Les zones de protection marine doivent faire l’objet d’un suivi complet pour garantir la réalisation de leurs objectifs. Toutefois, le suivi des écosystèmes naturels à grande échelle est compliqué par la biodiversité qu’il vise à mesurer. Le métacodage à barres de l’ADN environnemental (ADNe) est une solution prometteuse pour relever ce défi de surveillance. Nous avons procédé à un échantillonnage jumelé sur 54 sites pour les assemblages de poissons et d’invertébrés dans l’Atlantique nord-ouest en utilisant des chaluts à poissons de fond et un métacodage à barres de l’ADNe de l’eau de mer benthique en utilisant quatre marqueurs génétiques (ARNr 12S, ARNr 16S, ARNr 18S, et CO1). Par rapport au chalutage, l’ADNe a permis de détecter des schémas similaires de renouvellement des espèces, des estimations plus importantes de la diversité gamma et des estimations plus faibles de la diversité alpha. Au total, 63,6 % (42/66) des espèces de poissons capturées par chalutage ont été détectées par l’ADNe, ainsi que 26 espèces supplémentaires. Sur les 24 détections manquées par l’ADNe, 12 étaient inévitables, car elles manquaient de séquences de référence. Si l’on exclut les taxons classés à un niveau supérieur à celui de l’espèce et ceux qui n’ont pas de nom d’espèce, 23,6 % (17/72) des espèces d’invertébrés capturées par le chalutage ont été détectées par CO1, qui a détecté 98 espèces supplémentaires. Nous démontrons que l’ADNe est capable de détecter des schémas d’assemblage de communautés et de renouvellement des espèces dans un environnement extracôtier en soulignant son fort potentiel en tant qu’outil non invasif, complet et évolutif pour la surveillance de la biodiversité qui soutient les programmes de conservation marine.Citer ces données comme suit: Jeffery, N., Rubidge, E., Abbott, C., Westfall, K., Stanley, R. (2024).Données de Le métacodage à barres de l’ADNe enrichit les données des relevés au chalut traditionnels pour le suivi de la biodiversité dans l’environnement marin. Date de publication Août 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).https://open.canada.ca/data/en/dataset/43a91ba7-8025-4330-88db-db14022d729d

Les programmes de surveillance sont une composante importante de la gestion des zones de protection marine (ZPM), car ils fournissent l’information requise sur l’état des écosystèmes protégés et sur les changements qui surviennent dans ceux-ci. Une surveillance est requise pour évaluer l’efficacité des ZPM par rapport à leurs objectifs de conservation et fournit les renseignements nécessaires pour évaluer les avantages que présente un accès restreint pour la biodiversité. Toutefois, pour la zone côtière de la Nouvelle-Écosse, il manque de données de référence, notamment sur la diversité des poissons et la structure des communautés dans les lits de macrophytes, ce qui rend la surveillance difficile. En 2017, les îles de la côte Est ont été désignées comme site d’intérêt en zone côtière pour l’établissement potentiel d’une ZPM. En 2018, un aperçu a été réalisé pour détailler les paramètres écologiques spatiaux et temporels du site d’intérêt. Ces renseignements ont révélé un écosystème côtier unique associé à un archipel dense et à un paysage marin relativement naturel. On a supposé que les habitats biogéniques de plantes et d’algues dans la zone abritaient une diversité d’espèces juvéniles de poissons. Le principal objectif de ce projet est d’entreprendre l’élaboration d’un programme à long terme de surveillance de la biodiversité dans les îles de la côte Est et d’autres zones côtières d’intérêt pour la planification de la conservation. Nous proposons de mettre en œuvre ce programme avec l’utilisation de méthodes d’échantillonnage direct (senne de plage, plongée en scaphandre autonome et échantillonnage d’isotopes stables) et indirect (ADN environnemental – ADNe). L’ADNe est un outil utile pour examiner la biodiversité marine de manière non invasive, à une petite échelle spatiale. L’ADNe peut être facilement recueilli et filtré, son séquençage devient de plus en plus rentable, et il peut constituer un outil utile pour la surveillance des zones de protection marine. Bien que l’ADNe donne généralement des résultats comparables aux techniques d’échantillonnage traditionnelles pour ce qui est des données sur la biodiversité recueillies, on sait peu de choses sur la façon dont les signaux de l’ADNe fluctuent au fil des ans (ou même des jours ou des semaines). Nous comparerons les détections d’espèces à l’aide du métacodage de l’ADNe aux relevés visuels (plongée en scaphandre autonome, senne) et au recensement des herbiers de zostères sur le littoral, pour fournir une base de référence et des séries chronologiques de la diversité des espèces sur lesquelles fonder le suivi à long terme. Ce projet permettra de dresser des inventaires des emplacements des herbiers de zostères et de la diversité des poissons et des invertébrés qu’ils renferment. Nous recueillons également des données sur la distribution de la longueur des poissons afin d’examiner les tendances saisonnières et interannuelles de la structure selon la taille au fil du temps. Les données générées par les échantillonnages directs et indirects fourniront un catalogue complet et continu de la diversité des espèces et de la structure des communautés dans les herbiers de zostères sur les côtes, en plus de permettre d’établir les meilleures pratiques pour l’échantillonnage de l’ADNe dans l’environnement côtier.Citer ces données comme: Jeffery, N.W., Pettitt-Wade, H., Van Wyngaarden, M., and Stanley, R.R.E. Programme de surveillance de la biodiversité côtière des Maritimes – senne de plage.Publié en Decembre 2023. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É). https://open.canada.ca/data/en/dataset/dbbcb23a-d018-4b70-b8ec-89997aded770

