - Thomas A. Brown.Département des sciences des ressources naturelles, Université McGill, Sainte-Anne-de-Bellevue, Québec, Canada - Kyle H. Elliott.Département des sciences biologiques, Université du Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada - Steven H. Ferguson, Cory J.D. Matthews, Cortney A. Watt, David J. Yurkowski.École de l’environnement, Université de Windsor, Windsor, Ontario, Canada - Aaron T. Fisk.Direction générale des sciences et de la technologie, Environnement et Changement climatique Canada, Ottawa (Ontario), Canada - Grant Gilchrist.Collège des sciences de la pêche et de la mer, Université de l’Alaska Fairbanks, Fairbanks, AK, États-Unis - Katrin Iken.Département des sciences de la Terre, Université du Nouveau-Brunswick, Fredericton, N.-B., Canada - Audrey Limoges.Département de biologie intégrative, Université de Windsor, Windsor, Ontario, Canada - Oliver P. Love, Wesley R. Ogloff.Département de biologie arctique, Centre universitaire de Svalbard, Longyearbyen, Norvège - Janne E. Søreide.
Surveillance des interactions des écosystèmes d’aquaculture de bivalves à l’échelle de la baie au moyen de la cytométrie en flux
Il n’existe pas de données empiriques à l’échelle de la baie sur la manière dont l’aquaculture des bivalves modifie la composition du plancton et, par conséquent, le fonctionnement écologique et les niveaux trophiques supérieurs. Les variations temporelles, inter et intrabaie des pressions hydrodynamiques, environnementales et aquacoles limitent l’efficacité de la surveillance du plancton visant à détecter les changements à l’échelle de la baie et éclairer les interactions de l’écosystème aquacole. Ici, nous avons utilisé la cytométrie en flux pour étudier les variations spatio-temporelles de la composition des bactéries et du phytoplancton (< 20 µm) dans quatre échancrures d’aquaculture de bivalves. Nous avons observé une plus forte abondance de bactéries et de phytoplancton dans les échancrures peu profondes où l’eau douce et les nutriments étaient plus abondants. L’appauvrissement des éléments nutritifs peut avoir mené à la dominance des cellules de picophytoplankton, qui ont montré une forte variation à l’intérieur de la baie en fonction de l’influence fluviale par rapport à celle de l’eau douce et de la disponibilité des éléments nutritifs. Bien que les forçages environnementaux semblent être un facteur important des tendances spatio-temporelles, les résultats ont montré que l’aquaculture de bivalves peut réduire l’abondance du phytoplancton à proximité des zones de concession et favoriser la croissance bactérienne. Nous discutons des séquences des effets de l’aquaculture, comme le broutage, les processus de couplage benthique-pélagique et le cycle biogéochimique microbien. Les conclusions fournissent des indications sur les considérations optimales d’échantillonnage utilisant la cytométrie en flux dans les sites d’aquaculture en fonction de la géomorphologie et de l’hydrodynamique des échancrures.Citer ces données comme: Sharpe H, Lacoursière-Roussel A, Barrell J (2024). Monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry. Version 1.2. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=monitoring_bay-scale_bivalve_aquaculture_ecosystem_interactions_using_flow_cytometry&v=1.2
Études des côtes et des écosystèmes marins du Nord dans la mer de Beaufort canadienne—informations sur l'échantillonnage
Ce projet avait comme objectif de recueillir des données pour élaborer un modèle du réseau alimentaire des niveaux trophiques inférieurs de la zone littorale de la mer de Beaufort. L'échantillonnage a eu lieu de 2005 à 2008 à bord du NGCC Nahidik. Le caractère multidisciplinaire du programme Nahidik a permis de réaliser des mesures de biologie et d'écologie (production primaire, phytoplancton, zooplancton, benthos, poissons), d'océanographie chimique et physique, de contaminants, de géologie et d'hydroacoustique. Les données ont été recueillies en juillet et août de chaque année. Le programme Nahidik a fourni des données permettant de constituer une base de référence pour les études futures, ainsi qu'une source d'information pour l'évaluation environnementale.
