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Évaluation nationale des risques liés aux espèces aquatiques envahissantes (EAE) pour les moules zébrées et quagga
La moule zébrée (Dreissena polymorpha) et la moule quagga (Dreissena rostriformis bugensis) ont une longue histoire d’invasion dans les écosystèmes d’eau douce d’Europe et d’Amérique du Nord et ont des impacts écologiques et économiques significatifs. Une évaluation des risques écologiques liés à ces deux espèces envahissantes pour les écosystèmes d'eau douce du Canada a été complétée en avril 2022, dans le but de fournir des conseils scientifiques pour éclairer les décisions et les mesures de gestion. Celles-ci comprennent la détection précoce, les plans d’interventions et/ou les mesures réglementaires et politiques visant à atténuer la propagation potentielle et le risque que posent la moule zébrée et quagga pour les écosystèmes d'eau douce canadiens (MPO 2023). Le potentiel d'introduction (pression de propagules et connectivité), le potentiel d'établissement (habitats propices, y compris un modèle basé sur le calcium et Maximum Entropy (MaxEnt)), le potentiel d'invasion et les impacts écologiques ont été utilisés pour calculer le risque écologique pour les moules zébrées et les moules quagga au Canada. Cette évaluation n'a pas évalué le risque pour les plans d’eau individuels, mais a été réalisée à une résolution de 9 260 m x 9 260 m. Ces cartes à haute résolution sont fournies ici. Des cartes du risque écologique au niveau des sous-aires de drainage sont également fournies. Pêches et Océans Canada n'est pas responsable des omissions ou des erreurs qui peuvent être contenues dans ce jeu de données et ne peut être tenu responsable de toute perte, financière ou autre, due à l'utilisation de ces données. Veuillez indiquer Wilcox et collab. 2024 comme source de données dans les cartes, rapports ou articles imprimés ou publiés sur papier ou sur l'internet.
Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest
Une planification efficace de la conservation repose sur la compréhension de la connectivité entre les populations, qui peut être documentée par des données génomiques. Ceci est particulièrement important pour les espèces sessiles comme la modiole (Modiolus modiolus), une espèce essentielle à la formation de certains habitats qui constitue une priorité en matière de conservation au Canada atlantique. Cependant, peu d’informations génomiques sont disponibles pour décrire les tendances en matière de connectivité de la modiole. Nous avons utilisé plus de 8 000 polymorphismes mononucléotidiques dérivés du séquençage de l’ADN associé aux sites de restriction et un ensemble de 8 microsatellites pour examiner la connectivité génomique entre les populations de modioles dans la baie de Fundy, le long du plateau néo-écossais et dans l’Atlantique Nord-Ouest, jusqu’à Terre-Neuve. Malgré les différences phénotypiques entre les lieux d’échantillonnage, nous avons constaté un manque général de diversité génétique et de structure démographique chez les modioles dans l’Atlantique Nord-Ouest. Tous les sites échantillonnés présentaient une faible hétérozygosité, un très faible FST, des coefficients de consanguinité élevés et un écart par rapport à l’équilibre Hardy-Weinberg, ce qui met en évidence la diversité génétique généralement faible pour tous les paramètres mesurés. L’analyse des composantes principales, l’analyse du métissage, les calculs par paires du FST et l’analyse des loci aberrants (pouvant faire l’objet d’une sélection) n’ont révélé aucun groupe génomique indépendant dans les données, et une analyse de la variation moléculaire a montré que moins de 1 % de la variation observée dans l’ensemble de données sur les SNP était constatée entre les sites d’échantillonnage. Nos résultats suggèrent que la connectivité est élevée entre les populations de modioles de l’Atlantique Nord-Ouest, ce qui, conjugué à des tailles de population réelles importantes, a entraîné une divergence génomique minimale dans la région. Ces résultats peuvent éclairer les considérations relatives à la conception de mesures de conservation dans la baie de Fundy et favoriser une meilleure intégration dans l’ensemble du réseau régional de conservation.Citer ces données comme: an Wyngaarden, Mallory et al. (2024).Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest. Publié en Mai 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).
Données de relevés de la distribution de la gonidée des Rocheuses
Données de relevés indiquant la présence de la gonidée des Rocheuses (Gonidea angulata), une espèce en voie de disparition, de 2008 à 2011. Les relevés ont été effectués par différents chercheurs à différents endroits.
