Ces ensembles de données fournissent des informations relatives aux estimations des captures de crevettes et des prises accessoires associées Ie chalutage et Ie piégeage des crevettes dans le passage Clio en Colombie-Britannique. Les données ont été compilées et mises en forme par Meagan Mak.Résumé du rapport:Dans Ie cadre d'un projet d' étude des modifications potentielles des écosystèmes marins par Ie chalutage et Ie piégeage des crevettes, nous avons compté les prises réalisées par les chaluts à perche et les pièges à crevettes en deux endroits du passage Clio, dans la partie centresud de la côte de la Colombie-Britannique. Les relevés pour les chaluts à perche ont été effectués dans les baies Bones et Turnour respectivement, en octobre 2001 et en janvier 2002. Le relevé des pièges à crevettes s'est effectué dans la baie Turnour en mars 2002. Les données concernant les prises réalisées avec les deux types d'engins sont présentées.

Ces ensembles de données fournissent des informations sur les taxons abondants, y compris les crevettes et les poissons vivant sur le fond, le long des transects de chalutage et de piégeage dans le détroit de Simoom, de novembre 2000 à février 2001. Les données ont été compilées et mises en forme par Meagan Mak.Résumé du rapport:Cette étude fait partie d'un projet plus vaste visant à comparer les effets du chalutage et du piégeage des crevettes sur les crevettes, les poissons et l'habitat benthique du détroit de Simoom, situé dans l'archipel de Broughton, en Colombie-Britannique, au Canada. Le chalutage à panneaux, le chalutage à perche et le piégeage ont eu lieu dans trois blocs expérimentaux distincts du fond marin central du détroit. Chaque bloc était constitué de transects répétés, où une caméra vidéo submersible remorquée étudiait les crevettes et les poissons avant et après le chalutage. Les études vidéo n'ont été déployées qu'avant le piégeage. À partir des études vidéo, nous avons déterminé l'abondance des taxons de crevettes et de poissons communs.

Ces ensembles de données fournissent des informations relatives aux estimations de crevettes et de prises accessoires associées au chalutage à panneaux et au casier (novembre 2000) et au chalutage à perche (février 2001) dans le détroit de Simoom. Les ensembles de données ont été compilés et mis en forme par Meagan Mak.Résumé du rapport :Dans Ie cadre d'un projet d'étude des modifications physiques probables des écosystèmes marins imputables à la pêche des crevettes au chalut et au casier, on a recueilli des données sur les prises de poissons et de crevettes, les prises accessoires, ainsi que Ie poids, la proportion relative des sexes, l'emplacement des ceufs et les dommages collateraux à plusieurs espèces de Pandalides et d'Eualidés. On a aussi évalué les dommages causés en particulier à la crevette à front rayé (Pandalus hypsinotusy , soit au rostre, à la carapace, à I'abdomen et à l'éventail caudal, capturée au chalut à perche, au chalut à panneaux et au casier. Sont aussi inc1uses dans Ie présent document des données recueillies dans Ie cadre d'une étude préliminaire réalisée dans Ie chenal Northumberland en juin 2000 et d'un échantillonnage plus exhaustif effectué dans Ie détroit de Simoom en novembre 2000 et en février 2001.

Ces ensembles de données fournissent des informations sur les taxons de l'épifaune, y compris les crevettes et les poissons vivant sur le fond, le long des transects de chalutage dans Bones Bay et Turnour Bay entre 2001 et 2002. Les données ont été compilées et mises en forme par Meagan Mak.Résumé du rapport:Cette étude fait partie d'un projet plus vaste conçu pour évaluer les effets potentiels des engins de chalutage à crevettes sur l'épifaune, les crevettes, les poissons et l'habitat benthique du canal Clio situé dans l'archipel Broughton, en Colombie-Britannique, au Canada. Des relevés répétés au chalut à perche ont été effectués sur des transects individuels dans la baie Bones et la baie Turnour, situés respectivement dans les parties nord et sud du canal Clio. Une caméra vidéo submersible et remorquée a étudié les fonds marins pour collecter et énumérer l'épifaune et les taxons de poissons avant et après les activités de chalutage. En ce qui concerne les relevés vidéo collectés dans la baie Bones, l'abondance des poissons et de l'épifaune (par exemple, la crevette commune) a été estimée à partir des captures au chalut, tandis que l'épifaune (par exemple, la crevette commune, les sea whips) et les poissons ont été enregistrés par caméra à partir des transects vidéo de Turnour Bay.

Ces ensembles de données fournissent de l’information sur les sédiments, dont la taille des particules, la porosité, le contenu en matières organiques, les concentrations totales de carbone et d’azote, les concentrations d’éléments traces, et les concentrations de chlorophylle et de phéopigments, ainsi que sur l’abondance de la méiofaune et de la macrofaune dans le Simoom Sound, entre novembre 2000 et février 2001. Le formatage des données des fichiers a été effectué par Megan Mak.Sutherland et ses collaborateurs (2023) ont couvert la composante benthique d'un projet plus vaste portant sur la modification potentielle des écosystèmes marins par le chalutage et le piégeage des crevettes sur la côte centrale de la Colombie-Britannique. Des échantillons de sédiments et d'endofaune ont été prélevés avant et après la pêche avec des engins de pêche commerciale constitués de chaluts à panneaux, de chaluts à perche et de lignes de piégeage. Simoom Sound a été échantillonné en novembre 2000 et février 2001. Des données tabulées sur les caractéristiques des sédiments, notamment la granulométrie, la porosité, la teneur en carbone et en azote, les concentrations d'éléments traces et de chlorophylle, sont présentées dans ce rapport. De plus, les données endofauniques comprennent à la fois les communautés macrofauniques et méiofauniques.

Entre 1990 et 1993, Robin J. LeBrasseur et N. Brent Hargreaves ont mené un projet de recherche sur la migration des saumons juvéniles au large de la côte ouest de l’île de Vancouver, en Colombie-Britannique. Celle-ci incluait la mise au point d’un chalut à perche de surface pouvant être déployé depuis un gros chalutier (NGCC W.E. Ricker) et exploité en haute mer. Cet ensemble de données contient les données sur les prises des relevés de recherche et les données sur les examens individuels des poissons.

Cette ressource documente un jeu de données sur les occurrences d’épifaune collectées en 2021 dans le cadre du programme KEBABB (Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Baffin Bay) développé par Pêches et Océans Canada (MPO) en collaboration avec des partenaires universitaires. L’objectif général du programme KEBABB est de caractériser la variabilité et les tendances des conditions océanographiques physiques, chimiques et biologiques et des réseaux trophiques soutenant les pêches dans les écosystèmes de l’ouest de la baie de Baffin et du détroit de Lancaster. En 2021, le MPO a étendu le programme KEBABB au détroit de Barrow (KEBABS-Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Barrow Strait), une zone productive clé de l’aire marine nationale de conservation de Tallurutiup Imanga. L’étude a eu lieu dans l’Arctique canadien de l’Est (principalement dans la baie de Baffin, détroit de Davis et détroit de Barrow). L’échantillonnage est effectué le long de transects à des stations fixes dans la zone d’étude. Les prises sont collectées avec un chalut Agassiz de 3 m (filet à mailles internes de 5 mm) pendant 3 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 1.5 nœuds et avec un chalut à perche benthique de 3 m (filet à mailles internes de 6.4 mm) pendant 15 minutes de contact avec le fond à une vitesse cible de 3 nœuds. Un total de 16 stations ont été échantillonnées pour l’épifaune en 2021 entre 85 et 850 m. Les invertébrés épibenthiques sont identifiés au niveau taxonomique le plus bas possible et photographiés. Tous les spécimens inconnus sont congelés. En laboratoire, les identifications sont validées ou précisées avec les photos et les spécimens congelés.Les données sont présentées en format Darwin Core et sont séparées en deux fichiers :Le fichier “Activité_épifaune_KEBABB_epifauna_event_fr” qui contient les informations des missions, des stations et des déploiements, qui sont présenté sous une structure d’activité hiérarchique.Le fichier “Occurrence_épifaune_KEBABB_epifauna_fr” qui contient les occurrences taxonomiques.De plus amples détails sur l’échantillonnage se trouvent dans le rapport suivant : Pućko, M., Charette, J., Tremblay P., Brulotte S., St-Denis B., Ciastek S., Hedges, K., Kuzyk, Z., Roy V., and Michel, C. 2022. An ecosystem-based approach in the eastern Arctic: KEBABB/S (Knowledge and Ecosystem-Based Approach in Baffin Bay/Barrow Strait) 2021 expedition report. Can. Manuscr. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3250: viii + 58 p. https://publications.gc.ca/collections/collection_2022/mpo-dfo/Fs97-4-3250-eng.pdfLIMITATION DE L’UTILISATION :Pour assurer l’intégrité scientifique et l’utilisation appropriée des données, nous vous encourageons à contacter le gardien des données.

Ce jeu de données polygonales identifie la cote d'adéquation de l'habitat pour le hibou nain (FLOW) dans la région des ressources naturelles de Cariboo. L'évaluation de la qualité de l'habitat est basée sur la classification biogéoclimatique des écosystèmes (BEC), la classe d'âge de la forêt, la fermeture de la cime, les espèces d'arbres, l'activité de récolte, l'activité sylvicole, la pente et l'exposition.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

Les zones de protection marine doivent faire l’objet d’un suivi complet pour garantir la réalisation de leurs objectifs. Toutefois, le suivi des écosystèmes naturels à grande échelle est compliqué par la biodiversité qu’il vise à mesurer. Le métacodage à barres de l’ADN environnemental (ADNe) est une solution prometteuse pour relever ce défi de surveillance. Nous avons procédé à un échantillonnage jumelé sur 54 sites pour les assemblages de poissons et d’invertébrés dans l’Atlantique nord-ouest en utilisant des chaluts à poissons de fond et un métacodage à barres de l’ADNe de l’eau de mer benthique en utilisant quatre marqueurs génétiques (ARNr 12S, ARNr 16S, ARNr 18S, et CO1). Par rapport au chalutage, l’ADNe a permis de détecter des schémas similaires de renouvellement des espèces, des estimations plus importantes de la diversité gamma et des estimations plus faibles de la diversité alpha. Au total, 63,6 % (42/66) des espèces de poissons capturées par chalutage ont été détectées par l’ADNe, ainsi que 26 espèces supplémentaires. Sur les 24 détections manquées par l’ADNe, 12 étaient inévitables, car elles manquaient de séquences de référence. Si l’on exclut les taxons classés à un niveau supérieur à celui de l’espèce et ceux qui n’ont pas de nom d’espèce, 23,6 % (17/72) des espèces d’invertébrés capturées par le chalutage ont été détectées par CO1, qui a détecté 98 espèces supplémentaires. Nous démontrons que l’ADNe est capable de détecter des schémas d’assemblage de communautés et de renouvellement des espèces dans un environnement extracôtier en soulignant son fort potentiel en tant qu’outil non invasif, complet et évolutif pour la surveillance de la biodiversité qui soutient les programmes de conservation marine.Citer ces données comme suit: Jeffery, N., Rubidge, E., Abbott, C., Westfall, K., Stanley, R. (2024).Données de Le métacodage à barres de l’ADNe enrichit les données des relevés au chalut traditionnels pour le suivi de la biodiversité dans l’environnement marin. Date de publication Août 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).https://open.canada.ca/data/en/dataset/43a91ba7-8025-4330-88db-db14022d729d

La caractérisation des espèces par l’ADN environnemental (ADNe) est une méthode qui permet d’utiliser l’ADN libéré dans l’environnement par les organismes de diverses sources (sécrétions, fèces, gamètes, tissus, etc.). C’est un outil complémentaire aux méthodes standards d’échantillonnage pour l’identification de la biodiversité. Ce projet fournit une liste d’espèces d’invertébrés dont l’ADN a été détecté dans des échantillons d’eau collectés en 2018 à l’aide du marqueur COI.Les relevés ont étés réalisés à l’été 2018 du 11 au 14 août, entre Forestville et Godbout (Haute-Côte-Nord). L’échantillonnage a été réalisé entre 9-52 mètres de profondeur dans 40 stations, avec un seul échantillon par station. Deux litres d’eau ont été filtrés sur un filtre en fibre de verre de 1.2 µm. Les extractions de l’ADN ont été effectuées avec le kit d’extraction DNeasy Blood and Tissue (Qiagen). Des contrôles négatifs de terrains, d’extractions et de PCR ont été ajoutés aux différentes étapes du protocole. Les librairies au locus COI ont été préparées par Génome Québec et séquencées sur un système Illumina MiSeq PE250. L’analyse bio-informatique des séquences obtenues a été réalisée à l’aide d’un pipeline d’analyse maison tel que reporté dans Bourret et al. 2022. Une première étape a permis l’obtention d’une table d’unité moléculaire opérationnelle de taxonomie (ou Molecular operational taxonomic unit, MOTU) à l’aide du logiciel cutadapt pour le retrait des adaptateurs et du paquet R DADA2 pour la filtration, la fusion, le retrait des chimères et la compilation des données. La table de MOTUS a par la suite été corrigée en prenant compte des témoins négatifs, où le nombre d’observations dans ces derniers a été retiré des échantillons liés. Les MOTUs singletons ont également été retirés. Finalement, les assignations taxonomiques ont été effectuées sur les MOTUs à l’aide du classifier IDTAXA (présent dans le paquet R DECIPHIER) en utilisation un training set entrainé sur la banque de référence COI pour le Golf St-Laurent (GSL-rl v1.0, https://github.com/GenomicsMLI-DFO/MLI_GSL-rl) et une seuil de 40. Les détections avec une catégorie « Unreliable due to gaps » ont été rapportées au niveau du genre uniquement. Le fichier fournis comprend les informations génériques de l'activité, notamment le site, le nom de la station, la date, le type de marqueur, les types des assignations utilises pour l’identification des taxons et une liste de taxons ou espèces . La liste de taxons a été vérifiée par un expert en biodiversité de l’Institute Maurice-Lamontagne. Ce projet a été financé par le Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océans Canada dans le cadre du Plan de protection des océans. Cette initiative vise à acquérir des données environnementales de base qui contribuent à la caractérisation des zones côtières d’importance et appuient des évaluations fondées sur des preuves ainsi que les décisions de gestion afin de préserver les écosystèmes marins.Les données sont aussi accessible sur la plateforme OGSL : https://doi.org/10.26071/ogsl-cd4c205b-f63b