Aperçu écologique de la succession saisonnière du plancton aux fins de la surveillance des interactions entre la conchyliculture et l’écosystème
L’aquaculture des bivalves a des effets directs et indirects sur les communautés planctoniques, qui sont très sensibles aux changements climatiques à court terme (saisonniers et interannuels) et à long terme, bien que la façon dont ces dynamiques modifient les interactions entre l’aquaculture et l’écosystème soit mal comprise. Ici, nous étudions les tendances saisonnières de l’abondance du plancton et de la structure de la communauté couvrant plusieurs fractions de taille allant de 0,2 µm à 5 mm, dans une échancrure d’aquaculture profonde dans le nord-est de Terre-Neuve, au Canada. À l’aide de la cytométrie en flux et de l’imagerie FlowCam, nous avons observé une relation saisonnière claire entre les tailles de fractions découlant de la stratification des colonnes d’eau (apport d’eau douce, disponibilité des nutriments, disponibilité de la lumière et température de l’eau). L’abondance du plancton a diminué proportionnellement à l’augmentation de la fraction de taille, ce qui correspond à la théorie des spectres de taille. Dans la baie, on a observé une plus grande abondance de mésozooplancton et une plus grande abondance relative de copépodes à proximité de la concession aquacole. Aucun effet spatial important n’a été observé pour la composition du phytoplancton. Bien que l’on ait observé d’août à octobre des pentes spectrales de composition et de taille du plancton statistiquement semblables (c.-à-d. l’efficacité de la chaîne alimentaire) et que l’on puisse utiliser ces données pour comparer la variabilité interannuelle de la composition du plancton, l’échantillonnage sur de plus longues périodes pourrait permettre de saisir les changements phénologiques à long terme de l’abondance et de la composition du plancton liés à divers processus, y compris les changements climatiques. Les conclusions fournissent une orientation sur l’échantillonnage optimal aux fins de la surveillance et de l’évaluation des séquences des effets de l’aquaculture.Citer ces données comme: Sharpe H, Lacoursière-Roussel A, Gallardi D (2024). Ecological insight of seasonal plankton succession to monitor shellfish aquaculture ecosystem interactions. Version 3.2. Fisheries and Oceans Canada. Sampling event dataset. https://doi.org/10.25607/2ujdvh
Études des écosystèmes côtiers et marins du Nord dans la mer de Beaufort canadienne—lieux d'échantillonnage
Ce projet avait comme objectif de recueillir des données pour élaborer un modèle du réseau alimentaire des niveaux trophiques inférieurs de la zone littorale de la mer de Beaufort. L'échantillonnage a eu lieu de 2005 à 2008 à bord du NGCC Nahidik. Le caractère multidisciplinaire du programme Nahidik a permis de réaliser des mesures de biologie et d'écologie (production primaire, phytoplancton, zooplancton, benthos, poissons), d'océanographie chimique et physique, de contaminants, de géologie et d'hydroacoustique. Les données ont été recueillies en juillet et août de chaque année. Le programme Nahidik a fourni des données permettant de constituer une base de référence pour les études futures, ainsi qu'une source d'information pour l'évaluation environnementale. Ce registre contient les coordonnées géographiques et les noms des stations de 2005 à 2008.
Zostère marine du Québec
Ce jeu de données de format shapefile a été conçu à partir des polygones extraits de la géodatabase Cartographie des écosystèmes côtiers du Québec maritime (2022, Laboratoire de dynamique et de gestion intégrée des zones côtières, Pêches et Océans Canada), décrit dans le paragraphe ci-après. Il est constitué des polygones comportant de la zostère marine et rassemble les attributs décrivant la couverture végétale, la composition des herbiers, le nom de l’écosystème, les données d’imagerie ayant permis la photo-interprétation et la présence ou non de données de terrain. Un numéro séquentiel unique associé à chaque polygone permet de retracer le polygone apparié de la géodatabase des écosystèmes côtiers pour connaître les valeurs d’attributs non détaillé dans le présent shapefile. La région d’étude comprend l’ensemble des littoraux estuariens et maritimes du Québec, à l’exception de certains secteurs dont la majeure partie de la Basse-Côte-Nord et de l’Île d’Anticosti, à l’exception des villages de Kegaska, la Romaine, Chevery, Blanc-Sablon et Port-Menier. Certaines îles au large des côtes de l’estuaire et du golfe font parties de la région couverte, telles que l’Île d’Orléans, l’Isle-aux-Coudres, l’Île Verte et l’Île Bonaventure.Le projet de Cartographie des écosystèmes côtiers du Québec maritime a été réalisée conjointement par le Laboratoire de dynamique et de gestion intégrée des zones côtières (LDGIZC) de l’Université du Québec à Rimouski dans le cadre du Projet Résilience côtière; et par l’équipe de Pêches et Océans Canada, dans le cadre de l’initiative Planification pour une Intervention Marine Intégrée (PIMI) du Plan de Protection des Océans (PPO). Dans le cadre de ce projet, une classification des écosystèmes côtiers a été réalisée sur plus de 4 200 km de corridor côtier, avec pour sujet les littoraux estuariens et maritimes du Québec situés entre la limite du haut-estran et l'infralittoral peu profond (environ 10m de profondeur). La méthode de cartographie développée s’appuie sur une segmentation et classification semi-automatisée et une photo-interprétation des écosystèmes côtiers, à partir de photographies multispectrales (RBVI) à très haute résolution (30 cm) acquises entre 2015 et 2020 par le MPO. La classification des entités surfaciques (polygones) s'appuie sur l'attribution de classes de valeurs pour les attributs biologiques et physiques à l'étude (par ex. étagement, substrats, type végétaux, couverture de la végétation, géosystème, etc.). Des photographies obliques héliportées et des données de terrain ont contribué à réduire l’incertitude associée au travail de photo-interprétation. L'UQAR et le MPO ont mené des campagnes d'échantillonnage terrain visant respectivement le médiolittoral (4 390 stations) puis la zone médiolittorale inférieure et infralittorale (2 959 stations), ce qui a permis de valider certains attributs identifiés par photo-interprétation et d'apporter une information détaillée sur la structure des communautés. La géodatabase de la Cartographie des écosystèmes côtiers est hébergée et diffusée par l'UQAR sur la plateforme cartographique SIGEC-Web: https://ldgizc.uqar.ca/Web/sigecwebCredits © MPO (2023, Pêches et Océans Canada)Provencher-Nolet, L., Paquette, L., Pitre, L.D., Grégoire, B. and Desjardins, C. 2024. Cartographie des macrophytes estuariens et marins du Québec. Rapp. Tech. Can. Sci. halieut. Aquat. 3617 : v + 99 p.Grégoire, B., Pitre, L.D., Provencher-Nolet, L., Paquette, L. and Desjardins, C. 2024. Distribution d’organismes marins de la zone côtière peu profonde du Québec recensés par imagerie sous-marine de 2017 à 2021. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 3616 : v + 78 p.Grégoire, B. 2022. Biodiversité du relevé côtier Planification pour une intervention environnementale intégrée dans l’estuaire et le golfe du Saint-Laurent (2017–2021). Observatoire global du Saint-Laurent. [Jeu de données]Jobin, A., Marquis, G., Provencher-Nolet, L., Gabaj Castrillo. M. J., Trubiano C., Drouet, M., Eustache-Létourneau, D., Drejza, S. Fraser, C. Marie, G. et P. Bernatchez (2021) Cartographie des écosystèmes côtiers du Québec maritime — Rapport méthodologique. Chaire de recherche en géoscience côtière, Laboratoire de dynamique et de gestion intégrée des zones côtières, Université du Québec à Rimouski. Rapport remis au ministère de l’Environnement et de la Lutte contre les changements climatiques, septembre 2021, 98 p.
Dynamique glaciaire de la partie centrale de la région de Kivalliq - données de terrain 2025
Ce jeu de données regroupe les informations et les photographies collectées à 49 stations d'observation lors de la campagne de terrain menée du 31 juillet au 11 août 2025 dans la partie centrale de la région de Kivalliq. Il comprend la localisation des sites où des indicateurs d'écoulement glaciaire ont été mesurés, ainsi que leur chronologie relative lorsqu'elle a pu être déterminée sur le terrain.Il inclut également la localisation des sites d'échantillonnage de till prélevé à des fins d'analyses géochimiques et de minéraux indicateurs, ainsi que des sites où des blocs et des surfaces rocheuses ont été échantillonnés pour la datation par isotopes cosmogéniques.Les résultats analytiques et les interprétations feront l'objet de publications ultérieures.
Lacs participants au réseau de surveillance volontaire (RSVL) - États trophiques
Cette thématique présente l’état trophique des lacs suivis dans le cadre du Réseau de surveillance volontaire des lacs (RSVL) entre 2004 et 2024. L’état trophique est issu de la compilation des données acquises dans le cadre de ce réseau. Les niveaux trophiques servent à classer les lacs selon leur degré de productivité biologique, leur état pouvant varier d’ultra-oligotrophe à hyper-eutrophe.
Études des côtes et des écosystèmes marins du Nord dans la mer de Beaufort canadienne—données sur la qualité de l'eau
Ce projet avait comme objectif de recueillir des données pour élaborer un modèle du réseau alimentaire des niveaux trophiques inférieurs de la zone littorale de la mer de Beaufort. L'échantillonnage a eu lieu de 2005 à 2008 à bord du NGCC Nahidik. Le caractère multidisciplinaire du programme Nahidik a permis de réaliser des mesures de biologie et d'écologie (production primaire, phytoplancton, zooplancton, benthos, poissons), d'océanographie chimique et physique, de contaminants, de géologie et d'hydroacoustique. Les données ont été recueillies en juillet et août de chaque année. Le programme Nahidik a fourni des données permettant de constituer une base de référence pour les études futures, ainsi qu'une source d'information pour l'évaluation environnementale.Ce registre contient des données sur la qualité de l'eau, notamment l'azote et le phosphore en suspension et totaux, le carbone dissous et en suspension, la chlorophylle a et le silicium en suspension.
Surveillance de l'oxygène dissous, de la couverture de la zostère et des nutriments dans le sud du golfe du Saint-Laurent pour le programme la qualité du milieu marin (QMM)
OBJECTIF :Quantifier les impacts des nutriments sur les communautés végétales et animales et les conditions environnementales qui les supportent dans les estuaires du sud du golfe du Saint-LaurentDESCRIPTION :Le programme de surveillance du QMM est réalisé dans 35-40 estuaires du sud du golfe du Saint-Laurent (sGSL) pour supporter le développement de la mesure du QMM (limite) qui sera établit pour promouvoir les efforts pour adresser l’enrichissement des nutriments dans les estuaires. Les deux outils de surveillance principaux inclus dans le programme de surveillance du QMM sont l’oxygène dissout et la couverture de la zostère. Ces outils sont utilisés pour établir l’état trophique des estuaires de la région. Les deux facteurs les plus importants qui impactent le état trophique des estuaires sont la charge en azote et le temps de résidence de l’eau, i.e. la circulation de l’eau. Si le temps de résidence de l’eau est long et la charge en nutriments est élevée, des impacts causés par les nutriments sont probable. Un article scientifique primaire a démontré que ces deux facteurs peuvent prédire le régime d’oxygène dissout dans la section supérieur de l’estuaire et les résultats inclus dans cet article ont démontré que l’oxygène dissout peut être utilisé pour déterminer l’état trophique des estuaires. Une article scientifique accompagnateur a aussi déterminé que la charge en azote avait une corrélation négative avec la couverture de la zostère. La base du programme de surveillance du QMM est établit par ces deux articles (articles en attachement). NOTES SUR LE CONTRÔLE DE QUALITÉ :Les enregistreurs d'oxygène dissous nécessitent un étalonnage avant le déploiement et sont vérifiés pour la dérive après la récupération (jusqu'à présent, aucune dérive n'a été observée, ce qui est logique étant donné qu'ils utilisent la technologie optique).Dans le cas où les enregistreurs d'oxygène dissous n'étaient pas effacés à une fréquence suffisante pour empêcher les erreurs de données, ces données doivent être enlevées avant l'analyse.De plus, les données doivent être vérifiées pour enlever des mesures erronées qui sont relativement rares et très apparentes. Un code d'erreur de -888.88 est l'erreur principale pour les enregistreurs d'oxygène dissous. Les sondes de salinité fournissent rarement des données erronées et lorsqu'elles le font, ce n'est généralement que le résultat d'un encrassement.DÉTAILS DE L'ÉCHANTILLON PHYSIQUE :La collecte d’échantillons d'eau varie entre un échantillonnage au deux semaines jusqu’à une fois par mois. L’eau est échantillonnée à l'aide d'un échantillonneur d'eau Niskin à une profondeur de 0,5 m à partir de la surface de l’eau, de mai à novembre.Les échantillons sont traités en double pour la chlorophylle a et le seston. Les échantillons sont analysé en laboratoire en moins de 8 heures suivant le prélèvement.MÉTHODES D'ÉCHANTILLONNAGE :Dans chaque estuaire étudié, l’oxygène dissous est mesuré de façon continue avec des enregistreurs optiques déployés au milieu et dans la section supérieure de l'estuaire. La marée et la salinité (N.-B. et N.-E. seulement) furent aussi mesuré dans tous les estuaires du Nouveau-Brunswick et de la Nouvelle-Écosse dans la section supérieure de l’estuaire seulement. Des profils de profondeur pour d'autres variables de la qualité de l'eau sont pris à l'échelle bihebdomadaire ou mensuelle ainsi que des échantillons pour le seston (N.-B. et N.-E. seulement) et la chlorophylle a (un proxy pour le phytoplancton). La surveillance de ces paramètres est effectuée à chaque trois ans sauf à deux sites à l'Île-du-Prince-Édouard et un site au Nouveau-Brunswick et en Nouvelle-Écosse pour lesquels la surveillance est réalisée à chaque année, à la rivière West, Wheatley, Cocagne et Pugwash, respectivement.Les données sont récoltées pour la couverture de la zostère par un collaborateur entre juin et septembre, idéalement au cours de la même année que les données sur la qualité de l'eau sont récoltées.Les collaborateurs pour ce projet inclus le Département de l’environnement, eau et changement climatique de l'Île-du-Prince-Édouard et la Coalition pour la viabilité du sud du golfe du Saint Laurent.LIMITATION DE L'UTILISATION :Pour assurer l'intégrité scientifique et l'utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.
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