Pêches et Océans Canada (MPO) effectue des recherches et surveillons les environnements marins et dulcicoles pour soutenir la pêche durable, des écosystèmes aquatiques et des ressources vivantes en bonne santé, ainsi que des services maritimes sûrs et efficaces. Les Carnets d’expéditions contiennent des renseignements sur les activités scientifiques prévues sur le terrain dans l’océan Pacifique Nord et dans l’océan Arctique, ainsi que dans les eaux côtières et intérieures de la Colombie-Britannique et du Yukon.

Nous avons évalué un échantillonneur autonome d'ADN environnemental (ADNe) fabriqués par Dartmouth Ocean Technologies Inc. (DOT, Dartmouth, Canada) par rapport au temps de filtration de l'échantillon en laboratoire afin de déterminer la performance des échantillonneurs amarrés pour la surveillance du milieu marin. Nous avons déployé trois échantillonneurs autonomes de DOT dans le bassin de Bedford (Canada) pendant neuf semaines à l’été et à l’automne 2023. Les échantillonneurs ont filtré l'eau de mer in situ lors d'entretiens programmés au cours de cette période, et nous avons recueilli des échantillons contemporains avec une pompe à vide standard au cours de chaque période d'échantillonnage. Les deux types d’échantillons d’ADNe ont capturé une diversité de poissons similaire, y compris la diversité type de l’Atlantique Nord-Ouest. La communauté d’invertébrés détectée à l’aide du marqueur COI était différente d’un type d’échantillon à l’autre, probablement en raison des différences dans la taille des pores du filtre. Nous avons constaté que l'encrassement biologique des échantillonneurs amarrés était minime au cours de la période d'étude, même dans une zone très fréquentée comme le bassin de Bedford, probablement en raison de la période expérimentale relativement courte et du filtre en cuivre couvrant les clapets d’entrée et de sortie des instruments. Dans l’ensemble, nos résultats sont prometteurs en ce qui concerne le déploiement d’échantillonneurs autonomes d’ADNe dans les aires marines de conservation pour contribuer à la surveillance dans l’océan tempéré, mais d’autres essais sur de plus longues périodes sont nécessaires pour déterminer si l’ADN demeure bien préservé dans les échantillonneurs autonomes à des températures océaniques ambiantes.Citer ces données comme: Jeffery, N.W., Van Wyngaarden, M., and Stanley, R.R.E. Évaluation d’un échantillonneur autonome d’ADNe pour la surveillance du milieu marin : Applications à court et à long terme. Publié en Décembre 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).

L’indice de qualité de la bande riveraine (IQBR) sert à évaluer la condition écologique du milieu riverain. Il est construit à partir de neuf composantes qui ont été pondérées selon leur potentiel à remplir les fonctions écologiques en regard de la protection des écosystèmes aquatiques.Les données sur la qualité de la bande riveraine proviennent de stations de suivi du benthos échantillonnées entre 2003 et 2023.

Données océanographiques provenant des postes d'amarrage fixes déployés dans le cadre du programme de surveillance côtière du Centre de recherche appliquée marine (CMAR).** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

Données océanographiques provenant des postes d'amarrage fixes déployés dans le cadre du programme de surveillance côtière du Centre de recherche appliquée marine (CMAR).** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

Données océanographiques provenant des postes d'amarrage fixes déployés dans le cadre du programme de surveillance côtière du Centre de recherche appliquée marine (CMAR).** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **

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Données océanographiques provenant des postes d'amarrage fixes déployés dans le cadre du programme de surveillance côtière du Centre de recherche appliquée marine (CMAR).** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **