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Le métacodage à barres de l’ADNe enrichit les données des relevés au chalut traditionnels pour le suivi de la biodiversité dans l’environnement marin
Les zones de protection marine doivent faire l’objet d’un suivi complet pour garantir la réalisation de leurs objectifs. Toutefois, le suivi des écosystèmes naturels à grande échelle est compliqué par la biodiversité qu’il vise à mesurer. Le métacodage à barres de l’ADN environnemental (ADNe) est une solution prometteuse pour relever ce défi de surveillance. Nous avons procédé à un échantillonnage jumelé sur 54 sites pour les assemblages de poissons et d’invertébrés dans l’Atlantique nord-ouest en utilisant des chaluts à poissons de fond et un métacodage à barres de l’ADNe de l’eau de mer benthique en utilisant quatre marqueurs génétiques (ARNr 12S, ARNr 16S, ARNr 18S, et CO1). Par rapport au chalutage, l’ADNe a permis de détecter des schémas similaires de renouvellement des espèces, des estimations plus importantes de la diversité gamma et des estimations plus faibles de la diversité alpha. Au total, 63,6 % (42/66) des espèces de poissons capturées par chalutage ont été détectées par l’ADNe, ainsi que 26 espèces supplémentaires. Sur les 24 détections manquées par l’ADNe, 12 étaient inévitables, car elles manquaient de séquences de référence. Si l’on exclut les taxons classés à un niveau supérieur à celui de l’espèce et ceux qui n’ont pas de nom d’espèce, 23,6 % (17/72) des espèces d’invertébrés capturées par le chalutage ont été détectées par CO1, qui a détecté 98 espèces supplémentaires. Nous démontrons que l’ADNe est capable de détecter des schémas d’assemblage de communautés et de renouvellement des espèces dans un environnement extracôtier en soulignant son fort potentiel en tant qu’outil non invasif, complet et évolutif pour la surveillance de la biodiversité qui soutient les programmes de conservation marine.Citer ces données comme suit: Jeffery, N., Rubidge, E., Abbott, C., Westfall, K., Stanley, R. (2024).Données de Le métacodage à barres de l’ADNe enrichit les données des relevés au chalut traditionnels pour le suivi de la biodiversité dans l’environnement marin. Date de publication Août 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).https://open.canada.ca/data/en/dataset/43a91ba7-8025-4330-88db-db14022d729d
Surveillance de l’ADN environnemental au large de la zone d’intérêt des îles de la côte Est
Le site d’intérêt (SI) des îles de la côte Est constitue un grand SI côtier dans la région des Maritimes d’une superficie de 2 089 km2 et qui s’étend sur 100 km de littoral. Bien qu’une grande partie des données qui ont mené à la désignation de la zone comme site d’intérêt aient été recueillies dans les zones côtières (c.-à-d. répartition de la zostère marine et du varech, sites de nidification des oiseaux côtiers et frayères du hareng), il y a moins d’information disponible sur la structure des communautés de poissons et d’invertébrés dans les zones extracôtières du site d’intérêt. L’effort d’échantillonnage actuel au large des côtes est principalement axé sur le relevé plurispécifique estival par navire de recherche qui couvre le plateau néo-écossais, mais qui n’effectue pas d’échantillonnage dans la fourchette des profondeurs couverte par le SI (moins de 100 m de profondeur environ). L’ADN environnemental (ADNe) constitue une approche prometteuse pour la surveillance de la biodiversité qui fait l’objet d’une attention accrue dans le domaine marin. L’échantillonnage de volumes d’eau relativement petits (de 1 à 5 litres environ) permet de capturer des millions de fragments d’ADNe sur des filtres que l’on peut ensuite séquencer en vue d’identifier la composition des espèces d’une zone donnée. Le métacodage à barres de l’ADNe repose sur les principes du codage à barres de l’ADN, qui consiste à identifier les espèces uniquement à partir de leurs séquences d’ADN uniques. Le métacodage par barres de l’ADNe s’appuie sur une bibliothèque de références exhaustive de séquences génétiques d’espèces connues, permettant ainsi d’identifier rapidement les espèces capturées dans chaque échantillon d’eau. Cette méthode est relativement simple, efficace (elle permet de caractériser la diversité des poissons et des invertébrés à la fois) et non invasive, ce qui signifie qu’elle ne perturbe pas les habitats benthiques vulnérables et ne nécessite pas de dissection des échantillons de tissus prélevés sur les poissons et les invertébrés capturés. L’ADNe s’est révélé comparable à d’autres techniques de recensement de la biodiversité et offre la possibilité de réaliser rapidement des relevés sur la biodiversité dans une zone relativement vaste, comme le site d’intérêt des îles de la côte Est. Notre échantillonnage de l’ADNe dans les îles de la côte Est cible les poissons et les invertébrés au moyen de plusieurs marqueurs génétiques (p. ex. 12S et COI), en vue d’obtenir des renseignements de base sur ces communautés dans des transects s’étendant de la zone côtière à la zone extracôtière du site d’intérêt. Au fil du temps, nous étudierons les changements dans la richesse des espèces et la composition des communautés en utilisant les relevés annuels de l’ADNe comme outil de surveillance continue pour cette région côtière.Citer ces données comme: Jeffery, N.W.Surveillance de l’ADN environnemental au large de la zone d’intérêt des îles de la côte Est. Publié en avril 2026. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).
Type d'Arbre - Schéma des attributs communs pour les inventaires des ressources forestières
Le Schéma des attributs communs pour les inventaires des ressources forestières (SACIRF) est un dépôt de données d’inventaire sur les ressources forestières du Canada. Les ensembles de données d’inventaire sur les ressources forestières du SACIRF sont harmonisés selon un modèle de données commun afin de pouvoir utiliser ensemble les données recueillies par divers organismes appliquant des normes différentes. Les ministères et organismes provinciaux, territoriaux et fédéraux participants partagent des ensembles de données d’inventaire sur les ressources forestières cartographiques actuelles et historiques par l’intermédiaire du SACIRF, afin que leurs données soient accessibles aux utilisateurs dont les domaines d’intérêt couvrent de multiples provinces et territoires. Le SACIRF a initialement été élaboré par des chercheurs universitaires (Cumming et coll., https://doi.org/10.1139/cjfr-2014-0102).Cette version du SACIRF (SACIRF v5) a été élaborée de nouveau en collaboration avec des chercheurs universitaires de l’Université Laval pour offrir une version gouvernementale du SACIRF qui soit repérable, accessible, interexploitable et réutilisable. Elle utilise les données les plus actuelles sur l’inventaire forestier communiquées par les ministères et organismes provinciaux, territoriaux et fédéraux participants. Le SACIRFv5 est hébergé dans le portail de données du Conseil canadien des ministres des forêts, le Système national d’information sur les forêts (http://nfis.org).
Bâtiments et services municipaux
Principaux bâtiments et services municipaux.Attributs :ID - Identifiant uniqueSOUSTYPE - Sous-type d'élémentNOM - Nom du bâtiment ou du service
Cases de stationnement
Cases de stationnement public au centre-ville de Sherbrooke.Attributs :EMPLACEMENT - Emplacement de la case de stationnementNOM - Nom du stationnementNUMERO - Numéro du parcomètreTYPE - Type de stationnementNIVEAU - Niveau de la case de stationnement
Sous-ensemble des sites de loisirs - À des fins d'information uniquement
Cet ensemble de données contient un petit sous-ensemble de la couche WHSE_FOREST_TENURE.FTEN_RECREATION_POLY_SVW, sous forme de points, avec une attribution minimale dans le but d'afficher un ensemble sélectionné de sites de loisirs de grande valeur. Pour accéder à la liste complète des sites de loisirs forestiers, veuillez utiliser [Polygons de loisirs WHSE_FOREST_TENURE.FTEN_RECREATION_POLY_SVW] (http://catalogue.data.gov.bc.ca/dataset/263338a7-93ee-49c1-83e8-13f0bde70833)** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Ligne de notation des cartes de tenure forestière
Il s'agit d'une couche spatiale montrant les lignes de notation cartographique du ministère des Forêts. Il s'agit de la représentation spatiale linéaire d'une notation sur l'Atlas forestier qui enregistre la zone d'intérêt d'autres agences gouvernementales et individus.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Polygone de notation des cartes foncières forestières
Il s'agit d'une couche spatiale montrant les polygones de notation cartographique du ministère des Forêts. Il s'agit d'une représentation spatiale polygonale pour une notation sur l'Atlas forestier, qui enregistre la zone d'intérêt d'autres agences gouvernementales et individus.** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
Bâtiments
Bâtiments se trouvant sur le territoire de la Ville de Sherbrooke et appartenant à l'une des catégories suivantes : commerce, hôpital, école ou édifice municipal. Ces catégories sont respectivement associées aux codes de sous-type 2, 3, 4 et 5Attributs :ID - Identifiant uniqueSOUSTYPE - Code du sous-type du bâtiment (2 - Commerce, 3 - Hôpital, 4 - École, 5 - Édifice municipal)
Archéologie Borden Grid
Couche polygonale contenant une grille de référence archéologique établie par Charles Borden. Semblable au réseau BCGS ou au système de réseau TRIM. Tous les sites archéologiques du Canada sont numérotés en fonction de cette grille** Cet élément de métadonnées provenant d’une tierce partie a été traduit à l'aide d'un outil de traduction automatisée (Amazon Translate). **
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