Données du relevé de la densité de la gonidée des Rocheuses
La gonidée des Rocheuses (Gonidea angulata) est inscrite en vertu de la Loi sur les espèces en péril (LEP) en tant qu'espèce préoccupante et a fait l'objet d'une réévaluation par le COSEPAC, qui l'a désignée en voie de disparition. Cette moule d'eau douce est présente uniquement au Canada, dans la vallée de l'Okanagan en C.-B. Pour reprendre des travaux antérieurs et étayer des efforts d'évaluation et de conservation futurs dans cette aire de répartition géographique, sept sites facilement accessibles connus pour présenter de fortes densités de G. angulata ont été choisis à titre de sites repères prospectifs à utiliser pour surveiller l'abondance relative (c.-à-d. la densité des moulières) au moyen de relevés par tuba. En ce qui concerne les sites sur le lac, nous avons utilisé une conception de l'échantillonnage en deux étapes, en utilisant des transects et des quadrats. En ce qui concerne le site sur la rivière, on a effectué des dénombrements cumulatifs sur les deux berges de la rivière. Certains sites n'ont été échantillonnés qu'une seule fois, tandis que d'autres ont fait l'objet de multiples échantillonnages entre 2011 et 2016. Les densités moyennes des moules établies d'après tous les relevés oscillaient entre 0.19 et 2.86 moules/m2, ce qui correspond aux estimations de l'abondance sur les sites, qui s'échelonnent entre 102 et 3,276 moules. Des mesures de la profondeur ont aussi été prises sur la plupart des sites pour étayer l'outil de gestion de l'eau des poissons du Conseil de gestion de l'eau d'Okanagan.
Zones d'habitat des moules dans la région de l'Okanagan
Le but de ces données est de soutenir le Protocole sur les grands lacs, un document interinstitutions qui traite des processus à suivre lors de l'aménagement des zones côtières. Le processus de demande requis varie en fonction de la zone de valeur de l'habitat** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Développement d’une approche de caractérisation des espèces côtières à l’aide d’ADN environnemental (ADNe) en utilisant le marqueur MiFish (12S)
La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces de poissons et de mammifères marins dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés entre 2019 et 2021 à l’aide du marqueur mitochondrial MiFish (12S) . Les relevés ont été réalisés à l’été 2019 (14-18 juillet) et (30 juillet - 5 août), à l’automne 2020 (27-28 octobre) et à l’été-automne 2021 ( 31 mai - 3 juin) et (24-25 août) entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 1-50 mètres de profondeur dans 91 stations, avec 1 à 3 réplicas par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue ou PowerWater (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies ont été préparées soit par Génome Québec (2019, 2020) ou par le Laboratoire de Génomique de l’Institut Maurice-Lamontagne (2021), puis séquencées sur un système NovaSeq 4000 PE250 par Génome Québec. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse développé au laboratoire de Génomique. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUs a par la suite été corrigée à l’aide du paquet R metabaR pour éliminer le tag-jumping et prendre en considération les contaminants. Les échantillons présentant une forte présence de MOTUs contaminants ont été retirés du jeu de données. Les MOTUs ont été filtré également pour retirer toutes les séquences d’adapteurs restantes et conserver également ceux de la taille attendue (autour de 170 pb). Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du programme BLAST+ en utilisant la base de données de NCBI-nt. Les niveaux taxonomiques (espèce, genre ou famille) ont été attribués en utilisant une méthode de la meilleure correspondance (Top hit) avec un seuil de 95%. Seules les assignations au niveau des poissons et mammifères marins ont été considérées, et les taxons détectés ont été comparés à une liste d’espèce régionale, et corrigés si besoin. Les détections d’espèce des différents réplicas ont été combinés. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible via la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-2239bca5-c24a
Faune aquatique exotique envahissante au Québec
###DescriptionCette base de données contient les coordonnées d’observations de poissons et d’invertébrés, qui sont exotiques et envahissants, connues par le ministère de l’Environnement, de la Lutte contre les changements climatiques, de la Faune et des Parcs (MELCCFP) au Québec en date du mois de juin 2025.Une espèce aquatique envahissante est un végétal, un animal ou un micro-organisme (virus, bactérie ou champignon) qui est introduit hors de son aire de répartition naturelle, qui colonise de nouveaux sites ou de nouvelles régions à un rythme rapide et qui peut former des populations dominantes. Son établissement ou sa propagation peuvent constituer une menace pour l’environnement, l’économie ou la société.###Les observations proviennent de sources variées telles que :* les échantillonnages scientifiques effectués par le MELCCFP et par d’autres organismes gouvernementaux ou à but non lucratif;* les mentions de citoyens ayant communiqué directement avec le service à la clientèle du MELCCFP ou au moyen d’outils comme Sentinelle et iNaturalist;* les captures accidentelles de pêcheurs commerciaux membres du Réseau de détection précoce des espèces aquatiques exotiques envahissantes du Saint Laurent.Pour plus d’informations sur la lutte contre les espèces aquatiques envahissantes, les facteurs d’introduction ou les méthodes de prévention, consultez la page internet suivante : [Gestion des espèces exotiques envahissantes animales](https://www.quebec.ca/agriculture-environnement-et-ressources-naturelles/faune/gestion-faune-habitats-fauniques/gestion-especes-exotiques-envahissantes-animales).Pour vous aider à identifier les différentes espèces de poissons d’eau douce du Québec (indigènes et envahissantes), utilisez l’application mobile iPêche (disponible [ici](https://www.quebec.ca/tourisme-et-loisirs/activites-sportives-et-de-plein-air/peche-sportive/identifier-poisson-ipeche)), gratuite et développée par le gouvernement du Québec. Cette application permet le signalement volontaire des captures à des fins de recherche sur la faune.###Mises en garde* __Veuillez consulter le document PDF pour la liste des acronymes et références utilisés dans la base de données «Faune aquatique exotique envahissante au Québec».__* Les données ne sont pas des données exhaustives. Ainsi, l’absence d’informations dans un territoire donné ne signifie pas qu’il ne s’y trouve pas de faune aquatique envahissante.* Les observations transmises au moyen de photographies sont validées par des experts, mais n’ont pas toutes fait l’objet d’une validation terrain par le MELCCFP.* Les observations ont pu faire l’objet de changements depuis leur intégration dans la base de données (ex. : action de contrôle).
Relevé normalisé au casier ciblant la morue charbonnière – Bras de mer continentaux
Données sur les activités de pêche (année, date, heure, lieu, captures et effort) et données biologiques connexes provenant du relevé normalisé sur bras de mer s’inscrivant dans le relevé annuel d’évaluation et de recherche sur la morue charbonnière effectué sur la côte de la Colombie-BritanniqueIntroductionPêches et Océans Canada et la Canadian Sablefish Association collaborent afin de réaliser un relevé de recherche annuel indépendant de la pêche dans le cadre d’un accord conjoint. Pour se faire, on utilise des casiers afin d’obtenir des données sur les taux de capture, des échantillons biologiques, des mesures océanographiques et des données sur la remise à l’eau d'individus étiquetés et leur recapture.Des résumés de données sont fournis ici pour les calées standardisées qui sont menées à des stations fixes dans les bras de mer du continent. La conception du relevé de la morue charbonnière a évolué au fil du temps en incorporant et en abandonnant des éléments, y compris des études expérimentales individuelles (non disponibles sur OpenData). Ce relevé normalisé sur bras de mer est distinct des deux relevés suivants par sa méthodologie:(1) Relevé aléatoire stratifiée en zone extracôtière (2003 – aujourd'hui ; disponible sur OpenData en utilisant le lien ci-dessous),(2) Relevé normalisé au casier – données sur la remise à l’eau d'individus étiquetés et leur recapture en zone extracôtière (de 1990 à 2010, pas encore disponible sur OpenData).Pour le relevé normalisé sur bras de mer, les calées sont attribués à cinq polygones spécifiques dans chacune des quatre zones de bras de mer suivantes : Portland Inlet, Gil Island, Finlayson Channel et Dean/Burke Channel. Les quatre bras de mer ont fait l'objet de relevés réguliers entre 2003 et 2019. Aucun bras de mer n'a été étudié en 2020, et cheque bras de mer a été étudié chaque année depuis 2021. Les procédures du relevé sont normalisées et documentées dans les rapports techniques du ministère canadien de la pêche et des sciences aquatiques.Les tableaux fournis présentent les données du relevé normalisé sur bras de mer sur (i) l’effort, (ii) les captures, (iii) les renseignements biologiques.Données sur l'effort recueillie dans le bras de mer Ce tableau contient des renseignements sur les sorties et les activités de pêche (calées) réalisées dans le cadre du relevé annuel. Les renseignements concernant la sortie comprennent l’année du relevé, un numéro d’identification unique associé à la sortie, le navire à partir duquel le relevé a été réalisé et les dates de début et de fin de la sortie (c’est-à-dire les dates auxquelles le navire n’était pas amarré au quai et était utilisé pour le relevé). Les renseignements concernant la calée comprennent la date, l’heure, l’emplacement et la profondeur de la pêche, la strate de superficie et de profondeur du relevé pour cette calée, la raison justifiant la calée, le temps d’immersion, le nombre de casiers installés et le nombre de casiers avec captures.Tous les événements de pêche réussis sont inclus, les calées réussies étant celles qui répondent aux spécifications de conception de l'enquête.Données sur le capture recueillie dans le bras de merCe tableau contient des renseignements sur les captures issues d’activités de pêche fructueuses. Les captures sont identifiées en fonction de l’espèce ou du niveau taxonomique le plus bas possible. Elles sont consignées selon le poids des poissons pêchés ou leur nombre. Le numéro d’identification unique lié à la sortie et le numéro lié à la calée sont indiqués afin que les captures puissent être associées aux renseignements de l’activité de pêche en question (ce qui comprend l’emplacement de la pêche).Données biologiques recueillies dans le bras de merCe tableau contient les données biologiques des captures échantillonnées. Ces données peuvent comprendre une partie ou l’ensemble des renseignements suivants : la longueur, le poids, le sexe, la maturité et l’âge du poisson. La plupart des captures échantillonnées sont des morues charbonnières. Cependant, certaines années, les captures comprenaient des sébastes, des poissons plats et d’autres espèces de poissons ronds. Des structures servant à la détermination de l’âge sont prélevées et archivées jusqu’à ce qu’elles soient nécessaires à des fins d’analyse; des structures sont donc en attente d'analyse. Des échantillons de tissus (généralement une entaille de nageoire) peuvent être prélevés en vue d’une analyse génétique (ADN) pour identifier l'espèce avec précision. Des échantillons tissus peuvent être archivés jusqu’à ce qu’ils soient nécessaires à des fins d’analyse. Pour obtenir plus de renseignements à ce sujet, veuillez consulter les personnes-ressources. Le numéro d’identification unique lié à la sortie et le numéro lié à la calée sont indiqués afin que les échantillons puissent être associés à l’activité de pêche et aux renseignements sur les captures.
Base de données sur les contaminants dans les poissons
La base de données sur les contaminants dans les poissons est une compilation de données sur les contaminants analysés à partir d’échantillons de tissus de poissons à l’Institut des eaux douces, de 1970 à 2005. Les données comprennent le numéro de laboratoire, la région, l’analyse, les organes, les espèces, le lac, la forme (poisson entier, vidé non étêté, vidé sans tête), le poids, la longueur et les concentrations de contaminants. Le mercure total était le contaminant prédominant mesuré, mais les données comprennent un certain nombre d’échantillons qui ont été analysés pour les pesticides et d’autres contaminants. Les résultats ont été exprimés en parties par million (ppm) ou en parties par milliard (ppb) selon le paramètre analysé. Les concentrations sont exprimées en fonction du poids humide.
Abondance de crevettes et de poissons observée par une vidéo remorquée le long des transects de chalutage et de casier dans le détroit de Simoom, en Colombie-Britannique
Ces ensembles de données fournissent des informations sur les taxons abondants, y compris les crevettes et les poissons vivant sur le fond, le long des transects de chalutage et de piégeage dans le détroit de Simoom, de novembre 2000 à février 2001. Les données ont été compilées et mises en forme par Meagan Mak.Résumé du rapport:Cette étude fait partie d'un projet plus vaste visant à comparer les effets du chalutage et du piégeage des crevettes sur les crevettes, les poissons et l'habitat benthique du détroit de Simoom, situé dans l'archipel de Broughton, en Colombie-Britannique, au Canada. Le chalutage à panneaux, le chalutage à perche et le piégeage ont eu lieu dans trois blocs expérimentaux distincts du fond marin central du détroit. Chaque bloc était constitué de transects répétés, où une caméra vidéo submersible remorquée étudiait les crevettes et les poissons avant et après le chalutage. Les études vidéo n'ont été déployées qu'avant le piégeage. À partir des études vidéo, nous avons déterminé l'abondance des taxons de crevettes et de poissons communs.
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